Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SSSIKVLKGLDAVRKRPGMYIGDTDDGTGLHHMVFEVVDNAIDEALAGHCKEIIVTIHADNSVSVQDDGRGIPTGIHPEE
GVSAAEVIMTVLHGLHGVGVSVVNALSQKLELVIQREGKIHRQIYEHGVPQAPLAVTGETEKTGTMVRFWPSLETFTNVT
EFEYEILAKRLRELSFLNSGVSIRLRDKRDGKEDHFHY

The query sequence (length=198) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 9gbv:B 782 196 0.9697 0.2455 0.9796 1.22e-133 1aj6:A, 7c7n:A, 7c7o:A, 7dor:A, 7dor:B, 7dpr:A, 7dpr:B, 7dps:A, 7dps:B, 7dqf:A, 7dqf:B, 7dqh:A, 7dqh:B, 7dqi:A, 7dqi:B, 7dqj:A, 7dqj:B, 7dql:A, 7dql:B, 7dqm:A, 7dqm:B, 7dqs:A, 7dqs:B, 7dqu:A, 7dqu:B, 7dqw:A, 7dqw:B, 4duh:A, 4duh:B, 1ei1:A, 1ei1:B, 6eng:A, 6eng:B, 6f86:A, 6f8j:A, 6f94:A, 6f96:A, 3g7e:A, 9gbv:D, 9ggq:D, 9ggq:B, 4hyp:A, 4hyp:B, 4hyp:C, 4hyp:D, 6j90:A, 4kfg:A, 4kfg:B, 1kzn:A, 6kzv:A, 6kzx:A, 6kzz:A, 6l01:A, 5l3j:A, 5mmn:A, 5mmo:A, 5mmp:A, 7p2m:A, 7p2n:A, 7p2w:A, 7p2x:A, 4prv:A, 4prx:A, 4pu9:A, 8qdx:B, 8qdx:D, 8qqi:D, 8qqi:B, 8qqs:B, 8qqs:D, 8qqu:D, 6rku:D, 6rku:B, 6rkv:D, 6rkv:B, 6rkw:D, 6rkw:B, 4wub:A, 4wuc:A, 4wud:A, 4xtj:A, 6yd9:A, 5z4h:A, 5z4h:B, 5z4o:A, 5z4o:B, 5z9b:A, 5z9b:B, 5z9e:A, 5z9e:B, 5z9f:A, 5z9f:B, 5z9l:A, 5z9l:B, 5z9m:A, 5z9m:B, 5z9n:A, 5z9q:A, 5z9q:B, 7z9c:D, 7z9c:B, 7z9g:D, 7z9g:B, 7z9k:B, 7z9k:D, 7z9m:B, 7z9m:D, 4zvi:A, 5zxm:A, 5zxm:B
2 7pqi:A 198 197 0.7424 0.7424 0.7462 1.03e-98 7pql:A, 7pql:B, 7pqm:A, 7pqm:B
3 7ptf:A 212 211 0.7323 0.6840 0.6872 3.14e-97 8bn6:A, 6m1j:A, 6m1j:B, 6m1s:A, 6m1s:B, 7ptf:B, 7ptf:C, 7ptg:B
4 7ptg:A 183 190 0.6667 0.7213 0.6947 2.84e-89
5 4urm:B 195 194 0.5354 0.5436 0.5464 9.01e-67 5cph:A, 5cph:B, 5ctu:A, 5ctu:B, 5ctw:A, 5ctw:B, 5ctx:B, 5cty:B, 5d6p:A, 5d6p:B, 5d6q:B, 5d7c:A, 5d7c:B, 5d7d:A, 5d7d:B, 5d7r:A, 5d7r:B, 3g75:A, 3g75:B, 3g7b:A, 3g7b:B, 4p8o:A, 4p8o:B, 6tck:A, 6tck:B, 3ttz:A, 3ttz:B, 6ttg:A, 6ttg:B, 3u2d:A, 3u2d:B, 3u2k:A, 3u2k:B, 4urm:A, 4urm:C, 4urm:D, 4uro:A, 4uro:B, 4uro:C, 4uro:D, 5z9p:A, 5z9p:B
6 4gee:A 193 192 0.5101 0.5233 0.5260 4.55e-62 4gfn:A, 4ggl:A, 4hxw:A, 4k4o:A, 4ksg:A, 4ksh:A, 4ktn:A
7 6y8o:A 188 196 0.5152 0.5426 0.5204 7.30e-62 4b6c:A, 4b6c:B, 6y8o:B
8 6zt3:A 394 212 0.5354 0.2690 0.5000 4.83e-61 4bae:A, 4bae:B, 4bae:C, 4bae:D
9 6y8l:A 184 192 0.5051 0.5435 0.5208 2.49e-59 6y8l:B, 6y8n:A, 6y8n:B
10 4hz5:A 191 194 0.5455 0.5654 0.5567 3.24e-59 4hz5:B, 4hz5:C, 4hz5:D, 4hz5:E, 4hz5:F, 4hz5:G, 4hz5:J
