Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SVHIEAKQGEIAESILLPGDPLRAKYIAETFLEDVTCYNNVRGMLGFTGTYKGKRVSVQGTGMGVPSISIYVNELIQSYG
VKNLIRVGTCGAIQKDVKVRDVIIAMTACTDSNMNRLTFPGFDFAPAANFDLLKKAYDAGTEKGLHVRVGNVLTADVFYR
ESMDMVKKLGDYGVLAVEMETTALYTLAAKYGVNALSVLTVSDHIFSEERQTTFNEMIEIALDAAI

The query sequence (length=226) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 3uaw:A 233 232 1.0000 0.9700 0.9741 1.02e-166 2ac7:A, 2ac7:B, 3uav:A, 3uax:A, 3uay:A, 3uaz:A
2 4dae:A 232 230 0.7035 0.6853 0.6913 1.11e-115 4d8v:A, 4d8v:B, 4d9h:A, 4d9h:B, 4da0:A, 4da6:A, 4da7:A, 4da8:A, 4dab:A, 4dan:A, 4dan:B, 4dao:A, 4dao:B, 4dar:A
3 3occ:F 238 230 0.5664 0.5378 0.5565 1.39e-93 1a69:A, 1a69:B, 1a69:C, 5i3c:A, 5i3c:B, 5i3c:C, 5iu6:A, 5iu6:B, 5iu6:C, 1k9s:A, 1k9s:D, 1k9s:B, 1k9s:E, 1k9s:C, 1k9s:F, 3occ:A, 3occ:B, 3occ:C, 3occ:D, 3occ:E, 3ooe:A, 3ooe:B, 3ooe:C, 3ooe:D, 3ooe:E, 3ooe:F, 3opv:A, 3opv:B, 3opv:C, 3opv:D, 3opv:E, 3opv:F, 3opv:G, 3opv:H, 3opv:I, 3opv:J, 3opv:K, 3opv:L, 1oty:A, 1oty:B, 1oty:C, 1ou4:A, 1ou4:B, 1ou4:C, 1oum:A, 1oum:B, 1oum:C, 1ov6:A, 1ov6:B, 1ov6:C, 1ovg:A, 1ovg:B, 1ovg:C, 1pk7:A, 1pk7:B, 1pk7:C, 1pk9:A, 1pk9:B, 1pk9:C, 1pke:A, 1pke:B, 1pke:C, 1pr0:A, 1pr0:B, 1pr0:C, 1pr1:A, 1pr1:B, 1pr1:C, 1pr2:A, 1pr2:B, 1pr2:C, 1pr4:A, 1pr4:B, 1pr4:C, 1pr5:A, 1pr5:B, 1pr5:C, 1pr6:A, 1pr6:B, 1pr6:C, 1pw7:A, 1pw7:B, 1pw7:C, 4ts3:A, 4ts3:D, 4ts3:B, 4ts3:C, 4ts3:E, 4ts3:F, 4ts9:A, 4ts9:C, 4ts9:B, 4tta:A, 4tta:B, 4tta:C, 4tta:F, 4tta:D, 4tta:E, 4tti:A, 4tti:B, 4tti:C, 4tti:F, 4tti:D, 4tti:E, 4ttj:A, 4ttj:D, 4ttj:B, 3ut6:A, 3ut6:B, 3ut6:C, 6xz2:B, 6xz2:C
4 3of3:A 240 230 0.5398 0.5083 0.5304 1.27e-85 3of3:B, 3of3:C, 3of3:D, 3of3:E, 3of3:F, 3of3:G, 3of3:H, 3of3:I, 3of3:J, 3of3:K, 3of3:L, 1vhw:A, 1vhw:D, 1vhw:B, 1vhw:F, 1vhw:C, 1vhw:E
