BioLiP

>protein
SVLSIVTVPDKRLSLCSEEVEKVDQSIRKLVDDMFETMHANQGLGLAAVQVGVHKRILVMNVPEENVEDKIEGYELYGGP
YCIINPKIVDISQEKVKLKEGCLSVPGYFDYIVRPQRIAVQYLDYNGNECIIKAQGWLARCLQHEIDHLNGTVFLKYLSK
FKRDFAIEKVKKKERTDLI

The query sequence (length=179) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3oca:A	179	179	1.0000	1.0000	1.0000	3.77e-132	3oca:B, 3u04:A
2	1ix1:A	169	175	0.4302	0.4556	0.4400	1.13e-49	1ix1:B, 1lry:A, 1n5n:A, 1n5n:B, 1s17:A, 1s17:B
3	6jex:A	172	172	0.4134	0.4302	0.4302	2.96e-45	6jer:A, 6jer:B, 6jet:A, 6jet:B, 6jeu:A, 6jeu:B, 6jev:A, 6jev:B, 6jew:A, 6jew:B, 6jex:B
4	5j46:A	169	176	0.4413	0.4675	0.4489	6.02e-44
5	3fwx:A	165	174	0.4078	0.4424	0.4195	1.22e-41	3fwx:B
6	1bs4:A	168	175	0.3911	0.4167	0.4000	6.15e-41	2ai8:A, 2ai8:B, 2ai8:C, 4al2:B, 4al3:A, 4az4:A, 1bs4:B, 1bs4:C, 1bs5:A, 1bs5:B, 1bs5:C, 1bs6:A, 1bs6:B, 1bs6:C, 1bs8:A, 1bs8:B, 1bs8:C, 1bsj:A, 1bsk:A, 1bsz:A, 1bsz:B, 1bsz:C, 7d6z:g, 1def:A, 2def:A, 1dff:A, 1g27:A, 1g27:B, 1g27:C, 1g2a:A, 1g2a:B, 1g2a:C, 3k6l:A, 3k6l:B, 2kmn:A, 1lru:A, 1lru:B, 1lru:C, 8ofe:A, 8rhr:A, 2w3t:A, 2w3u:A, 1xem:A, 1xen:A, 1xeo:A
7	6ck7:A	172	175	0.4134	0.4302	0.4229	1.98e-40	6ck7:B, 6ck7:C, 6ck7:D
8	4wxl:C	165	172	0.3911	0.4242	0.4070	1.99e-39	4wxl:A, 4wxl:B, 4wxl:D
9	3qu1:A	168	173	0.3799	0.4048	0.3931	4.39e-35	3qu1:B
10	2ew5:A	166	164	0.3631	0.3916	0.3963	7.52e-35	4e9a:A, 4e9b:A, 2ew6:A, 2ew7:A
11	4dr8:A	188	170	0.3296	0.3138	0.3471	2.09e-31	4dr8:B, 4dr8:C, 4dr8:D, 4dr9:A, 4dr9:B, 4dr9:C, 4dr9:D
12	3uwb:A	149	157	0.3575	0.4295	0.4076	3.01e-30	3uwa:A
13	3cpm:A	184	159	0.3073	0.2989	0.3459	1.16e-27	3m6o:A, 3m6o:B, 3m6p:A, 3m6p:B, 3m6q:A, 3m6r:A, 3m6r:B, 3m6r:C, 3m6r:D, 3o3j:A, 3pn2:A, 3pn3:A, 3pn3:B, 3pn4:A, 3pn5:A, 3pn6:A, 3pn6:B
14	1jym:A	179	158	0.3296	0.3296	0.3734	1.84e-25	1jym:B, 1jym:C, 1jym:D, 1jym:E, 1jym:F, 1jym:G, 1jym:H, 1jym:I, 1jym:J, 1rl4:A, 1rl4:B, 1rqc:A, 1rqc:B, 1rqc:C, 1rqc:D, 1rqc:E, 1rqc:F, 1rqc:G, 1rqc:H, 1rqc:I, 1rqc:J
15	6jfc:B	161	162	0.3073	0.3416	0.3395	8.35e-25	6jfa:A, 6jfc:A, 6jfd:C, 6jfe:B, 6jff:B, 6jfn:B
16	1y6h:A	177	170	0.3408	0.3446	0.3588	1.14e-24	1sv2:A, 1sv2:B, 1szz:A, 1szz:B, 1szz:C, 1szz:D, 1szz:E, 1szz:F, 1szz:G, 1szz:H, 1vev:A, 1vev:B, 1vey:A, 1vey:B, 1vez:A, 1vez:B, 1y6h:B
