Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SVLSIVTVPDKRLSLCSEEVEKVDQSIRKLVDDMFETMHANQGLGLAAVQVGVHKRILVMNVPEEFEDDKIEGYELYGGP
YCIINPKIVDISQEKVKLKEGCLSVPGYFDYIVRPQRIAVQYLDYNGNECIIKAQGWLARCLQHEIDHLNGTVFLKYLSK
FKRDFAIEKVKKKERTDLI

The query sequence (length=179) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3oca:A 179 179 0.9832 0.9832 0.9832 3.08e-129 3oca:B, 3u04:A
2 1ix1:A 169 175 0.4413 0.4675 0.4514 3.58e-49 1ix1:B, 1lry:A, 1n5n:A, 1n5n:B, 1s17:A, 1s17:B
3 6jex:A 172 172 0.4078 0.4244 0.4244 7.00e-45 6jer:A, 6jer:B, 6jet:A, 6jet:B, 6jeu:A, 6jeu:B, 6jev:A, 6jev:B, 6jew:A, 6jew:B, 6jex:B
4 5j46:A 169 176 0.4358 0.4615 0.4432 3.05e-43
5 3fwx:A 165 174 0.4078 0.4424 0.4195 1.22e-41 3fwx:B
6 1bs4:A 168 175 0.3911 0.4167 0.4000 1.07e-40 2ai8:A, 2ai8:B, 2ai8:C, 4al2:B, 4al3:A, 4az4:A, 1bs4:B, 1bs4:C, 1bs5:A, 1bs5:B, 1bs5:C, 1bs6:A, 1bs6:B, 1bs6:C, 1bs8:A, 1bs8:B, 1bs8:C, 1bsj:A, 1bsk:A, 1bsz:A, 1bsz:B, 1bsz:C, 7d6z:g, 1def:A, 2def:A, 1dff:A, 1g27:A, 1g27:B, 1g27:C, 1g2a:A, 1g2a:B, 1g2a:C, 3k6l:A, 3k6l:B, 2kmn:A, 1lru:A, 1lru:B, 1lru:C, 8ofe:A, 8rhr:A, 2w3t:A, 2w3u:A, 1xem:A, 1xen:A, 1xeo:A
7 4wxl:C 165 172 0.3966 0.4303 0.4128 5.29e-40 4wxl:A, 4wxl:B, 4wxl:D
8 6ck7:A 172 175 0.4078 0.4244 0.4171 1.74e-39 6ck7:B, 6ck7:C, 6ck7:D
9 3qu1:A 168 173 0.3799 0.4048 0.3931 4.02e-35 3qu1:B
10 2ew5:A 166 163 0.3520 0.3795 0.3865 3.08e-34 4e9a:A, 4e9b:A, 2ew6:A, 2ew7:A
11 4dr8:A 188 170 0.3352 0.3191 0.3529 1.24e-32 4dr8:B, 4dr8:C, 4dr8:D, 4dr9:A, 4dr9:B, 4dr9:C, 4dr9:D
12 3uwb:A 149 157 0.3575 0.4295 0.4076 2.70e-30 3uwa:A
13 3cpm:A 184 159 0.3128 0.3043 0.3522 2.03e-27 3m6o:A, 3m6o:B, 3m6p:A, 3m6p:B, 3m6q:A, 3m6r:A, 3m6r:B, 3m6r:C, 3m6r:D, 3o3j:A, 3pn2:A, 3pn3:A, 3pn3:B, 3pn4:A, 3pn5:A, 3pn6:A, 3pn6:B
14 1jym:A 179 158 0.3352 0.3352 0.3797 1.29e-25 1jym:B, 1jym:C, 1jym:D, 1jym:E, 1jym:F, 1jym:G, 1jym:H, 1jym:I, 1jym:J, 1rl4:A, 1rl4:B, 1rqc:A, 1rqc:B, 1rqc:C, 1rqc:D, 1rqc:E, 1rqc:F, 1rqc:G, 1rqc:H, 1rqc:I, 1rqc:J
15 6jfc:B 161 162 0.3073 0.3416 0.3395 9.30e-25 6jfa:A, 6jfc:A, 6jfd:C, 6jfe:B, 6jff:B, 6jfn:B
16 1y6h:A 177 170 0.3408 0.3446 0.3588 1.21e-24 1sv2:A, 1sv2:B, 1szz:A, 1szz:B, 1szz:C, 1szz:D, 1szz:E, 1szz:F, 1szz:G, 1szz:H, 1vev:A, 1vev:B, 1vey:A, 1vey:B, 1vez:A, 1vez:B, 1y6h:B
17 1ws1:A 151 161 0.3352 0.3974 0.3727 9.07e-24
18 2os3:A 205 149 0.3240 0.2829 0.3893 8.78e-21
19 5kob:A 171 165 0.3073 0.3216 0.3333 1.06e-20 5kob:B, 5kob:C, 5kob:D, 5vcp:A, 5vcp:B, 5vcp:C, 5vcp:D
20 3g5k:A 183 163 0.2682 0.2623 0.2945 1.63e-20 3g5k:B, 3g5k:C, 3g5k:D, 3g5p:A, 3g5p:B, 3g5p:C, 3g5p:D
