BioLiP

>protein
SSTHRKFGGSGGSPFSGSGLSSIAVRSGSYLDAIIIDGVHHGGSGGNLSPTFTFGSGEYISNMTIRSGDYIDNISFETNM
GRRFGPYGGSGGSANTLSNVKVIQINGSAGDYLDSLDIYYEQY

The query sequence (length=123) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3ll2:A	123	123	1.0000	1.0000	1.0000	1.89e-83	2guc:A, 2guc:B, 2gud:A, 2gud:B, 2hyq:A, 2hyq:B, 2hyr:A, 2hyr:B, 2nuo:A, 2nuo:B, 7ria:A, 7ria:B, 7rib:A, 7rib:B, 7rib:C, 7rkg:A, 7rkg:B, 7rki:A, 7rki:B
2	1zgs:A	442	139	0.3252	0.0905	0.2878	8.89e-07	4mq0:A, 1zgs:B
3	1zgs:A	442	137	0.3415	0.0950	0.3066	3.96e-04	4mq0:A, 1zgs:B
4	1zgs:A	442	82	0.2195	0.0611	0.3293	0.027	4mq0:A, 1zgs:B
5	1zgs:A	442	144	0.3252	0.0905	0.2778	1.0	4mq0:A, 1zgs:B
6	1j4u:A	149	51	0.1545	0.1275	0.3725	8.11e-04	1j4u:B, 1j4u:C, 1j4u:D, 1vbo:A, 1vbo:B, 1vbo:C, 1vbo:E, 1vbo:G, 1vbo:H, 1vbo:D, 1vbo:F, 1vbp:A, 1vbp:B
7	5m6o:A	150	51	0.1545	0.1267	0.3725	8.60e-04	5m6o:B, 5m6o:C, 5m6o:D, 5tqz:A, 5tqz:B, 5tqz:C, 5tqz:D
8	5yrf:B	142	45	0.1138	0.0986	0.3111	0.054	5yrf:A, 5yrg:A, 5yrg:B, 5yri:B, 5yri:A, 5yrj:A, 5yrj:B, 5yrl:A, 5yrl:B, 5yrm:B
9	4pit:B	144	119	0.2520	0.2153	0.2605	0.087	2bmz:A, 2bmz:B, 2bn0:A, 2bn0:B, 8hyf:A, 3mit:A, 3mit:B, 3miu:A, 3miu:B, 3miv:B, 4pik:B, 4pik:C, 4pik:D, 4pik:A, 4pit:A, 4pit:C, 4pit:D, 1x1v:A, 1x1v:B
10	4ddn:A	154	55	0.1382	0.1104	0.3091	0.54	4ddn:B, 4ddn:C, 4ddn:D, 3r51:A, 3r52:A, 3r52:B, 3r52:C, 3r52:D
11	2on5:A	206	43	0.1138	0.0680	0.3256	1.2	2on5:B, 2on5:C, 2on5:D, 2on5:E, 2on5:F, 2on5:G, 2on5:H
12	8ro4:A	339	56	0.1789	0.0649	0.3929	1.8	8ro4:C, 8ro4:D, 8ro4:B, 8ro4:E, 8ro4:F
13	2xq1:B	494	59	0.1463	0.0364	0.3051	1.8	2xq1:C, 2xq1:D, 2xq1:E, 2xq1:F, 2xq1:G, 2xq1:H, 2xq1:I, 2xq1:J, 2xq1:K, 2xq1:L, 2xq1:M, 2xq1:N, 2xq1:O, 2xq1:P
14	5z1x:A	495	48	0.1463	0.0364	0.3750	3.2	5z1x:B, 5z22:A
15	6rjn:A	502	59	0.1382	0.0339	0.2881	5.0	6rjn:B, 6rjn:C, 6rjn:D
16	3gd7:A	378	49	0.1301	0.0423	0.3265	5.9	3gd7:B, 3gd7:C, 3gd7:D, 6uk1:A, 6uk1:B, 6uk1:C, 6uk1:D
17	8v7z:A	1104	49	0.1301	0.0145	0.3265	6.6
18	5uak:A	1139	49	0.1301	0.0140	0.3265	6.6	2bbs:B, 7svr:A, 8v81:A
19	6msm:A	1181	49	0.1301	0.0135	0.3265	6.6	8eig:A, 8eio:A, 8eiq:A, 8fzq:A, 6gjq:A, 6gjq:C, 6gjq:E, 6gjq:G, 6gjs:A, 6gk4:A, 6gk4:D, 6gkd:A, 6gkd:L, 6gkd:F, 6gkd:I, 6gkd:O, 6gkd:R, 8gls:A, 6o1v:A, 6o2p:A, 2pze:A, 2pze:B, 2pzf:A, 2pzf:B, 2pzg:A, 2pzg:B, 7sv7:A, 7svd:A, 5tf7:A, 5tf8:A, 5tfa:A, 5tfb:A, 5tfc:A, 5tfd:A, 5tff:A, 5tfg:A, 5tfi:A, 5tfj:A, 5tgk:A, 8ubr:A, 6wbs:A, 6wbs:B, 6ze1:A

[Back]