Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
STLANLTEVLFRLDFDPDTAVYHYRGQTLSRLQCRTYILSQASQLARLLKPGDRVVLALNDSPSLACLFLACIAVGAIPA
VINPKSREQALADIAADCQASLVVREADAPSLSGPLAPLTLRAAAGRPLLDDFSLDALVGPADLDWSAFHRQDPAAACFL
QYTGAPKGVMHSLRNTLGFCRAFATELLALQAGDRLYSIPKMFFGYGMGNSLFFPWFSGASALLDDTWPSPERVLENLVA
FRPRVLFGVPAIYASLRPQARELLSSVRLAFSAGSPLPRGEFEFWAAHGLEICDGIGATEVGHVFLANRPGQARADSTGL
PLPGYECRLVDREGHTIEEAGRQGVLLVRGPGLSPGYWRASEEQQARFAGGWYRTGDLFERDESGAYRHCGRED

The query sequence (length=394) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 5oe3:A 394 394 1.0000 1.0000 1.0000 0.0 5oe3:B, 5oe3:C, 5oe3:D, 5oe4:A, 5oe4:B, 5oe5:A, 5oe6:A, 5oe6:B, 5oe6:C, 5oe6:D
2 4wv3:B 518 381 0.3274 0.2490 0.3386 1.94e-52 4wv3:A
3 4rlf:B 519 399 0.3223 0.2447 0.3183 3.64e-43 6m2t:A, 6m2t:B, 6m2t:C, 6m2t:D, 6m2u:A, 6m2u:B, 4rlf:A, 4rlq:A, 4rlq:B, 4rm2:A, 4rm2:B, 4rm3:A, 4rm3:B, 4rmn:A, 4rmn:B, 4zjz:A, 4zjz:B
4 2p20:A 641 430 0.2792 0.1716 0.2558 2.38e-19 5jrh:A, 5jrh:B, 2p20:B, 2p2b:A, 2p2b:B, 2p2f:A, 2p2f:B, 2p2j:A, 2p2j:B, 2p2m:A, 2p2m:B, 2p2q:A, 2p2q:B, 1pg3:A, 1pg3:B, 1pg4:A, 1pg4:B
5 8yyr:A 496 404 0.2817 0.2238 0.2748 1.00e-18 7dq5:A, 7dq5:B, 7dq6:A, 7dq6:B, 6m01:A, 8yyq:A
6 8wev:A 486 390 0.2563 0.2078 0.2590 1.07e-18 8wev:B
7 3r44:A 502 353 0.2437 0.1912 0.2720 2.48e-17 5zrn:A, 5zrn:B
8 4gxq:A 506 373 0.2563 0.1996 0.2708 6.23e-16 4fut:A, 4gxq:B, 4gxq:C, 4gxr:A
9 3b7w:A 537 389 0.2589 0.1899 0.2622 3.79e-15 3c5e:A, 3day:A, 3eq6:A, 3eq6:B, 3gpc:A, 3gpc:B, 2vze:A, 2vze:B, 2vze:C, 2wd9:A, 2wd9:B, 2wd9:C
10 3nyq:A 460 331 0.2462 0.2109 0.2931 1.83e-14 3nyr:A
11 7mmz:A 559 441 0.2741 0.1932 0.2449 3.49e-14
12 6qjz:A 504 366 0.2234 0.1746 0.2404 5.41e-14
13 6ijb:B 538 383 0.2462 0.1803 0.2533 8.00e-14 6ihk:B
14 8rpl:B 630 432 0.2589 0.1619 0.2361 8.99e-14 8rpk:A, 8rpk:B, 8rpk:C, 8rpk:D, 8rpl:A, 8rpl:C, 8rpl:D
15 6e97:B 537 398 0.2690 0.1974 0.2663 3.54e-13 6e8o:A, 6e8o:B, 6e97:A
16 8g96:A 406 254 0.1701 0.1650 0.2638 7.84e-13 8g96:B, 8g97:A, 8g97:B, 8g98:A
17 7wew:A 481 373 0.2843 0.2328 0.3003 1.42e-12
18 8u2r:A 664 439 0.2589 0.1536 0.2323 1.63e-12 8sf3:A, 8u2s:A, 8u2s:B, 8u2t:A, 8u2u:A
19 5x8f:B 485 386 0.2157 0.1753 0.2202 5.67e-12 5buq:B, 5bur:A, 5bur:B, 5bus:A, 5bus:B, 5gtd:A, 5gtd:B, 5x8f:A, 5x8f:C, 5x8f:D, 5x8g:A, 5x8g:B, 5x8g:D, 5x8g:C
