Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SVQTAATSWGTVPSIAVYTANNGKITERCWDGKGWYTGAFNEPGDNVSVTSWLVGSAIHIRVYASTGTTTTEWCWDGNGW
TKGAYTGDQTAATSWGVPSIAVYTANNGKITERCWDGKGWYTGAFNEPGDNVSVTSWLVGSAIHIRVYASTGTTTTEWCW
DGNGWTKGAYTGDQTAATSWGTVPSIAVYTANNGKITERCWDGKGWYTGAFNEPGDNVSVTSWLVGSAIHIRVYASTGTT
TTEWCWDGGWTKGAYT

The query sequence (length=256) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 7e7v:A 271 268 0.9883 0.9336 0.9440 6.82e-170 2bt9:A, 2bt9:B, 2bt9:C, 4csd:A, 4csd:B, 7e7n:A, 7e7r:A, 7e7r:B, 7e7t:A, 7e7t:B, 7e7u:A, 7e7u:B, 7e7v:B, 7e7v:C, 5o7v:A, 5o7v:B, 6stz:A, 6stz:D, 6stz:B, 6stz:F, 6stz:C, 6stz:E, 6su0:A, 6su0:I, 6su0:K, 6su0:C, 6su0:B, 6su0:J, 6su0:D, 6su0:F, 6su0:M, 6su0:E, 6su0:N, 6su0:O, 3zi8:A, 6zuk:D, 6zuk:E
2 6f37:A 113 86 0.3320 0.7522 0.9884 4.70e-55 5ajb:A, 5ajb:B, 5ajb:C, 5ajc:A, 5ajc:B, 5ajc:C, 7alf:A, 7alf:B, 7alg:A, 7alg:B, 2bs5:A, 2bs6:A, 2bs6:B, 2bs6:C, 8c9y:A, 8c9z:A, 8cf6:A, 8cf6:C, 8cf6:B, 8cf7:A, 8cf7:B, 8cf7:C, 8cf7:D, 8cf7:E, 8cf7:F, 6f37:B, 6f7w:A, 6f7w:B, 6f7w:C, 6f7x:A, 6f7x:C, 6f7x:B, 6gl5:A, 6gl5:B, 6gl5:C, 4i6s:A, 4i6s:B, 4i6s:C, 5o7u:A, 5o7u:B, 5o7w:A, 5o7w:B, 7p2h:A, 7p2h:B, 7p2i:A, 7p2i:C, 7p2i:B, 7p2j:A, 7p2j:B, 7pr5:A, 7pr5:C, 7pr5:F, 7pr5:B, 7pr5:D, 7pr5:E, 7pr5:G, 7pr5:I, 7pr5:H, 7pr5:J, 7pr5:L, 7pr5:K, 8q6a:A, 8q6b:A, 8q6c:A, 6s99:A, 6s99:C, 6s99:B, 6s99:D, 6s99:F, 6s99:E, 6sth:A, 6sth:B, 6t99:A, 6t99:B, 6t99:C, 6t99:D, 6t99:E, 6t99:F, 6t99:G, 6t99:H, 6t99:I, 6t9a:A, 6t9a:B, 6t9a:C, 6t9b:A, 6t9b:B, 6t9b:C, 6t9b:D, 6t9b:E, 6t9b:F, 6t9b:G, 6t9b:H, 6t9b:I, 6y0x:B, 6y0x:F, 6y0x:C, 6y0x:D, 6y0x:E, 6y0x:A, 6z5g:A, 6z5m:A, 6z5p:A, 6z5p:B, 6z5q:A, 6z5q:B, 6z5w:A, 6z5x:A, 6z5z:A, 6z60:A, 6z62:A, 6zuk:A, 6zuk:B, 6zuk:C, 6zul:A, 6zul:B, 6zul:C, 6zul:D, 6zul:E, 6zul:F, 6zum:A
