Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SVEEIRLPRAPLGLSIVGGSDHHPFGEPGVFISKVLPSGLRVGDRILAVNGQDVRDATHQEAVSALLRPELSLLVRRD

The query sequence (length=78) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4wyu:A 201 91 0.9872 0.3831 0.8462 8.46e-38 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
2 4wyu:A 201 81 0.4487 0.1741 0.4321 1.26e-06 8b8o:B, 8b8o:A, 8b9t:A, 8bj0:A, 7qs8:A, 7qs8:B, 7qsa:A, 7qsa:B, 7qtu:B, 7qtu:A, 7qtu:E, 7qtu:G, 5vwi:A, 5vwi:B, 4wyu:B, 6xa6:B, 6xa6:A
3 6xa7:B 96 78 0.4103 0.3333 0.4103 1.13e-11 7qrt:A, 7qrt:B, 6xa7:A, 6xa7:C, 6xa7:D
4 2ka9:A 189 74 0.4615 0.1905 0.4865 1.17e-11 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
5 2ka9:A 189 76 0.3718 0.1534 0.3816 4.59e-09 8cn1:B, 8cn1:A, 8cn1:E, 8cn1:D, 2mho:A, 1rgr:A, 3rl7:A, 3rl7:F, 3rl7:D, 3rl7:C, 3rl7:E, 6spv:A, 6spz:A
6 8cn1:H 101 74 0.4487 0.3465 0.4730 2.30e-11 8cn1:C, 8cn1:G, 8cn1:J, 8cn1:L, 8cn1:F, 8cn1:K, 8cn1:I, 3rl7:B
7 3jxt:A 96 71 0.4231 0.3438 0.4648 2.69e-11 3jxt:B
8 7p73:A 420 71 0.3846 0.0714 0.4225 7.77e-11 8ael:A, 7p74:A, 7pc9:A, 7pc9:B, 7r2m:A, 7r2m:D, 7r2t:A
9 5wou:A 95 87 0.4744 0.3895 0.4253 2.16e-10
10 7pc3:A 405 75 0.3590 0.0691 0.3733 2.09e-09 2awu:B, 2aww:A, 2awx:B, 8cn3:A, 8cn3:B, 2g2l:A, 2g2l:B, 4g69:A, 2i0l:A, 2i0l:B, 2m3m:A, 4oaj:A, 2oqs:A, 3rl8:B
11 5heb:A 119 62 0.3974 0.2605 0.5000 4.05e-09 1be9:A, 5d13:B, 5d13:A, 5d13:C, 5d13:D, 5hed:A, 5hey:A, 5hf1:A, 5hfb:A, 5hfc:A, 5hfe:A, 5hff:A, 1tp3:A, 1tp5:A
12 4e34:A 87 62 0.3846 0.3448 0.4839 5.96e-09 4e34:B, 4e35:A, 4e35:B, 5ic3:A, 5ic3:B, 4joe:A, 4joe:B, 4jof:A, 4jof:B, 4jog:A, 4jog:B, 4joh:A, 4joh:B, 4joj:A, 4joj:B, 4jok:A, 4jok:B, 4jop:A, 4jop:B, 4jor:A, 4jor:B, 7jzo:A, 7jzo:B, 7jzp:A, 7jzp:B, 7jzq:A, 7jzr:A, 7jzr:B, 5k4f:A, 5k4f:B, 4k6y:A, 4k6y:B, 4k72:A, 4k72:B, 4k75:A, 4k76:A, 4k76:B, 4k76:C, 4k76:D, 4k78:A, 2lob:A, 4nmo:A, 4nmo:B, 4nmp:A, 4nmp:B, 4nmq:A, 4nmq:B, 4nmr:A, 4nmr:B, 4nms:A, 4nms:B, 4nmt:A, 4nmt:B, 4nmv:A, 4nmv:B, 6ov7:A, 6ov7:B, 4q6h:A, 4q6s:A, 4q6s:B, 6v84:A, 6v84:B, 6xnj:A
13 8b82:A 108 63 0.3590 0.2593 0.4444 6.46e-09 8b82:B, 8b87:A, 8b87:B, 8bia:A, 8cd3:B, 6ms1:A, 6ms1:B, 6mtu:B, 6mtu:A, 6mtv:A, 6mtv:B, 6mye:A, 7qrs:B, 7qrs:A, 7qs9:A, 7qs9:B, 7qto:A, 7qto:B, 7qtp:A, 5vwk:D, 5vwk:C, 5vwk:B, 5vwk:A, 6xa8:B, 6xa8:A
