Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
STQKFIEDNIEYITIIAFAQYVQEATFEEMEKLVKDMVEYKDRCMADKTLPECSKLPNNVLQEKICAMEGLPQKHNFSHC
CSKVDAQRRLCFFYNKKSDVGFLPPFLNHFLYEVARRNPFVFAPTLLTVAVHFEEVAKPVTQYLKAFSSYQKHVCGALLK
FGTKVVHFIYIAILSQKFPKIEFKELISLVEDVSSNYDGCCEGDVVQCIRDTSKVMNHICSKQDSISSKIKECCEKKIPE
RGQCIINSNKDDRPKDLEGKFTDSENVCQERDADPDTFFAKFTFEYSRRHPDLSIPELLRIVQIYKDLLRNCCNTENPPG
CYRYAEDKFNETTEKSLKMVQQECKHFQNLGKDGLKYHYLIRLTKIAPQLSTEELVSLGEKMVTAFTTCCTLSEEFACVD
NLADLVFGELCGVNENRTINPAVDHCCKTNFAFRRPCFESLKADKTYVPPPFSELQRKTDRFLVNLVKLKHELTDEELQ

The query sequence (length=479) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6rq7:B 479 479 1.0000 1.0000 1.0000 0.0
2 5okl:B 558 516 1.0000 0.8584 0.9283 0.0
3 5okl:B 558 377 0.1482 0.1272 0.1883 3.33e-08
4 8x1n:A 591 536 0.3967 0.3215 0.3545 1.72e-114
5 8x1n:A 591 385 0.1503 0.1218 0.1870 5.88e-15
6 8cks:A 585 531 0.3674 0.3009 0.3315 3.47e-94 3a73:A, 3a73:B, 6a7p:A, 6a7p:B, 8a9q:A, 8a9q:B, 7aai:AAA, 3b9l:A, 3b9m:A, 1bke:A, 2bx8:A, 2bx8:B, 2bxa:A, 2bxa:B, 2bxb:A, 2bxb:B, 2bxc:A, 2bxc:B, 2bxd:A, 2bxd:B, 2bxe:A, 2bxe:B, 2bxf:A, 2bxf:B, 2bxg:A, 2bxg:B, 2bxh:A, 2bxh:B, 2bxi:A, 2bxk:A, 2bxl:A, 2bxm:A, 2bxn:A, 2bxo:A, 2bxp:A, 2bxq:A, 9csg:A, 3cx9:A, 7d6j:A, 7d6j:B, 7dl4:A, 1e7a:A, 1e7a:B, 1e7b:A, 1e7b:B, 1e7c:A, 4e99:A, 7eek:A, 7eek:B, 8ew4:A, 8ew7:A, 8ey5:A, 6ezq:A, 5gix:A, 5gix:B, 5giy:A, 1gni:A, 1gnj:A, 8h0o:A, 1h9z:A, 1ha2:A, 1hk1:A, 1hk2:A, 1hk3:A, 1hk4:A, 1hk5:A, 6hsc:B, 2i30:A, 5id7:A, 5id7:B, 5ifo:A, 5ijf:A, 8ism:A, 8itr:A, 8itt:A, 8itt:B, 4iw1:A, 4iw2:A, 8j8e:A, 8j8e:I, 3jqz:A, 7jwn:A, 8k1y:A, 6l4k:A, 4l8u:A, 4l9k:A, 4l9k:B, 4l9q:A, 4l9q:B, 4la0:A, 4la0:B, 4lb2:A, 4lb2:B, 4lb9:A, 3lu6:A, 3lu6:B, 3lu7:A, 3lu7:B, 3lu8:A, 3lu8:B, 6m5e:A, 6m5e:B, 6m5e:C, 1n5u:A, 1o9x:A, 7ov5:A, 7ov5:B, 7ov6:A, 7ov6:B, 7qfe:A, 6qio:A, 6qip:A, 6r7s:A, 8rco:A, 8rco:B, 8rgk:A, 8rgk:B, 8rgl:A, 8rgl:B, 3tdl:A, 3uiv:H, 5ujb:A, 5ujb:B, 8vac:A, 8vae:A, 2vdb:A, 5vnw:B, 7vr9:A, 7vr9:B, 2vue:A, 2vue:B, 2vuf:A, 2vuf:B, 7wkz:A, 7wkz:B, 