BioLiP

>protein
SVPWFPKKISDLDHCANRVDNVYRKRRKYFADLAMNYKHGDPIPKVEFTEEEIKTWGTVFQELNKLYPTHACREYLKNLP
LLSKYCGYREDNIPQLEDVSNFLKERTGFSIRPVAGYLSPRDFLSGLAFRVFHCTQYVRHSSDPFYTPEPDTCHELLGHV
PLLAEPSFAQFSQEIGLASLGASEEAVQKLATCYFFTVEFGLCKQDGQLRVFGAGLLSSISELKHALSGHAKVKPFDPKI
TCKQECLITTFQDVYFVSESFEDAKEKMREFTKTI

The query sequence (length=275) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5tpg:A	271	275	0.9782	0.9926	0.9782	0.0
2	3e2t:A	307	290	0.9200	0.8241	0.8724	0.0	8cji:A, 8cjj:A, 8cjk:A, 8cjl:A, 8cjm:A, 8cjn:A, 8cjo:A, 3hf6:A, 3hf8:A, 3hfb:A, 5j6d:A, 5l01:A, 1mlw:A, 7zif:A, 7zig:A, 7zih:A, 7zii:A, 7zij:A, 7zik:A, 7zik:B
3	4v06:A	349	289	0.8145	0.6418	0.7751	2.36e-172	4v06:B, 7wiy:B, 7wiy:C, 7wiy:D, 7wiy:A
4	5j6d:B	248	281	0.8618	0.9556	0.8434	5.43e-162
5	5fgj:A	428	287	0.6509	0.4182	0.6237	2.20e-128	4anp:A, 5den:A, 5den:B, 5den:C, 5den:D, 1dmw:A, 5fgj:B, 5fgj:C, 5fgj:D, 6hpo:A, 6hyc:D, 6hyc:C, 6hyc:B, 1j8t:A, 1j8u:A, 1kw0:A, 1lrm:A, 1mmk:A, 1mmt:A, 6n1k:A, 6n1k:B, 6n1k:C, 6n1k:D, 1pah:A, 2pah:A, 2pah:B, 3pah:A, 4pah:A, 5pah:A, 6pah:A, 1phz:A, 2phm:A, 1tdw:A, 1tg2:A
6	6zvp:D	458	289	0.6255	0.3755	0.5952	5.56e-126	7a2g:A, 7a2g:B, 7a2g:C, 7a2g:D, 7pim:B, 7pim:A, 7pim:D, 7pim:F, 1toh:A, 2toh:A, 2xsn:A, 2xsn:B, 2xsn:C, 2xsn:D, 6zn2:A, 6zn2:C, 6zn2:E, 6zn2:G, 6zvp:A, 6zvp:B, 6zvp:C, 6zzu:B, 6zzu:A, 6zzu:C, 6zzu:D
7	5jk5:A	400	288	0.6218	0.4275	0.5938	5.20e-125	5jk5:B, 5jk6:A, 5jk6:B, 5jk8:A, 5jk8:B
8	4etl:A	277	223	0.2909	0.2888	0.3587	4.67e-34	4esm:A, 4jpx:A, 4jpy:A, 1ltv:A, 1ltz:A, 4q3w:A, 4q3x:A, 4q3y:A, 4q3z:A, 3tcy:A, 3tk2:A, 3tk4:A
9	2v27:B	272	227	0.2727	0.2757	0.3304	6.29e-32	2v27:A
10	7vgm:A	571	235	0.2073	0.0998	0.2426	1.15e-16
11	2csh:A	110	62	0.0727	0.1818	0.3226	0.45
12	7nhk:F	132	70	0.0764	0.1591	0.3000	0.78
13	5b46:A	627	45	0.0582	0.0255	0.3556	1.6	5b47:A
14	8sny:A	1388	45	0.0582	0.0115	0.3556	1.7	8fu3:A, 8snx:A
15	8fpi:A	1357	45	0.0582	0.0118	0.3556	1.8
16	4p10:A	402	152	0.1236	0.0846	0.2237	2.6	3d66:A, 3d66:B, 3d66:C, 3d67:A, 3d67:B, 3d67:C, 3d68:A, 3d68:B, 3d68:C, 5hvg:A, 5hvg:C, 5hvh:A, 3lms:A, 7nee:A, 7neu:A
17	5hvf:A	372	151	0.1236	0.0914	0.2252	3.0
18	7p7q:F	226	68	0.0727	0.0885	0.2941	3.1	7p7r:F, 7p7s:F, 7p7t:F
19	6n9a:D	330	39	0.0582	0.0485	0.4103	3.4	6nak:B, 6nak:G, 6s84:A, 6s84:D
20	8dd5:A	272	73	0.0800	0.0809	0.3014	3.4	1m36:A, 2ozu:A, 2rc4:A
21	6om8:D	468	41	0.0545	0.0321	0.3659	4.0	6om8:A, 6om8:B, 6om8:C, 6om8:E, 6om8:F, 6om8:G, 6om8:H, 6om8:I, 6om8:J, 6om8:K, 6om8:L
22	3dwc:B	504	112	0.1200	0.0655	0.2946	5.1	3dwc:A, 3dwc:C, 3dwc:D
23	5z9x:A	288	139	0.1127	0.1076	0.2230	7.2

[Back]