BioLiP

>protein
STNLPRNPSMADYEARIFTFGTWIYSVNKEQLARAGFYALGEGDKVKCFHCGGGLTDWKPSEDPWEQHAKWYPGCKYLLE
QKGQEYINNIHLTHSLEECLVRT

The query sequence (length=103) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	1f9x:A	117	103	1.0000	0.8803	1.0000	6.81e-77	5c0k:A, 5c0l:A, 5c3h:A, 5c3k:A, 5c7a:A, 5c7b:A, 5c7c:A, 5c7d:A, 5c83:A, 5c84:A, 3clx:D, 3clx:A, 3clx:B, 3clx:C, 3cm2:D, 3cm2:H, 3cm2:A, 3cm2:B, 3cm2:C, 3cm2:G, 3cm2:E, 3cm2:F, 3cm2:I, 3cm2:J, 3cm7:C, 3cm7:A, 3cm7:B, 3cm7:D, 4ec4:A, 4ec4:F, 4ec4:B, 4ec4:G, 4ec4:C, 4ec4:D, 4ec4:K, 4ec4:E, 4ec4:L, 4ec4:J, 3eyl:A, 3eyl:B, 6ey2:A, 6ey2:C, 6ey2:B, 6ey2:G, 6ey2:D, 6ey2:E, 6ey2:F, 6ey2:H, 1g3f:A, 1g73:C, 1g73:D, 3g76:A, 3g76:B, 3g76:C, 3g76:D, 3g76:E, 3g76:F, 3g76:G, 3g76:H, 8gh7:A, 8gh7:B, 6h6q:A, 6h6q:B, 6h6r:A, 3hl5:A, 3hl5:B, 4hy0:A, 4hy0:D, 4hy0:B, 4hy0:G, 4hy0:C, 4hy0:E, 4hy0:F, 4hy0:H, 2jk7:A, 4kmp:A, 4kmp:B, 5m6e:A, 5m6f:A, 5m6h:A, 5m6l:A, 5m6m:A, 1nw9:A, 2opy:A, 2opz:A, 2opz:B, 2opz:C, 2opz:D, 5oqw:A, 5oqw:B, 1tfq:A, 1tft:A, 2vsl:A
2	1xb0:F	103	102	0.8155	0.8155	0.8235	5.56e-63	1xb0:A, 1xb0:B, 1xb0:C, 1xb0:D, 1xb0:E, 1xb1:A, 1xb1:B, 1xb1:C, 1xb1:D, 1xb1:E, 1xb1:F
3	2i3h:B	95	94	0.5146	0.5579	0.5638	2.42e-33	3f7h:A, 3f7h:B, 3f7i:A, 3f7i:B, 3gt9:A, 3gt9:B, 3gta:A, 3gta:B, 2i3h:A, 2i3i:A, 2i3i:B, 1tw6:A, 1tw6:B, 3uw5:A, 3uw5:B
4	2uvl:B	95	87	0.4563	0.4947	0.5402	6.20e-28	2uvl:A
5	3t6p:A	330	96	0.4563	0.1424	0.4896	1.23e-27	3d9t:A, 3d9t:B, 3d9u:A, 8dsf:A, 8dsf:B, 8dsf:C, 8dsf:D, 8dso:D, 4eb9:A, 4eb9:B, 4eb9:C, 4eb9:D, 6exw:A, 6exw:C, 6hpr:A, 4hy4:A, 4hy4:B, 4hy5:A, 4hy5:B, 4lge:A, 4lge:B, 4lgu:A, 4lgu:B, 5m6n:A, 5m6n:B, 4mti:A, 4mti:B, 3mup:A, 3mup:B, 3mup:C, 3mup:D, 4mu7:A, 4mu7:B, 3oz1:A, 3oz1:B, 3oz1:C, 3oz1:D, 1qbh:A, 7trm:A, 3uw4:A, 6w74:A, 6w7o:C, 6w7o:D, 6w8i:F, 6w8i:D, 6w8i:E
6	4kmn:A	103	87	0.4272	0.4272	0.5057	1.47e-26	7trl:A
7	3f7g:B	101	93	0.4078	0.4158	0.4516	2.10e-26	3f7g:A, 3f7g:C, 3f7g:D, 3f7g:E, 1oxn:E, 1oxn:A, 1oxn:B, 1oxn:C, 1oxn:D, 1oxq:E, 1oxq:A, 1oxq:B, 1oxq:C, 1oxq:D, 1oy7:E, 1oy7:A, 1oy7:B, 1oy7:C, 1oy7:D
8	1jd5:A	105	97	0.4078	0.4000	0.4330	1.94e-24	1jd4:A, 1jd4:B, 1jd6:A, 1q4q:G, 1q4q:I, 1q4q:F, 1q4q:H, 1q4q:J, 1q4q:A, 1q4q:C, 1q4q:D, 1q4q:B, 1q4q:E
