Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SRVAELANAVVSNADQKDLLRMSWGVLSVDMEGTGLMLMANLFKTSPSAKGKFARLGDVSAGKDNSKLRGHSITLMYALQ
NFVDALDDVERLKCVVEKFAVNHINRQISADEFGEIVGPLRQTLKARMGNYFDEDTVAAWASLVAVVQAAL

The query sequence (length=151) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 4hrr:B 151 151 1.0000 1.0000 1.0000 7.90e-110 4hrr:D, 4hrr:F, 4hrr:H, 4hrt:B, 4hrt:D, 4hrt:F, 4hrt:H
2 4hrr:A 149 132 0.6225 0.6309 0.7121 2.21e-67 4hrr:C, 4hrr:E, 4hrr:G, 4hrt:A, 4hrt:C, 4hrt:E, 4hrt:G
3 3g46:A 146 138 0.5298 0.5479 0.5797 2.01e-48 2auo:A, 2auo:B, 2aup:A, 2aup:B, 2auq:A, 2auq:B, 2aur:A, 2aur:B, 2av0:A, 2av0:B, 2av3:A, 2av3:B, 3g46:B, 3g4q:A, 3g4q:B, 3g4r:A, 3g4r:B, 3g4u:A, 3g4u:B, 3g4v:A, 3g4v:B, 3g4w:A, 3g4w:B, 3g4y:A, 3g4y:B, 3g52:A, 3g52:B, 3g53:A, 3g53:B, 2grf:A, 2grf:B, 2grh:A, 2grh:B, 2grz:A, 2grz:B, 1hbi:A, 1hbi:B, 4hbi:A, 4hbi:B, 5hbi:A, 5hbi:B, 6hbi:A, 6hbi:B, 7hbi:A, 7hbi:B, 1jwn:A, 1jwn:B, 1jwn:C, 1jwn:D, 1jzk:A, 1jzk:B, 1jzk:C, 1jzk:D, 1jzl:A, 1jzl:B, 1jzm:A, 1jzm:B, 1nwi:A, 1nwi:B, 1nwi:C, 1nwi:D, 1nwn:A, 1nwn:B, 1nxf:A, 1nxf:B, 3qob:A, 3qob:B, 2r4w:A, 2r4w:B, 2r4x:A, 2r4x:B, 2r4y:A, 2r4y:B, 2r4z:A, 2r4z:B, 3sdh:A, 3sdh:B, 4sdh:A, 4sdh:B, 3ugy:A, 3ugy:B, 3ugz:A, 3ugz:B, 3uh3:A, 3uh3:B, 3uh5:A, 3uh5:B, 3uh6:A, 3uh6:B, 3uh7:A, 3uh7:B, 3uhb:A, 3uhb:B, 3uhc:A, 3uhc:B, 3uhd:A, 3uhd:B, 3uhe:A, 3uhe:B, 3uhg:A, 3uhg:B, 3uhh:A, 3uhh:B, 3uhi:A, 3uhi:B, 3uhi:C, 3uhi:D, 3uhk:A, 3uhk:B, 3uhk:C, 3uhk:D, 3uhn:A, 3uhn:B, 3uhq:A, 3uhq:B, 3uhr:A, 3uhr:B, 3uhs:A, 3uhs:B, 3uht:A, 3uht:B, 3uhu:A, 3uhu:B, 3uhv:A, 3uhv:B, 3uhw:A, 3uhw:B, 3uhx:A, 3uhx:B, 3uhy:A, 3uhy:B, 3uhz:A, 3uhz:B, 3ui0:A, 3ui0:B, 2z85:A, 2z85:B, 2z8a:A, 2z8a:B
4 8oup:B 151 134 0.3046 0.3046 0.3433 6.78e-19 8oup:A, 8oup:C, 8oup:D
5 1hlb:A 157 138 0.2517 0.2420 0.2754 5.88e-12
6 1hlm:A 158 141 0.2384 0.2278 0.2553 1.60e-10
7 2bk9:A 153 143 0.2450 0.2418 0.2587 1.02e-09 2g3h:A
8 6q6p:B 157 140 0.1854 0.1783 0.2000 5.29e-08 6q6p:A
9 6otw:B 152 135 0.2517 0.2500 0.2815 6.56e-08 6otx:B, 6oty:B, 3pt7:B, 3pt8:B