7wlf:A, 7woj:A, 7wok:A, 7wok:B, 6wuw:A, 6wuw:B, 7wz9:A, 5x52:A, 5x52:B, 7x7x:A, 7x7x:B, 2xsi:A, 2xvq:A, 2xvq:B, 2xvu:A, 2xvu:B, 2xvv:A, 2xvw:A, 6xv0:A, 2xw0:A, 2xw0:B, 2xw1:A, 2xw1:B, 7y2d:A, 5yb1:A, 5yb1:B, 2ydf:A, 2ydf:B, 6yg9:A, 5yoq:A, 5yoq:B, 1ysx:A, 8yxa:A, 8yxa:B, 8yxb:A, 8yxb:B, 5z0b:A, 5z0b:B, 5z0b:C, 7z57:A, 4z69:A, 4z69:I
7 8cks:A 585 392 0.1712 0.1402 0.2092 4.25e-10 3a73:A, 3a73:B, 6a7p:A, 6a7p:B, 8a9q:A, 8a9q:B, 7aai:AAA, 3b9l:A, 3b9m:A, 1bke:A, 2bx8:A, 2bx8:B, 2bxa:A, 2bxa:B, 2bxb:A, 2bxb:B, 2bxc:A, 2bxc:B, 2bxd:A, 2bxd:B, 2bxe:A, 2bxe:B, 2bxf:A, 2bxf:B, 2bxg:A, 2bxg:B, 2bxh:A, 2bxh:B, 2bxi:A, 2bxk:A, 2bxl:A, 2bxm:A, 2bxn:A, 2bxo:A, 2bxp:A, 2bxq:A, 9csg:A, 3cx9:A, 7d6j:A, 7d6j:B, 7dl4:A, 1e7a:A, 1e7a:B, 1e7b:A, 1e7b:B, 1e7c:A, 4e99:A, 7eek:A, 7eek:B, 8ew4:A, 8ew7:A, 8ey5:A, 6ezq:A, 5gix:A, 5gix:B, 5giy:A, 1gni:A, 1gnj:A, 8h0o:A, 1h9z:A, 1ha2:A, 1hk1:A, 1hk2:A, 1hk3:A, 1hk4:A, 1hk5:A, 6hsc:B, 2i30:A, 5id7:A, 5id7:B, 5ifo:A, 5ijf:A, 8ism:A, 8itr:A, 8itt:A, 8itt:B, 4iw1:A, 4iw2:A, 8j8e:A, 8j8e:I, 3jqz:A, 7jwn:A, 8k1y:A, 6l4k:A, 4l8u:A, 4l9k:A, 4l9k:B, 4l9q:A, 4l9q:B, 4la0:A, 4la0:B, 4lb2:A, 4lb2:B, 4lb9:A, 3lu6:A, 3lu6:B, 3lu7:A, 3lu7:B, 3lu8:A, 3lu8:B, 6m5e:A, 6m5e:B, 6m5e:C, 1n5u:A, 1o9x:A, 7ov5:A, 7ov5:B, 7ov6:A, 7ov6:B, 7qfe:A, 6qio:A, 6qip:A, 6r7s:A, 8rco:A, 8rco:B, 8rgk:A, 8rgk:B, 8rgl:A, 8rgl:B, 3tdl:A, 3uiv:H, 5ujb:A, 5ujb:B, 8vac:A, 8vae:A, 2vdb:A, 5vnw:B, 7vr9:A, 7vr9:B, 2vue:A, 2vue:B, 2vuf:A, 2vuf:B, 7wkz:A, 7wkz:B, 7wlf:A, 7woj:A, 7wok:A, 7wok:B, 6wuw:A, 6wuw:B, 7wz9:A, 5x52:A, 5x52:B, 7x7x:A, 7x7x:B, 2xsi:A, 2xvq:A, 2xvq:B, 2xvu:A, 2xvu:B, 2xvv:A, 2xvw:A, 6xv0:A, 2xw0:A, 2xw0:B, 2xw1:A, 2xw1:B, 7y2d:A, 5yb1:A, 5yb1:B, 2ydf:A, 2ydf:B, 6yg9:A, 5yoq:A, 5yoq:B, 1ysx:A, 8yxa:A, 8yxa:B, 8yxb:A, 8yxb:B, 5z0b:A, 5z0b:B, 5z0b:C, 7z57:A, 4z69:A, 4z69:I