3 6f37:A 113 84 0.3203 0.7257 0.9762 1.50e-51 5ajb:A, 5ajb:B, 5ajb:C, 5ajc:A, 5ajc:B, 5ajc:C, 7alf:A, 7alf:B, 7alg:A, 7alg:B, 2bs5:A, 2bs6:A, 2bs6:B, 2bs6:C, 8c9y:A, 8c9z:A, 8cf6:A, 8cf6:C, 8cf6:B, 8cf7:A, 8cf7:B, 8cf7:C, 8cf7:D, 8cf7:E, 8cf7:F, 6f37:B, 6f7w:A, 6f7w:B, 6f7w:C, 6f7x:A, 6f7x:C, 6f7x:B, 6gl5:A, 6gl5:B, 6gl5:C, 4i6s:A, 4i6s:B, 4i6s:C, 5o7u:A, 5o7u:B, 5o7w:A, 5o7w:B, 7p2h:A, 7p2h:B, 7p2i:A, 7p2i:C, 7p2i:B, 7p2j:A, 7p2j:B, 7pr5:A, 7pr5:C, 7pr5:F, 7pr5:B, 7pr5:D, 7pr5:E, 7pr5:G, 7pr5:I, 7pr5:H, 7pr5:J, 7pr5:L, 7pr5:K, 8q6a:A, 8q6b:A, 8q6c:A, 6s99:A, 6s99:C, 6s99:B, 6s99:D, 6s99:F, 6s99:E, 6sth:A, 6sth:B, 6t99:A, 6t99:B, 6t99:C, 6t99:D, 6t99:E, 6t99:F, 6t99:G, 6t99:H, 6t99:I, 6t9a:A, 6t9a:B, 6t9a:C, 6t9b:A, 6t9b:B, 6t9b:C, 6t9b:D, 6t9b:E, 6t9b:F, 6t9b:G, 6t9b:H, 6t9b:I, 6y0x:B, 6y0x:F, 6y0x:C, 6y0x:D, 6y0x:E, 6y0x:A, 6z5g:A, 6z5m:A, 6z5p:A, 6z5p:B, 6z5q:A, 6z5q:B, 6z5w:A, 6z5x:A, 6z5z:A, 6z60:A, 6z62:A, 6zuk:A, 6zuk:B, 6zuk:C, 6zul:A, 6zul:B, 6zul:C, 6zul:D, 6zul:E, 6zul:F, 6zum:A
4 6f37:A 113 84 0.3203 0.7257 0.9762 3.33e-51 5ajb:A, 5ajb:B, 5ajb:C, 5ajc:A, 5ajc:B, 5ajc:C, 7alf:A, 7alf:B, 7alg:A, 7alg:B, 2bs5:A, 2bs6:A, 2bs6:B, 2bs6:C, 8c9y:A, 8c9z:A, 8cf6:A, 8cf6:C, 8cf6:B, 8cf7:A, 8cf7:B, 8cf7:C, 8cf7:D, 8cf7:E, 8cf7:F, 6f37:B, 6f7w:A, 6f7w:B, 6f7w:C, 6f7x:A, 6f7x:C, 6f7x:B, 6gl5:A, 6gl5:B, 6gl5:C, 4i6s:A, 4i6s:B, 4i6s:C, 5o7u:A, 5o7u:B, 5o7w:A, 5o7w:B, 7p2h:A, 7p2h:B, 7p2i:A, 7p2i:C, 7p2i:B, 7p2j:A, 7p2j:B, 7pr5:A, 7pr5:C, 7pr5:F, 7pr5:B, 7pr5:D, 7pr5:E, 7pr5:G, 7pr5:I, 7pr5:H, 7pr5:J, 7pr5:L, 7pr5:K, 8q6a:A, 8q6b:A, 8q6c:A, 6s99:A, 6s99:C, 6s99:B, 6s99:D, 6s99:F, 6s99:E, 6sth:A, 6sth:B, 6t99:A, 6t99:B, 6t99:C, 6t99:D, 6t99:E, 6t99:F, 