BioLiP

>protein
SVPWFPKKISDLDHCANRDNVYRKRRKYFADLAMNYKHGDPIPKVEFTEEEIKTWGTVFQELNKLYPTHACREYLKNLPL
LSKYCGYREDNIPQLEDVSNFLKERTGFSIRPVAGYLSPRDFLSGLAFRVFHCTQYVRHSSDPFYTPEPDTCHELLGHVP
LLAEPSFAQFSQEIGLASLGASEEAVQKLATCYFFTVEFGLCKQDGQLRVFGAGLLSSISELKHALSGHAKVKPFDPKIT
CKQECLITTFQDVYFVSESFEDAKEKMREFTKTI

The query sequence (length=274) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5tpg:A	271	274	0.9818	0.9926	0.9818	0.0
2	3e2t:A	307	290	0.9197	0.8208	0.8690	0.0	8cji:A, 8cjj:A, 8cjk:A, 8cjl:A, 8cjm:A, 8cjn:A, 8cjo:A, 3hf6:A, 3hf8:A, 3hfb:A, 5j6d:A, 5l01:A, 1mlw:A, 7zif:A, 7zig:A, 7zih:A, 7zii:A, 7zij:A, 7zik:A, 7zik:B
3	4v06:A	349	289	0.8139	0.6390	0.7716	2.24e-171	4v06:B, 7wiy:B, 7wiy:C, 7wiy:D, 7wiy:A
4	5j6d:B	248	281	0.8613	0.9516	0.8399	3.96e-161
5	5fgj:A	428	287	0.6533	0.4182	0.6237	1.01e-127	4anp:A, 5den:A, 5den:B, 5den:C, 5den:D, 1dmw:A, 5fgj:B, 5fgj:C, 5fgj:D, 6hpo:A, 6hyc:D, 6hyc:C, 6hyc:B, 1j8t:A, 1j8u:A, 1kw0:A, 1lrm:A, 1mmk:A, 1mmt:A, 6n1k:A, 6n1k:B, 6n1k:C, 6n1k:D, 1pah:A, 2pah:A, 2pah:B, 3pah:A, 4pah:A, 5pah:A, 6pah:A, 1phz:A, 2phm:A, 1tdw:A, 1tg2:A
6	6zvp:D	458	289	0.6277	0.3755	0.5952	1.77e-125	7a2g:A, 7a2g:B, 7a2g:C, 7a2g:D, 7pim:B, 7pim:A, 7pim:D, 7pim:F, 1toh:A, 2toh:A, 2xsn:A, 2xsn:B, 2xsn:C, 2xsn:D, 6zn2:A, 6zn2:C, 6zn2:E, 6zn2:G, 6zvp:A, 6zvp:B, 6zvp:C, 6zzu:B, 6zzu:A, 6zzu:C, 6zzu:D
7	5jk5:A	400	288	0.6204	0.4250	0.5903	3.10e-124	5jk5:B, 5jk6:A, 5jk6:B, 5jk8:A, 5jk8:B
8	4etl:A	277	223	0.2920	0.2888	0.3587	4.75e-34	4esm:A, 4jpx:A, 4jpy:A, 1ltv:A, 1ltz:A, 4q3w:A, 4q3x:A, 4q3y:A, 4q3z:A, 3tcy:A, 3tk2:A, 3tk4:A
9	2v27:B	272	227	0.2737	0.2757	0.3304	6.00e-32	2v27:A
10	7vgm:A	571	235	0.2080	0.0998	0.2426	1.14e-16
11	8sny:A	1388	73	0.0803	0.0159	0.3014	0.28	8fu3:A, 8snx:A
12	8fpi:A	1357	73	0.0803	0.0162	0.3014	0.28
13	2csh:A	110	62	0.0730	0.1818	0.3226	0.45
14	5b46:A	627	45	0.0584	0.0255	0.3556	1.5	5b47:A
15	4p10:A	402	205	0.1496	0.1020	0.2000	2.0	3d66:A, 3d66:B, 3d66:C, 3d67:A, 3d67:B, 3d67:C, 3d68:A, 3d68:B, 3d68:C, 5hvg:A, 5hvg:C, 5hvh:A, 3lms:A, 7nee:A, 7neu:A
16	5hvf:A	372	204	0.1496	0.1102	0.2010	2.1
17	6n9a:D	330	39	0.0584	0.0485	0.4103	3.2	6nak:B, 6nak:G, 6s84:A, 6s84:D
18	8dd5:A	272	73	0.0803	0.0809	0.3014	3.4	1m36:A, 2ozu:A, 2rc4:A
19	7nhk:F	132	45	0.0511	0.1061	0.3111	3.8
20	6om8:D	468	41	0.0547	0.0321	0.3659	3.8	6om8:A, 6om8:B, 6om8:C, 6om8:E, 6om8:F, 6om8:G, 6om8:H, 6om8:I, 6om8:J, 6om8:K, 6om8:L
21	7p7q:F	226	45	0.0511	0.0619	0.3111	4.3	7p7r:F, 7p7s:F, 7p7t:F
22	3dwc:B	504	112	0.1204	0.0655	0.2946	5.4	3dwc:A, 3dwc:C, 3dwc:D
23	5b46:B	301	53	0.0547	0.0498	0.2830	6.7
24	5z9x:A	288	108	0.0949	0.0903	0.2407	7.2

[Back]