8 8cks:A 585 104 0.0626 0.0513 0.2885 0.18 3a73:A, 3a73:B, 6a7p:A, 6a7p:B, 8a9q:A, 8a9q:B, 7aai:AAA, 3b9l:A, 3b9m:A, 1bke:A, 2bx8:A, 2bx8:B, 2bxa:A, 2bxa:B, 2bxb:A, 2bxb:B, 2bxc:A, 2bxc:B, 2bxd:A, 2bxd:B, 2bxe:A, 2bxe:B, 2bxf:A, 2bxf:B, 2bxg:A, 2bxg:B, 2bxh:A, 2bxh:B, 2bxi:A, 2bxk:A, 2bxl:A, 2bxm:A, 2bxn:A, 2bxo:A, 2bxp:A, 2bxq:A, 9csg:A, 3cx9:A, 7d6j:A, 7d6j:B, 7dl4:A, 1e7a:A, 1e7a:B, 1e7b:A, 1e7b:B, 1e7c:A, 4e99:A, 7eek:A, 7eek:B, 8ew4:A, 8ew7:A, 8ey5:A, 6ezq:A, 5gix:A, 5gix:B, 5giy:A, 1gni:A, 1gnj:A, 8h0o:A, 1h9z:A, 1ha2:A, 1hk1:A, 1hk2:A, 1hk3:A, 1hk4:A, 1hk5:A, 6hsc:B, 2i30:A, 5id7:A, 5id7:B, 5ifo:A, 5ijf:A, 8ism:A, 8itr:A, 8itt:A, 8itt:B, 4iw1:A, 4iw2:A, 8j8e:A, 8j8e:I, 3jqz:A, 7jwn:A, 8k1y:A, 6l4k:A, 4l8u:A, 4l9k:A, 4l9k:B, 4l9q:A, 4l9q:B, 4la0:A, 4la0:B, 4lb2:A, 4lb2:B, 4lb9:A, 3lu6:A, 3lu6:B, 3lu7:A, 3lu7:B, 3lu8:A, 3lu8:B, 6m5e:A, 6m5e:B, 6m5e:C, 1n5u:A, 1o9x:A, 7ov5:A, 7ov5:B, 7ov6:A, 7ov6:B, 7qfe:A, 6qio:A, 6qip:A, 6r7s:A, 8rco:A, 8rco:B, 8rgk:A, 8rgk:B, 8rgl:A, 8rgl:B, 3tdl:A, 3uiv:H, 5ujb:A, 5ujb:B, 8vac:A, 8vae:A, 2vdb:A, 5vnw:B, 7vr9:A, 7vr9:B, 2vue:A, 2vue:B, 2vuf:A, 2vuf:B, 7wkz:A, 7wkz:B, 7wlf:A, 7woj:A, 7wok:A, 7wok:B, 6wuw:A, 6wuw:B, 7wz9:A, 5x52:A, 5x52:B, 7x7x:A, 7x7x:B, 2xsi:A, 2xvq:A, 2xvq:B, 2xvu:A, 2xvu:B, 2xvv:A, 2xvw:A, 6xv0:A, 2xw0:A, 2xw0:B, 2xw1:A, 2xw1:B, 7y2d:A, 5yb1:A, 5yb1:B, 2ydf:A, 2ydf:B, 6yg9:A, 5yoq:A, 5yoq:B, 1ysx:A, 8yxa:A, 8yxa:B, 8yxb:A, 8yxb:B, 5z0b:A, 5z0b:B, 5z0b:C, 7z57:A, 4z69:A, 4z69:I
9 6hn0:A 583 530 0.3528 0.2899 0.3189 1.50e-93 6hn1:A, 4jk4:A, 4jk4:B, 8kfo:B, 4luf:A, 4luh:A, 4or0:A, 4or0:B, 5orf:A, 5orf:B, 5orf:C, 5orf:D, 5osw:A, 5otb:A, 5otb:B, 5otb:C, 5otb:D, 6qs9:A, 6qs9:B, 6rjv:A, 6rjv:B, 3v03:A, 3v03:B, 8wdd:A, 8wdd:B
10 6hn0:A 583 389 0.1754 0.1441 0.2159 1.37e-11 6hn1:A, 4jk4:A, 4jk4:B, 8kfo:B, 4luf:A, 4luh:A, 4or0:A, 4or0:B, 5orf:A, 5orf:B, 5orf:C, 5orf:D, 5osw:A, 5otb:A, 5otb:B, 5otb:C, 5otb:D, 6qs9:A, 6qs9:B, 6rjv:A, 6rjv:B, 3v03:A, 3v03:B, 8wdd:A, 8wdd:B
11 6hn0:A 583 104 0.0647 0.0532 0.2981 0.023 6hn1:A, 4jk4:A, 4jk4:B, 8kfo:B, 4luf:A, 4luh:A, 4or0:A, 4or0:B, 5orf:A, 5orf:B, 5orf:C, 5orf:D, 5osw:A, 5otb:A, 5otb:B, 5otb:C, 5otb:D, 6qs9:A, 6qs9:B, 6rjv:A, 6rjv:B, 3v03:A, 3v03:B, 8wdd:A, 8wdd:B
