BioLiP

>protein
SVPWFPKKISDLDHCANRVLDADHPGFKDNVYRKRRKYFADLAMNYKHGDPIPKVEFTEEEIKTWGTVFQELNKLYPTHA
CREYLKNLPLLSKYCGYREDNIPQLEDVSNFLKERTGFSIRPVAGYLSPRDFLSGLAFRVFHCTQYVRHSSDPFYTPEPD
TCHELLGHVPLLAEPSFAQFSQEIGLASLGASEEAVQKLATCYFFTVEFGLCKQDGQLRVFGAGLLSSISELKHALSGHA
KVKPFDPKITCKQECLITTFQDVYFVSESFEDAKEKMREFTKTIK

The query sequence (length=285) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3e2t:A	307	291	0.9228	0.8567	0.9038	0.0	8cji:A, 8cjj:A, 8cjk:A, 8cjl:A, 8cjm:A, 8cjn:A, 8cjo:A, 3hf6:A, 3hf8:A, 3hfb:A, 5j6d:A, 5l01:A, 1mlw:A, 7zif:A, 7zig:A, 7zih:A, 7zii:A, 7zij:A, 7zik:A, 7zik:B
2	5tpg:A	271	285	0.9474	0.9963	0.9474	0.0
3	4v06:A	349	289	0.8175	0.6676	0.8062	0.0	4v06:B, 7wiy:B, 7wiy:C, 7wiy:D, 7wiy:A
4	5j6d:B	248	282	0.8351	0.9597	0.8440	5.14e-162
5	5fgj:A	428	287	0.6596	0.4393	0.6551	2.71e-137	4anp:A, 5den:A, 5den:B, 5den:C, 5den:D, 1dmw:A, 5fgj:B, 5fgj:C, 5fgj:D, 6hpo:A, 6hyc:D, 6hyc:C, 6hyc:B, 1j8t:A, 1j8u:A, 1kw0:A, 1lrm:A, 1mmk:A, 1mmt:A, 6n1k:A, 6n1k:B, 6n1k:C, 6n1k:D, 1pah:A, 2pah:A, 2pah:B, 3pah:A, 4pah:A, 5pah:A, 6pah:A, 1phz:A, 2phm:A, 1tdw:A, 1tg2:A
6	6zvp:D	458	290	0.6281	0.3908	0.6172	1.12e-133	7a2g:A, 7a2g:B, 7a2g:C, 7a2g:D, 7pim:B, 7pim:A, 7pim:D, 7pim:F, 1toh:A, 2toh:A, 2xsn:A, 2xsn:B, 2xsn:C, 2xsn:D, 6zn2:A, 6zn2:C, 6zn2:E, 6zn2:G, 6zvp:A, 6zvp:B, 6zvp:C, 6zzu:B, 6zzu:A, 6zzu:C, 6zzu:D
7	5jk5:A	400	290	0.6211	0.4425	0.6103	1.89e-131	5jk5:B, 5jk6:A, 5jk6:B, 5jk8:A, 5jk8:B
8	4etl:A	277	223	0.2807	0.2888	0.3587	5.29e-34	4esm:A, 4jpx:A, 4jpy:A, 1ltv:A, 1ltz:A, 4q3w:A, 4q3x:A, 4q3y:A, 4q3z:A, 3tcy:A, 3tk2:A, 3tk4:A
9	2v27:B	272	227	0.2632	0.2757	0.3304	9.37e-32	2v27:A
10	7vgm:A	571	235	0.2000	0.0998	0.2426	1.45e-16
11	2csh:A	110	62	0.0702	0.1818	0.3226	0.45
12	8sny:A	1388	76	0.0737	0.0151	0.2763	0.73	8fu3:A, 8snx:A
13	8fpi:A	1357	76	0.0737	0.0155	0.2763	0.73
14	5b46:A	627	45	0.0561	0.0255	0.3556	1.7	5b47:A
15	5hvf:A	372	199	0.1474	0.1129	0.2111	2.2
16	4p10:A	402	200	0.1474	0.1045	0.2100	2.5	3d66:A, 3d66:B, 3d66:C, 3d67:A, 3d67:B, 3d67:C, 3d68:A, 3d68:B, 3d68:C, 5hvg:A, 5hvg:C, 5hvh:A, 3lms:A, 7nee:A, 7neu:A
17	8dd5:A	272	73	0.0772	0.0809	0.3014	3.3	1m36:A, 2ozu:A, 2rc4:A
18	6n9a:D	330	39	0.0561	0.0485	0.4103	3.6	6nak:B, 6nak:G, 6s84:A, 6s84:D
19	7nhk:F	132	45	0.0491	0.1061	0.3111	3.7
20	6om8:D	468	41	0.0526	0.0321	0.3659	4.4	6om8:A, 6om8:B, 6om8:C, 6om8:E, 6om8:F, 6om8:G, 6om8:H, 6om8:I, 6om8:J, 6om8:K, 6om8:L
21	7p7q:F	226	45	0.0491	0.0619	0.3111	4.5	7p7r:F, 7p7s:F, 7p7t:F
22	3dwc:B	504	112	0.1158	0.0655	0.2946	5.7	3dwc:A, 3dwc:C, 3dwc:D
23	5z9x:A	288	128	0.1053	0.1042	0.2344	6.8

[Back]