10 2olp:A 151 100 0.2053 0.2053 0.3100 4.75e-07 2olp:B, 6otw:A, 6otx:A, 6oty:A, 3pi1:A, 3pi1:B, 3pi2:A, 3pi2:B, 3pi3:A, 3pi3:B, 3pi4:A, 3pi4:B, 3pt7:A, 3pt8:A
11 2d2m:B 142 121 0.2450 0.2606 0.3058 6.16e-07 2d2n:B, 7e96:B, 7e97:B, 7e98:B, 7e99:B, 2zfo:B, 2zs0:B, 2zs1:B
12 3s1i:A 131 134 0.1921 0.2214 0.2164 7.15e-07 3s1i:B, 3s1i:C, 3s1j:A, 3s1j:B, 3s1j:C, 3ubc:A, 3ubc:D, 3ubc:G, 3ubv:A, 3ubv:D, 3ubv:G
13 7vlc:B 144 122 0.2252 0.2361 0.2787 9.65e-07 7vlc:F, 7vld:B, 7vld:F, 7vle:B, 7vle:F, 7vlf:B, 7vlf:F, 3wct:B, 3wct:F, 3wcu:B, 3wcu:F, 3wcv:B, 3wcv:F, 3wcw:B, 3wcw:F
14 6iyi:B 146 126 0.2053 0.2123 0.2460 1.27e-05 6iyh:B
15 1yhu:C 148 109 0.2119 0.2162 0.2936 1.77e-05 1yhu:G, 1yhu:K, 1yhu:O, 1yhu:S, 1yhu:W
16 1dm1:A 146 106 0.1722 0.1781 0.2453 2.78e-05 2fal:A, 2fam:A, 1mba:A, 3mba:A, 4mba:A, 5mba:A
17 4u8u:D 141 116 0.1921 0.2057 0.2500 3.10e-05 4u8u:H, 4u8u:L, 4u8u:S, 4u8u:W, 4u8u:a, 4u8u:h, 4u8u:l, 4u8u:p, 4wch:D
18 3qqq:A 150 66 0.1325 0.1333 0.3030 3.67e-05 3qqq:B, 3qqr:A, 3qqr:B
19 3bom:B 147 133 0.2583 0.2653 0.2932 5.35e-05 3bom:D, 2r1h:B, 2r1h:D
20 3d4x:B 145 142 0.2450 0.2552 0.2606 7.73e-05 3d4x:D, 3gqp:B, 3gqp:D, 3gqr:B, 3gqr:D, 3gqr:F, 3gqr:H, 3gys:B, 3gys:D, 3gys:F, 3gys:H
21 7z1u:A 147 66 0.1325 0.1361 0.3030 1.14e-04 7z1u:B, 7zos:A
22 1fhj:B 146 142 0.2517 0.2603 0.2676 1.85e-04 2b7h:B, 2b7h:D, 1fhj:D, 3gou:B, 3gou:D, 3pel:B, 2qls:B, 2qls:D
23 4esa:D 145 128 0.1987 0.2069 0.2344 2.06e-04 4esa:B, 6rp5:B
24 3bcq:B 146 133 0.2318 0.2397 0.2632 2.14e-04 3bcq:D
25 1f5o:A 149 94 0.1258 0.1275 0.2021 2.21e-04 1f5o:B, 1f5o:C, 1f5o:D, 1f5o:E, 1f5o:F, 1f5p:A, 1f5p:B, 1f5p:C, 1f5p:D, 1f5p:E, 1f5p:F, 2lhb:A, 3lhb:A, 3lhb:B, 3lhb:C, 3lhb:D, 3lhb:E, 3lhb:F, 3lhb:G, 3lhb:H, 3lhb:I, 3lhb:J, 3lhb:K, 3lhb:L, 1uc3:A, 1uc3:B, 1uc3:C, 1uc3:D, 1uc3:E, 1uc3:F, 1uc3:G, 1uc3:H, 1uc3:I, 1uc3:J, 1uc3:K, 1uc3:L
26 1v4w:B 146 128 0.2053 0.2123 0.2422 3.86e-04 1v4u:B, 1v4u:D, 1v4w:D, 1v4x:B, 1v4x:D
27 1b0b:A 142 103 0.1921 0.2042 0.2816 5.34e-04 1ebt:A, 1flp:A, 1moh:A
28 1spg:B 147 144 0.2318 0.2381 0.2431 5.57e-04
29 6hit:B 145 128 0.1854 0.1931 0.2188 6.33e-04 6hit:D, 6hit:F, 6hit:H