12 6ci6:A 581 533 0.3570 0.2943 0.3208 2.03e-90 5dby:A, 5dqf:A, 5id9:A, 5iih:A, 5iiu:A, 5iix:A, 5ij5:A, 5ije:A, 4j2v:A, 7mbl:A, 6mdq:A, 6oci:A, 6ocj:A, 4ot2:A, 7q4x:A, 6u4r:A, 6u4x:A, 6u5a:A, 5v0v:A, 6xk0:A, 4zbq:A, 4zbr:A
13 6ci6:A 581 392 0.1733 0.1429 0.2117 4.97e-09 5dby:A, 5dqf:A, 5id9:A, 5iih:A, 5iiu:A, 5iix:A, 5ij5:A, 5ije:A, 4j2v:A, 7mbl:A, 6mdq:A, 6oci:A, 6ocj:A, 4ot2:A, 7q4x:A, 6u4r:A, 6u4x:A, 6u5a:A, 5v0v:A, 6xk0:A, 4zbq:A, 4zbr:A
14 6ci6:A 581 104 0.0605 0.0499 0.2788 0.61 5dby:A, 5dqf:A, 5id9:A, 5iih:A, 5iiu:A, 5iix:A, 5ij5:A, 5ije:A, 4j2v:A, 7mbl:A, 6mdq:A, 6oci:A, 6ocj:A, 4ot2:A, 7q4x:A, 6u4r:A, 6u4x:A, 6u5a:A, 5v0v:A, 6xk0:A, 4zbq:A, 4zbr:A
15 8bsg:A 584 531 0.3466 0.2842 0.3126 2.59e-90 6ock:A, 6ocl:A, 4po0:A
16 8bsg:A 584 387 0.1754 0.1438 0.2171 5.09e-13 6ock:A, 6ocl:A, 4po0:A
17 8bsg:A 584 105 0.0605 0.0497 0.2762 0.29 6ock:A, 6ocl:A, 4po0:A
18 1j78:B 447 420 0.1754 0.1879 0.2000 1.73e-13 1j7e:A, 1j7e:B
19 1j78:B 447 257 0.1065 0.1141 0.1984 6.76e-10 1j7e:A, 1j7e:B
20 1j78:B 447 84 0.0418 0.0447 0.2381 0.009 1j7e:A, 1j7e:B
21 6s1y:A 595 83 0.0585 0.0471 0.3373 0.052 6s1z:A
22 8rch:A 2036 65 0.0418 0.0098 0.3077 0.69 8rch:B, 8rck:B, 8rcn:B
23 6bcu:A 2204 65 0.0418 0.0091 0.3077 0.70 6bcu:B, 6bcx:A, 6bcx:B, 4drh:B, 4drh:E, 4dri:B, 4drj:B, 8er6:B, 8er6:D, 8er6:F, 8er7:B, 8er7:D, 8er7:F, 8era:A, 9f44:A, 9f44:B, 9f45:A, 9f45:B, 1fap:B, 2fap:B, 3fap:B, 4fap:B, 5flc:B, 5flc:F, 5gpg:B, 4jsp:B, 4jsp:A, 4jsv:B, 4jsv:A, 4jsx:B, 4jsx:A, 4jt5:B, 4jt5:A, 4jt6:B, 4jt6:A, 6m4u:B, 6m4u:F, 6m4w:G, 6m4w:H, 6m4w:I, 1nsg:B, 7pe7:B, 7pe7:A, 7pe8:A, 7pe9:A, 7pea:B, 7pea:A, 7peb:A, 7pec:A, 8ppz:B, 7uxc:A, 7uxh:A, 7uxh:C, 5wbh:C, 5wbh:D, 5wbu:B, 5wbu:A, 6zwo:B
24 6zwm:B 2185 65 0.0418 0.0092 0.3077 0.71 6zwm:A
25 3o1h:B 296 31 0.0251 0.0405 0.3871 1.4
26 7dvl:B 407 58 0.0418 0.0491 0.3448 5.2 7dvl:A
27 5iko:A 807 27 0.0271 0.0161 0.4815 5.3 5ikp:A
28 7znn:B 559 66 0.0334 0.0286 0.2424 6.0 7zn7:B
