BioLiP

>protein
SVLQVLHIPDERLRKVAKPVEEVNAEIQRIVDDMFETMYAEEGIGLAATQVDIHQRIIVIDVSENRDERLVLINPELLEK
SGETGIEEGCLSIPEQRALVPRAEKVKIRALDRDGKPFELEADGLLAICIQHEMDHLVGKLFMDYLSPLKQQRIRQKVEK
LD

The query sequence (length=162) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1bs4:A	168	162	1.0000	0.9643	1.0000	1.79e-115	2ai8:A, 2ai8:B, 2ai8:C, 4al2:B, 4al3:A, 4az4:A, 1bs4:B, 1bs4:C, 1bs5:A, 1bs5:B, 1bs5:C, 1bs6:A, 1bs6:B, 1bs6:C, 1bs8:A, 1bs8:B, 1bs8:C, 1bsj:A, 1bsk:A, 1bsz:A, 1bsz:B, 1bsz:C, 7d6z:g, 1def:A, 2def:A, 1dff:A, 1g27:A, 1g27:B, 1g27:C, 1g2a:A, 1g2a:B, 1g2a:C, 3k6l:A, 3k6l:B, 2kmn:A, 1lru:A, 1lru:B, 1lru:C, 8ofe:A, 8rhr:A, 2w3t:A, 2w3u:A, 1xem:A, 1xen:A, 1xeo:A
2	3fwx:A	165	160	0.7099	0.6970	0.7188	3.09e-84	3fwx:B
3	4wxl:C	165	160	0.6728	0.6606	0.6813	4.12e-74	4wxl:A, 4wxl:B, 4wxl:D
4	6jex:A	172	162	0.5988	0.5640	0.5988	5.58e-65	6jer:A, 6jer:B, 6jet:A, 6jet:B, 6jeu:A, 6jeu:B, 6jev:A, 6jev:B, 6jew:A, 6jew:B, 6jex:B
5	5j46:A	169	163	0.5741	0.5503	0.5706	1.23e-64
6	1ix1:A	169	161	0.5679	0.5444	0.5714	1.81e-61	1ix1:B, 1lry:A, 1n5n:A, 1n5n:B, 1s17:A, 1s17:B
7	6ck7:A	172	161	0.5062	0.4767	0.5093	1.97e-59	6ck7:B, 6ck7:C, 6ck7:D
8	3qu1:A	168	161	0.5123	0.4940	0.5155	4.01e-51	3qu1:B
9	3oca:A	179	172	0.4259	0.3855	0.4012	2.18e-40	3oca:B, 3u04:A
10	2ew5:A	166	166	0.4198	0.4096	0.4096	2.51e-37	4e9a:A, 4e9b:A, 2ew6:A, 2ew7:A
11	4dr8:A	188	146	0.4259	0.3670	0.4726	7.09e-33	4dr8:B, 4dr8:C, 4dr8:D, 4dr9:A, 4dr9:B, 4dr9:C, 4dr9:D
12	3uwb:A	149	148	0.3704	0.4027	0.4054	3.44e-31	3uwa:A
13	1y6h:A	177	162	0.3765	0.3446	0.3765	1.74e-28	1sv2:A, 1sv2:B, 1szz:A, 1szz:B, 1szz:C, 1szz:D, 1szz:E, 1szz:F, 1szz:G, 1szz:H, 1vev:A, 1vev:B, 1vey:A, 1vey:B, 1vez:A, 1vez:B, 1y6h:B
14	1ws1:A	151	147	0.3827	0.4106	0.4218	9.86e-28
15	5cy7:A	171	148	0.3765	0.3567	0.4122	5.47e-27	5cp0:A, 5cpd:A, 5cvk:A, 5cvp:A, 5cvq:A, 5cwx:A, 5cwy:A, 5cx0:A, 5cxj:A, 5cy8:A, 6ikt:A, 6iky:A, 6il0:A, 6il2:A, 4nt8:A
16	6jfc:B	161	144	0.3333	0.3354	0.3750	7.64e-27	6jfa:A, 6jfc:A, 6jfd:C, 6jfe:B, 6jff:B, 6jfn:B
17	5kob:A	171	151	0.3519	0.3333	0.3775	1.64e-26	5kob:B, 5kob:C, 5kob:D, 5vcp:A, 5vcp:B, 5vcp:C, 5vcp:D
18	6jes:A	159	157	0.3704	0.3774	0.3822	1.35e-24	6jes:B, 6jf3:A, 6jf3:B, 6jf4:B, 6jf4:A, 6jf5:B, 6jf5:A, 6jf6:C, 6jf6:A, 6jf6:B, 6jf6:D, 6jf7:A, 6jf7:B, 6jf8:A, 6jf8:B, 6jf8:C, 6jf8:D
