Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SVIKPDMKIKLRMEGAVNGHPFAIEGVGLGKPFEGKQSMDLKVKEGGPLPFAYDILTTVFNRVFAKYPENIVDYFKQSFP
EGYSWERSMNYEDGGICNATNDITLDGDCYIYEIRFDGVNFPANGPVMQKRTVKWEPSTEKLYVRDGVLKGDVNMALSLE
GGGHYRCDFKTTYKAKKVVQLPDYHFVDHHIEIKSHDKDYSNVNLHEHAEAHSE

The query sequence (length=214) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2gx2:F 217 214 1.0000 0.9862 1.0000 8.34e-163 2gx2:A, 2gx2:D, 2gx2:H, 2gx2:K, 5hzs:A, 5hzs:B, 5hzs:C, 5hzs:D, 5hzs:E, 5hzs:F, 5hzs:G, 5hzs:H, 5hzs:I, 5hzs:J, 5hzs:K, 5hzs:L, 5hzt:B, 5hzt:C, 5hzt:D, 5hzt:E, 5hzt:F, 5hzt:G, 5hzt:H, 5hzt:I, 5hzt:J, 5hzt:L
2 5hzt:A 192 213 0.8972 1.0000 0.9014 9.05e-139 5hzt:K
3 4dxp:A 216 213 0.8271 0.8194 0.8310 5.92e-132
4 8hgi:A 220 212 0.7757 0.7545 0.7830 1.67e-127 8hgi:B, 8tjh:A, 8tjh:B
5 4ljb:C 223 215 0.7523 0.7220 0.7488 2.42e-117 4ljb:A, 4ljc:C, 4ljd:A, 4ljd:B, 4ljd:C, 4ljd:D, 3p8u:A, 3p8u:B, 3p8u:D, 3tmr:A, 3tmr:B, 3tmr:C, 3tmr:D, 2vvh:A, 2vvh:B, 2vvh:C, 2vvh:D, 2vvi:A, 2vvi:B, 2vvi:C, 2vvi:D, 2vvj:A, 2vvj:B, 2vvj:C, 2vvj:D
6 4q9x:A 213 212 0.6495 0.6526 0.6557 1.46e-104 4r6d:A
7 7x2b:A 217 213 0.5981 0.5899 0.6009 9.82e-96
8 2vad:A 217 210 0.5841 0.5760 0.5952 1.57e-93
9 2arl:A 218 212 0.5514 0.5413 0.5566 7.66e-90
10 5exc:gg 165 151 0.5234 0.6788 0.7417 4.75e-84 5exc:ee, 5exc:ff, 5exc:hh
11 7qgk:A 217 213 0.5140 0.5069 0.5164 4.84e-79
12 6u1a:A 220 217 0.5280 0.5136 0.5207 1.45e-75
13 1uis:A 224 215 0.5093 0.4866 0.5070 1.84e-75 1uis:B
14 7dna:I 207 143 0.4907 0.5072 0.7343 9.13e-73 7dna:F
15 7dna:I 207 68 0.2523 0.2609 0.7941 4.08e-29 7dna:F
16 1xmz:B 231 196 0.4813 0.4459 0.5255 4.06e-72 1xmz:A
17 4q7r:A 223 212 0.5047 0.4843 0.5094 1.61e-68 8bgl:A, 8bgl:B, 4q7r:B
18 5ukg:A 393 141 0.3785 0.2061 0.5745 6.33e-55 5ukg:B
19 5ukg:A 393 78 0.1589 0.0865 0.4359 1.78e-11 5ukg:B
20 3u0k:A 397 142 0.3598 0.1940 0.5423 4.24e-54
21 3u0k:A 397 77 0.1495 0.0806 0.4156 4.29e-11
22 4i2y:A 381 142 0.3458 0.1942 0.5211 2.51e-43 4i2y:B
23 4i2y:A 381 74 0.1636 0.0919 0.4730 5.47e-15 4i2y:B
24 5exc:E 59 59 0.1776 0.6441 0.6441 3.36e-22 5exc:F, 5exc:G, 5exc:H
25 4z4k:A 282 190 0.2336 0.1773 0.2632 5.84e-18 5aas:A, 4bmj:A, 4bmj:B, 4bmj:D, 4bmj:E, 4bmj:F, 4bmj:G, 4bmj:I, 4bmj:K, 3vht:B, 5yt6:D, 4z4k:B, 4z4m:A, 4z4m:B
26 6wvb:A 408 151 0.2009 0.1054 0.2848 7.32e-18 6wv8:A
27 6quh:B 228 191 0.2336 0.2193 0.2618 1.34e-17 6quh:E, 6qui:B, 6qui:E, 6quj:B, 6quj:E