11 5j5p:A 397 213 0.5354 0.2670 0.4977 7.58e-58 5boc:A, 5bod:A, 4em7:A, 4emv:A, 5j5p:B, 5j5q:B, 5j5q:A, 5j5q:C, 5j5q:D, 4lp0:A, 4lpb:A, 4mb9:A, 4mbc:A, 4mot:A, 5yig:A, 5yig:B
12 3zm7:A 359 196 0.4949 0.2730 0.5000 7.62e-57 3zm7:B, 3zm7:C, 3zm7:D, 3zm7:E, 3zm7:F
13 3zkb:D 392 203 0.4949 0.2500 0.4828 1.72e-56 3zkb:A, 3zkb:B, 3zkb:C, 3zkb:E, 3zkb:F, 3zkb:G, 3zkb:H, 3zkb:I, 3zkb:J, 3zkb:K, 3zkb:L, 3zkb:M, 3zkb:N, 3zkb:O, 3zkb:P, 3zkd:A, 3zkd:B, 3zkd:C, 3zkd:D, 3zkd:E, 3zkd:F, 3zkd:G, 3zkd:H
14 4url:A 364 194 0.5152 0.2802 0.5258 2.35e-55 4url:B, 4urn:A, 4urn:B, 4urn:C
15 1kij:A 384 210 0.4899 0.2526 0.4619 5.85e-51 6enh:A, 1kij:B
16 7cmp:A 374 214 0.4697 0.2487 0.4346 1.21e-50 7cmp:B, 7cmp:C, 7cmp:D, 3lps:A
17 1s16:A 380 214 0.4697 0.2447 0.4346 1.74e-49 4hz0:A, 4hz0:B, 1s16:B
18 6gau:A 1088 179 0.4394 0.0800 0.4860 9.66e-46 5bs8:A, 5bs8:B, 5bs8:C, 5bs8:D, 5bta:A, 5bta:B, 5bta:C, 5bta:D, 5btc:A, 5btc:B, 5btc:C, 5btc:D, 5btd:A, 5btd:B, 5btd:C, 5btd:D, 5btf:A, 5btf:B, 5btf:C, 5btf:D, 5btg:A, 5btg:B, 5btg:C, 5btg:D, 5bti:A, 5bti:B, 5bti:C, 5bti:D, 5btl:A, 5btl:B, 5btl:C, 5btl:D, 5btn:A, 5btn:B, 5btn:C, 5btn:D, 9foy:A, 9foy:B, 6gau:B, 7ugw:A, 7ugw:B, 7ugw:C, 7ugw:D
19 3fv5:B 181 192 0.4242 0.4641 0.4375 1.97e-45 3fv5:A, 1s14:A, 1s14:B
20 4hxz:A 366 202 0.4040 0.2186 0.3960 1.93e-44 4hxz:B, 4hy1:A, 4hy1:B, 4hym:A, 4kqv:A, 4kqv:B
21 4i3h:A 1037 194 0.4545 0.0868 0.4639 3.65e-40 3foe:D, 3foe:C, 3fof:C, 3fof:D, 4i3h:B, 4juo:A, 4juo:C, 3k9f:A, 3k9f:C, 3k9f:D, 3k9f:B, 4koe:A, 4koe:C, 4koe:D, 4koe:B, 4kpe:A, 4kpe:C, 4kpe:D, 4kpe:B, 4kpf:A, 4kpf:C, 4kpf:D, 4kpf:B, 3ksa:A, 3ksa:C, 3ksa:D, 3ksa:B, 3ksb:A, 3ksb:B, 3ksb:C, 3ksb:D, 3ltn:A, 3ltn:C, 3ltn:D, 3ltn:B, 3rad:A, 3rad:C, 3rad:D, 3rad:B, 3rae:A, 3rae:C, 3rae:D, 3rae:B, 3raf:A, 3raf:C, 3raf:D, 3raf:B, 4z3o:B, 4z3o:A, 4z4q:A, 4z4q:B, 4z53:A, 4z53:B
22 8yon:C 605 235 0.2879 0.0942 0.2426 5.57e-09 9imj:A, 8ylu:C, 8ylu:D, 8yo1:C, 8yo1:D, 8yo7:D, 8yo7:C, 8yod:C, 8yod:D, 8yon:D
23 4gfh:A 1102 223 0.2879 0.0517 0.2556 1.01e-06 4gfh:F, 3l4j:A, 3l4k:A, 1pvg:A, 1pvg:B, 1qzr:A, 1qzr:B, 2rgr:A
24 7l6s:A 396 207 0.2525 0.1263 0.2415 1.45e-05
25 4r3a:B 278 65 0.1061 0.0755 0.3231 0.046