14 7p70:A 407 64 0.3846 0.0737 0.4688 9.71e-09 7pc4:A, 7qql:A
15 8c1t:A 90 76 0.3846 0.3333 0.3947 2.77e-08 8c1t:D, 8c1t:B, 8c1t:C
16 8bq8:C 93 63 0.3205 0.2688 0.3968 3.01e-08 8bq8:A, 8bq8:B
17 7x2e:A 163 61 0.3462 0.1656 0.4426 8.36e-08 2kbs:A
18 2pdz:A 86 65 0.3590 0.3256 0.4308 3.57e-07
19 1ihj:B 95 74 0.2949 0.2421 0.3108 8.98e-07 1ihj:A
20 2l4t:A 124 71 0.3205 0.2016 0.3521 2.79e-06 3diw:A, 3diw:B, 4e3b:A, 4e3b:B, 3gj9:A, 3gj9:B, 4nnl:A, 4nnl:B, 4nnm:A, 4nnm:B, 3sfj:A, 3sfj:C, 2vz5:A
21 2koh:A 111 67 0.2692 0.1892 0.3134 9.78e-06 9imp:A, 9imp:B, 9imp:C, 9imp:D, 9imp:E, 9imp:F, 6jue:L, 2k20:A
22 2m0z:A 97 62 0.2821 0.2268 0.3548 1.28e-05 1d5g:A, 3lny:A, 2m10:A, 1vj6:A, 7xty:A, 7xty:B
23 7qqm:A 413 86 0.3590 0.0678 0.3256 1.40e-05
24 7pc5:A 405 67 0.2949 0.0568 0.3433 8.12e-05
25 1zub:A 109 79 0.3462 0.2477 0.3418 1.15e-04
26 7weg:B 96 67 0.2949 0.2396 0.3433 1.28e-04 7weg:A
27 1n7t:A 103 86 0.3590 0.2718 0.3256 1.67e-04 7lul:A, 1mfg:A, 1mfl:A, 6q0m:A, 6q0n:A, 6q0n:B, 6q0u:A, 6q0u:B, 6ubh:A, 6ubh:B, 6ubh:C, 6ubh:D
28 7qqn:C 414 63 0.3205 0.0604 0.3968 3.37e-04 7pc7:A, 7pc7:B, 7pc8:A, 7pc8:B, 7qql:C, 7qql:B, 7qqn:A
29 2i0i:A 81 51 0.2949 0.2840 0.4510 3.63e-04 2i0i:B, 2i0i:C
30 3vqg:A 85 55 0.2949 0.2706 0.4182 4.11e-04
31 2m0u:A 117 49 0.2564 0.1709 0.4082 4.39e-04
32 3ch8:A 190 78 0.3333 0.1368 0.3333 6.97e-04 2qbw:A
33 8bv7:A 95 56 0.2308 0.1895 0.3214 0.001 8buw:A, 8buw:B
34 2m0v:A 128 67 0.3333 0.2031 0.3881 0.001
35 7d6f:A 87 37 0.2179 0.1954 0.4595 0.001
36 7pcb:A 415 54 0.2692 0.0506 0.3889 0.003 7e0b:A, 5elq:A, 5elq:B, 5em9:A, 5ema:A, 5emb:A, 7p72:A, 3qgl:A, 3qgl:B, 3qgl:C, 3qgl:D, 3qgl:E, 4z8j:A
37 7qct:A 90 54 0.2692 0.2333 0.3889 0.005 7qct:B
38 3tsz:A 341 62 0.2949 0.0674 0.3710 0.007 3shw:A
39 6yx0:B 112 39 0.1795 0.1250 0.3590 0.007 7a00:A, 7a00:B, 1q3p:A, 1q3p:B, 3qjm:A, 3qjm:B, 3qjn:A, 3qjn:B, 3qjn:C, 3qjn:D, 3qjn:E, 3qjn:F, 3qjn:G, 3qjn:H, 8s1r:AAA, 8s1r:BBB, 8s1r:CCC, 8s1r:DDD, 6ywz:B, 6ywz:A, 6yx0:A, 6yx1:A, 6yx1:B, 6yx2:A, 6yx2:B
40 6gbe:A 119 40 0.2308 0.1513 0.4500 0.008
