Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SSPGIWQLDCTHLEGKVILVAVHVASGYIEAEVIPAETGQETAYFLLKLAGRWPVKTIHTDNGSNFTSATVKAACDWAGI
KQEDGIPYNPESMNKELKKIIGQVRDQAEHLKTAVQMAVFIHNKKRYSAGERIVDIIATD

The query sequence (length=140) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6u8q:A 270 151 0.9571 0.4963 0.8874 2.44e-90 8a1p:B, 8a1p:C, 8a1p:D, 8a1p:A, 8a1q:B, 8a1q:D, 4ah9:A, 4ah9:B, 4ahr:A, 4ahr:B, 4ahs:A, 4ahs:B, 4aht:A, 4aht:B, 4ahu:A, 4ahu:B, 4ahv:A, 4ahv:B, 3ao1:A, 3ao1:B, 3ao2:A, 3ao2:B, 3ao3:A, 3ao3:B, 3ao4:A, 3ao4:B, 3ao5:A, 3ao5:B, 3av9:A, 3av9:B, 3ava:A, 3ava:B, 3avb:A, 3avb:B, 3avc:A, 3avc:B, 3avf:A, 3avf:B, 3avg:A, 3avg:B, 3avh:B, 3avh:A, 3avi:A, 3avi:B, 3avj:A, 3avj:B, 3avk:A, 3avk:B, 3avl:A, 3avl:B, 3avm:A, 3avm:B, 3avn:A, 3avn:B, 1biu:B, 1biu:C, 1biz:A, 1biz:B, 1bl3:A, 1bl3:B, 1bl3:C, 8buv:B, 8buv:D, 8bv2:A, 9c9m:A, 9c9m:D, 9c9m:I, 9c9m:M, 8cbr:A, 8cbr:B, 8cbr:D, 8cbr:C, 8cbs:B, 8cbs:C, 8cbs:D, 8cbs:A, 8cbt:A, 8cbt:B, 8cbt:D, 8cbt:C, 8cbu:B, 8cbu:C, 8cbu:D, 8cbu:A, 8cbv:A, 8cbv:B, 8cbv:D, 8cbv:C, 4ce9:A, 4ce9:B, 4cea:A, 4cea:B, 4ceb:A, 4ceb:B, 4cec:A, 4cec:B, 4ced:A, 4ced:B, 4cee:A, 4cee:B, 4cef:A, 4cef:B, 4ceo:A, 4ceo:B, 4ceq:A, 4ceq:B, 4cer:A, 4cer:B, 4ces:A, 4ces:B, 4cez:A, 4cez:B, 4cf0:A, 4cf0:B, 4cf1:A, 4cf1:B, 4cf2:A, 4cf2:B, 4cf8:A, 4cf8:B, 4cf9:A, 4cf9:B, 4cfa:A, 4cfa:B, 4cfb:A, 4cfb:B, 4cfc:A, 4cfc:B, 4cfd:A, 4cfd:B, 4cgd:A, 4cgd:B, 4cgf:A, 4cgf:B, 4cgg:A, 4cgg:B, 4cgh:A, 4cgh:B, 4cgi:A, 4cgi:B, 4cgj:A, 4cgj:B, 4chn:A, 4chn:B, 4cho:A, 4cho:B, 4chp:A, 4chp:B, 4chq:A, 4chq:B, 4chy:A, 4chy:B, 4chz:A, 4chz:B, 4cie:A, 4cie:B, 4cif:A, 4cif:B, 4cig:A, 4cig:B, 4cj3:A, 4cj3:B, 4cj4:A, 4cj4:B, 4cj5:A, 4cj5:B, 4cje:A, 4cje:B, 4cjf:A, 4cjf:B, 4cjk:A, 4cjk:B, 4cjl:A, 4cjp:A, 4cjp:B, 4cjq:A, 4cjq:B, 4cjr:A, 4cjr:B, 4cjs:A, 4cjs:B, 4cjt:A, 4cjt:B, 4cju:A, 4cju:B, 4cjv:A, 4cjv:B, 4cjw:A, 4cjw:B, 4ck1:A, 4ck1:B, 4ck2:A, 4ck2:B, 4ck3:A, 4ck3:B, 8ct7:A, 8cta:A, 8cta:B, 8cta:D, 8cta:E, 8cta:F, 8cta:H, 