30 2oif:G 154 68 0.1258 0.1234 0.2794 7.04e-04 2oif:A, 2oif:B, 2oif:C, 2oif:D, 2oif:E, 2oif:F, 2oif:H
31 2gtl:D 140 111 0.1854 0.2000 0.2523 0.001 2gtl:H, 2gtl:L, 5m3l:D, 5m3l:H, 5m3l:L, 1x9f:D, 1x9f:H, 1x9f:L
32 5eui:B 146 143 0.2318 0.2397 0.2448 0.001
33 2r50:C 147 66 0.1325 0.1361 0.3030 0.002 2r50:A, 2r50:B, 2r50:D
34 1d8u:A 165 72 0.1523 0.1394 0.3194 0.002 1d8u:B, 2gnv:A, 2gnv:B, 2gnw:A, 2gnw:B
35 7ddu:A 154 120 0.2185 0.2143 0.2750 0.002 7ddu:C, 1mbs:A
36 3a5a:A 152 136 0.1854 0.1842 0.2059 0.002 3a5b:A, 3a5g:A, 3a9m:A, 3arj:A, 3ark:A, 3arl:A, 1x3k:A, 2zwj:A
37 1lhs:A 153 84 0.1391 0.1373 0.2500 0.003 1lht:A
38 6h6c:A 151 142 0.2649 0.2649 0.2817 0.003 5eet:A, 5eoh:A, 5eqm:A, 5eu2:A, 5ev5:A, 5eyj:A, 5eys:A, 6eye:A, 5f0b:A, 5f2a:A, 3gk9:A, 3gkt:A, 3gln:A, 8grz:A, 6h5z:A, 6h6i:A, 6h6j:A, 6i3t:A, 6i40:A, 5mjc:A, 5mjd:A, 4mpm:A, 4mpm:B, 4mu5:A, 5nvi:A, 5nw6:A, 4nzi:A, 4o1t:A, 5o17:A, 5o18:A, 5o1k:A, 4o2g:A, 5o27:A, 4o35:A, 4o4t:A, 4o4z:A, 7ohd:A, 1oj6:A, 1oj6:B, 1oj6:C, 1oj6:D, 1q1f:A, 6r1q:A, 6ra6:A, 7vqg:A, 2vry:A, 1w92:A
39 2aa1:B 146 102 0.1788 0.1849 0.2647 0.003 2aa1:D
40 1out:B 146 140 0.2119 0.2192 0.2286 0.003 1ouu:B, 1ouu:D
41 7ohd:B 134 136 0.2252 0.2537 0.2500 0.004
42 3rgk:A 149 84 0.1457 0.1477 0.2619 0.019
43 2gtl:C 149 145 0.2252 0.2282 0.2345 0.022 2gtl:G, 2gtl:K, 5m3l:C, 5m3l:G, 5m3l:K, 1x9f:C, 1x9f:G, 1x9f:K
44 1yhu:B 144 118 0.1854 0.1944 0.2373 0.028 1yhu:F, 1yhu:J, 1yhu:N, 1yhu:R, 1yhu:V
45 3at5:A 141 80 0.1325 0.1418 0.2500 0.039 3at6:A
46 1v75:A 141 138 0.1987 0.2128 0.2174 0.051 1wmu:A, 2z6n:A
47 1bin:A 143 127 0.1788 0.1888 0.2126 0.064 1bin:B, 1fsl:A, 1fsl:B
48 3bj1:A 142 77 0.1258 0.1338 0.2468 0.070 3bj1:C, 3bj2:A, 3bj2:C, 3bj3:A, 3bj3:C, 1xq5:A, 1xq5:C
49 3ciu:C 141 81 0.1457 0.1560 0.2716 0.13 3ciu:A, 3cy5:A, 3cy5:C, 3d1a:A, 3d1a:C, 3eu1:A, 3eu1:C, 1fsx:A, 1fsx:C, 1g08:A, 1g08:C, 1g09:A, 1g09:C, 1g0a:A, 1g0a:C, 1hda:A, 1hda:C, 6ihx:A, 6ihx:C, 6ii1:A, 6ii1:C, 3pi8:A, 3pi8:C, 3pi9:A, 3pi9:C, 3pia:A, 3pia:C, 2qsp:A, 2qsp:C, 2qss:A, 2qss:C, 2qu0:A, 2qu0:C, 2ri4:A, 2ri4:C, 2ri4:I, 2ri4:K
