Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SSFVEKMKKTGRNIIVFYGSQTGTAEEFANRLSKDAHRYGMRGMSADPEEYDLADLSSLPEIDKSLVVFCMATYGEGDPT
DNAQDFYDWLQETDVDLTGVKFAVFGLGNKTYEHFNAMGKYVDQRLEQLGAQRIFELGLGDDDGNLEEDFITWREQFWPA
VCEFFGVEATSSIRQYELVVHEDMDVAKVYTGEMGRLKSYENQKPPFDAKNPFLAAVTANRKLNQGTERHLMHLELDISD
SKIRYESGDHVAVYPANDSALVNQIGEILGADLDVIMSLNNLDEESNKKHPFPCPTTYRTALTYYLDITNPPRTNVLYEL
AQYASEPSEQEHLHKMASSSGEGKELYLSWVVEARRHILAILQDYPSLRPPIDHLCELLPRLQARYYSIASSSKVHPNSV
HICAVAVEYEAKSGRVNKGVATSWLRAKEPARALVPMFVRKSQFRLPFKSTTPVIMVGPGTGIAPFMGFIQERAWLREQG
KEVGETLLYYGCRRSDEDYLYREELARFHKDGALTQLNVAFSREQAHKVYVQHLLKRDREHLWKLIHEGGAHIYVCGFAR
NMAKDVQNTFYDIVAEFGPMEHTQAVDYVKKLMTKGRYSLDVWS

The query sequence (length=604) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6j79:A 816 604 0.9967 0.7377 0.9967 0.0 1amo:A, 1amo:B, 1b1c:A, 1dve:A, 1dvg:A, 1dvg:B, 2dy5:A, 2e7e:A, 5emn:A, 5emn:B, 3es9:A, 3es9:B, 3es9:C, 5fa6:A, 5fa6:B, 4g7l:A, 4g7p:A, 4g7t:A, 4g7u:A, 4g8p:A, 4g8u:A, 4g8w:A, 4g98:A, 4g99:A, 3i9t:A, 3i9u:A, 1ivj:A, 1ix3:A, 1ix4:A, 1j02:A, 1j2c:A, 6j79:B, 6j7a:A, 6j7a:B, 6j7i:A, 6j7i:B, 1j9z:A, 1j9z:B, 1ja0:A, 1ja0:B, 1ja1:A, 1ja1:B, 7l18:AAA, 7l18:BBB, 4mec:A, 4mec:B, 4mec:C, 4mec:D, 4mec:E, 6njr:A, 6njr:B, 3ojw:A, 3ojx:A, 3qe2:A, 3qe2:B, 3qfc:A, 3qfc:B, 3qfr:A, 3qfr:B, 1ubb:A, 1ulx:A, 5urd:A, 5urd:B, 5ure:A, 5ure:B, 5urg:A, 5urg:B, 5urh:A, 5urh:B, 5uri:A, 5uri:B, 1vgi:A, 3wkt:A, 3wkt:B, 3wkt:C, 3wkt:D, 4y7c:A, 4y7c:B, 4y9r:A, 4y9r:B, 4y9u:A, 4y9u:B, 4yaf:A, 4yaf:B, 4yal:A, 4yal:B, 4yao:A, 4yao:B, 4yau:A, 4yau:B, 4yaw:A, 4yaw:B, 2zvu:A
2 3fjo:A 603 604 0.7649 0.7662 0.7649 0.0 3qfs:A, 3qft:A
3 5gxu:A 552 605 0.3990 0.4366 0.3983 7.66e-143 5gxu:B
4 6t1t:A 635 641 0.3957 0.3764 0.3729 4.82e-123 6t1t:B, 6t1u:A, 6t1u:B
5 7suz:A 389 403 0.2616 0.4062 0.3921 6.69e-102 7sux:A, 7sv0:A
6 2bf4:A 645 655 0.3609 0.3380 0.3328 3.02e-96 2bf4:B, 2bn4:A, 2bn4:B, 2bpo:A, 2bpo:B