20 5ie2:A 506 360 0.2132 0.1660 0.2333 4.95e-11 5ie2:B, 5ie3:A, 5ie3:B
21 7kdn:A 622 439 0.2538 0.1608 0.2278 8.25e-11 7kdn:B, 7kdn:C, 7kdn:D, 7kdn:E, 7kdn:F
22 7en2:B 1410 412 0.2970 0.0830 0.2840 2.56e-10 7emy:A, 7emy:B, 7en1:A, 7en1:B, 7en2:A
23 1v26:B 510 428 0.2614 0.2020 0.2407 3.52e-10 1v25:A, 1v25:B, 1v26:A
24 6sq8:B 494 244 0.1701 0.1356 0.2746 3.59e-10 6h1b:A, 6h1b:B, 6h1b:C, 6h1b:D, 6h1b:E, 6sq8:A, 6sq8:C, 6sq8:D, 6sq8:E
25 5gxd:A 627 445 0.2766 0.1738 0.2449 9.10e-10
26 5u89:A 1039 381 0.2284 0.0866 0.2362 3.34e-09
27 7thq:B 505 369 0.2360 0.1842 0.2520 3.90e-09 6o6e:B, 7thq:A
28 8www:A 501 402 0.2716 0.2136 0.2662 4.16e-09 8www:B
29 5wm3:A 537 397 0.2665 0.1955 0.2645 4.20e-09 5wm2:A, 5wm4:A, 5wm5:A, 5wm6:A, 5wm7:A
30 6mfz:A 1789 408 0.2513 0.0553 0.2426 1.18e-08 5es7:A, 5es8:A, 5es8:B, 5es9:A, 6mfw:A, 6mfx:A, 6mfy:A, 6mg0:A, 6ulz:A
31 6mfz:A 1789 405 0.2284 0.0503 0.2222 0.015 5es7:A, 5es8:A, 5es8:B, 5es9:A, 6mfw:A, 6mfx:A, 6mfy:A, 6mg0:A, 6ulz:A
32 4ir7:A 508 369 0.2487 0.1929 0.2656 1.80e-08
33 6ulw:A 1193 388 0.2386 0.0788 0.2423 1.86e-08 6ulw:D, 6ulx:A, 6uly:A, 6uly:B
34 6mg0:B 1687 406 0.2462 0.0575 0.2389 2.85e-08
35 6mg0:B 1687 405 0.2284 0.0533 0.2222 0.015
36 8biq:A 562 138 0.1244 0.0872 0.3551 8.26e-08 8biq:B, 8biq:C, 8biq:D, 8bit:A, 8bit:B
37 5n9x:A 489 423 0.2843 0.2290 0.2648 9.17e-08 5n9x:B
38 3kxw:A 572 396 0.2284 0.1573 0.2273 1.00e-07 3lnv:A
39 2vsq:A 1273 414 0.2386 0.0738 0.2271 1.87e-07
40 8i22:A 530 251 0.1548 0.1151 0.2430 2.47e-07 8i22:F, 8i22:B, 8i22:C, 8i22:D, 8i22:E, 8i3i:A, 8i3i:D, 8i3i:B, 8i3i:C, 8i49:A, 8i49:D, 8i49:E, 8i49:F, 8i49:C, 8i49:B, 8i51:A, 8i51:B, 8i51:C, 8i51:D, 8i51:E, 8i51:F, 8i6m:A, 8i6m:F, 8i6m:D, 8i6m:C, 8i6m:B, 8i6m:E, 8i8d:A, 8i8d:B, 8i8d:C, 8i8d:D, 8i8d:E, 8i8d:F, 8i8e:F, 8i8e:D, 8i8e:A, 8i8e:B, 8i8e:C, 8i8e:E, 8jyl:A, 8jyl:B, 8jyl:C, 8jyl:D, 8jyl:E, 8jyl:F, 8jyu:A, 8jyu:D, 8jyu:B, 8jyu:C, 8jyu:E, 8jyu:F
41 6k4d:A 539 265 0.1574 0.1150 0.2340 3.70e-07 6k4c:A
42 8rwj:D 676 417 0.2411 0.1405 0.2278 6.27e-07 8rwj:I, 8rwj:A, 8rwj:B, 8rwj:C, 8rwj:E, 8rwj:F, 8rwj:G, 8rwj:H, 1ry2:A
43 3wv5:A 387 356 0.2081 0.2119 0.2303 6.67e-07 3wvn:A
44 7kvy:A 633 435 0.2360 0.1469 0.2138 7.28e-07 7kcp:A, 7kq6:A, 7kq6:B, 7kq6:C, 7kqz:A, 7l3p:A, 7l3q:A, 7l3q:B, 7l3q:C