6t99:G, 6t99:H, 6t99:I, 6t9a:A, 6t9a:B, 6t9a:C, 6t9b:A, 6t9b:B, 6t9b:C, 6t9b:D, 6t9b:E, 6t9b:F, 6t9b:G, 6t9b:H, 6t9b:I, 6y0x:B, 6y0x:F, 6y0x:C, 6y0x:D, 6y0x:E, 6y0x:A, 6z5g:A, 6z5m:A, 6z5p:A, 6z5p:B, 6z5q:A, 6z5q:B, 6z5w:A, 6z5x:A, 6z5z:A, 6z60:A, 6z62:A, 6zuk:A, 6zuk:B, 6zuk:C, 6zul:A, 6zul:B, 6zul:C, 6zul:D, 6zul:E, 6zul:F, 6zum:A
5 6f37:A 113 83 0.1445 0.3274 0.4458 7.30e-11 5ajb:A, 5ajb:B, 5ajb:C, 5ajc:A, 5ajc:B, 5ajc:C, 7alf:A, 7alf:B, 7alg:A, 7alg:B, 2bs5:A, 2bs6:A, 2bs6:B, 2bs6:C, 8c9y:A, 8c9z:A, 8cf6:A, 8cf6:C, 8cf6:B, 8cf7:A, 8cf7:B, 8cf7:C, 8cf7:D, 8cf7:E, 8cf7:F, 6f37:B, 6f7w:A, 6f7w:B, 6f7w:C, 6f7x:A, 6f7x:C, 6f7x:B, 6gl5:A, 6gl5:B, 6gl5:C, 4i6s:A, 4i6s:B, 4i6s:C, 5o7u:A, 5o7u:B, 5o7w:A, 5o7w:B, 7p2h:A, 7p2h:B, 7p2i:A, 7p2i:C, 7p2i:B, 7p2j:A, 7p2j:B, 7pr5:A, 7pr5:C, 7pr5:F, 7pr5:B, 7pr5:D, 7pr5:E, 7pr5:G, 7pr5:I, 7pr5:H, 7pr5:J, 7pr5:L, 7pr5:K, 8q6a:A, 8q6b:A, 8q6c:A, 6s99:A, 6s99:C, 6s99:B, 6s99:D, 6s99:F, 6s99:E, 6sth:A, 6sth:B, 6t99:A, 6t99:B, 6t99:C, 6t99:D, 6t99:E, 6t99:F, 6t99:G, 6t99:H, 6t99:I, 6t9a:A, 6t9a:B, 6t9a:C, 6t9b:A, 6t9b:B, 6t9b:C, 6t9b:D, 6t9b:E, 6t9b:F, 6t9b:G, 6t9b:H, 6t9b:I, 6y0x:B, 6y0x:F, 6y0x:C, 6y0x:D, 6y0x:E, 6y0x:A, 6z5g:A, 6z5m:A, 6z5p:A, 6z5p:B, 6z5q:A, 6z5q:B, 6z5w:A, 6z5x:A, 6z5z:A, 6z60:A, 6z62:A, 6zuk:A, 6zuk:B, 6zuk:C, 6zul:A, 6zul:B, 6zul:C, 6zul:D, 6zul:E, 6zul:F, 6zum:A
6 6zfc:A 87 86 0.2539 0.7471 0.7558 4.75e-41 6zfc:B, 6zfc:C, 6zfc:D, 6zfc:E, 6zfc:F, 3zw0:C, 3zw1:A, 3zw1:B, 3zw2:A, 3zw2:B, 3zw2:C, 3zwe:A, 3zwe:B, 3zwe:C, 3zzv:A, 3zzv:B, 3zzv:C
7 6zfc:A 87 85 0.2500 0.7356 0.7529 1.94e-38 6zfc:B, 6zfc:C, 6zfc:D, 6zfc:E, 6zfc:F, 3zw0:C, 3zw1:A, 3zw1:B, 3zw2:A, 3zw2:B, 3zw2:C, 3zwe:A, 3zwe:B, 3zwe:C, 3zzv:A, 3zzv:B, 3zzv:C
