BioLiP

>protein
STGFLVKQRAFLKLYMITMTEQERLYGLKLLEVLRSEFKEIGFKPNHTEVYRSLHELLDDGILKQIKVKKEGAKLQEVVL
YQFKDYEAAKLYKKQLKVELDRSKKLIEKALSDNF

The query sequence (length=115) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2dpd:B	117	115	1.0000	0.9829	1.0000	1.77e-78	2dpd:A, 2dpu:A, 2efw:A, 2efw:B, 2efw:F, 2efw:G, 1f4k:A, 1f4k:B
2	1q0d:A	117	53	0.1565	0.1538	0.3396	0.16	1q0d:B, 1q0d:C, 1q0d:D, 1q0d:E, 1q0d:F, 1q0d:G, 1q0d:H, 1q0d:I, 1q0d:J, 1q0d:K, 1q0d:L, 1q0f:A, 1q0f:B, 1q0f:C, 1q0f:D, 1q0f:E, 1q0f:F, 1q0f:G, 1q0f:H, 1q0f:I, 1q0f:J, 1q0f:K, 1q0f:L, 1q0g:A, 1q0g:B, 1q0g:C, 1q0g:D, 1q0g:E, 1q0g:F, 1q0g:G, 1q0g:H, 1q0g:I, 1q0g:J, 1q0g:K, 1q0g:L, 1q0k:A, 1q0k:B, 1q0k:C, 1q0k:D, 1q0k:E, 1q0k:F, 1q0k:G, 1q0k:I, 1q0k:H, 1q0k:J, 1q0k:K, 1q0k:L, 1q0m:A, 1q0m:B, 1q0m:C, 1q0m:D, 1q0m:E, 1q0m:F
3	3g4x:A	117	53	0.1652	0.1624	0.3585	0.25	3g4x:B, 3g4x:C, 3g4z:A, 3g4z:B, 3g4z:C, 3g50:A, 3g50:C, 1t6u:A, 1t6u:B, 1t6u:C, 1t6u:D, 1t6u:E, 1t6u:F, 1t6u:G, 1t6u:H, 1t6u:I, 1t6u:J, 1t6u:K, 1t6u:L
4	1ee9:A	317	34	0.1304	0.0473	0.4412	0.47
5	4u10:A	264	55	0.1304	0.0568	0.2727	0.53	4u10:B
6	7njn:C	536	44	0.1391	0.0299	0.3636	0.73	6foc:A, 6foc:B, 6foc:C, 8g08:B, 8g08:C, 8g08:A, 8g09:A, 8g09:B, 8g09:C, 8g0a:A, 8g0a:B, 8g0a:C, 8g0c:B, 8g0c:C, 8g0c:A, 8g0d:C, 8g0d:A, 8g0d:B, 8g0e:A, 8g0e:B, 8g0e:C, 7jg5:A, 7jg5:B, 7jg5:C, 7jga:A, 7jga:B, 7jga:C, 7njk:A, 7njk:B, 7njk:C, 7njl:A, 7njl:B, 7njl:C, 7njm:A, 7njm:B, 7njm:C, 7njn:A, 7njn:B, 7njo:A, 7njo:B, 7njo:C, 7njp:A, 7njp:B, 7njp:C, 7njq:A, 7njq:B, 7njq:C, 7njr:A, 7njr:B, 7njr:C, 7njs:A, 7njs:B, 7njs:C, 7nk7:A, 7nk7:B, 7nk7:C, 7nkh:A, 7nkh:B, 7nkh:C, 7nkj:A, 7nkj:B, 7nkj:C, 7y5a:A, 7y5a:B, 7y5a:C, 7y5b:A, 7y5b:B, 7y5b:C, 7y5c:A, 7y5c:B, 7y5c:C
7	5zi8:A	104	56	0.1304	0.1442	0.2679	0.96	7wh4:A, 7wh4:B, 5zhv:A, 5zhv:B, 5zi8:B
8	7byi:A	463	40	0.1043	0.0259	0.3000	1.4	8aql:A, 8aql:B, 8aql:C, 8aql:D, 9box:A, 9box:C, 9box:B, 9box:D, 7byi:B, 8fjt:A, 8fjt:B, 8fju:A, 8fju:B, 8gks:A, 8gks:B, 8gkt:A, 8gkt:B, 8gku:A, 8gku:B, 8gkw:A, 8gkw:B, 8gky:A, 8gky:B, 8gkz:A, 8gkz:B, 6m5o:A, 6m5o:B, 6qvg:A, 6qvg:B, 6qvl:A, 6qvl:B, 8t4o:A, 8t4o:B, 8t4p:A, 8t4p:B, 8tlc:A, 8tlc:B, 5v7i:A, 5v7i:B
9	2jg1:A	318	41	0.1391	0.0503	0.3902	1.9	2jg1:B, 2jg1:C, 2jg1:D, 2jgv:B, 2jgv:D
10	3wgv:B	303	34	0.1043	0.0396	0.3529	2.3	7d92:B, 7d93:D, 7d94:D, 7ddf:B, 7ddf:D, 7ddh:B, 7ddh:D, 7ddk:B, 7ddk:D, 7ddl:B, 7ddl:D, 7e1z:B, 7e20:B, 7e21:B, 4hqj:B, 4hqj:D, 4hyt:B, 4hyt:D, 8jbk:B, 8jbk:D, 8jbl:B, 8jbl:D, 8jbm:D, 3kdp:B, 3kdp:D, 4ret:B, 3wgv:D, 7wys:B, 7wys:D, 7wyt:D, 4xe5:B
11	5gtb:A	130	74	0.1913	0.1692	0.2973	3.4
12	3g5s:A	424	19	0.1043	0.0283	0.6316	5.5	3g5q:A, 3g5r:A
13	7rwa:M	379	62	0.1739	0.0528	0.3226	7.4	7rwa:m

[Back]