BioLiP

>protein
SVAHGLAWSYYIGYLRLILPELQARIRTYNQHYNNLLRGAVSQRLYILLPLDCGVPDNLSMADPNIRFLDKLPQSNSIYE
LLENGQRAGTCVLEYATPLQTLFAMSQYSQAGFSREDRLEQAKLFCQTLEDILADAPESQNNCRLIAYQEPADDSSFSLS
QEVLRHLRQ

The query sequence (length=169) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8ik3:A	328	182	0.9882	0.5091	0.9176	5.90e-117	8a2h:A, 8a2h:B, 8a2i:A, 8a2i:B, 8a2j:A, 8a2j:B, 8a2k:A, 8a2k:B, 8a2x:A, 7a90:A, 8b2j:A, 8b2j:B, 5bqx:A, 6cff:A, 6cy7:A, 6dnk:A, 6dxg:A, 6dxl:A, 6dxl:B, 4ef4:A, 4ef4:B, 4emt:A, 4emt:B, 4emu:B, 4f5d:A, 4f5d:B, 4f5w:A, 4f5y:A, 4f5y:B, 4f9g:C, 8flk:A, 8flk:B, 8flk:C, 8flk:D, 8flm:A, 8flm:B, 8flm:C, 8flm:D, 8gjx:A, 8gjx:B, 8gt6:A, 8gt6:B, 8ik3:C, 8ik3:E, 8ik3:G, 8ik3:F, 8ik3:H, 4ksy:A, 7kvx:A, 7kvz:A, 7kw1:A, 4loh:A, 4loh:B, 4loi:A, 4loi:B, 7mhc:A, 6mx0:B, 6mx3:B, 6mxe:A, 6mxe:B, 7ob3:A, 8orw:A, 8p01:A, 8p45:A, 7q3b:A, 7q85:A, 4qxo:A, 4qxp:A, 4qxp:B, 4qxq:A, 4qxq:B, 4qxr:A, 4qxr:B, 6s26:A, 6s26:B, 6s27:A, 6s86:A, 6s86:B, 7sho:B, 7shp:A, 7shp:B, 7shp:C, 7shp:D, 7sii:A, 7sii:B, 7sii:C, 7sii:D, 7ssm:A, 8sth:A, 8sti:A, 8t5k:B, 8t5l:B, 7t9u:A, 7t9v:A, 7t9v:B, 6ukm:A, 6uku:A, 6ukv:A, 6ukv:B, 6ukw:A, 6ukw:B, 6ukx:A, 6ukx:B, 6uky:A, 6ukz:A, 6ukz:B, 6ul0:A, 7x9p:A, 7x9q:A, 6xf3:A, 6xf3:B, 6xf4:A, 6xf4:B, 6xnp:A, 6xnp:B, 6y99:A, 6ydb:A, 6ydz:A, 6yea:A, 6ywa:A, 6ywa:B, 6ywb:A, 6z0z:A, 6z15:A, 7zku:A, 7zku:B, 7zv0:A, 7zvk:A, 7zvk:B, 7zwl:A, 7zwl:B, 7zxb:A
2	4f9g:A	170	170	0.9408	0.9353	0.9353	1.65e-109	6mx3:A
3	6a06:A	188	182	0.7988	0.7181	0.7418	2.12e-95	6a03:A, 6a03:B, 6a04:A, 6a04:B, 6a05:A, 6a05:B, 6a06:B, 6iyf:A, 6iyf:B
4	5grm:B	190	181	0.7929	0.7053	0.7403	6.70e-95	5grm:A, 4jc5:A, 4jc5:B, 4kby:A, 4kby:B, 4loj:A, 4loj:B, 4lok:A, 4lok:B, 4lol:A, 4lol:B, 6xnn:A, 6xnn:B, 4yp1:A, 4yp1:B
5	6nt7:A	294	182	0.4615	0.2653	0.4286	2.99e-37	6nt7:B, 6nt8:A, 6nt8:B, 6nt8:D, 6nt8:E
6	8gjz:B	182	175	0.3136	0.2912	0.3029	4.80e-25	8efm:A, 8efm:B, 8gjz:A
7	8efn:A	175	159	0.2959	0.2857	0.3145	2.79e-23	8efn:D
8	5cfl:A	187	185	0.3373	0.3048	0.3081	2.81e-22	5cfl:B, 5cfm:A, 5cfm:B, 5cfn:A, 5cfn:B, 5cfp:A, 5cfp:B, 5cfq:A, 5cfq:B, 5cfr:A, 5cfr:B
9	6wt7:A	331	163	0.2663	0.1360	0.2761	6.59e-19
10	7mwz:D	301	166	0.3077	0.1728	0.3133	6.19e-07
11	7mwz:B	352	165	0.3077	0.1477	0.3152	7.13e-07	7mwz:A, 7mwz:C
12	1ecx:B	365	53	0.0828	0.0384	0.2642	0.46	1ecx:A, 1eg5:A, 1eg5:B
13	6bea:A	433	98	0.1302	0.0508	0.2245	2.1
14	3u5z:B	320	30	0.0473	0.0250	0.2667	3.1	3u5z:C, 3u5z:D, 3u5z:E, 3u5z:L, 3u5z:M, 3u5z:N, 3u5z:O, 3u60:B, 3u60:C, 3u60:D, 3u60:E, 3u61:C, 3u61:D, 3u61:E, 3u61:B, 8uh7:B, 8uh7:C, 8uh7:D, 8uh7:E, 8uk9:B, 8uk9:C, 8uk9:D, 8uk9:E, 8uk9:K, 8uk9:L, 8uk9:M, 8uk9:N, 8unf:E, 8unf:D, 8unf:C, 8unf:B, 8unh:B, 8unh:E
15	4rz3:A	244	140	0.1953	0.1352	0.2357	3.4	4rz3:B
16	4wh3:A	356	58	0.0947	0.0449	0.2759	6.2	4ock:A, 4oco:A, 4ocp:A, 4ocv:A, 4wh2:A
17	6g2g:B	273	42	0.0828	0.0513	0.3333	10.0	6g2g:A

[Back]