7 8dme:A 1034 612 0.3228 0.1886 0.3186 1.16e-81 5b2u:A, 5b2u:B, 5b2v:A, 5b2v:B, 5b2w:A, 5b2w:B, 5b2x:A, 5b2x:B, 5b2y:A, 5b2y:B, 3ben:A, 3ben:B, 2bmh:A, 2bmh:B, 1bu7:A, 1bu7:B, 1bvy:A, 1bvy:F, 1bvy:B, 3cbd:A, 3cbd:B, 7ckn:A, 7ckn:B, 7con:A, 7con:B, 7coo:A, 7coo:B, 7cp8:A, 7cp8:B, 7cvr:A, 7cvr:B, 7cx6:A, 7cx6:B, 7cx8:A, 7cx8:B, 7czi:A, 7czi:B, 7d0t:A, 7d0t:B, 7d0u:A, 7d0u:B, 7d1f:A, 7d1f:B, 3dgi:A, 8dme:B, 8dmg:A, 8dmg:B, 4dqk:A, 4dqk:B, 4dql:A, 4dql:B, 8dsg:A, 8dsg:B, 8dsg:C, 8dsg:D, 4dtw:B, 4dtw:A, 4dty:B, 4dty:A, 4dtz:A, 4dtz:B, 4du2:B, 4du2:A, 4dua:A, 4dua:B, 4dub:A, 4dub:B, 4duc:A, 4duc:B, 4dud:A, 4dud:B, 4due:A, 4due:B, 4duf:A, 4duf:B, 4duf:C, 4duf:D, 5dyp:A, 5dyp:C, 5dyz:A, 5dyz:C, 7e46:A, 7e46:B, 5e78:A, 5e78:B, 5e7y:A, 5e7y:B, 5e9z:A, 5e9z:B, 5e9z:C, 5e9z:D, 7egn:A, 7egn:B, 3ekb:A, 3ekb:B, 3ekd:A, 3ekd:B, 3ekf:A, 3ekf:B, 1fag:A, 1fag:B, 1fag:C, 1fag:D, 1fah:A, 1fah:B, 6h1l:A, 6h1l:B, 6h1o:A, 6h1o:B, 6h1s:A, 6h1s:B, 6h1t:A, 6h1t:B, 6h1t:C, 6h1t:D, 4h23:A, 4h23:B, 4h24:A, 4h24:B, 4h24:C, 4h24:D, 4hgf:A, 4hgf:B, 4hgg:A, 4hgg:B, 4hgh:A, 4hgh:B, 4hgi:A, 4hgi:B, 4hgj:A, 4hgj:B, 6hn8:A, 6hn8:B, 8hon:A, 8hon:B, 8hoo:A, 8hoo:B, 8hop:A, 8hop:B, 8hoq:A, 8hoq:B, 8hor:A, 8hor:B, 8hos:A, 8hos:B, 8hot:A, 8hot:B, 8hou:A, 8hou:B, 2hpd:A, 2hpd:B, 6iao:A, 6iao:B, 6iao:C, 6iao:D, 2ij2:A, 2ij2:B, 2ij3:A, 2ij3:B, 2ij4:A, 2ij4:B, 2j1m:A, 2j1m:B, 2j4s:A, 2j4s:B, 8jc3:B, 8jc3:A, 8jc4:A, 8jc4:B, 6jlv:A, 6jlv:B, 1jme:A, 1jme:B, 6jmh:A, 6jmh:B, 6jmw:A, 6jmw:B, 6jo1:A, 6jo1:B, 1jpz:A, 1jpz:B, 5jq2:A, 5jq2:B, 5jqu:A, 5jqu:B, 5jqu:C, 5jqu:D, 5jqu:E, 5jqu:F, 5jqu:G, 5jqu:H, 5jqv:A, 5jqv:B, 5jqv:C, 5jqv:D, 5jqv:E, 5jqv:F, 5jqv:G, 5jqv:H, 6js8:A, 6js8:B, 5jtd:A, 5jtd:B, 6jvc:A, 6jvc:C, 6jzs:A, 6jzs:C, 6k24:A, 6k24:B, 6k3q:A, 6k3q:B, 6k58:A, 6k58:B, 6k9s:A, 6k9s:B, 4kew:A, 4kew:B, 4key:A, 4key:B, 4kf0:A, 4kf0:B, 4kf2:A, 4kf2:B, 4kpa:A, 4kpb:A, 4kpb:B, 3kx3:A, 3kx3:B, 3kx4:A, 3kx4:B, 3kx5:A, 3kx5:B, 6l1a:A, 6l1a:B, 6l1b:A, 6l1b:B, 6ly4:A, 3m4v:A, 3m4v:B, 2nnb:A, 2nnb:B, 3npl:A, 3npl:B, 4o4p:A, 4o4p:B, 5og9:A, 5og9:B, 1p0v:A, 1p0v:B, 1p0w:A, 1p0w:B, 1p0x:A, 1p0x:B, 3qi8:B, 8qze:A, 8qze:B, 8qzf:A, 8qzf:B, 4rsn:A, 4rsn:B, 1smi:A, 1smi:B, 1smj:A, 1smj:B, 1smj:C, 1smj:D, 5ucw:A, 5ucw:B, 2uwh:A, 2uwh:B, 2uwh:C, 2uwh:D, 2uwh:E, 2uwh:F, 7w97:A, 7w97:B, 7w9d:A, 7w9d:B, 7w9j:A, 