BioLiP

>protein
SSEYIVEKFLGKRYLRGRPQYLTKWEGYPIEQCTWEPLENLGKCMTLIADYEAELFQQSR

The query sequence (length=60) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7vrf:A	61	60	1.0000	0.9836	1.0000	2.19e-40	7vrf:B
2	4u68:A	64	58	0.5833	0.5469	0.6034	2.28e-25	4quf:A, 4quf:B, 4quf:C, 4quf:D, 4quf:E, 4quf:F, 4u68:B, 4u68:C
3	6asz:A	53	51	0.4000	0.4528	0.4706	6.68e-10	6at0:A, 1kna:A, 1kne:A, 6mha:A, 1q3l:A
4	2rvn:A	83	48	0.3667	0.2651	0.4583	6.84e-10
5	3tzd:A	58	50	0.3500	0.3621	0.4200	1.44e-08	3dm1:A, 3dm1:C, 3dm1:G, 3dm1:E, 2l11:A
6	1guw:A	73	42	0.3333	0.2740	0.4762	2.78e-08	6d07:A, 6d07:B, 6d08:A, 6d08:B
7	8uxq:A	170	46	0.3500	0.1235	0.4565	3.17e-08	3fdt:A
8	6v41:AAA	61	52	0.3333	0.3279	0.3846	7.18e-08
9	7vyw:A	47	38	0.3333	0.4255	0.5263	8.42e-08
10	7n27:A	57	49	0.3333	0.3509	0.4082	1.14e-07	7n27:D, 7n27:B, 7n27:C, 7n27:E, 7n27:F
11	3gv6:A	56	49	0.3333	0.3571	0.4082	1.56e-07	3i90:A, 3i90:B
12	5eq0:A	55	51	0.3333	0.3636	0.3922	1.32e-06	3i91:A
13	5epl:B	58	46	0.3333	0.3448	0.4348	2.43e-06	5epl:A
14	5ejw:A	80	51	0.3167	0.2375	0.3725	4.75e-06	5epj:A, 2kvm:A, 2l12:A, 2l1b:A, 4mn3:A, 8sii:A, 8sii:B, 6v2r:A, 4x3k:A, 4x3k:B, 4x3s:B, 4x3s:A, 4x3t:A, 4x3t:B, 4x3t:C, 4x3t:D, 4x3t:E, 4x3t:F, 4x3u:A, 4x3u:B
15	5epk:A	54	46	0.2833	0.3148	0.3696	1.80e-05	3h91:A, 3h91:B
16	6v2d:G	64	51	0.3000	0.2812	0.3529	4.84e-05	5jjz:A, 7slw:A, 7slw:B, 7slw:C, 7slw:D, 7slw:E, 7slw:F, 8sp6:A, 8sp6:B, 8sp6:C, 8sp6:D, 8sp6:E, 8sp6:F, 6v2d:I, 6v2d:K, 6v2d:A, 6v2d:C, 6v2d:E, 6v2h:A, 6v2h:C, 6v2h:E, 6v2h:G, 6v2h:I, 6v2h:K, 6v3n:A, 6v3n:B, 6v8w:A, 6v8w:B, 6v8w:C, 6v8w:D, 6v8w:E, 6v8w:F, 6v8w:G, 6v8w:H, 6v8w:I, 6v8w:J, 6v8w:K, 6v8w:L, 6v8w:M, 6v8w:N, 6v8w:O, 6v8w:P, 6v8w:Q, 6v8w:R, 6v8w:S, 6v8w:T, 6v8w:U, 6v8w:V, 6v8w:W, 6v8w:X, 6v8w:Y, 6v8w:Z
17	7ubu:A	708	57	0.3333	0.0282	0.3509	7.68e-05	4ft4:A, 4ft4:B
18	4fsx:A	680	57	0.3333	0.0294	0.3509	8.39e-05	4fsx:B, 4ft2:B, 4ft2:A
19	3qo2:A	61	54	0.2500	0.2459	0.2778	6.50e-04	7m5u:A, 3qo2:D, 3qo2:B, 3qo2:C, 3r93:A, 3r93:D, 3r93:B, 3r93:C, 3svm:A, 6v2s:A, 6v2s:B
20	1pfb:A	55	38	0.2500	0.2727	0.3947	0.001	1pdq:A
21	2rsn:A	75	39	0.2833	0.2267	0.4359	0.009	3g7l:A
22	6guu:B	204	21	0.1833	0.0539	0.5238	0.071	6guu:A
23	2b2w:A	177	20	0.1667	0.0565	0.5000	0.079	5afw:A, 2b2t:A, 2b2u:A, 2b2v:A, 4nw2:A, 4nw2:C, 4o42:A
24	2b2w:A	177	25	0.2000	0.0678	0.4800	1.6	5afw:A, 2b2t:A, 2b2u:A, 2b2v:A, 4nw2:A, 4nw2:C, 4o42:A
25	8rv0:Y	495	38	0.2167	0.0263	0.3421	0.16	8rvm:YYY, 8rxu:AAA, 8rxu:MMM, 8rxu:YYY
26	4d90:A	127	26	0.1833	0.0866	0.4231	0.19	4d90:B
27	6ryr:W	708	44	0.2667	0.0226	0.3636	0.21	2l75:A, 1mm2:A, 6q3m:D, 6ryu:W, 6ryu:V
28	6q3m:C	219	44	0.2667	0.0731	0.3636	0.94	6q3m:A, 6q3m:B
29	6q3m:C	219	23	0.1667	0.0457	0.4348	6.5	6q3m:A, 6q3m:B
30	3uyt:D	268	39	0.2333	0.0522	0.3590	1.5	4kb8:A, 4kba:A
31	5l0t:B	40	22	0.1167	0.1750	0.3182	3.9	5ky7:B, 5l0u:B, 5l0v:B
32	6s47:Bi	952	36	0.1667	0.0105	0.2778	5.7
33	7w7g:A	1528	25	0.1333	0.0052	0.3200	8.0
34	4d0f:A	125	30	0.1333	0.0640	0.2667	8.5	4cud:A, 4cue:A, 4cuf:A, 4d0e:A, 5ub5:B, 2vj3:A, 4xlw:A
35	4o8m:A	303	38	0.2167	0.0429	0.3421	9.8	4o8m:B, 4o8m:C, 4o8m:D, 4o8m:E, 4o8m:F, 4o8m:G, 4o8m:H

[Back]