50 8wix:A 141 84 0.1391 0.1489 0.2500 0.17 8wiy:A, 8wiz:A
51 3tm9:A 146 107 0.1523 0.1575 0.2150 0.17 3tld:A, 3tld:B, 3tm3:A, 1vhb:A, 1vhb:B, 2vhb:A, 2vhb:B, 3vhb:A, 3vhb:B, 4vhb:A, 4vhb:B
52 6hit:A 142 78 0.1258 0.1338 0.2436 0.18 6hit:C, 6hit:E, 6hit:G
53 4u8u:A 148 81 0.1391 0.1419 0.2593 0.18 4u8u:E, 4u8u:I, 4u8u:P, 4u8u:T, 4u8u:X, 4u8u:e, 4u8u:i, 4u8u:m
54 3bom:A 142 77 0.1126 0.1197 0.2208 0.26 3bom:C, 2r1h:A, 2r1h:C
55 5yci:B 157 84 0.1457 0.1401 0.2619 0.37 1azi:A, 5azq:A, 5azr:A, 3ba2:A, 1bje:A, 8bkh:A, 8bkn:A, 5cmv:A, 5cn4:A, 5cn5:A, 5cn6:A, 5cn7:A, 5cn8:A, 5cn9:A, 5cnb:A, 5cnc:A, 5cnd:A, 5cne:A, 5cnf:A, 5cng:A, 5d5r:A, 4dc7:A, 4dc8:A, 7ddr:A, 7dds:A, 7ddt:A, 7dgj:A, 7dgj:B, 7dgk:A, 7dgk:B, 7dgl:A, 7dgl:B, 7dgm:A, 7dgm:B, 7dgn:A, 7dgn:B, 7dgo:A, 7dgo:B, 1dwr:A, 1dws:A, 1dwt:A, 2frf:A, 2fri:X, 2frj:X, 2frk:X, 1gjn:A, 3hc9:A, 3hen:A, 3heo:A, 3hep:A, 1hrm:A, 1hsy:A, 2in4:A, 3lr7:A, 3lr9:A, 6ls8:A, 6ls8:C, 6ls8:E, 6ls8:G, 6ls8:I, 6ls8:K, 6ltl:A, 6ltl:B, 6ltm:A, 6ltm:B, 1m6c:A, 1m6c:B, 1m6m:A, 1m6m:B, 1mdn:A, 1mdn:B, 1mnh:A, 1mni:A, 1mni:B, 1mnj:A, 1mnj:B, 1mnk:A, 1mnk:B, 1mno:A, 1mno:B, 1mwc:A, 1mwc:B, 1mwd:A, 1mwd:B, 1myg:A, 1myg:B, 1myh:A, 1myh:B, 1myi:A, 1myi:B, 1myj:A, 1myj:B, 1npf:A, 1npg:A, 2nsr:A, 2nss:A, 4ns2:A, 1nz2:A, 1nz3:A, 1nz4:A, 1nz5:A, 2o58:X, 2o5b:X, 2o5l:X, 2o5m:X, 2o5o:X, 2o5q:X, 2o5s:X, 2o5t:X, 1pmb:A, 1pmb:B, 8r8f:A, 8r8g:A, 8r8h:A, 8r8i:A, 8r8j:A, 8r8w:A, 8r8x:A, 8r8y:A, 8r8z:A, 8r90:A, 8r91:A, 8r92:A, 8r93:A, 8r94:A, 8r95:A, 8r9c:A, 8r9d:A, 8r9e:A, 8r9f:A, 8r9g:A, 8r9h:A, 8r9i:A, 8r9j:A, 8r9k:A, 8r9l:A, 8r9m:A, 8r9n:A, 8r9p:A, 8r9q:A, 8ra1:A, 8ra2:A, 8ra3:A, 8ra4:A, 8ra5:A, 8ra6:A, 8ra7:A, 8ra8:A, 8ra9:A, 8raa:A, 8rab:A, 8rac:A, 8rad:A, 8rae:A, 3rj6:A, 3rj6:B, 3rjn:B, 1rse:A, 4twu:A, 4twv:A, 2v1e:A, 2v1f:A, 2v1g:A, 2v1h:A, 2v1i:A, 2v1j:A, 2v1k:A, 3v2v:A, 3v2z:A, 7v5p:A, 7v5p:B, 7v5q:A, 7v5q:B, 7v5r:A, 7v5r:B, 3vau:A, 2vlx:A, 2vly:A, 2vlz:A, 2vm0:A, 3vm9:A, 3vm9:B, 3wft:A, 3wfu:A, 8wf5:A, 3wi8:A, 1wla:A, 3wyo:A, 3wyo:B, 3wyo:C, 3wyo:D, 1xch:A, 1yca:A, 1yca:B, 1ycb:A, 1ycb:B, 5ycg:A, 5ycj:B, 5yl3:A, 1yma:A, 1ymb:A, 1ymc:A, 5z7e:A, 5z7f:A, 5zze:A