7w9j:B, 7wdd:A, 7wdd:B, 7wde:A, 7wde:B, 7wdg:A, 7wdg:B, 7wdh:A, 7wdh:B, 7wdi:A, 7wdi:B, 4wg2:A, 4wg2:B, 4wg2:C, 7wg0:A, 7wg0:B, 3wsp:A, 3wsp:B, 7wy1:A, 7wy1:B, 7wy2:A, 7wy2:B, 7wy3:A, 7wy3:B, 7wy4:A, 7wy4:B, 2x7y:A, 2x7y:B, 2x80:A, 2x80:B, 5xa3:A, 5xa3:B, 5xa3:C, 5xa3:D, 5xhj:A, 5xhj:B, 7xzk:A, 7xzk:B, 7y0p:B, 7y0p:A, 7y0q:A, 7y0q:B, 7y0r:A, 7y0r:B, 7y0s:B, 7y0s:A, 7y0t:B, 7y0t:A, 7y0u:A, 7y0u:B, 7y9j:A, 7y9j:B, 7y9k:A, 7y9k:B, 7y9l:A, 7y9l:B, 7y9m:A, 7yd9:A, 7yd9:B, 7yda:A, 7yda:B, 7ydb:A, 7ydb:B, 7ydc:A, 7ydc:B, 7ydd:A, 7ydd:B, 7yde:A, 7yde:B, 7ydl:A, 7ydl:B, 7yft:A, 7yft:B, 7yjd:A, 7yjd:B, 7yje:A, 7yje:B, 7yjf:A, 7yjf:B, 7yjg:A, 7yjg:B, 7yjh:A, 7yjh:B, 1yqo:A, 1yqo:B, 1yqp:A, 1yqp:B, 4zf6:A, 4zf8:A, 4zfa:A, 4zfb:A, 5zis:A, 5zis:B, 5zis:C, 5zis:D, 5zlh:A, 5zlh:B, 5zlh:C, 5zlh:D, 1zo4:A, 1zo4:B, 1zo9:A, 1zo9:B, 1zoa:A, 1zoa:B
8 1tll:A 630 636 0.3212 0.3079 0.3050 1.90e-79 1f20:A, 1tll:B
9 6efv:A 530 605 0.3013 0.3434 0.3008 1.99e-73 1ddg:A, 1ddg:B, 1ddi:A, 1ykg:A
10 2qtl:A 448 385 0.2268 0.3058 0.3558 6.34e-62 2qtz:A
11 3vo2:A 296 231 0.1093 0.2230 0.2857 1.03e-17 3vo1:A, 3vo1:B, 3vo2:B
12 4h2d:A 158 153 0.0861 0.3291 0.3399 4.11e-17 4h2d:B
13 1gaw:B 305 230 0.0977 0.1934 0.2565 2.09e-15 1gaq:A, 1gaq:C, 1gaw:A, 3w5u:A, 3w5u:C, 3w5u:E, 3w5u:G, 3w5v:A, 3w5v:C
14 4oxx:A 153 124 0.0745 0.2941 0.3629 1.56e-13
15 1qfy:A 308 228 0.0977 0.1916 0.2588 1.84e-13 4af6:A, 4af6:B, 4af7:A, 4af7:B, 3mhp:A, 3mhp:B, 1qfy:B, 1qfz:A, 1qfz:B, 1qg0:A, 1qg0:B, 1qga:A, 1qga:B, 1sm4:A, 1sm4:B, 2xnc:A, 2xnc:B
16 3hr4:A 189 173 0.0844 0.2698 0.2948 1.72e-12 3hr4:C, 3hr4:E, 3hr4:G
17 1ewy:A 303 234 0.1076 0.2145 0.2778 1.75e-12 1b2r:A, 1bjk:A, 2bmw:A, 4bpr:A, 1bqe:A, 2bsa:A, 4c43:A, 1e62:A, 1e63:A, 1e64:A, 1ewy:B, 1gjr:A, 1go2:A, 1gr1:A, 1h42:A, 1h85:A, 1ogi:A, 1ogj:A, 1qgy:A, 1qgz:A, 1qh0:A, 1que:A, 1quf:A, 2vyq:A, 2vzl:A, 1w34:A, 1w35:A, 1w87:A, 1w87:B, 2x3u:A, 3zbt:A, 3zbu:A, 3zc3:A, 3zc3:B
18 1ewy:A 303 109 0.0430 0.0858 0.2385 3.2 1b2r:A, 1bjk:A, 2bmw:A, 4bpr:A, 1bqe:A, 2bsa:A, 4c43:A, 1e62:A, 1e63:A, 1e64:A, 1ewy:B, 1gjr:A, 1go2:A, 1gr1:A, 1h42:A, 1h85:A, 1ogi:A, 1ogj:A, 1qgy:A, 1qgz:A, 1qh0:A, 1que:A, 1quf:A, 2vyq:A, 2vzl:A, 1w34:A, 1w35:A, 1w87:A, 1w87:B, 2x3u:A, 3zbt:A, 3zbu:A, 3zc3:A, 3zc3:B