5 2isc:D 238 230 0.4779 0.4538 0.4696 2.02e-71 2i4t:A, 2i4t:B, 2i4t:C, 2isc:A, 2isc:B, 2isc:C, 2isc:E, 2isc:F, 1z34:A, 1z35:A, 1z36:A, 1z37:A, 1z38:A, 1z39:A
6 3u40:D 241 231 0.4779 0.4481 0.4675 2.59e-65 3u40:A, 3u40:B, 3u40:C, 3u40:E, 3u40:F
7 6f4w:A 233 227 0.4336 0.4206 0.4317 2.06e-62 6f4w:D, 6f4w:B, 6f4w:E, 6f4w:C, 6f4w:F, 6f4x:A, 6f4x:D, 6f4x:B, 6f4x:E, 6f4x:C, 6f4x:F, 5lu0:A, 5lu0:B, 5lu0:C, 5lu0:E, 5mx4:C, 5mx6:A, 5mx6:B, 5mx6:C, 5mx6:D, 5mx6:F, 5mx8:A, 7ooy:B, 7ooz:B, 7op9:A, 7op9:B, 7op9:C, 7op9:D, 7op9:E, 7op9:F, 7op9:G, 7op9:H, 7op9:I, 7op9:J, 7op9:K, 7op9:L, 7opa:C, 7opa:H
8 1odi:A 234 232 0.3982 0.3846 0.3879 6.44e-52 1odi:B, 1odi:C, 1odi:D, 1odi:E, 1odi:F, 1odj:A, 1odj:B, 1odj:C, 1odj:D, 1odj:E, 1odj:F, 1odl:A, 1odl:F, 1odl:B, 1odl:C, 1odl:D, 1odl:E
9 1jdv:C 235 228 0.3628 0.3489 0.3596 8.71e-34 1jds:A, 1jds:B, 1jds:C, 1jds:D, 1jds:E, 1jds:F, 1jdt:A, 1jdt:B, 1jdt:C, 1jdv:A, 1jdv:B, 1jdv:D, 1jdv:E, 1jdv:F, 1jdz:A, 1jdz:B, 1jdz:C, 1je0:A, 1je0:B, 1je0:C, 1je1:A, 1je1:B, 1je1:C, 1je1:D, 1je1:E, 1je1:F, 1jp7:A, 1jp7:B, 1jp7:C, 1jpv:A, 1jpv:B, 1jpv:C
10 3qpb:C 254 206 0.2965 0.2638 0.3252 1.31e-25 3qpb:A, 3qpb:B, 3qpb:D, 3qpb:E, 3qpb:F, 3qpb:G, 3qpb:H, 3qpb:I, 3qpb:J, 3qpb:K, 3qpb:L, 3qpb:M, 3qpb:N, 3qpb:O, 3qpb:P, 3qpb:Q, 3qpb:R
11 4r2w:D 251 200 0.3142 0.2829 0.3550 4.31e-24 7q2w:FFF, 4r2w:A, 4r2w:B, 4r2w:C, 4r2w:E, 4r2w:F, 4r2x:C, 4r2x:D, 4r2x:E, 4r2x:F, 4r2x:A, 4r2x:B, 4yjk:D, 4yjk:F, 4yjk:A
12 5efo:B 253 194 0.2876 0.2569 0.3351 2.33e-22 5c80:A, 5c80:B, 5c80:C, 5c80:D, 5c80:E, 5c80:F, 5efo:A, 5efo:C, 5efo:D, 5efo:E, 5efo:F, 5epu:A, 5epu:B, 5epu:C, 5epu:D, 5epu:E, 5epu:F, 4k6o:A, 4k6o:B, 4k6o:C, 4k6o:D, 4k6o:E, 4k6o:F, 5lhv:A, 5lhv:B, 5lhv:C, 5lhv:D, 5lhv:E, 5lhv:F, 5lok:A, 5lok:B, 5lok:C, 5lok:D, 5lok:E, 5lok:F, 5m2t:A, 5m2t:B, 5m2t:C, 5m2t:D, 5m2t:E, 5m2t:F, 5miw:A, 5miw:B, 5miw:C, 5miw:D, 5miw:E, 5miw:F, 4oeh:A, 4oeh:B, 4oeh:E, 4oeh:F, 4ogl:A, 4ogl:B, 4ogl:C, 4ogl:D, 4ogl:E, 4ogl:F, 3pns:B, 3pns:C, 3pns:D, 3pns:E, 3pns:F, 3pns:G, 3pns:H, 3pns:I, 3pns:J, 3pns:K, 3pns:L, 6rca:A, 6rca:B, 6rca:C, 6rca:D, 6rca:E, 6rca:F, 4u2k:B, 4u2k:D, 4u2k:F