41 8bp4:A 93 67 0.2692 0.2258 0.3134 0.009 8bp4:C, 8bp4:B
42 3bpu:A 86 43 0.2179 0.1977 0.3953 0.018
43 1rzx:A 98 56 0.2051 0.1633 0.2857 0.020 5i7z:A, 1x8s:A
44 3r0h:D 199 55 0.2051 0.0804 0.2909 0.020 3r0h:A, 3r0h:C, 3r0h:B, 3r0h:E, 3r0h:H, 3r0h:F, 3r0h:G
45 4xh7:A 110 62 0.2821 0.2000 0.3548 0.039
46 5zys:A 90 77 0.3205 0.2778 0.3247 0.046
47 5f67:A 98 66 0.3077 0.2449 0.3636 0.046 5f67:B
48 1n7f:A 86 70 0.2949 0.2674 0.3286 0.051 1n7f:B
49 2r4h:C 98 59 0.1795 0.1429 0.2373 0.064
50 6x23:A 89 31 0.1667 0.1461 0.4194 0.11
51 2qt5:A 194 76 0.3205 0.1289 0.3289 0.11 2qt5:B
52 2qt5:A 194 72 0.3333 0.1340 0.3611 0.39 2qt5:B
53 5ez0:D 95 79 0.2949 0.2421 0.2911 0.13 5eyz:A, 5eyz:B, 5eyz:C, 5eyz:D, 5ez0:A, 5ez0:C, 5ez0:B, 3nfk:A, 3nfk:B, 3nfl:A, 3nfl:B, 3nfl:C, 3nfl:D, 7vze:A, 7vze:B, 7vze:C, 7vze:D
54 3pv3:A 392 64 0.2436 0.0485 0.2969 0.13 3pv3:B, 3pv3:C, 3pv3:D
55 2kqf:A 96 31 0.1795 0.1458 0.4516 0.13 2kyl:A
56 6hks:B 94 80 0.2692 0.2234 0.2625 0.14 8cqy:A, 6hks:A, 6hks:C, 6hks:D, 6hks:E, 6hks:F, 8oep:A, 8oep:C, 6t36:A
57 2joa:A 105 57 0.2564 0.1905 0.3509 0.19
58 5hj1:A 97 53 0.2564 0.2062 0.3774 0.20
59 2os6:A 89 44 0.2051 0.1798 0.3636 0.33
60 4xhv:A 94 74 0.2821 0.2340 0.2973 0.58
61 7w6z:A 414 33 0.1667 0.0314 0.3939 1.2 7w6y:A
62 6ar4:B 87 57 0.2308 0.2069 0.3158 1.2 6ar4:A, 6bjo:A, 6bjo:B, 2pku:A
63 2c1v:A 335 25 0.1667 0.0388 0.5200 1.2 2c1u:A, 2c1u:B, 2c1u:C, 2c1u:D, 2c1v:B
64 4gvc:A 94 39 0.2051 0.1702 0.4103 1.3 4gvd:A, 4gvd:B, 3kze:A, 3kze:B, 3kze:C, 4nxq:A, 4nxq:B, 4nxq:C, 4nxr:A
65 3cs0:A 392 32 0.1538 0.0306 0.3750 1.6 8f0a:A, 8f0a:B, 8f0a:C, 8f0u:A, 8f1t:A, 8f1t:B, 8f1t:C, 8f1u:A, 8f1u:B, 8f1u:C, 8f21:A, 8f21:B, 8f21:C, 8f26:A, 6jjk:A, 6jjk:B, 6jjk:C, 6jjk:D, 6jjk:E, 6jjk:F, 6jjl:A, 6jjl:B, 6jjl:C, 6jjl:D, 6jjl:E, 6jjl:F, 6jjo:A, 6jjo:B, 6jjo:C, 6jjo:D, 6jjo:E, 6jjo:F, 3mh5:A, 3mh5:B, 3mh6:A, 3mh7:A, 3otp:A, 3otp:B, 3otp:C, 3otp:D, 3otp:E, 3otp:F, 3ou0:A
66 6kz1:A 97 65 0.2692 0.2165 0.3231 3.2 6y38:A, 6y38:B, 6y9n:A, 6y9o:A, 6y9p:A, 6y9p:B, 6y9p:I, 6y9p:E, 6y9p:G, 6y9p:K, 6y9q:B
67 2qag:B 246 51 0.1923 0.0610 0.2941 3.4
68 3pak:A 145 27 0.1410 0.0759 0.4074 3.5 5ffr:A, 5ffs:A, 5fft:A, 3paq:A, 3par:A, 3pbf:A, 1r13:A, 1r14:A, 4wr9:A, 4wrc:A, 4wre:A, 4wrf:A, 4wuw:A, 4wux:A