8cta:G, 8cta:I, 8cta:J, 8cta:L, 8cta:K, 8cta:M, 8cta:N, 8cta:P, 8cta:O, 8d3s:A, 7d83:A, 4dmn:A, 4e1m:A, 4e1n:A, 6eb1:A, 6ex9:A, 8fn7:A, 8fn7:D, 8fn7:G, 8fn7:J, 8fnd:A, 8fnd:D, 8fnd:G, 8fnd:J, 8fng:A, 8fng:D, 8fng:G, 8fng:J, 8fnh:A, 8fnh:D, 8fnh:G, 8fnh:J, 8fnj:A, 8fnj:D, 8fnj:G, 8fnj:J, 8fnl:A, 8fnl:D, 8fnl:G, 8fnl:J, 8fnm:A, 8fnm:D, 8fnm:G, 8fnm:J, 8fnn:A, 8fnn:D, 8fnn:G, 8fnn:J, 8fno:A, 8fno:D, 8fno:G, 8fno:J, 8fnp:A, 8fnp:D, 8fnp:G, 8fnp:J, 8fnq:A, 8fnq:D, 8fnq:G, 8fnq:J, 4gvm:A, 4gw6:A, 5hot:A, 5hot:B, 5hrn:A, 5hrp:A, 5hrr:A, 5hrs:A, 1hyv:A, 4id1:A, 4jlh:A, 1k6y:A, 1k6y:B, 1k6y:C, 7ke0:A, 5kgw:A, 5kgx:A, 5krs:A, 5krt:A, 7l1p:A, 7l1p:B, 7l23:A, 7l2y:AAA, 3l3v:B, 3l3v:A, 4lh4:A, 4lh5:A, 6lmi:A, 6lmq:A, 3lpt:A, 3lpu:A, 7lqp:A, 7lqp:B, 6ncj:A, 3nf6:A, 3nf6:B, 3nf7:A, 3nf7:B, 3nf8:A, 3nf8:B, 3nf9:A, 3nf9:B, 3nfa:A, 3nfa:B, 6nuj:A, 4nyf:A, 4nyf:B, 4o0j:A, 4o55:A, 4o5b:A, 5oi2:A, 5oi5:A, 4ojr:A, 3ovn:B, 3ovn:A, 4ovl:A, 4ovl:B, 6put:A, 6put:C, 6put:D, 6puw:A, 6puw:C, 6puw:D, 6puy:A, 6puy:D, 6puz:A, 6puz:D, 1qs4:A, 1qs4:B, 1qs4:C, 7rq0:A, 7rq0:B, 8s9q:A, 7sia:A, 7sia:B, 8t5b:A, 8t5b:B, 7t9h:A, 7t9h:B, 7t9o:A, 4tsx:A, 5u1c:A, 5u1c:C, 7u2u:A, 6u8q:C, 7ue1:A, 7ue1:B, 6um8:A, 6um8:B, 7uoq:A, 6v3k:A, 6v3k:D, 6vdk:A, 6vdk:C, 6vdk:M, 6vdk:P, 6vka:A, 6vka:B, 6vlh:A, 6vlh:B, 6vlm:A, 6vlm:B, 3vq4:A, 3vq4:B, 3vq5:A, 3vq5:B, 3vq6:A, 3vq7:A, 3vq7:B, 3vq8:A, 3vq8:B, 3vq9:A, 3vqa:A, 3vqa:B, 3vqb:A, 3vqb:B, 3vqc:A, 3vqd:A, 3vqe:A, 3vqe:B, 3vqp:A, 3vqp:B, 3vqq:A, 3vqq:B, 6vqs:A, 6vx2:A, 6w0u:A, 8w09:A, 8w09:D, 8w09:I, 8w09:M, 8w2r:A, 8w2r:C, 8w2r:D, 8w2r:I, 8w2r:M, 8w2r:L, 8w34:A, 8w34:C, 8w34:D, 8w34:I, 8w34:M, 8w34:L, 6w42:A, 6wc8:A, 7wce:A, 6we7:A, 1wja:A, 1wja:B, 1wjb:A, 1wjb:B, 1wjc:A, 1wjc:B, 1wjd:A, 1wjd:B, 1wje:A, 1wje:B, 1wjf:A, 1wjf:B, 3wne:A, 3wnf:B, 3wng:B, 3wng:A, 3wnh:A, 3wnh:B, 4y1c:B, 4y1d:A, 4y1d:B, 3zcm:A, 3zcm:B, 8zh4:A, 8zha:A, 3zso:A, 3zso:B, 3zsq:A, 3zsq:B, 3zsr:A, 3zsr:B, 3zsv:A, 3zsv:B, 3zsw:A, 3zsw:B, 3zsx:A, 3zsx:B, 3zsy:A, 3zsy:B, 3zsz:A, 3zsz:B, 3zt0:A, 3zt0:B, 3zt1:A, 3zt1:B, 3zt2:A, 3zt2:B, 3zt3:A, 3zt3:B, 3zt4:A, 3zt4:B