45 6q2m:A 544 232 0.1548 0.1121 0.2629 7.97e-07 1ba3:A, 5dwv:A, 4e5d:A, 4g36:A, 4g36:B, 4g37:A, 4g37:B, 5gyz:A, 5gz2:A, 6hps:A, 6hps:B, 3ies:A, 5kyt:A, 5kyt:B, 5kyv:A, 5kyv:B, 6q2m:B, 6q2m:C, 3rix:A, 5wys:A
46 7l4g:B 668 257 0.1650 0.0973 0.2529 8.48e-07 9c8s:A, 9c8s:B, 9c8s:C, 8eps:A, 8eps:B, 8eps:C, 8g0r:A, 8g0r:B, 8g0r:C, 8g0s:A, 8g0s:B, 8g0s:C, 8g0t:A, 8g0t:B, 8g0t:C, 8g0u:A, 8g0u:B, 8g0v:A, 8g0v:B, 8g0v:C, 5ifi:A, 5ifi:B, 5ifi:C, 5k85:A, 5k85:B, 5k85:C, 5k8f:A, 5k8f:B, 5k8f:C, 7kno:A, 7kno:B, 7kno:C, 7knp:A, 7knp:B, 7knp:C, 7l4g:A, 7l4g:C, 5u29:A, 5u29:B, 5u29:C, 8v5g:A, 8v5g:B
47 7a9j:A 503 379 0.1980 0.1551 0.2058 1.49e-06 7a9i:A
48 3pbk:A 555 416 0.2589 0.1838 0.2452 1.57e-06 3pbk:B
49 4r0m:A 637 64 0.0635 0.0392 0.3906 1.71e-06 4r0m:B
50 7r27:B 398 409 0.2259 0.2236 0.2176 1.99e-06 7r27:A
51 8w0b:A 667 414 0.2411 0.1424 0.2295 2.10e-06 7kds:A, 8v4o:A, 8v4o:B, 8v4o:C, 8v4p:A, 8v4p:B, 8v4p:C, 8v4r:A, 8v4r:B, 8v4r:C, 8w0b:B, 8w0b:C, 8w0c:A, 8w0c:B, 8w0c:C, 8w0d:A, 8w0d:B, 8w0d:C, 8w0h:A, 8w0h:B, 8w0h:C, 8w0j:A, 8w0j:B, 8w0j:C, 8w0l:A, 8w0l:B, 8w0l:C, 8w0m:A, 8w0m:B, 8w0m:C
52 7tz4:A 530 71 0.0812 0.0604 0.4507 4.32e-06 7tyb:A
53 5ups:A 520 97 0.0787 0.0596 0.3196 5.52e-06 5upq:A, 5upq:B, 5ups:B, 5upt:A
54 7ywk:A 401 375 0.2132 0.2095 0.2240 5.90e-06 5n81:A, 5n81:B, 5n82:A, 7ywk:B
55 5bsm:A 530 358 0.1980 0.1472 0.2179 7.24e-06 5bsm:B, 5bsr:A, 5bst:A, 5bsu:A, 5bsv:A, 5bsw:A, 5bsw:B, 5u95:D, 5u95:B, 5u95:C
56 2d1r:A 539 235 0.1421 0.1039 0.2383 7.89e-06 2d1q:A, 2d1s:A, 2d1t:A
57 3dlp:X 504 399 0.2589 0.2024 0.2556 8.57e-06 3cw8:X, 3cw9:A, 3cw9:B, 2qvx:X, 2qvy:X, 2qvz:X, 2qw0:X, 1t5d:X, 1t5h:X
58 3vnq:A 497 385 0.2462 0.1952 0.2519 1.44e-05 3vnr:A, 3vns:A
59 1amu:A 509 377 0.2132 0.1650 0.2228 1.63e-05 1amu:B
60 7thn:B 478 267 0.1878 0.1548 0.2772 3.55e-05
61 3a9v:A 528 364 0.2234 0.1667 0.2418 3.88e-05 3ni2:A
62 5jjq:C 489 268 0.1904 0.1534 0.2799 4.09e-05 5jjq:A, 5jjq:B, 5jjq:D
63 8g0u:C 455 345 0.2005 0.1736 0.2290 5.27e-05
64 7r7e:A 567 372 0.2360 0.1640 0.2500 8.17e-05 7r7e:B, 7r7f:A, 7r7f:B, 7r7g:A, 7r7g:B
65 5c5h:B 448 251 0.1726 0.1518 0.2709 1.06e-04 5c5h:A, 6nj0:A
66 8hlk:A 910 403 0.2234 0.0967 0.2184 1.25e-04