13 4mch:A 243 199 0.2522 0.2346 0.2864 4.54e-20
14 2hn9:A 253 198 0.2699 0.2411 0.3081 1.03e-18 3c74:A, 3c74:F, 3c74:B, 3c74:C, 3c74:D, 3c74:E, 4e1v:A, 4e1v:E, 4e1v:F, 4e1v:D, 4e1v:C, 4e1v:B, 4e1v:H, 4e1v:G, 3fwp:B, 3fwp:D, 3fwp:C, 3fwp:E, 3fwp:A, 3fwp:F, 2hn9:B, 2hn9:D, 2hn9:F, 2hrd:A, 2hrd:B, 2hrd:C, 2hrd:D, 2hrd:E, 2hrd:F, 2hwu:A, 2hwu:B, 2hwu:C, 2hwu:D, 2hwu:E, 2hwu:F, 3kvv:A, 3kvv:B, 3kvv:C, 3kvv:D, 3kvv:E, 3kvv:F, 2oec:B, 2oec:F, 2pga:B, 2pga:D, 2pga:F, 2rj3:A, 2rj3:D, 2rj3:F, 2rj3:E, 2rj3:B, 1rxc:A, 1rxc:B, 1rxc:C, 1rxc:D, 1rxc:E, 1rxc:F, 1rxc:I, 1rxc:J, 1rxc:K, 1rxc:L, 1rxs:A, 1rxs:a, 1rxs:B, 1rxs:b, 1rxs:C, 1rxs:c, 1rxs:D, 1rxs:d, 1rxs:E, 1rxs:e, 1rxs:F, 1rxs:R, 1rxs:G, 1rxs:P, 1rxs:H, 1rxs:h, 1rxs:I, 1rxs:i, 1rxs:J, 1rxs:j, 1rxs:K, 1rxs:k, 1rxs:L, 1rxs:l, 1rxs:M, 1rxs:m, 1rxs:O, 1rxs:N, 1rxs:Q, 1rxs:o, 1rxu:A, 1rxu:B, 1rxu:C, 1rxu:D, 1rxu:E, 1rxu:F, 1rxu:G, 1rxu:H, 1rxu:I, 1rxu:J, 1rxu:K, 1rxu:L, 1rxu:M, 1rxu:N, 1rxu:O, 1rxu:P, 1rxu:Q, 1rxu:R, 1rxy:A, 1rxy:B, 1sj9:B, 1tgv:A, 1tgv:B, 1tgy:A, 1tgy:B, 1u1c:A, 1u1c:B, 1u1c:C, 1u1c:D, 1u1c:E, 1u1c:F, 1u1d:A, 1u1d:B, 1u1d:C, 1u1d:D, 1u1d:E, 1u1d:F, 1u1e:A, 1u1e:B, 1u1e:C, 1u1e:D, 1u1e:E, 1u1e:F, 1u1f:A, 1u1f:B, 1u1f:C, 1u1f:D, 1u1f:E, 1u1f:F, 1u1g:A, 1u1g:B, 1u1g:C, 1u1g:D, 1u1g:E, 1u1g:F, 1y1q:C, 1y1r:D, 1y1r:B, 1y1s:A, 1y1s:D, 1y1s:F, 1y1s:E, 1y1s:B, 1zl2:B, 1zl2:D, 1zl2:F
15 3enz:C 246 238 0.2699 0.2480 0.2563 1.38e-12 6aqs:A, 2bsx:A, 3enz:A, 3enz:B, 3enz:D, 3enz:E, 3enz:F, 3fow:A, 3fow:B, 1nw4:A, 1nw4:B, 1nw4:C, 1nw4:D, 1nw4:E, 1nw4:F, 3phc:A, 3phc:B, 3phc:C, 3phc:D, 3phc:E, 3phc:F, 1q1g:A, 1q1g:B, 1q1g:C, 1q1g:D, 1q1g:E, 1q1g:F, 1sq6:A, 8w7h:A, 5znc:A, 5zni:A