2 6puy:B 242 145 0.9214 0.5331 0.8897 2.20e-86 6eb2:A, 1k6y:D, 5oi3:A, 5oi8:A, 5oia:A, 6put:B, 6puw:B, 6puz:B, 8t52:A, 8t5a:A, 6u8q:M, 6u8q:P, 6v3k:B, 6vrg:A, 6vrg:B, 6vrg:C, 6vrg:D, 3wne:B, 3wnf:A
3 5u1c:D 172 136 0.8357 0.6802 0.8603 6.40e-79 5u1c:B
4 6rwl:A 270 152 0.7500 0.3889 0.6908 1.45e-70 6rwl:I, 6rwl:N, 6rwl:F, 6rwl:M, 6rwl:E, 6rwm:A, 6rwm:I, 6rwm:N, 6rwm:F, 6rwm:M, 6rwm:E, 6rwn:N, 6rwn:I, 6rwn:F, 6rwn:A, 6rwn:E, 6rwn:M, 6rwo:N, 6rwo:L, 6rwo:I, 6rwo:A, 6rwo:F, 6rwo:D, 6rwo:E, 6rwo:M
5 6rwl:B 252 146 0.7214 0.4008 0.6918 2.74e-66 6rwl:C, 6rwl:J, 6rwl:K, 6rwm:B, 6rwm:C, 6rwm:J, 6rwm:K, 6rwn:K, 6rwn:J, 6rwn:C, 6rwn:B, 6rwo:K, 6rwo:J, 6rwo:C, 6rwo:B
6 3f9k:A 204 149 0.5786 0.3971 0.5436 2.43e-53 1e0e:A, 1e0e:B, 3f9k:B, 3f9k:E, 3f9k:F, 3f9k:I, 3f9k:J, 3f9k:M, 3f9k:N, 3f9k:Q, 3f9k:R, 3f9k:U, 3f9k:V, 3f9k:Y, 3f9k:Z, 3f9k:c, 3f9k:d, 3f9k:g, 3f9k:h, 3f9k:k, 3f9k:l, 3f9k:o, 3f9k:p, 3f9k:s, 3f9k:t
7 7z1z:D 252 87 0.2500 0.1389 0.4023 9.09e-16 7z1z:L
8 5m0r:A 276 87 0.2500 0.1268 0.4023 1.37e-15 3hpg:A, 3hpg:B, 3hpg:C, 3hpg:D, 3hpg:E, 3hpg:F, 3hph:A, 3hph:B, 3hph:C, 3hph:D, 5m0r:D, 5m0r:I, 5m0r:L, 5m0r:N, 5m0r:E, 5m0r:F, 5m0r:M, 7u32:I, 7u32:N, 7u32:A, 7u32:F, 7u32:B, 7u32:C, 7u32:E, 7u32:G, 7u32:J, 7u32:K, 7u32:M, 7u32:O, 7z1z:A, 7z1z:I, 7z1z:N, 7z1z:F, 7z1z:B, 7z1z:C, 7z1z:E, 7z1z:G, 7z1z:J, 7z1z:K, 7z1z:M, 7z1z:O, 7zpp:A, 7zpp:I
9 7ouf:E 278 95 0.2500 0.1259 0.3684 8.86e-07 7ouf:B, 7oug:E, 7oug:B, 7ouh:E, 7ouh:B, 7pel:B, 7pel:E
10 6voy:A 276 93 0.2357 0.1196 0.3548 8.36e-06 6voy:C, 6voy:B, 6voy:D
11 7usf:A 265 92 0.2071 0.1094 0.3152 2.53e-04 5cz2:A, 5cz2:B, 5cz2:C, 5cz2:D, 5cz2:E, 5cz2:G, 5cz2:H, 5cz2:I, 5cz2:J, 5cz2:K, 5cz2:L, 3jca:A, 3jca:D, 3jca:E, 3jca:G, 3jca:C, 3jca:H, 3jca:B, 3jca:F, 7usf:B, 7ut1:a, 7ut1:d, 7ut1:e, 7ut1:A, 7ut1:D, 7ut1:E, 7ut1:C