67 5ja2:A 1238 407 0.2589 0.0824 0.2506 1.79e-04 5ja1:A, 5t3d:A
68 3rg2:C 613 383 0.2360 0.1517 0.2428 2.63e-04 6iyk:A, 6iyk:B, 6iyl:A, 6iyl:B, 4iz6:A, 4iz6:B, 8k5s:A, 8k5s:B, 8k5t:A, 8k5t:B, 3rg2:A, 3rg2:B, 3rg2:H, 3rg2:D, 3rg2:E, 3rg2:F, 3rg2:I, 3rg2:G, 3rg2:J
69 1md9:A 536 87 0.0736 0.0541 0.3333 3.10e-04 1mdb:A
70 7wua:A 603 115 0.0812 0.0531 0.2783 3.55e-04 7wua:B, 7wua:C, 7wua:D
71 8ppp:A 500 94 0.0812 0.0640 0.3404 3.62e-04 8ppp:B, 8pyx:A, 8pyx:B
72 3wv5:B 359 330 0.1929 0.2117 0.2303 4.21e-04 3wvn:B
73 4dg9:A 575 193 0.1193 0.0817 0.2435 0.001 4dg8:A
74 3u16:B 437 68 0.0584 0.0526 0.3382 0.002 3o82:A, 3o82:B, 3o83:A, 3o83:B, 3o84:A, 3o84:B, 3u16:A, 3u17:A, 3u17:B
75 3lgx:A 508 113 0.0761 0.0591 0.2655 0.002 3lgx:B, 3lgx:C, 3lgx:D
76 7kyd:A 534 154 0.0939 0.0693 0.2403 0.005
77 4zxh:A 1314 365 0.2157 0.0647 0.2329 0.008 4zxi:A
78 4gr5:C 457 370 0.2360 0.2035 0.2514 0.040 4gr5:A, 4gr5:B, 4gr5:D
79 8gic:A 392 370 0.2259 0.2270 0.2405 0.045 8gic:B, 8gkm:A, 8gkm:B
80 6ltb:A 928 267 0.1624 0.0690 0.2397 0.063 6ltc:A, 6ltd:A, 6ltd:B
81 3e7w:A 508 71 0.0609 0.0472 0.3380 0.072 3e7x:A
82 8iqu:A 545 87 0.0685 0.0495 0.3103 0.073 8hd4:A, 8hdf:A
83 8iqu:A 545 151 0.1015 0.0734 0.2649 6.5 8hd4:A, 8hdf:A
84 3fcc:A 500 388 0.2234 0.1760 0.2268 0.078 3dhv:A, 3fce:A
85 6akd:A 488 56 0.0584 0.0471 0.4107 0.090
86 6n8e:A 1332 373 0.2284 0.0676 0.2413 0.18
87 5wmm:A 870 366 0.2183 0.0989 0.2350 0.26
88 5jox:A 502 92 0.0635 0.0498 0.2717 0.33 5jox:B, 5joy:A, 5joy:B
89 5d6j:A 630 184 0.1142 0.0714 0.2446 0.36 5ey8:A, 5ey8:B, 5ey8:C, 5ey8:D, 5ey8:E, 5ey8:F, 5ey8:G, 5ey8:H, 5icr:A, 5icr:B, 5icr:C, 5icr:D
90 6vhy:C 540 79 0.0558 0.0407 0.2785 1.1 6vhv:A, 6vhw:A, 6vhw:B, 6vhx:A, 6vhx:B, 6vhy:D, 6vhy:A, 6vhy:B, 6vhz:A, 6vhz:B
91 2e50:P 186 23 0.0305 0.0645 0.5217 1.5 2e50:A, 2e50:Q
92 8u05:B 290 47 0.0431 0.0586 0.3617 1.8 8u05:A, 8u06:A, 8u06:B, 8u07:A, 8u07:B
93 6fhj:A 979 51 0.0406 0.0163 0.3137 2.4 6fhn:A
94 4wd1:A 646 416 0.2690 0.1641 0.2548 2.5
95 7xbt:A 487 254 0.1574 0.1273 0.2441 2.6 7xbu:A, 7xbv:A
96 6t4h:A 771 60 0.0508 0.0259 0.3333 3.3
97 8k4r:A 506 250 0.1675 0.1304 0.2640 3.8 8k4r:C
98 7m7f:A 1390 108 0.0838 0.0237 0.3056 4.3 2fr0:A, 2fr1:A, 7m7i:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218