16 3mb8:A 248 239 0.2699 0.2460 0.2552 3.64e-12 3mb8:B
17 6k8p:A 294 105 0.1549 0.1190 0.3333 1.44e-10 6k5h:A, 6k5h:D, 6k5h:B, 6k5h:C, 6k5k:A, 6k5k:C, 6k5k:B, 6k5k:D, 6k8p:B, 6k8p:C, 6k8p:D
18 3bje:A 327 125 0.1681 0.1162 0.3040 1.50e-08 3bje:B
19 6if8:B 228 186 0.2168 0.2149 0.2634 2.50e-08 6if8:A, 6if8:C, 6if8:D, 6k2q:A, 6k2q:B, 6k2q:C, 6k2q:D
20 4l0m:A 237 185 0.1991 0.1899 0.2432 4.05e-08
21 4yo8:B 242 178 0.1726 0.1612 0.2191 4.70e-07 4bmx:B, 4bmz:A, 4bmz:B, 5ccd:A, 5cce:A, 6dyu:A, 6dyu:B, 6dyv:A, 6dyv:B, 6dyw:A, 6dyw:B, 6dyy:A, 6dyy:B, 6dyy:C, 6dyy:D, 4ffs:A, 5jpc:A, 5k1z:A, 5kb3:A, 3nm5:A, 3nm5:B, 3nm6:B, 4ojt:A, 4oy3:A, 4p54:A, 4wkn:A, 4wko:A, 4wkp:A, 4wkp:B, 4wkp:C, 4wkp:D, 4ynb:A, 4yo8:A
22 6po4:A 233 164 0.1770 0.1717 0.2439 1.72e-06 6po4:B, 6po4:C, 6po4:D, 6po4:E, 6po4:F
23 3bl6:A 230 183 0.2035 0.2000 0.2514 1.80e-05
24 4f2p:B 239 182 0.1814 0.1715 0.2253 2.25e-05 3df9:A, 3df9:B, 4f1w:A, 4f1w:B, 4f2p:A, 4f2w:A, 4f2w:B, 4f3c:A, 4f3c:B, 4f3k:A, 4f3k:B, 1jys:A, 1jys:B, 1nc1:A, 1nc1:B, 1nc3:A, 1nc3:B, 3o4v:A, 3o4v:B, 4wkc:A, 1y6q:A, 1y6q:B, 1y6r:A, 1y6r:B, 4yml:A, 1z5n:A, 1z5n:B, 1z5o:A, 1z5o:B
25 4g89:A 233 182 0.1770 0.1717 0.2198 1.05e-04 4g89:B
26 5ue1:A 233 186 0.2080 0.2017 0.2527 1.91e-04 5ue1:B
27 4jos:B 230 166 0.1770 0.1739 0.2410 8.72e-04 4jos:A
28 4wkb:A 237 204 0.2212 0.2110 0.2451 0.001 3dp9:A, 3dp9:C, 4wkb:B, 4x24:A, 4x24:B
29 1zos:A 230 206 0.2301 0.2261 0.2524 0.003 3mms:A, 1zos:B, 1zos:C, 1zos:D, 1zos:E, 1zos:F
30 4jwt:A 245 199 0.1903 0.1755 0.2161 0.003
31 3p0f:A 293 200 0.2080 0.1604 0.2350 0.034 3p0e:A, 3p0e:B, 3p0e:C, 3p0e:D, 3p0e:E, 3p0e:F, 2xrf:A, 2xrf:B, 2xrf:C
32 5dk6:A 242 186 0.1903 0.1777 0.2312 0.095
33 3ku4:B 293 38 0.0885 0.0683 0.5263 0.11 3ku4:A, 3ku4:C, 3ku4:D, 3kuk:A, 3kuk:B, 3kvr:A, 3kvr:B, 3kvy:A, 3kvy:B