8 6zfc:A 87 84 0.2500 0.7356 0.7619 4.77e-38 6zfc:B, 6zfc:C, 6zfc:D, 6zfc:E, 6zfc:F, 3zw0:C, 3zw1:A, 3zw1:B, 3zw2:A, 3zw2:B, 3zw2:C, 3zwe:A, 3zwe:B, 3zwe:C, 3zzv:A, 3zzv:B, 3zzv:C
9 6zfc:A 87 76 0.1289 0.3793 0.4342 5.09e-10 6zfc:B, 6zfc:C, 6zfc:D, 6zfc:E, 6zfc:F, 3zw0:C, 3zw1:A, 3zw1:B, 3zw2:A, 3zw2:B, 3zw2:C, 3zwe:A, 3zwe:B, 3zwe:C, 3zzv:A, 3zzv:B, 3zzv:C
10 6trv:AAA 294 237 0.3281 0.2857 0.3544 7.93e-19 6trv:BBB
11 6trv:AAA 294 232 0.3008 0.2619 0.3319 7.12e-17 6trv:BBB
12 6trv:AAA 294 88 0.1445 0.1259 0.4205 1.61e-08 6trv:BBB
13 6htn:A 143 128 0.2148 0.3846 0.4297 1.11e-18 6htn:B, 6htn:C, 6htn:D, 6htn:E, 6htn:F
14 6htn:A 143 143 0.2344 0.4196 0.4196 1.58e-18 6htn:B, 6htn:C, 6htn:D, 6htn:E, 6htn:F
15 6htn:A 143 77 0.1367 0.2448 0.4545 1.36e-08 6htn:B, 6htn:C, 6htn:D, 6htn:E, 6htn:F
16 6z6c:BBB 317 244 0.2969 0.2397 0.3115 1.10e-11 4agi:A, 4agi:B, 4agi:C, 4agi:D, 4agt:A, 4agt:B, 4ah4:A, 4ah4:B, 4aha:A, 4aha:B, 4c1y:A, 4c1y:B, 4c1y:C, 4c1y:D, 4d4u:A, 4d4u:B, 4d52:A, 4d52:B, 4d52:C, 4d52:D, 6z6c:AAA
17 5mxc:A 313 231 0.2656 0.2173 0.2944 4.53e-11 6gke:A, 1iub:A, 1iuc:A, 1ofz:A, 1ofz:B
18 5mxc:A 313 157 0.2031 0.1661 0.3312 1.40e-09 6gke:A, 1iub:A, 1iuc:A, 1ofz:A, 1ofz:B
19 5mxc:A 313 198 0.2383 0.1949 0.3081 1.37e-04 6gke:A, 1iub:A, 1iuc:A, 1ofz:A, 1ofz:B
20 5mxc:A 313 83 0.1055 0.0863 0.3253 0.060 6gke:A, 1iub:A, 1iuc:A, 1ofz:A, 1ofz:B
21 5mxc:A 313 96 0.1094 0.0895 0.2917 8.4 6gke:A, 1iub:A, 1iuc:A, 1ofz:A, 1ofz:B
22 5eo8:A 311 222 0.2656 0.2186 0.3063 2.34e-10 5eo7:A, 5eo7:B, 5eo7:C, 5h47:A, 5h47:B, 5h47:C, 5h47:J, 5h47:D, 5h47:E, 5h47:F, 5h47:G, 5h47:K, 5h47:H, 5h47:I, 5h47:L
23 5eo8:A 311 189 0.1836 0.1511 0.2487 0.37 5eo7:A, 5eo7:B, 5eo7:C, 5h47:A, 5h47:B, 5h47:C, 5h47:J, 5h47:D, 5h47:E, 5h47:F, 5h47:G, 5h47:K, 5h47:H, 5h47:I, 5h47:L