28 4anj:A 995 193 0.2336 0.0503 0.2591 1.98e-17 1jbz:A
29 6hr1:A 406 193 0.2336 0.1232 0.2591 2.16e-17 6hr1:B
30 8ovo:A 503 122 0.1729 0.0736 0.3033 2.63e-17 8ovo:B, 8ovp:A, 8ovp:B, 2vha:A, 2vha:B
31 7s7t:A 509 122 0.1729 0.0727 0.3033 3.43e-17 8i4o:A, 8i4o:C, 8i4o:E, 8i4o:G, 8i4o:I, 8i4o:K
32 6wv7:B 388 122 0.1729 0.0954 0.3033 6.49e-17 6wv3:A, 6wv4:A, 6wv5:A, 6wv6:A, 6wv7:A, 6wvh:A, 6wvh:B
33 3o78:A 402 122 0.1822 0.0970 0.3197 9.12e-17 7aug:A, 3ek4:A, 3ek7:A, 3ek8:A, 3ekh:A, 3evr:A, 3evu:A, 3evv:A, 4ik1:A, 4ik3:A, 4ik4:A, 4ik5:A, 4ik8:A, 4ik9:A, 3o77:A, 3o78:B, 3sg2:A, 3sg3:A, 3sg4:A, 3sg5:A, 3sg6:A, 3sg7:A, 7st4:A, 6tv7:A, 3wlc:A, 3wld:A, 6ya9:A, 6zsm:A, 6zsn:A
34 6m63:A 359 122 0.1776 0.1058 0.3115 9.82e-17 6m63:B
35 6wvf:A 386 122 0.1729 0.0959 0.3033 1.14e-16 3e9j:C, 3e9j:F, 2hi7:B, 2leg:B, 2ltq:A, 2zup:B, 2zuq:A, 2zuq:D
36 6gez:B 532 122 0.1822 0.0733 0.3197 1.44e-16 6gel:A, 6gel:B, 6gez:A
37 6gez:B 532 188 0.2336 0.0940 0.2660 1.81e-16 6gel:A, 6gel:B, 6gez:A
38 4pa0:A 974 122 0.1776 0.0390 0.3115 1.88e-16 4db1:A, 4db1:B, 8efe:A, 8efh:A, 9f6c:A, 6fsa:A, 6fsa:B, 5n69:A, 5n69:B, 5n6a:A, 8qyu:A
39 7bwn:J 280 191 0.2290 0.1750 0.2565 1.98e-16 7bwn:O, 7bwn:C, 7bwn:M, 4gf6:B, 4w74:A, 4w74:B, 4w74:H, 4w74:C, 4w74:D, 4w74:E, 4w76:A, 4w76:B, 4w77:A, 4w77:B, 4w7a:A, 4w7a:B, 4w7c:B, 4w7d:A, 4w7f:A, 4w7r:A, 4w7r:B, 4w7r:C, 4w7r:D
40 6xu4:A 389 122 0.1729 0.0951 0.3033 3.37e-16 6xu4:B, 6xu4:E
41 7vcm:A 371 122 0.1729 0.0997 0.3033 8.40e-16 7pvc:A, 7vcm:B
42 8xld:A 213 120 0.1682 0.1690 0.3000 1.43e-15 8ill:B
43 7e9y:A 563 122 0.1729 0.0657 0.3033 1.56e-15
44 8b6s:A 517 192 0.2243 0.0928 0.2500 2.14e-15 8b6r:A, 8b6s:B, 8b6t:A, 8b6t:B, 1cqw:A, 4fwb:A, 4hzg:A, 8j1o:A, 4kac:A, 4kac:B, 4kaj:A, 4kyv:A, 4kyv:B, 7o3o:A, 7o8b:A, 7ond:A, 7ond:B, 7oo4:A, 7pcw:A, 7pcw:B, 7pcw:C, 7pcw:D, 7pcx:A, 7pcx:B, 7pcx:F, 7pcx:C, 7pcx:D, 7pcx:E, 3rk4:A, 8sw8:AAA, 6u32:A, 5uxz:A, 5uxz:B, 5vnp:A, 5vnp:B, 7wam:A, 7wan:A, 5y2y:A, 5y2y:B, 6y7a:A, 6y7b:A, 6y7b:B, 6y7b:E, 6y7b:C, 6y7b:D, 7zba:A, 7zba:B, 7zbb:A, 7zbb:B, 7zbd:A, 7zbd:B, 6zcc:A, 7ziv:A, 7ziw:A, 7ziw:B, 7zix:A, 7zix:B, 7ziy:A, 7ziy:B, 7ziz:A, 7zj0:A, 7zj0:B, 6zvu:A, 6zvv:A, 6zvv:B, 6zvv:C, 6zvv:D, 6zvw:A, 6zvw:B, 6zvx:A, 6zvy:A, 6zvy:B
45 3osq:A 607 122 0.1729 0.0610 0.3033 2.27e-15
46 3osr:A 603 122 0.1729 0.0614 0.3033 2.74e-15 3osr:B