69 5t63:A 283 44 0.2051 0.0565 0.3636 3.6 5b6l:A, 5gnd:A
70 8blu:B 195 42 0.1538 0.0615 0.2857 3.9 5a2p:A, 5a2p:B, 5a2p:D, 5a2p:C, 8aai:A, 8aai:B, 8aai:C, 8aai:D, 8aak:A, 8aak:B, 8aao:A, 8aao:B, 8aap:A, 8aap:B, 6ak2:A, 6ak2:B, 8blu:C, 8blu:D, 8blv:A, 8blv:B, 7fsg:B, 7fsg:C, 7fsg:D, 7fsh:B, 7fsh:C, 7fsh:D, 7fsi:B, 7fsi:C, 7fsi:D, 7fsj:A, 7fsj:B, 7fsj:C, 7fsj:D, 7fsk:B, 7fsk:C, 7fsk:D, 7fsl:A, 7fsl:B, 7fsl:C, 7fsl:D, 7fsm:A, 7fsm:B, 7fsm:C, 7fsm:D, 7fsn:A, 7fsn:B, 7fsn:C, 7fsn:D, 7fso:B, 7fso:C, 7fso:D, 7fsp:B, 7fsp:C, 7fsp:D, 7fsq:B, 7fsq:A, 7fsq:C, 7fsq:D, 7fsr:B, 7fsr:C, 7fsr:D, 7fss:A, 7fss:B, 7fss:C, 7fss:D, 7fst:B, 7fst:C, 7fst:D, 7fsu:B, 7fsu:C, 7fsu:D, 7fsv:A, 7fsv:B, 7fsv:C, 7fsv:D, 7fsw:A, 7fsw:B, 7fsw:C, 7fsw:D, 7fsx:B, 7fsx:C, 7fsx:D, 7fsy:A, 7fsy:B, 7fsy:C, 7fsy:D, 7fsz:B, 7fsz:C, 7fsz:D, 7ft0:B, 7ft0:C, 7ft0:D, 7ft1:B, 7ft1:C, 7ft1:D, 7ft2:B, 7ft2:C, 7ft2:D, 7ft3:B, 7ft3:A, 7ft3:C, 7ft3:D, 7ft4:A, 7ft4:B, 7ft4:C, 7ft4:D, 7ft5:A, 7ft5:B, 7ft5:C, 7ft5:D, 7ft6:B, 7ft6:C, 7ft6:D, 7ft7:A, 7ft7:B, 7ft7:C, 7ft7:D, 7ft8:B, 7ft8:C, 7ft8:D, 7ft9:B, 7ft9:C, 7ft9:D, 7fta:B, 7fta:C, 7fta:D, 7ftb:B, 7ftb:C, 7ftb:D, 7ftc:B, 7ftc:C, 7ftc:D, 7ftd:A, 7ftd:C, 7ftd:B, 7ftd:D, 5g1d:B, 5g1d:A, 8hck:A, 8hu2:A, 1obx:A, 1oby:A, 1oby:B, 1obz:A, 6r9h:A, 6r9h:C, 6rlc:A, 6rlc:B, 6rlc:C, 6rlc:D, 1v1t:B, 1v1t:A, 1w9e:A, 1w9e:B, 1w9o:B, 1w9o:A, 1w9q:B, 1ybo:A, 1ybo:B, 4z33:A, 4z33:B
71 2w0m:A 220 41 0.1795 0.0636 0.3415 6.7
72 8j4q:D 724 66 0.2564 0.0276 0.3030 8.4 8j4q:A, 8j4q:B, 8j4q:C, 8j4r:A, 8j4r:B, 8j4r:C, 8j4r:D, 6lfk:A, 6lfk:B, 6lfk:C, 6lfk:D
73 6ezi:A 86 44 0.2051 0.1860 0.3636 9.0 3tmh:A, 3tmh:E, 3tmh:I
74 4ynn:A 400 31 0.1410 0.0275 0.3548 9.5 4ynn:B, 4ynn:C, 4ynn:D, 4ynn:E, 4ynn:F, 4ynn:G, 4ynn:H
75 7sqm:A 346 55 0.2308 0.0520 0.3273 9.6 7avq:A, 3dlz:A, 3e7v:A, 3f2n:A, 9flb:A, 9flc:A, 9flo:A, 9flq:A, 9flt:A, 3fmd:A, 6g34:A, 6g35:A, 6g36:A, 6g37:A, 6g38:A, 6g39:A, 6g3a:A, 5htb:A, 5htc:A, 3iq7:A, 7ops:A, 4ouc:A, 4qtc:A, 8rdk:A, 2vuw:A, 6z56:A, 6z57:A, 6z58:A, 6z59:A, 6z5a:A, 6z5b:A, 6z5c:A, 6z5d:A, 6z5e:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218