19 1bx0:A 296 229 0.0960 0.1959 0.2533 1.21e-11 1bx1:A, 1fnb:A, 1fnc:A, 1fnd:A, 1frn:A, 1frq:A
20 2b5o:A 292 206 0.0944 0.1952 0.2767 2.69e-10 2b5o:B
21 2b5o:A 292 83 0.0381 0.0788 0.2771 0.19 2b5o:B
22 5veg:B 149 117 0.0646 0.2617 0.3333 4.44e-10 5veg:A, 5veg:C
23 5h59:A 311 211 0.0977 0.1897 0.2796 8.83e-10 5h5j:A, 5h5j:C, 1jb9:A, 3lo8:A, 3lvb:A, 5vw2:A, 5vw3:A, 5vw4:A, 5vw5:A, 5vw6:A, 5vw7:A, 5vw8:A, 5vw9:A, 5vwa:A, 5vwb:A
24 2rc5:A 306 212 0.1010 0.1993 0.2877 1.57e-09 2rc5:B, 2rc5:C, 2rc5:D, 2rc6:A, 2rc6:B, 2rc6:C, 2rc6:D
25 3jqp:D 269 200 0.0795 0.1784 0.2400 7.67e-07 3jqp:A, 3jqp:B, 3jqp:C, 3jqp:E, 3jqp:F, 3jqq:A, 3jqq:B, 3jqq:C, 3jqq:D, 3jqq:E, 3jqq:F, 3jqr:A, 2ok7:A, 2ok7:B, 2ok7:C, 2ok7:D, 2ok7:E, 2ok7:F, 2ok8:A, 2ok8:B, 2ok8:C, 2ok8:D
26 6fsg:A 147 126 0.0579 0.2381 0.2778 9.62e-07 6fsi:A, 6ft1:A
27 6gaq:A 146 131 0.0712 0.2945 0.3282 1.03e-06 6gaq:B
28 5lji:A 145 142 0.0712 0.2966 0.3028 1.26e-06 5lji:C
29 3f6r:A 147 148 0.0695 0.2857 0.2838 2.60e-06 3f6r:B, 3f6r:C, 3f6r:D, 3f6s:A, 3f6s:G, 3f6s:B, 3f6s:D, 3f6s:E, 3f6s:F, 3f6s:H, 3f6s:I, 3f90:A, 3f90:B, 3f90:D, 3f90:E, 3f90:F, 3f90:H, 3f90:I, 3f90:G
30 2m6s:A 149 141 0.0662 0.2685 0.2837 3.53e-06
31 7ddz:A 437 153 0.0662 0.0915 0.2614 1.97e-05
32 7epe:A 389 147 0.0646 0.1003 0.2653 3.40e-05 7epf:A
33 5v57:A 645 152 0.0646 0.0605 0.2566 4.57e-05 1akq:A, 1akr:A, 1akt:A, 1aku:A, 1akv:A, 1akw:A, 1azl:A, 1bu5:A, 1bu5:B, 1c7e:A, 1c7e:B, 1c7f:A, 1c7f:B, 1f4p:A, 1fx1:A, 2fx2:A, 3fx2:A, 4fx2:A, 5fx2:A, 1i1o:A, 1j8q:A, 1j9e:A, 1j9g:A, 5v56:A, 5v56:B, 5v57:B, 1wsb:A, 1wsw:A, 1xt6:A, 1xyv:A, 1xyy:A, 5yob:A, 5yoc:A, 5yoe:A, 5yog:A
34 4heq:A 145 120 0.0530 0.2207 0.2667 9.33e-05 4heq:B
35 5tgz:A 439 143 0.0629 0.0866 0.2657 1.11e-04 7v3z:A, 5xr8:A, 5xra:A
36 5zkp:A 436 153 0.0662 0.0917 0.2614 1.11e-04
37 7k15:A 455 143 0.0629 0.0835 0.2657 1.12e-04
38 6li0:A 441 150 0.0679 0.0930 0.2733 1.53e-04 6li1:A