56 1out:A 142 77 0.1192 0.1268 0.2338 0.40 1ouu:A, 1ouu:C
57 3d1k:B 146 133 0.1987 0.2055 0.2256 0.44 4g51:B, 4g51:D, 3gkv:B, 3gqg:B, 3gqg:D, 2h8d:B, 2h8d:D, 2h8f:B, 2h8f:D, 1hbh:B, 1hbh:D, 4iro:B, 4iro:D, 1la6:B, 5lfg:B, 5lfg:D, 3nfe:B, 3nfe:D, 3ng6:B, 3ng6:D, 4odc:B, 1pbx:B, 2peg:B, 1s5x:B, 1s5y:B, 1s5y:D, 1t1n:B
58 2gtl:A 147 78 0.1258 0.1293 0.2436 0.52 2gtl:E, 2gtl:I, 5m3l:A, 5m3l:E, 5m3l:I, 1x9f:A, 1x9f:E, 1x9f:I
59 7vlf:C 150 100 0.1589 0.1600 0.2400 0.69 7vlc:C, 7vlc:G, 7vld:C, 7vld:G, 7vle:C, 7vle:G, 7vlf:G, 3wct:C, 3wct:G, 3wcu:C, 3wcu:G, 3wcv:C, 3wcv:G, 3wcw:C, 3wcw:G
60 1myt:A 146 70 0.0993 0.1027 0.2143 0.86 2nrl:A, 2nrm:A, 2nx0:A, 3qm5:A, 3qm6:A, 3qm7:A, 3qm8:A, 3qm9:A, 3qma:A
61 3hf4:A 141 80 0.1325 0.1418 0.2500 1.3 3dht:A, 3hf4:E
62 1jer:A 110 55 0.1258 0.1727 0.3455 1.4
63 3lxd:A 409 70 0.1391 0.0513 0.3000 1.6
64 1gcv:A 140 78 0.1457 0.1571 0.2821 1.8 1gcv:C, 1gcw:A, 1gcw:C
65 1gdi:A 153 131 0.1788 0.1765 0.2061 2.0 1gdj:A, 1gdk:A, 1gdl:A, 2gdm:A, 1lh1:A, 1lh2:A, 1lh3:A, 1lh5:A, 1lh6:A, 1lh7:A, 2lh1:A, 2lh2:A, 2lh3:A, 2lh5:A, 2lh6:A, 2lh7:A
66 4h2l:A 141 80 0.1391 0.1489 0.2625 2.2 3hrw:A, 3hrw:C, 5ker:C, 5ker:E, 5ker:G, 5ker:A
67 7vlf:D 149 116 0.1457 0.1477 0.1897 2.7 7vlc:D, 7vlc:H, 7vld:D, 7vld:H, 7vle:D, 7vle:H, 7vlf:H, 3wct:D, 3wct:H, 3wcu:D, 3wcu:H, 3wcv:D, 3wcv:H, 3wcw:D, 3wcw:H
68 1cqx:A 403 68 0.0993 0.0372 0.2206 2.9 1cqx:B, 3ozu:A, 3ozv:B, 3ozv:A, 3ozw:A, 3ozw:B
69 4esa:A 142 71 0.1060 0.1127 0.2254 3.4 4esa:C, 6rp5:A
70 2wy4:A 139 55 0.0861 0.0935 0.2364 3.5
71 3wfw:A 138 124 0.1722 0.1884 0.2097 4.0 3wfx:A, 3wfx:B
72 1v4u:A 143 73 0.1060 0.1119 0.2192 6.6 1v4u:C, 1v4w:A, 1v4w:C, 1v4x:A, 1v4x:C
73 8uhw:B 859 85 0.1457 0.0256 0.2588 6.8 8uhw:C, 8uhw:D, 8uhw:E
74 3mkb:A 140 45 0.1060 0.1143 0.3556 7.9 3mkb:C
75 5ld5:C 342 38 0.0927 0.0409 0.3684 9.2 5ld5:A, 5ld5:B, 5ld5:D
76 8umc:A 322 47 0.1060 0.0497 0.3404 9.9 8umc:C

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218