BioLiP

>protein
STLKIAPSILAADYANFASELARIEETDAEYVHIDIMDGQFVPNISFGADVVASMRKHSKLVFDCHLMVVDPERYVEAFA
QAGADIMTIHTESTRHIHGALQKIKAAGMKAGVVINPGTPATALEPLLDLVDQVLIMTVNPGFGGQAFIPECLEKVATVA
KWRDEKGLSFDIEVDGGVDNKTIRACYEAGANVFVAGSYLFKASDLVSQVQTLRTALN

The query sequence (length=218) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2fli:C	219	218	1.0000	0.9954	1.0000	9.14e-164	2fli:A, 2fli:B, 2fli:D, 2fli:E, 2fli:F, 2fli:G, 2fli:H, 2fli:I, 2fli:J, 2fli:K, 2fli:L
2	1rpx:A	230	218	0.4725	0.4478	0.4725	1.50e-68	1rpx:B, 1rpx:C
3	1h1y:B	219	218	0.4817	0.4795	0.4817	4.91e-66	1h1z:A, 1h1z:B
4	7b1w:F	234	218	0.4495	0.4188	0.4495	2.32e-64	7b1w:J, 7b1w:A, 7b1w:B, 7b1w:C, 7b1w:D, 7b1w:E, 7b1w:G, 7b1w:H, 7b1w:I, 7b1w:K, 7b1w:L
5	5umf:C	224	218	0.4312	0.4196	0.4312	2.74e-62	5umf:A, 5umf:B
6	3qc3:A	225	217	0.4404	0.4267	0.4424	4.41e-60	3ovp:A, 3ovp:B, 3ovq:A, 3ovq:B, 3ovr:A, 3ovr:B, 3qc3:B
7	3ct7:A	219	219	0.3945	0.3927	0.3927	9.24e-55	3ct7:B, 3ct7:C, 3ct7:D, 3ct7:E, 3ct7:F, 3ctl:A, 3ctl:B, 3ctl:C, 3ctl:D, 3ctl:E, 3ctl:F
8	4nu7:C	227	220	0.4358	0.4185	0.4318	6.75e-54	4nu7:A, 4nu7:B, 4nu7:D
9	7u5y:A	227	214	0.4083	0.3921	0.4159	8.36e-53	7u5y:B, 7u5y:C, 7u5y:D, 7u5y:E, 7u5y:F
10	7sbj:A	221	212	0.4220	0.4163	0.4340	1.84e-52	7sbj:B, 7sbj:C
11	1tqx:A	221	220	0.3807	0.3756	0.3773	1.56e-46	1tqx:B
12	4hnn:F	320	143	0.1835	0.1250	0.2797	0.095	4hnn:A, 4hnn:B, 4hnn:C, 4hnn:D, 4hnn:E, 4hnn:G, 4hnn:H
13	5ui3:C	306	75	0.1101	0.0784	0.3200	0.81	5ui3:D, 5ui3:A, 5ui3:B
14	1rm6:A	761	19	0.0459	0.0131	0.5263	0.86	1rm6:D, 1sb3:A, 1sb3:D
15	1cm5:A	759	52	0.0872	0.0250	0.3654	1.1	1cm5:B, 1h16:A, 1h17:A, 1h18:A, 1h18:B, 1mzo:A, 1mzo:B
16	8fve:B	538	53	0.0826	0.0335	0.3396	1.4	2ad5:A, 2ad5:B, 8fv6:AAA, 8fv6:BBB, 8fv7:AAA, 8fv7:BBB, 8fv8:AAA, 8fv8:BBB, 8fv9:AAA, 8fv9:BBB, 8fva:AAA, 8fva:BBB, 8fvb:AAA, 8fvb:BBB, 8fvc:AAA, 8fvc:BBB, 8fvd:A, 8fvd:B, 8fve:A, 8i9o:A, 8i9o:B, 8i9o:D, 8i9o:C, 1s1m:A, 1s1m:B, 8sbr:A, 8sbr:B, 5tkv:A, 5tkv:B, 5u3c:A, 5u3c:B, 5u3c:C, 5u3c:D, 5u6r:A, 5u6r:B, 5u6r:C, 5u6r:D