9	7qgj:A	79	75	0.3010	0.3924	0.4133	2.82e-18	7qgj:B
10	1c9q:A	117	80	0.3204	0.2821	0.4125	3.73e-18	8aza:C, 1i3o:E, 1i3o:F, 4j3y:A, 4j3y:C, 4j44:A, 4j44:C, 4j45:A, 4j45:C, 4j46:A, 4j46:C, 4j47:A, 4j47:C, 4j48:A, 4j48:C, 4kju:A, 4kju:C, 4kjv:A, 4kjv:C, 4wvs:A, 4wvt:A, 4wvt:B, 4wvu:A
11	8fvu:A	1361	78	0.3107	0.0235	0.4103	5.69e-17	2vm5:A
12	8fvu:A	1361	80	0.2816	0.0213	0.3625	6.28e-11	2vm5:A
13	8fvu:A	1361	86	0.2718	0.0206	0.3256	2.46e-05	2vm5:A
14	5yud:A	1238	77	0.3107	0.0258	0.4156	1.14e-16
15	5yud:A	1238	74	0.2427	0.0202	0.3378	8.41e-05
16	7rav:A	773	77	0.3107	0.0414	0.4156	1.98e-16
17	7rav:A	773	49	0.2330	0.0310	0.4898	4.41e-12
18	7rav:A	773	74	0.2427	0.0323	0.3378	1.33e-04
19	3m0d:D	75	65	0.2913	0.4000	0.4615	8.92e-15	3m0a:D, 7nk0:D, 7nk0:E
20	3m1d:A	78	65	0.2718	0.3590	0.4308	1.83e-13	3m1d:B
21	3sip:F	108	66	0.2621	0.2500	0.4091	1.15e-12	1sdz:A, 1se0:A, 3sip:E, 3siq:A, 3siq:B, 3siq:C, 3siq:D, 3siq:E, 3siq:F
22	1m4m:A	112	79	0.2718	0.2500	0.3544	7.36e-10
23	2pop:D	80	52	0.1942	0.2500	0.3846	5.65e-09	6gjw:A, 6gjw:B, 6gjw:C, 6gjw:D, 4mtz:A, 4mtz:B, 4mtz:C, 4mtz:D, 4oxc:A, 4oxc:B, 4oxc:C, 4oxc:D, 2poi:A, 2pop:B, 6qci:A, 6qci:B, 6qci:C, 6qci:D, 2qra:D, 2qra:C, 2qra:B, 2qra:A
24	3ued:C	139	89	0.2913	0.2158	0.3371	7.66e-09	4a0i:A, 4a0i:B, 4a0j:A, 4a0j:B, 4a0n:A, 1e31:A, 1e31:B, 1f3h:A, 1f3h:B, 7lbk:B, 7lbk:A, 7lbo:A, 7lbo:B, 7lbp:A, 7lbp:C, 7lbq:A, 2qfa:A, 2raw:A, 2rax:A, 2rax:E, 2rax:X, 6sho:A, 6sho:B, 3uec:A, 3ued:A, 3uee:A, 3uee:C, 3uef:A, 3uef:C, 3ueg:A, 3ueg:B, 3ueh:A, 3ueh:B, 3uei:A, 3uei:B, 3uig:A, 3uig:B, 3uih:A, 3uih:B, 3uii:A, 3uii:B, 3uij:A, 3uij:B, 3uik:A, 3uik:B, 1xox:A, 1xox:B, 6yie:A, 6yie:D, 6yif:A, 6yih:A
25	8atu:A	2837	85	0.2621	0.0095	0.3176	8.82e-09	8atu:B, 8atx:A, 8atx:B, 8auk:A, 8auk:B, 8auw:B
26	8auw:A	2900	85	0.2621	0.0093	0.3176	8.82e-09
27	8tcd:D	272	50	0.1650	0.0625	0.3400	0.031	8tcd:B, 8tcd:C, 8tcd:A, 8tcr:C, 8tcr:B, 8tcr:A, 8tcr:D, 8tcs:D, 8tcs:C, 8tcs:A, 8tcs:B
28	5mmi:V	134	58	0.1553	0.1194	0.2759	0.81	6eri:AU, 5h1s:W, 5mlc:W, 5mmm:V, 4v61:BW, 5x8p:V, 5x8t:V
29	2wda:A	742	39	0.0971	0.0135	0.2564	2.2
30	6pl6:B	577	73	0.2136	0.0381	0.3014	8.3

[Back]