24 7c39:A 346 180 0.1914 0.1416 0.2722 0.007 7c38:A, 7c38:B, 7c39:B, 7c3c:A, 7c3c:B, 7c3d:A, 7c3d:B
25 7c39:A 346 180 0.1914 0.1416 0.2722 0.018 7c38:A, 7c38:B, 7c39:B, 7c3c:A, 7c3c:B, 7c3d:A, 7c3d:B
26 7c39:A 346 146 0.1641 0.1214 0.2877 0.045 7c38:A, 7c38:B, 7c39:B, 7c3c:A, 7c3c:B, 7c3d:A, 7c3d:B
27 3kow:B 728 96 0.0977 0.0343 0.2604 1.7 3kow:A, 3kow:C, 3kow:D, 3kox:A, 3kox:B, 3kox:C, 3kox:D, 3koy:A, 3koy:B, 3koy:D, 3koy:C, 3koz:A, 3koz:B, 3koz:C, 3koz:D, 3kp0:A, 3kp0:B, 3kp0:C, 3kp0:D, 3kp1:C, 3kp1:A, 3kp1:D, 3kp1:B
28 5d4h:B 341 60 0.0742 0.0557 0.3167 5.2 2afn:A, 2afn:B, 2afn:C, 1aq8:A, 1aq8:B, 1aq8:C, 1as6:A, 1as6:B, 1as6:C, 1as7:A, 1as7:B, 1as7:C, 1as8:A, 1as8:B, 1as8:C, 2b08:A, 2b08:B, 2b08:C, 5d4h:A, 5d4h:C, 5d4i:A, 5d4i:C, 5d4i:B, 5d4j:A, 5d4j:B, 5d4j:C, 2e86:A, 2e86:B, 2e86:C, 1et5:A, 1et7:A, 1et8:A, 5f7a:A, 5f7a:C, 5f7a:B, 5f7b:A, 5f7b:B, 5f7b:C, 2fjs:A, 2fjs:B, 2fjs:C, 3h4f:A, 3h4f:B, 3h4f:C, 3h4h:A, 3h4h:B, 3h4h:C, 3h56:A, 1j9q:A, 1j9q:B, 1j9q:C, 1j9r:A, 1j9r:B, 1j9r:C, 1j9s:A, 1j9s:B, 1j9s:C, 1j9t:A, 1j9t:B, 1j9t:C, 1l9o:A, 1l9o:B, 1l9o:C, 1l9p:A, 1l9p:B, 1l9p:C, 1l9q:A, 1l9q:C, 1l9q:B, 1l9r:A, 1l9r:B, 1l9r:C, 1l9s:A, 1l9s:B, 1l9s:C, 1l9t:A, 1l9t:C, 1l9t:B, 1npj:A, 1npj:B, 1npj:C, 1npn:A, 1npn:B, 1npn:C, 1ntd:A, 2p80:A, 2p80:B, 2p80:C, 2pp7:A, 2pp7:B, 2pp7:C, 2pp8:A, 2pp8:B, 2pp8:C, 2pp9:A, 2pp9:B, 2pp9:C, 2ppa:A, 2ppa:B, 2ppa:C, 2ppc:A, 2ppc:B, 2ppc:C, 2ppd:A, 2ppd:B, 2ppd:C, 2ppe:A, 2ppe:B, 2ppe:C, 2ppf:A, 2ppf:B, 2ppf:C, 1sjm:A, 1sjm:B, 1sjm:C, 1snr:A, 1snr:B, 1snr:C, 4ysc:A, 4ysc:B, 4ysc:C, 4yse:A, 4yse:B, 4yse:C, 1zdq:A, 1zdq:B, 1zdq:C, 1zds:A, 1zds:B, 1zds:C

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218