17	1ws1:A	151	161	0.3128	0.3709	0.3478	4.92e-24
18	5kob:A	171	164	0.3128	0.3275	0.3415	2.08e-21	5kob:B, 5kob:C, 5kob:D, 5vcp:A, 5vcp:B, 5vcp:C, 5vcp:D
19	2os3:A	205	152	0.3520	0.3073	0.4145	6.06e-21
20	3g5k:A	183	163	0.2682	0.2623	0.2945	1.41e-20	3g5k:B, 3g5k:C, 3g5k:D, 3g5p:A, 3g5p:B, 3g5p:C, 3g5p:D
21	5mtc:A	137	130	0.2849	0.3723	0.3923	2.84e-20	5mtc:B, 5mtd:A, 5mtd:B, 5mte:A, 5mte:B
22	6jes:A	159	132	0.2737	0.3082	0.3712	3.20e-20	6jes:B, 6jf3:A, 6jf3:B, 6jf4:B, 6jf4:A, 6jf5:B, 6jf5:A, 6jf6:C, 6jf6:A, 6jf6:B, 6jf6:D, 6jf7:A, 6jf7:B, 6jf8:A, 6jf8:B, 6jf8:C, 6jf8:D
23	2okl:A	185	149	0.3017	0.2919	0.3624	6.38e-19	2okl:B
24	6ow7:P	196	141	0.3184	0.2908	0.4043	6.91e-19	2ai7:A, 2aia:A, 2aie:P, 4eox:P, 1lm6:A, 6ow2:P, 6ow7:Q, 3str:P, 3svj:P, 3sw8:P
25	5cy7:A	171	158	0.2849	0.2982	0.3228	2.34e-18	5cp0:A, 5cpd:A, 5cvk:A, 5cvp:A, 5cvq:A, 5cwx:A, 5cwy:A, 5cx0:A, 5cxj:A, 5cy8:A, 6ikt:A, 6iky:A, 6il0:A, 6il2:A, 4nt8:A
26	5jex:A	203	145	0.3017	0.2660	0.3724	4.54e-18	5jez:A, 5jf0:A, 5jf1:A, 5jf2:A, 5jf3:A, 5jf4:A, 5jf5:A, 5jf6:A, 5jf7:A, 5jf8:A
27	4je6:A	193	136	0.2514	0.2332	0.3309	1.61e-17	4je6:B, 4je7:A, 4je7:B, 4je8:A, 4je8:B, 1zxz:A, 1zxz:B, 1zy0:A, 1zy0:B, 1zy1:A, 1zy1:B
28	3l87:A	200	137	0.2682	0.2400	0.3504	3.56e-17
29	1lqy:A	184	149	0.3073	0.2989	0.3691	4.81e-17
30	1lm4:A	190	121	0.2402	0.2263	0.3554	1.29e-16	6jfg:A, 6jfo:A, 6jfq:A, 6jfr:A, 6jfs:A, 1lm4:B, 1lmh:A, 1lqw:A, 1lqw:B, 1q1y:A, 3u7k:A, 3u7l:A, 3u7m:A, 3u7n:A
31	2os1:A	179	179	0.3128	0.3128	0.3128	5.19e-16
32	3cmd:B	188	140	0.2682	0.2553	0.3429	7.77e-16	3cmd:A, 3g6n:A, 3g6n:B
33	3e3u:A	196	144	0.2570	0.2347	0.3194	5.06e-15
34	5hgw:A	174	164	0.2961	0.3046	0.3232	1.37e-14	5hgw:B, 5i2b:A, 5t8z:A
35	5kca:A	807	93	0.1453	0.0322	0.2796	0.57	5kc8:A
36	8bot:A	3528	69	0.1285	0.0065	0.3333	0.88
37	7nfe:A	3585	69	0.1285	0.0064	0.3333	0.91
38	4tsh:B	485	129	0.1844	0.0680	0.2558	2.5
39	2b1g:A	590	50	0.0782	0.0237	0.2800	4.1	2b1g:D, 2b1i:A, 2b1i:B, 1g8m:A, 2iu0:B, 2iu3:B, 1m9n:A, 1m9n:B, 1oz0:A, 1oz0:B, 1thz:A, 1thz:B
40	2xon:L	146	51	0.1006	0.1233	0.3529	4.3	2xom:A, 2xon:A
41	2rar:A	261	73	0.0950	0.0651	0.2329	5.4	2rav:A, 2rb5:A, 2rbk:A, 1ymq:A
42	8je0:A	378	25	0.0615	0.0291	0.4400	6.8	8je0:B, 8je0:C, 8je0:D

[Back]