26 6zy7:B 1160 171 0.2121 0.0362 0.2456 0.056 4fm9:A, 5gwk:A, 5gwk:B, 4r1f:B, 4r1f:C, 4r1f:D, 1zxm:A, 1zxm:B, 1zxn:B, 1zxn:C, 1zxn:D, 6zy5:B, 6zy5:A, 6zy6:A, 6zy6:B, 6zy7:A, 6zy8:A, 6zy8:B
27 4r1f:A 366 187 0.2273 0.1230 0.2406 0.086 1zxn:A
28 5v69:A 322 52 0.0909 0.0559 0.3462 0.10 6bi8:A, 6bi8:B, 5ko3:A, 4p16:A, 4pt5:A, 4r3d:B, 4r3d:A, 4rez:A, 4rf0:A, 4rf1:A, 4rna:A, 5v6a:A, 5w8t:A, 5w8t:C, 5w8u:A, 5w8u:C, 4wur:A
29 4r3a:A 318 69 0.1061 0.0660 0.3043 0.12 4r38:A, 4r38:B, 4r38:C, 4r38:D, 4r39:A, 4r39:B, 4r39:C, 4r39:D
30 7qfo:A 379 208 0.2323 0.1214 0.2212 0.38 7qfn:A, 7zbg:A
31 2q8g:A 368 75 0.1212 0.0652 0.3200 0.50 2q8h:A
32 7ebg:A 337 50 0.0859 0.0504 0.3400 0.79 2zdx:A
33 7lub:B 462 105 0.1364 0.0584 0.2571 0.87 7lub:A
34 5nq5:A 191 54 0.1010 0.1047 0.3704 2.0 5nr7:A, 5nr7:B, 5nrn:A, 5nrq:B, 4unn:A, 4unn:B, 4unp:A, 4unq:A, 4unq:B, 4unr:A, 4unr:B, 4uns:A, 4uns:B
35 3cgy:A 133 81 0.1263 0.1880 0.3086 2.3 3cgy:B, 3cgy:C
36 5nrn:B 211 54 0.1010 0.0948 0.3704 2.6 1g3u:A, 1gsi:A, 1gtv:A, 1gtv:B, 1mrn:A, 1mrs:A, 1n5i:A, 1n5j:A, 1n5k:A, 1n5k:B, 1n5l:A, 1n5l:B, 5nrq:A, 1w2g:A, 1w2g:B, 1w2h:A, 1w2h:B, 6yt1:A, 6yt1:B
37 7lxd:A 1190 69 0.0960 0.0160 0.2754 2.9 6v8p:A
38 5j71:A 338 52 0.0758 0.0444 0.2885 3.8
39 1tv2:A 457 94 0.1162 0.0503 0.2447 4.2 1tv3:A, 1tv4:A
40 4iwh:A 358 74 0.1061 0.0587 0.2838 4.4 4iwh:B, 4xxv:A, 4xxv:B
41 3d2r:B 362 56 0.0960 0.0525 0.3393 4.5 3d2r:A, 2e0a:A, 2e0a:B, 7eat:A, 7eat:B, 7ebb:A, 7ebb:B, 7ebg:B, 2zdx:B, 2zdy:A, 2zdy:B, 2zkj:A, 2zkj:B
42 5jp2:A 272 53 0.0758 0.0551 0.2830 4.6 5jp2:B
43 3crl:B 383 52 0.0758 0.0392 0.2885 5.5 2bu2:A, 2bu5:A, 2bu6:A, 2bu7:A, 2bu8:A, 3crk:A, 3crk:B, 3crl:A, 7ea0:A, 7eas:A, 7ebh:A, 5j6a:A, 1jm6:A, 1jm6:B, 6lil:A, 6lil:B, 6lin:A, 6lin:B, 6lin:C, 6lin:D, 6lio:A, 6lio:B, 5m4k:A, 5m4m:A, 5m4n:A, 5m4p:A, 4mp2:A, 4mp7:A, 4mpc:A, 4mpe:A, 4mpn:A, 6tmp:AAA, 6tmq:AAA, 6tmz:AAA, 6tn0:AAA, 6tn2:AAA, 4v25:A, 4v26:A, 7vbu:A, 7vbv:A, 7vbv:B, 7vbx:A, 8zm1:A, 8zm2:A
44 6ddt:A 862 72 0.0909 0.0209 0.2500 6.8 6ddu:A
45 6pcb:A 403 88 0.1212 0.0596 0.2727 7.5 6pcb:B, 6pcb:C, 6pcb:D, 6pcc:A, 6pcc:B, 6pcc:C, 6pcc:D, 6pcd:A, 6pcd:B, 6pcd:D
46 8fkp:NO 305 65 0.1111 0.0721 0.3385 7.8 8fkr:NO, 8fkt:NO, 8fkv:NO
47 3hpe:A 164 47 0.0859 0.1037 0.3617 9.0 3hpe:B
48 2eis:A 121 58 0.0909 0.1488 0.3103 9.9 2eis:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218