39 1czh:A 169 124 0.0613 0.2189 0.2984 0.001 1czk:A, 1czl:A, 1czn:A, 1czo:A, 1czr:A, 1czu:A, 1d03:A, 1d04:A, 6kif:P, 6kif:X, 6kif:p, 1ofv:A
40 8snz:A 167 119 0.0546 0.1976 0.2773 0.004 8snz:B, 8v2y:A
41 5ogx:A 333 102 0.0596 0.1081 0.3529 0.013
42 3kap:A 147 125 0.0513 0.2109 0.2480 0.016 3kaq:A
43 8v2y:B 151 146 0.0695 0.2781 0.2877 0.12
44 2bmv:A 163 109 0.0480 0.1779 0.2661 0.27 1fue:A, 2w5u:A, 2w5u:B
45 8fy9:D 93 41 0.0265 0.1720 0.3902 0.54 8fy9:A, 8fya:D, 8fya:A, 8fyb:D, 8fyb:A, 8fyc:D, 8fyc:A, 8fyd:A
46 6puq:A 171 140 0.0662 0.2339 0.2857 0.65 6pup:A
47 2mok:A 176 148 0.0646 0.2216 0.2635 0.69 1ag9:A, 1ag9:B, 1ahn:A
48 1krh:A 337 126 0.0563 0.1009 0.2698 0.89 1krh:B
49 2wc1:A 182 114 0.0563 0.1868 0.2982 1.2
50 6bdd:A 185 33 0.0215 0.0703 0.3939 3.7 6bde:A
51 1js8:A 382 53 0.0265 0.0419 0.3019 4.1 1js8:B
52 2fcr:A 173 103 0.0480 0.1676 0.2816 5.0
53 1a8p:A 257 121 0.0629 0.1479 0.3140 5.1
54 8qq7:A 399 116 0.0447 0.0677 0.2328 6.3 8qq1:C, 8qq1:F, 8qq1:G, 8qq5:A, 8qq5:B, 8qq5:C, 8qt6:A, 8qt7:A, 8qt9:A, 8qta:A
55 3esx:B 169 126 0.0480 0.1716 0.2302 6.5 3esx:A, 3esy:A, 3esy:B, 3esy:C, 3esy:D, 3esz:A, 3esz:B, 1flv:A, 5ljp:A, 1obo:A, 1obo:B, 1obv:A, 1rcf:A, 2v5u:A, 2v5u:B, 2v5v:A, 2v5v:B
56 6ahd:O 141 63 0.0281 0.1206 0.2698 7.1 6ah0:O, 4bwq:A, 4bwq:C, 4bwq:E, 4bwq:G, 4bws:A, 4bws:D, 8h6e:4F, 8h6k:4F, 8h6l:4F, 5o9z:J, 8q7n:D, 8qo9:D, 8qoz:D, 8qp8:D, 8qpa:D, 8qpb:D, 8qpe:D, 8qpk:D, 6qw6:5D, 6qx9:5D, 8qxd:D, 8qzs:D, 8r09:D, 8r0a:D, 8r0b:D, 8rm5:D
57 2fax:A 138 92 0.0348 0.1522 0.2283 9.0 2fdx:A, 1fla:A, 1fld:A, 1fln:A, 2flv:A, 2fox:A, 1fvx:A, 2fvx:A, 3nll:A, 4nll:A, 5nll:A, 4nul:A, 5nul:A, 6nul:A, 5ull:A
58 2n1u:A 70 51 0.0265 0.2286 0.3137 9.0
59 5a4u:A 211 55 0.0298 0.0853 0.3273 10.0 5a4u:B, 5a4u:C, 5a4u:D, 5a4u:E, 5a4u:F, 5a4v:A, 5a4v:B, 5a4v:C, 5a4v:D, 5a4v:E, 5a4v:F, 5a4w:A, 5a4w:B, 5a4w:C, 5a4w:D, 5a4w:E, 5a4w:F, 5a5k:A, 5a5k:B, 5a5k:C, 5a5k:D, 5a5k:E, 5a5k:F, 5a5k:G, 5a5k:H, 5a5k:I, 5a5k:J, 5a5k:K, 5a5k:L, 5a5k:M, 5a5k:N, 5a5k:O, 5a5k:P, 5a5k:Q, 5a5k:R, 5a5k:S, 5a5k:T, 5a5k:U, 5a5k:V, 5a5k:W, 5a5k:X, 1bx9:A, 1gnw:A, 1gnw:B

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218