29 8e5t:5 530 46 0.0334 0.0302 0.3478 7.2
30 3gpb:A 833 53 0.0355 0.0204 0.3208 9.4 1a8i:A, 1abb:A, 1abb:B, 1abb:C, 1abb:D, 2amv:A, 3amv:A, 1axr:A, 1b4d:A, 3bcr:A, 3bcs:A, 3bd6:A, 3bd7:A, 3bd8:A, 3bda:A, 8bzs:A, 1c50:A, 1c8k:A, 1c8l:A, 4ctm:A, 4ctn:A, 4cto:A, 3cut:A, 3cuu:A, 3cuv:A, 3cuw:A, 3e3n:A, 3e3n:B, 3e3n:D, 3e3n:F, 3e3n:G, 3e3n:H, 3e3o:B, 3ebo:A, 3ebp:A, 4ej2:A, 4eke:A, 4eky:A, 4el0:A, 4el5:A, 2f3p:A, 2f3q:A, 2f3s:A, 2f3u:A, 6f3j:A, 6f3l:A, 6f3r:A, 6f3s:A, 6f3u:A, 2fet:A, 2ff5:A, 2ffr:A, 1fs4:A, 1ftq:A, 1ftw:A, 1fty:A, 1fu4:A, 1fu7:A, 1fu8:A, 3g2h:A, 3g2i:A, 3g2j:A, 3g2k:A, 3g2l:A, 3g2n:A, 2g9r:A, 2g9v:A, 1gfz:A, 1gg8:A, 1ggn:A, 1gpa:A, 1gpa:B, 1gpa:C, 1gpa:D, 1gpb:A, 1gpy:A, 2gpb:A, 4gpb:A, 5gpb:A, 6gpb:A, 7gpb:A, 7gpb:B, 7gpb:C, 7gpb:D, 8gpb:A, 9gpb:A, 9gpb:B, 9gpb:C, 9gpb:D, 1h5u:A, 1hlf:A, 5jtt:A, 5jtu:A, 1k06:A, 1k08:A, 1kti:A, 3l79:A, 3l7a:A, 3l7b:A, 3l7c:A, 3l7d:A, 5lrc:A, 5lrd:A, 5lre:A, 5lrf:A, 1lwn:A, 1lwo:A, 5mcb:A, 5mem:A, 4mho:A, 4mhs:A, 4mi3:A, 4mi6:A, 4mi9:A, 4mic:A, 3mqf:A, 3mrt:A, 3mrv:A, 3mrx:A, 4mra:A, 3ms2:A, 3ms4:A, 3ms7:A, 3msc:A, 3mt7:A, 3mt8:A, 3mt9:A, 3mta:A, 3mtb:A, 3mtd:A, 3nc4:A, 1noi:A, 1noi:B, 1noi:C, 1noi:D, 1noj:A, 1nok:A, 3np7:A, 3np9:A, 3npa:A, 5o50:A, 5o52:A, 5o54:A, 5o56:A, 2off:A, 7onf:A, 5owy:A, 5owz:A, 5ox0:A, 5ox1:A, 5ox3:A, 5ox4:A, 1p29:A, 1p2b:A, 1p2d:A, 1p2g:A, 1p4g:A, 1p4h:A, 1p4j:A, 2pri:A, 2prj:A, 2pyd:A, 2pyi:A, 7q5i:AAA, 6qa6:A, 6qa7:A, 6qa8:A, 2qlm:A, 2qln:A, 2qn1:A, 2qn2:A, 2qn3:A, 2qn7:A, 2qn8:A, 2qn9:A, 2qnb:A, 2qrg:A, 2qrh:A, 2qrm:A, 2qrp:A, 2qrq:A, 6r0h:A, 6r0i:A, 3s0j:A, 6s4h:A, 6s4k:A, 6s4o:A, 6s4p:A, 6s4r:A, 6s51:A, 6s52:A, 2skc:A, 2skd:A, 2ske:A, 3sym:A, 3syr:A, 3t3d:A, 3t3e:A, 3t3g:A, 3t3h:A, 3t3i:A, 1uzu:A, 1wut:A, 1wuy:A, 1wv0:A, 1wv1:A, 1ww2:A, 1ww3:A, 1xc7:A, 1xkx:A, 1xl0:A, 1xl1:A, 6y55:A, 6y5c:A, 6y5o:A, 4yi3:A, 4yi5:A, 4yua:A, 6yve:AAA, 4z5x:A, 1z62:A, 1z6p:A, 1z6q:A, 1z8d:A, 3zcp:A, 3zcq:A, 3zcr:A, 3zcs:A, 3zct:A, 3zcu:A, 3zcv:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218