12 7ouf:A 258 104 0.2500 0.1357 0.3365 6.72e-04 7ouf:D, 7oug:D, 7oug:A, 7ouh:D, 7ouh:A, 7pel:D, 7pel:A
13 4bac:A 368 55 0.1286 0.0489 0.3273 0.008 7adu:A, 7adv:A, 7adv:B, 4bac:B, 4bdy:A, 4bdz:A, 4be0:A, 4be1:A, 4be1:B, 4be2:A, 4be2:B, 3dlr:A, 4e7h:A, 4e7i:A, 4e7i:B, 4e7j:A, 4e7k:A, 4e7k:B, 4e7l:A, 4e7l:B, 5frm:A, 5frn:A, 5fro:A, 5fro:B, 4ikf:A, 3l2q:A, 3l2r:A, 3l2r:B, 3l2u:A, 3l2u:B, 3l2v:A, 3l2v:B, 3l2w:A, 3l2w:B, 5mma:A, 5mma:B, 5mmb:A, 5mmb:B, 5no1:A, 5no1:B, 3os0:A, 3os0:B, 3os1:A, 3os1:B, 3os2:A, 3oy9:A, 3oy9:B, 3oya:A, 3oya:B, 3oyb:A, 3oyb:B, 3oyc:A, 3oyd:A, 3oyd:B, 3oye:A, 3oye:B, 3oyf:A, 3oyf:B, 3oyg:A, 3oyg:B, 3oyh:A, 3oyh:B, 3oyi:A, 3oyi:B, 3oyj:A, 3oyj:B, 3oyk:A, 3oyk:B, 3oyl:A, 3oyl:B, 3oym:A, 3oym:B, 3oyn:A, 6rny:K, 6rny:O, 3s3m:A, 3s3n:A, 3s3o:A, 5uop:A, 5uoq:A, 2x6n:A, 2x6n:B, 2x6n:C, 2x6n:D, 2x6n:E, 2x6n:F, 2x6s:A, 2x6s:B, 2x6s:C, 2x6s:D, 2x6s:E, 2x6s:F, 4ztf:A, 4ztj:A
14 1u3e:M 174 79 0.1714 0.1379 0.3038 0.16
15 6qbt:A 148 86 0.2143 0.2027 0.3488 0.26 6qbv:B, 6qbv:C, 6qbv:D, 6qbw:A
16 8e14:A 269 52 0.1500 0.0781 0.4038 0.26 1a5v:A, 1a5w:A, 1a5x:A, 8e14:E, 8e14:C, 8e14:G, 5ejk:A, 5ejk:E, 5ejk:C, 5ejk:H, 5ejk:D, 5ejk:G, 5ejk:B, 5ejk:F, 7jn3:A, 7jn3:G, 7jn3:C, 7jn3:E, 7ku7:A, 7ku7:G, 7ku7:C, 7ku7:E, 7kui:A, 7kui:G, 7kui:C, 7kui:E, 3o4n:A, 3o4n:B, 1vsd:A, 1vsf:A, 1vsh:A, 1vsi:A, 1vsj:A
17 2jk1:A 138 60 0.1429 0.1449 0.3333 0.43 2vui:B
18 3j79:R 252 138 0.2643 0.1468 0.2681 1.2 3jbn:AR, 3jbo:AR, 3jbp:AR, 8tpu:AR, 5umd:R
19 7ut1:b 244 73 0.1571 0.0902 0.3014 1.2 7usf:D, 7usf:C, 7ut1:g, 7ut1:h, 7ut1:H, 7ut1:f, 7ut1:B, 7ut1:F, 7ut1:G
20 3fb4:A 215 57 0.1143 0.0744 0.2807 2.6
21 4zg9:B 764 28 0.0857 0.0157 0.4286 3.0 5kxa:A, 5m7m:A, 4zg6:A, 4zg6:B, 4zg9:A, 4zga:A
22 1uhn:A 189 49 0.1143 0.0847 0.3265 3.4 2zfd:A
23 1su2:A 159 32 0.0714 0.0629 0.3125 4.0 1su2:B, 1sz3:A, 1sz3:B
24 3ui2:A 234 28 0.0786 0.0470 0.3929 5.8 3dep:A, 2hug:A
25 5t79:A 315 33 0.0786 0.0349 0.3333 5.9 3erp:A, 3erp:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218