17	8b9n:A	239	24	0.0505	0.0460	0.4583	1.8	8b9n:C
18	3tm2:A	367	63	0.1009	0.0599	0.3492	2.0	3tm2:B
19	5hrf:A	178	37	0.0505	0.0618	0.2973	2.0	7cpw:A, 7cpw:B, 8e9a:A, 8e9a:B, 5hr9:A, 5hr9:B, 5hrb:A, 5hrd:A, 5hrd:B, 5hrd:C, 5hrd:D, 5hre:A, 5hrf:B, 5hrg:A, 5hrg:B, 5hrh:A, 5hrh:B, 5hri:A, 5hri:B, 5hrk:A, 5hrk:B, 5hrl:A, 5hrl:B, 8ild:A, 8ild:B, 8ile:B, 8ile:A, 8ilf:B, 8ilf:A, 8ilg:A, 8ilg:B, 8ilh:B, 8ilh:A, 8ilh:C, 8ilh:D, 8ili:A, 8ili:B, 8ili:C, 8ili:D, 2m2u:A, 2m2w:A, 5xm8:A, 5xm8:B, 5xm8:C, 5xm8:D, 5xm9:A, 5xm9:B, 5xm9:C, 5xm9:D, 5xma:A, 5xma:B
20	7n4y:B	2455	56	0.0826	0.0073	0.3214	2.9	7n4y:A
21	8ptk:f	4502	25	0.0413	0.0020	0.3600	3.1	8ptk:e
22	5nug:A	2920	25	0.0413	0.0031	0.3600	3.4	5nug:B
23	8pqw:A	2892	25	0.0413	0.0031	0.3600	3.5	8pqy:A, 8pqz:A, 8pqz:J
24	8dyu:A	2562	25	0.0413	0.0035	0.3600	3.7	8dyv:A
25	4cc5:A	308	51	0.0734	0.0519	0.3137	3.9	4cc6:A, 5fpo:A, 5fpr:A
26	2bhr:B	439	33	0.0596	0.0296	0.3939	4.1	2bhr:A
27	1lpa:B	449	34	0.0642	0.0312	0.4118	4.2	1lpb:B
28	4w8f:B	2609	39	0.0596	0.0050	0.3333	5.7	220l:A, 223l:A, 225l:A, 227l:A, 148l:E, 258l:A, 259l:A, 260l:A, 182l:A, 183l:A, 184l:A, 185l:A, 186l:A, 187l:A, 188l:A, 2a4t:A, 1c61:A, 1c62:A, 1c65:A, 1c66:A, 1c67:A, 1c68:A, 1c6a:A, 1c6b:A, 1c6d:A, 1c6e:A, 1c6g:A, 1c6h:A, 1c6j:A, 1c6k:A, 1c6m:A, 1c6n:A, 1c6q:A, 1c6t:A, 2cuu:A, 3dmx:A, 3dmz:A, 3dn0:A, 3dn1:A, 3dn2:A, 3dn3:A, 3dn4:A, 3dn6:A, 3dn8:A, 3dna:A, 1epy:A, 5g27:A, 3g3v:A, 3g3w:A, 3g3x:A, 3guj:A, 3guk:A, 3gul:A, 3gul:B, 3gum:A, 3gum:B, 3gun:A, 3gun:B, 3guo:A, 3guo:B, 3gup:A, 3gup:B, 3hh3:A, 3hh5:A, 3hh6:A, 3ht6:A, 3ht7:A, 3ht8:A, 3ht9:A, 3htb:A, 3htd:A, 3htf:A, 3htg:A, 3hu8:A, 3hu9:A, 3hua:A, 3huk:A, 3huq:A, 3hwl:A, 2igc:A, 5jdt:A, 5jgn:A, 5jgr:A, 5jgv:A, 5jgz:A, 5jws:A, 5jwt:A, 5jwu:A, 5jwv:A, 5jww:A, 3k2r:A, 3l2x:A, 7l3b:A, 7l3c:A, 