BioLiP

>protein
SVPAIFLDRDGTINVDHGYVHEIDNFEFIDGVIDAMRELKKMGFALVVVTNQSGIARGKFTEAQFETLTEWMDWSLADRD
VDLDGIYYCPHHPQGSVEEFRQVCDCRKPHPGMLLSARDYLHIDMAASYMVGDKLEDMQAAVAANVGTKVLVRTGKPITP
EAENAADWVLNSLADLPQAIKKQQ

The query sequence (length=184) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3l8e:A	185	184	1.0000	0.9946	1.0000	1.50e-139	3esq:A, 3esr:A, 2gmw:A, 2gmw:B, 3l1u:A, 3l1u:B, 3l1v:A, 3l1v:B, 3l8e:B, 3l8f:A, 3l8g:A
2	3l8h:A	179	163	0.3098	0.3184	0.3497	1.05e-23	3l8h:B, 3l8h:C, 3l8h:D
3	2fps:B	163	150	0.2663	0.3006	0.3267	8.87e-20	2fpr:A, 2fpr:B, 2fps:A, 2fpu:A, 2fpu:B, 2fpw:A, 2fpw:B, 2fpx:A, 2fpx:B
4	3u7e:B	380	35	0.0815	0.0395	0.4286	0.10	3u7f:B, 3u7g:A, 3u7h:B, 3zvl:A, 3zvm:A, 3zvm:B, 3zvn:A
5	4u00:A	241	31	0.0761	0.0581	0.4516	0.24
6	7eap:A	755	64	0.1087	0.0265	0.3125	0.41	5yot:A, 5yot:B, 5yqs:A, 5yqs:B
7	6d0p:A	288	46	0.0815	0.0521	0.3261	0.56	6d0p:B, 6d0p:C, 6d0p:D
8	5gyn:A	295	36	0.0870	0.0542	0.4444	0.86	5aes:A, 5aes:B, 4bx0:A, 4bx2:A, 4bx2:B, 4bx3:A, 4bx3:B, 2cfr:A, 2cfs:A, 2cft:A, 9em1:A, 2oyc:A, 2p27:A, 2p69:A, 8qfw:A, 8qfw:B, 8s8a:A
9	5hrm:B	495	58	0.1141	0.0424	0.3621	1.2	5hrm:A, 5hrm:C, 5hrm:D
10	7ocn:A	690	76	0.1196	0.0319	0.2895	1.3	7ocn:B, 7ocp:A, 7ocp:B, 7ocq:A, 7ocq:B, 7ocr:A, 7ocr:B, 7ocs:A, 7ocs:B, 7ocs:C, 7ocs:D, 7oct:A, 7oct:B, 7ocu:A, 7ocu:B
11	4ggm:X	277	39	0.0707	0.0469	0.3333	2.0	4j6e:A
12	3bex:A	248	39	0.0870	0.0645	0.4103	2.0	3bex:B, 3bex:C, 3bex:D, 3bex:E, 3bex:F, 3bf1:A, 3bf1:F, 3bf1:B, 3bf1:C, 3bf1:E, 3bf1:D, 3bf3:A, 3bf3:B, 3bf3:C, 3bf3:D, 3bf3:E, 3bf3:F
13	3ahv:A	472	83	0.1304	0.0508	0.2892	2.2	3aht:A, 3aht:B, 3ahv:B, 7bzm:A, 7bzm:B, 3f4v:A, 3f4v:B, 3f5j:A, 3f5j:B, 3f5k:A, 3f5k:B, 3f5l:A, 3f5l:B, 4qlj:A, 4qlj:B, 4qlk:A, 4qlk:B, 4qll:A, 4qll:B, 2rgl:A, 2rgl:B, 2rgm:A, 2rgm:B, 3scn:A, 3scn:B, 3sco:A, 3sco:B, 3scp:A, 3scp:B, 3scq:A, 3scq:B, 3scr:A, 3scr:B, 3scs:A, 3scs:B, 3sct:A, 3sct:B, 3scu:A, 3scu:B, 3scv:A, 3scv:B, 3scw:A, 3scw:B
14	3fir:A	231	36	0.0652	0.0519	0.3333	2.9	3fir:B, 3fj7:A, 3fj7:B, 3fjm:A, 3fjm:B, 2hxw:A, 2hxw:B
15	4ygr:A	215	81	0.1087	0.0930	0.2469	2.9	4ygs:A
16	5jwz:A	724	74	0.1196	0.0304	0.2973	3.2	5jwz:B
17	7uuk:C	276	42	0.0761	0.0507	0.3333	3.5	7jm1:A, 7jm1:C, 7jm1:B, 7jm2:A, 7jm2:C, 7jm2:B, 7uuj:A, 7uuj:C, 7uuj:B, 7uuk:A, 7uuk:B, 7uul:A, 7uul:B, 7uul:D, 7uul:C, 7uul:F, 7uul:E, 7uum:A, 7uun:A, 7uuo:B
18	4jdp:B	265	80	0.1304	0.0906	0.3000	3.8	4jdp:A, 3qgm:A, 3qgm:B, 3qgm:C, 3qgm:D
19	6f5p:A	708	99	0.1250	0.0325	0.2323	4.4	5d98:A, 5d98:D, 6f5p:D, 6xzd:AP1, 6xzg:AP1, 6xzp:AP1, 6xzq:A, 6xzr:AP1, 6y0c:A
20	3gnn:A	266	73	0.1087	0.0752	0.2740	5.4
21	5tf0:A	733	33	0.0707	0.0177	0.3939	5.5	5tf0:B
22	3r09:A	197	54	0.1087	0.1015	0.3704	5.6	2ybd:A
23	3w81:A	616	66	0.1250	0.0373	0.3485	6.0	6i6r:A, 6i6r:B, 6i6x:A, 6i6x:B, 4kgj:B, 4kgj:A, 4kgl:B, 4kgl:A, 4kh2:B, 4kh2:A, 4obr:B, 4obr:A, 3w81:B, 3w82:A, 3w82:B
24	1og6:C	298	93	0.1250	0.0772	0.2473	6.1	1og6:A, 1og6:B
25	5n0k:A	1034	43	0.0761	0.0135	0.3256	7.2	5n4l:A, 5n4l:B
26	3l8a:B	385	137	0.1848	0.0883	0.2482	9.3	3l8a:A

[Back]