BioLiP

>protein
STVYNINLGIGWASSGVEYAQAYRAQILRRIQQPAKFIFMDMILADNIQHLTENIGFLDEEIIWLYNYFTDIKIAPTTVT
LDQVLAQVAGQPERSEKEGKIVRYFYPQDDQFITCYLRQEDQDFVEHVEYVSRGRLIRKDYFSYVRYASEYFAPHNDAAT
LYQRRFYHEDGSVAYDMLIEDGQEKLYRFPDRIFYSKAELVRYFLQCLQLQADDVVILDRETGIGQVVFEESQKAKLGVV
VHAEHFSENASSDDYILWNNFYDYQFTNADKVDFFIVATEAQKRILEQQFQHYSDKQPQIATIPVGSLDQLTYPKEPRKP
YSMITASRLATEKHIDWLVAATVQAHAQLPELTLDIYGKGSEEDKLRRRIEEAGAQDYIRLKGHADLSQIYAGYELYLTA
STSEGFGLTLMEAVGSGLPLIGFDVRYGNQTFIDDGKNGYLLPVSSNHVEDQIIAAFVEKIIALFSQGRQQEMSQHSYQV
AENYLTSRVEAAWTQLLKEVRDD

The query sequence (length=503) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5e9u:A	503	503	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	5e9u:E
2	4pqg:A	506	502	0.6382	0.6344	0.6394	0.0	4pqg:B
3	7ec3:A	500	522	0.2425	0.2440	0.2337	4.77e-28	7ec3:C, 7ec6:A, 7ec7:A, 7ec7:B, 7vfl:A, 7vfl:C, 7vfm:A, 7vfm:C, 7vfn:A, 7vfo:A, 7vfo:B
4	4wad:A	498	308	0.1650	0.1667	0.2695	1.01e-21	4x6l:A, 4x6l:B, 4x6l:C, 4x7m:A, 4x7m:B, 4x7r:A, 4x7r:B
5	8p1x:AAA	492	433	0.2008	0.2053	0.2333	4.64e-19	8p20:AAA, 8p20:BBB, 8p20:CCC, 8p20:DDD, 7qd7:AAA, 7qh9:AAA, 7qh9:BBB, 7qh9:CCC, 7qh9:DDD
6	6n1x:A	377	179	0.0855	0.1141	0.2402	2.75e-06	6d9t:A
7	5zer:A	354	212	0.1153	0.1638	0.2736	6.70e-06	5zer:B, 5zes:A, 5zfk:A, 5zfk:B
8	5d00:A	361	136	0.0696	0.0970	0.2574	1.02e-05	5d00:B, 5d01:A, 5d01:B
9	3mbo:E	375	121	0.0775	0.1040	0.3223	2.03e-05	3mbo:A, 3mbo:C, 3mbo:H
10	6kih:A	400	214	0.1093	0.1375	0.2570	7.20e-05	6kih:C, 6kih:D, 6kih:E, 6kih:F, 6kih:H, 6kih:I, 6kih:K, 6kih:L, 6kih:B, 6kih:G, 6kih:J
11	5n80:A	358	145	0.0815	0.1145	0.2828	1.02e-04	6y6i:A
12	8b5q:B	365	75	0.0497	0.0685	0.3333	0.002	8b5q:A, 8b5s:A, 8b5s:B, 8b62:A, 8b62:B, 8b63:A, 8b63:B
13	3c4q:A	393	207	0.0994	0.1272	0.2415	0.003	3c4q:B, 3c4v:A, 3c4v:B
14	8qoy:A	1036	158	0.0795	0.0386	0.2532	0.004
15	2iv7:A	370	130	0.0636	0.0865	0.2462	0.011	2iw1:A
16	2xa2:A	412	147	0.0815	0.0995	0.2789	0.034	2xa2:B, 2xa9:A, 2xa9:B, 2xmp:A, 2xmp:B
17	3oka:A	378	108	0.0676	0.0899	0.3148	0.086	3oka:B, 3okc:A, 3okp:A
18	2r66:A	456	195	0.1054	0.1162	0.2718	0.19	2r68:A
19	7fga:B	344	151	0.0736	0.1076	0.2450	0.36	7fg9:A, 7fg9:B, 7fga:D, 7fga:A, 7fga:C
20	6eji:A	360	210	0.0815	0.1139	0.1952	0.49	6eji:B, 6ejj:A, 6ejj:B, 6ejk:A, 6ejk:B
21	8dqd:A	370	109	0.0636	0.0865	0.2936	0.93	8dvw:A, 8dvz:A
22	6zn1:AAA	400	174	0.0815	0.1025	0.2356	1.4	6zjh:AAA, 6zmz:AAA
23	3s27:H	797	44	0.0298	0.0188	0.3409	3.3	3s27:A, 3s27:B, 3s27:C, 3s27:D, 3s27:E, 3s27:F, 3s27:G, 3s28:A, 3s28:B, 3s28:C, 3s28:D, 3s28:E, 3s28:F, 3s28:G, 3s28:H, 3s29:A, 3s29:B, 3s29:C, 3s29:D, 3s29:E, 3s29:F, 3s29:G, 3s29:H
24	4gz8:A	557	72	0.0437	0.0395	0.3056	3.4	4gz8:B
25	8ro2:I	753	37	0.0278	0.0186	0.3784	3.5
26	7v94:A	1076	73	0.0358	0.0167	0.2466	4.7	7v93:A
27	2cg9:B	618	56	0.0398	0.0324	0.3571	4.9	1a4h:A, 1am1:A, 1amw:A, 4as9:A, 4asa:A, 4asb:A, 4asf:A, 4asg:A, 1bgq:A, 2brc:A, 2bre:A, 2bre:B, 3c11:A, 4ce1:A, 4ce2:A, 4ce3:A, 2cg9:A, 2cgf:A, 2fxs:A, 2iws:A, 2iwu:A, 2iwx:A, 8oxu:B, 8oxu:C, 2vw5:A, 2vw5:B, 2vw5:C, 2vw5:D, 2vwc:A, 2wep:A, 2weq:A, 2wer:A, 2wer:B, 2xd6:A, 6xlc:A, 6xlc:B, 6xld:A, 6xld:B, 6xle:A, 6xle:B, 6xlf:A, 6xlf:B, 6xlg:A, 6xlg:B, 6xlh:A, 6xlh:B, 2xx2:A, 2xx2:B, 2xx2:C, 2xx2:D, 2xx4:A, 2xx5:A, 2yga:A, 2yge:A, 2ygf:A, 1zw9:A, 1zwh:A
28	8sli:A	894	84	0.0417	0.0235	0.2500	6.0	8sli:D, 8sli:C, 8sli:B
29	5bxy:A	155	68	0.0378	0.1226	0.2794	7.2	5bxy:B
30	1o7d:A	291	97	0.0477	0.0825	0.2474	9.5

[Back]