21 5mtc:A 137 130 0.2849 0.3723 0.3923 2.57e-20 5mtc:B, 5mtd:A, 5mtd:B, 5mte:A, 5mte:B
22 6jes:A 159 132 0.2737 0.3082 0.3712 8.63e-20 6jes:B, 6jf3:A, 6jf3:B, 6jf4:B, 6jf4:A, 6jf5:B, 6jf5:A, 6jf6:C, 6jf6:A, 6jf6:B, 6jf6:D, 6jf7:A, 6jf7:B, 6jf8:A, 6jf8:B, 6jf8:C, 6jf8:D
23 6ow7:P 196 141 0.3073 0.2806 0.3901 9.08e-19 2ai7:A, 2aia:A, 2aie:P, 4eox:P, 1lm6:A, 6ow2:P, 6ow7:Q, 3str:P, 3svj:P, 3sw8:P
24 2okl:A 185 149 0.3073 0.2973 0.3691 1.23e-18 2okl:B
25 5cy7:A 171 158 0.2849 0.2982 0.3228 4.45e-18 5cp0:A, 5cpd:A, 5cvk:A, 5cvp:A, 5cvq:A, 5cwx:A, 5cwy:A, 5cx0:A, 5cxj:A, 5cy8:A, 6ikt:A, 6iky:A, 6il0:A, 6il2:A, 4nt8:A
26 4je6:A 193 136 0.2458 0.2280 0.3235 1.48e-17 4je6:B, 4je7:A, 4je7:B, 4je8:A, 4je8:B, 1zxz:A, 1zxz:B, 1zy0:A, 1zy0:B, 1zy1:A, 1zy1:B
27 5jex:A 203 142 0.2737 0.2414 0.3451 2.21e-17 5jez:A, 5jf0:A, 5jf1:A, 5jf2:A, 5jf3:A, 5jf4:A, 5jf5:A, 5jf6:A, 5jf7:A, 5jf8:A
28 3l87:A 200 137 0.2737 0.2450 0.3577 2.66e-17
29 1lm4:A 190 121 0.2514 0.2368 0.3719 5.58e-17 6jfg:A, 6jfo:A, 6jfq:A, 6jfr:A, 6jfs:A, 1lm4:B, 1lmh:A, 1lqw:A, 1lqw:B, 1q1y:A, 3u7k:A, 3u7l:A, 3u7m:A, 3u7n:A
30 3cmd:B 188 140 0.2682 0.2553 0.3429 1.03e-16 3cmd:A, 3g6n:A, 3g6n:B
31 1lqy:A 184 149 0.3017 0.2935 0.3624 5.32e-16
32 2os1:A 179 179 0.3128 0.3128 0.3128 1.45e-15
33 3e3u:A 196 144 0.2570 0.2347 0.3194 1.16e-14
34 5hgw:A 174 175 0.2905 0.2989 0.2971 7.20e-14 5hgw:B, 5i2b:A, 5t8z:A
35 6pi8:B 348 103 0.1453 0.0747 0.2524 0.92 6phr:A, 6phr:B, 6pht:A, 6pht:B, 6pht:C, 6pht:D, 6phz:A, 6phz:B, 6pi1:A, 6pi1:B, 6pi1:C, 6pi1:D, 6pi8:A, 6pia:A, 6pia:B, 6pia:C, 6pia:D, 6pic:A, 6pic:B, 6pic:C, 6pic:D, 6pic:E, 6pic:F, 6pic:G, 6pic:H, 6pid:A, 6pid:B
36 5kca:A 807 90 0.1397 0.0310 0.2778 2.2 5kc8:A
37 2xon:L 146 51 0.1006 0.1233 0.3529 4.0 2xom:A, 2xon:A
38 2rar:A 261 73 0.0950 0.0651 0.2329 4.8 2rav:A, 2rb5:A, 2rbk:A, 1ymq:A
39 6w6j:D 707 59 0.0950 0.0240 0.2881 5.5 6dju:D, 6dju:E, 6djv:D, 6djv:E, 6djv:F, 7l6n:D, 7l6n:E, 7l6n:F, 6w6e:D, 6w6e:E, 6w6e:F, 6w6g:D, 6w6g:E, 6w6h:D, 6w6h:E, 6w6i:D, 6w6i:E, 6w6j:E
40 6djv:C 615 59 0.0950 0.0276 0.2881 6.9 6dju:A, 6dju:B, 6dju:C, 6djv:A, 6djv:B
41 8je0:A 378 25 0.0615 0.0291 0.4400 6.9 8je0:B, 8je0:C, 8je0:D
42 6w6h:C 636 59 0.0950 0.0267 0.2881 7.8 6w6e:B, 6w6e:C, 6w6g:A, 6w6g:B, 6w6g:C, 6w6h:A, 6w6h:B, 6w6h:F, 6w6i:A, 6w6i:B, 6w6i:C, 6w6j:A, 6w6j:B, 6w6j:C
43 6w6i:F 605 59 0.0950 0.0281 0.2881 7.9 6w6j:F
44 7l6n:C 675 59 0.0950 0.0252 0.2881 8.6 7l6n:A, 7l6n:B, 6w6e:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218