34 6ayo:A 229 179 0.1504 0.1485 0.1899 0.17 6ayo:B, 6ayq:A, 6ayq:B, 6ayr:A, 6ayr:B, 6ayr:C, 6ayr:D, 6ays:A, 6ays:B, 6ays:C, 6ays:G, 6ays:D, 6ays:H, 6ays:E, 6ays:F, 6ayt:A, 6ayt:B, 6ayt:C, 6ayt:D
35 3eei:A 231 184 0.1991 0.1948 0.2446 0.33 3eei:B
36 3eue:A 295 37 0.0796 0.0610 0.4865 0.37 3euf:A, 3euf:B, 3euf:C, 3euf:D, 3nbq:A, 3nbq:B, 3nbq:C, 3nbq:D
37 4txl:C 290 176 0.1947 0.1517 0.2500 2.0 4txl:D, 4txl:A, 4txl:B, 4txm:A, 4txm:B, 4txn:A, 4txn:B, 4txn:C, 4txn:D
38 4u1q:A 341 33 0.0708 0.0469 0.4848 2.7 4u1q:B, 4u1q:C, 4u1q:D, 4x3q:A, 4x3q:B, 4x3q:C, 4x3q:D
39 4g41:B 236 190 0.1947 0.1864 0.2316 2.8
40 8dh2:E 841 95 0.1195 0.0321 0.2842 5.0 8dh0:B, 8dh1:E, 8dh1:I, 8dh2:I, 8dh3:I, 8dh4:E, 8dh5:I, 1s76:D, 1s77:D
41 3f70:B 410 52 0.0619 0.0341 0.2692 5.5
42 4qez:B 231 57 0.0619 0.0606 0.2456 5.9 4qez:A, 4qez:C
43 7qzl:D 341 82 0.0973 0.0645 0.2683 6.0 6iau:B, 7qzl:A, 7qzn:A, 7qzn:B
44 5u8u:D 477 32 0.0575 0.0273 0.4062 6.4 1lpf:A, 1lpf:B, 5u8u:A, 5u8u:B, 5u8u:C, 5u8v:A, 5u8v:B, 5u8v:C, 5u8v:D, 5u8w:A, 5u8w:B, 5u8w:C, 5u8w:D
45 7nu2:A 875 45 0.0619 0.0160 0.3111 6.5 7a0p:A, 7ap2:A, 7nty:A, 7nu0:A, 7nu1:A, 7nu4:A, 7nu5:A, 7nu8:A, 7nu9:A, 7nua:A, 7nuc:A, 6q8a:A, 6ykk:A, 6ykl:A, 6ykn:A, 6yko:A, 6ykq:A, 6yks:A, 6ykt:A, 6yku:A, 6ykv:A, 6ykw:A, 6ykx:A, 7yp8:A
46 1msw:D 863 95 0.1195 0.0313 0.2842 6.8 1cez:A, 8dh1:B, 8dh2:B, 8dh3:B, 8dh4:B, 8dh5:B, 3e2e:A, 3e3j:C, 3e3j:B, 1h38:A, 1h38:B, 1h38:C, 1h38:D, 2pi4:A, 2pi5:A, 1qln:A, 1s0v:A, 1s0v:B, 1s0v:C, 1s0v:D
47 6q89:A 852 45 0.0619 0.0164 0.3111 6.9 7ntz:A, 7nu3:A, 7nu6:A, 7nu7:A, 7nub:A, 6q8b:A, 6q8c:A
48 4m1e:B 273 157 0.1504 0.1245 0.2166 7.0 4m1e:A, 4m1e:F, 4m1e:E, 4m1e:C, 4m1e:D
49 6rxx:UV 1061 47 0.0708 0.0151 0.3404 7.9
50 8swu:A 269 118 0.1372 0.1152 0.2627 9.2 8swu:B, 8swu:C

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218