19	3cpm:A	184	163	0.3580	0.3152	0.3558	2.00e-24	3m6o:A, 3m6o:B, 3m6p:A, 3m6p:B, 3m6q:A, 3m6r:A, 3m6r:B, 3m6r:C, 3m6r:D, 3o3j:A, 3pn2:A, 3pn3:A, 3pn3:B, 3pn4:A, 3pn5:A, 3pn6:A, 3pn6:B
20	5hgw:A	174	149	0.3765	0.3506	0.4094	3.88e-23	5hgw:B, 5i2b:A, 5t8z:A
21	3e3u:A	196	162	0.3457	0.2857	0.3457	4.73e-22
22	1jym:A	179	163	0.3457	0.3128	0.3436	7.70e-21	1jym:B, 1jym:C, 1jym:D, 1jym:E, 1jym:F, 1jym:G, 1jym:H, 1jym:I, 1jym:J, 1rl4:A, 1rl4:B, 1rqc:A, 1rqc:B, 1rqc:C, 1rqc:D, 1rqc:E, 1rqc:F, 1rqc:G, 1rqc:H, 1rqc:I, 1rqc:J
23	4je6:A	193	175	0.3889	0.3264	0.3600	2.25e-19	4je6:B, 4je7:A, 4je7:B, 4je8:A, 4je8:B, 1zxz:A, 1zxz:B, 1zy0:A, 1zy0:B, 1zy1:A, 1zy1:B
24	5mtc:A	137	115	0.2716	0.3212	0.3826	5.89e-19	5mtc:B, 5mtd:A, 5mtd:B, 5mte:A, 5mte:B
25	3g5k:A	183	166	0.3333	0.2951	0.3253	3.59e-18	3g5k:B, 3g5k:C, 3g5k:D, 3g5p:A, 3g5p:B, 3g5p:C, 3g5p:D
26	1lm4:A	190	114	0.2593	0.2211	0.3684	8.63e-16	6jfg:A, 6jfo:A, 6jfq:A, 6jfr:A, 6jfs:A, 1lm4:B, 1lmh:A, 1lqw:A, 1lqw:B, 1q1y:A, 3u7k:A, 3u7l:A, 3u7m:A, 3u7n:A
27	2okl:A	185	122	0.2716	0.2378	0.3607	3.01e-15	2okl:B
28	6ow7:P	196	123	0.2593	0.2143	0.3415	9.78e-15	2ai7:A, 2aia:A, 2aie:P, 4eox:P, 1lm6:A, 6ow2:P, 6ow7:Q, 3str:P, 3svj:P, 3sw8:P
29	1lqy:A	184	157	0.3086	0.2717	0.3185	1.03e-14
30	3cmd:B	188	116	0.2407	0.2074	0.3362	7.02e-14	3cmd:A, 3g6n:A, 3g6n:B
31	2os1:A	179	109	0.2346	0.2123	0.3486	1.00e-12
32	2os3:A	205	129	0.2531	0.2000	0.3178	2.86e-12
33	5jex:A	203	129	0.2593	0.2069	0.3256	6.00e-12	5jez:A, 5jf0:A, 5jf1:A, 5jf2:A, 5jf3:A, 5jf4:A, 5jf5:A, 5jf6:A, 5jf7:A, 5jf8:A
34	3l87:A	200	123	0.2407	0.1950	0.3171	6.33e-11
35	8p4a:M	507	53	0.0988	0.0316	0.3019	0.18	8p4b:M, 8w8e:a
36	4dff:B	277	44	0.1049	0.0614	0.3864	0.54
37	8ab3:A	330	56	0.1296	0.0636	0.3750	0.55	8ab3:B, 8ab3:C, 8ab3:D
38	4std:A	164	40	0.0802	0.0793	0.3250	2.4	1std:A, 2std:A, 3std:A, 3std:B, 3std:C, 4std:B, 4std:C, 5std:A, 5std:B, 5std:C, 6std:A, 6std:B, 6std:C, 7std:A, 7std:B, 7std:C
39	8jxu:A	1410	51	0.1235	0.0142	0.3922	3.5	8jxq:A
40	4jay:A	338	49	0.1049	0.0503	0.3469	5.9	4jay:B, 4jay:C, 4jay:D, 4jb1:A, 7or2:A, 7orz:A, 7osq:A
41	2cgj:A	479	28	0.0617	0.0209	0.3571	6.4	2cgl:A, 2uyt:A
42	7a3z:A	307	23	0.0679	0.0358	0.4783	7.1
43	1olt:A	434	53	0.0802	0.0300	0.2453	7.2
44	7a5e:A	338	23	0.0679	0.0325	0.4783	7.7	7a5e:B

[Back]