47 4w75:B 187 152 0.1916 0.2193 0.2697 1.15e-13
48 7ydq:A 598 195 0.2336 0.0836 0.2564 1.31e-13 4as8:A, 2b3q:A, 2b3q:D, 8dhy:A, 8dpd:A, 4eul:A, 6gqg:A, 6ir7:A, 4jfg:A, 4jfg:B, 4jfg:C, 4jfg:D, 4jfg:E, 4jfg:F, 4jfg:G, 4jfg:H, 6jgj:A, 4ka9:A, 4kw9:A, 1kyr:A, 1kys:A, 4l1i:A, 5nhn:B, 5nhn:A, 5ni3:A, 5ni3:D, 5ni3:B, 5ni3:C, 2o24:A, 7pca:A, 6sm0:A, 5t3i:A, 4w7c:D, 4w7e:A
49 3u8p:A 336 152 0.1682 0.1071 0.2368 2.91e-10 3c63:A, 3c63:B, 3c63:C, 3c63:D, 8drj:A, 6dy8:A, 6dy8:B, 6dy8:D, 6dy8:C, 6dyf:A, 6dyf:B, 6dyg:A, 6dyg:B, 6dyh:A, 6dyh:D, 7lr5:C, 7lr5:A, 7lra:C, 7lra:A, 7lrb:A, 7lrb:B, 7lrr:A, 7lrr:B, 7lrv:C, 7lrv:A, 7lv1:C, 7lv1:A, 7lv4:C, 7lv4:A, 7mk4:A, 7mk4:B, 7n4f:C, 7n4f:A, 7n4g:C, 7n4g:A, 3u8p:B, 3u8p:C, 6wyu:A, 6wyu:B, 6wyu:C, 6wz0:A, 6wz0:B, 6wz0:C
50 4pa0:B 920 83 0.1402 0.0326 0.3614 3.18e-10 8qyu:B
51 8smu:D 394 152 0.1682 0.0914 0.2368 1.01e-09 8smu:A, 8smu:C, 8smu:B
52 5mwc:D 275 134 0.1869 0.1455 0.2985 2.64e-09
53 8osi:A 400 121 0.1776 0.0950 0.3140 6.31e-09
54 6xw2:A 387 121 0.1776 0.0982 0.3140 9.82e-09
55 8c0t:A 281 121 0.1776 0.1352 0.3140 1.17e-08
56 8ckk:B 121 119 0.1542 0.2727 0.2773 1.6 8ckg:A, 8ckg:B, 8ckk:A, 8ckl:A, 8ckl:B
57 7qe7:K 531 38 0.0701 0.0282 0.3947 2.4 5a31:J, 5a31:K, 5g04:J, 5g04:K, 5g05:J, 5g05:K, 9gaw:Q, 9gaw:K, 3hym:B, 3hym:D, 3hym:F, 3hym:H, 3hym:J, 3hym:L, 5lcw:J, 5lcw:K, 8pkp:Q, 8pkp:K, 6q6g:Q, 6q6g:K, 6q6h:Q, 6q6h:K, 7qe7:Q, 8s4g:Q, 8s4g:K, 6tlj:J, 6tlj:K, 6tm5:J, 6tm5:K, 6tnt:J, 6tnt:K, 4ui9:J, 4ui9:K
58 8owm:C 413 77 0.0981 0.0508 0.2727 3.7 8owm:A, 8owm:B, 8owm:D, 8owm:E, 8owm:F, 8own:A, 8own:B, 8own:C, 8own:D, 8own:E, 8own:F
59 3uel:A 521 62 0.0794 0.0326 0.2742 5.8 5a7r:A, 4b1h:A, 4b1i:A, 4b1j:A, 6hh6:A, 6hmk:A, 6hml:A, 6hmm:A, 6hmn:A, 7kfp:A, 7kg0:A, 7kg1:A, 7kg6:A, 7kg7:A, 7kg8:A, 5lhb:A, 4n9y:A, 4n9z:A, 4n9z:B, 4na0:A, 4na0:B, 4na0:C, 4na4:A, 4na4:B, 4na4:C, 6o9x:A, 6o9y:A, 6oa0:A, 6oa1:A, 6oa3:A, 6oak:A, 6oal:A, 3uel:B, 3uel:C
60 3mk4:A 285 26 0.0421 0.0316 0.3462 6.2
61 4hjv:C 185 50 0.0654 0.0757 0.2800 6.2 4hjv:A, 4hjv:D, 4hjv:B
62 8uat:F 351 48 0.0701 0.0427 0.3125 6.3 3hf3:A, 3hf3:B, 3hf3:C, 3hf3:D, 3hgj:A, 3hgj:B, 3hgj:C, 3hgj:D, 5nux:A, 5nux:B, 5nux:C, 5nux:D, 5ogt:A, 5ogt:B, 5ogt:C, 5ogt:D, 8uaj:A, 8uaj:B, 8uaj:C, 8uaj:D, 8uat:B, 8uat:C, 8uat:D, 8uat:E, 8uat:G, 8uat:H, 8uat:A
63 3vte:A 502 108 0.1449 0.0618 0.2870 6.6

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218