7l3d:A, 7l3e:A, 7l3f:A, 7l3g:A, 7l3h:A, 7l3i:A, 7l3j:A, 7l3k:A, 1l83:A, 1l84:A, 1lgw:A, 1lgx:A, 1li3:A, 1li6:A, 7loa:A, 7lob:A, 7loc:A, 7lod:A, 7loe:A, 7lof:A, 7log:A, 7loj:A, 5lwo:A, 7lx6:A, 7lx7:A, 7lx8:A, 7lx9:A, 7lxa:A, 4lzm:A, 5lzm:A, 6lzm:A, 7lzm:A, 1nhb:A, 2ntg:A, 2nth:A, 2oty:X, 2otz:X, 2ou0:X, 2ou8:A, 2ou9:A, 1ov5:A, 1ov7:A, 1ovh:A, 1ovj:A, 1ovk:A, 1owy:A, 1owz:A, 6pgy:A, 6pgz:A, 6pgz:B, 4pjz:A, 4pk0:A, 2q9d:A, 2q9e:B, 2q9e:C, 2ray:X, 2raz:X, 2rb0:X, 2rb1:X, 2rb2:X, 2rbn:A, 2rbo:A, 2rbp:A, 2rbq:A, 2rbr:A, 2rbs:A, 3run:A, 3sb5:B, 3sb5:A, 3sb5:C, 3sb5:D, 3sb6:A, 3sb6:B, 3sb8:A, 3sb8:B, 3sb9:A, 3sb9:B, 3sba:B, 3sba:C, 3sba:F, 8tat:A, 6v51:A, 4w52:A, 4w53:A, 4w54:A, 4w55:A, 4w56:A, 4w57:A, 4w58:A, 4w59:A, 4w8f:A, 1xep:A, 1zur:A, 1zwn:A, 1zyt:A
29	8dzz:A	2363	39	0.0596	0.0055	0.3333	5.9	8dzz:D, 8e00:A
30	6l5s:A	454	32	0.0505	0.0242	0.3438	5.9	6l5p:A, 6l5q:A, 6l5r:A, 6l7h:A
31	6ttb:A	331	34	0.0642	0.0423	0.4118	6.0
32	5dx6:B	557	75	0.0734	0.0287	0.2133	6.0	5d6r:B, 5d6r:M, 5dx6:A, 1ozf:A, 1ozf:B, 1ozg:A, 1ozg:B, 1ozh:A, 1ozh:B, 1ozh:C, 1ozh:D, 5wdg:A, 5wdg:B
33	8hz4:A	456	55	0.0596	0.0285	0.2364	6.2	8hz4:B, 8hz4:C, 8hz4:D
34	7mgm:A	2274	39	0.0596	0.0057	0.3333	6.2
35	4ai6:A	2650	39	0.0596	0.0049	0.3333	6.6	4ai6:B, 4akg:A, 4akg:B, 4akh:A, 4akh:B, 4aki:A, 4aki:B, 3crt:A, 3cru:A, 3d0z:A, 1dug:A, 1dug:B, 1gne:A, 1gtb:A, 8gyd:A, 8gyd:B, 5gzz:B, 5gzz:C, 5gzz:D, 5gzz:E, 5gzz:F, 5gzz:G, 6ji6:A, 1m99:A, 1m9a:A, 1m9b:A, 7mi3:A, 7mi6:A, 6rwd:A, 6rwd:B, 1u87:A, 1u88:A, 1ua5:A, 4wr4:A, 4wr5:A
36	2i1o:A	389	32	0.0596	0.0334	0.4062	7.1	1yte:A, 1ytk:A
37	3vkg:B	2853	25	0.0413	0.0032	0.3600	8.3
38	7us3:A	428	61	0.0917	0.0467	0.3279	8.3	7us3:B, 7us3:C, 7us3:D
39	3vkh:B	2908	25	0.0413	0.0031	0.3600	8.4
40	6hbv:A	414	27	0.0459	0.0242	0.3704	8.5	6hbs:A, 6hbs:B, 6hbv:B
41	3vkg:A	2954	25	0.0413	0.0030	0.3600	8.5
42	3vkh:A	3042	25	0.0413	0.0030	0.3600	8.8

[Back]