BioLiP

>protein
SRRLLEETLAPFRLNHDQLAAVQAQMRKAMAKGLRGEASSLRMLPTFVRATPDGSERGDFLALDLGGTNFRVLLVRVTTG
VQITSEIYSIPETVAQGSGQQLFDHIVDCIVDFQQKQGLSGQSLPLGFTFSFPCRQLGLDQGILLNWTKGFKASDCEGQD
VVSLLREAITRRQAVELNVVAIVNDTVGTMMSCGYEDPRCEIGLIVGTGTNACYMEELRNVAGVPGDSGRMCINMEWGAF
GDDGSLAMLSTRFDASVDQASINPGKQRFEKMISGMYLGEIVRHILLHLTSLGVLFRGQQIQRLQTRDIFKTKFLSEIES
DSLALRQVRAILEDLGLPLTSDDALMVLEVCQAVSQRAAQLCGAGVAAVVEKIRENRGLEELAVSVGVDGTLYKLHPRFS
SLVAATVRELAPRCVVTFLQSEDGSGKGAALVTAVACRLAQ

The query sequence (length=441) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3hm8:A	441	441	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	3hm8:B, 3hm8:C, 3hm8:D
2	5hg1:A	867	444	0.6599	0.3356	0.6554	0.0
3	5hg1:A	867	443	0.5147	0.2618	0.5124	1.39e-149
4	5hfu:B	897	447	0.6599	0.3244	0.6510	0.0	5hex:A, 5hex:B, 5hfu:A, 2nzt:A
5	5hfu:B	897	443	0.5488	0.2698	0.5463	6.54e-171	5hex:A, 5hex:B, 5hfu:A, 2nzt:A
6	1qha:A	903	445	0.6440	0.3145	0.6382	0.0	1bg3:A, 1bg3:B, 1cza:N, 1dgk:N, 4f9o:A, 4f9o:B, 4foe:A, 4foe:B, 4foi:A, 4foi:B, 4fpa:A, 4fpa:B, 4fpb:A, 4fpb:B, 1hkb:A, 1hkb:B, 1hkc:A, 1qha:B
7	1qha:A	903	446	0.5238	0.2558	0.5179	4.07e-162	1bg3:A, 1bg3:B, 1cza:N, 1dgk:N, 4f9o:A, 4f9o:B, 4foe:A, 4foe:B, 4foi:A, 4foi:B, 4fpa:A, 4fpa:B, 4fpb:A, 4fpb:B, 1hkb:A, 1hkb:B, 1hkc:A, 1qha:B
8	2nzt:B	867	443	0.6417	0.3264	0.6388	0.0
9	2nzt:B	867	439	0.5465	0.2780	0.5490	3.91e-168
10	3idh:A	453	445	0.5306	0.5166	0.5258	9.68e-168	3a0i:X, 4dhy:A, 6e0e:A, 6e0i:A, 3f9m:A, 3fgu:A, 3fr0:A, 3goi:A, 3h1v:X, 3id8:A, 3imx:A, 4iwv:A, 4ixc:A, 4l3q:A, 4mle:A, 4mlh:A, 4no7:A, 3qic:A, 4rch:A, 3s41:A, 7t78:A, 7t78:B, 7t79:A, 7t79:B, 1v4s:A, 3vev:A, 3vey:A, 3vf6:A
11	4dch:A	434	446	0.4943	0.5023	0.4888	1.30e-149	4ise:A, 4isf:A, 4isg:A, 5v4w:A, 5v4x:A
12	1bdg:A	444	440	0.4467	0.4437	0.4477	6.48e-121
13	3o5b:A	479	451	0.3515	0.3236	0.3437	1.30e-83	3o5b:B, 3o80:A, 3o8m:A
14	6jj7:A	465	463	0.4014	0.3806	0.3823	2.45e-81	6jj7:C, 6jj7:E, 6jj8:C, 6jj8:A, 6jj8:B, 6jj9:C, 6jj9:A, 6jj9:E, 5zqt:A, 5zqt:B, 5zqt:C
15	3b8a:X	470	446	0.3469	0.3255	0.3430	2.75e-79
16	4qs7:A	455	439	0.3719	0.3604	0.3736	6.92e-75	4qs9:A
17	6pdt:A	500	462	0.3651	0.3220	0.3485	3.56e-71	6pdt:B, 6pdt:C, 6pdt:D
18	6ksr:A	467	468	0.3401	0.3212	0.3205	7.14e-58
19	7zzi:B	467	436	0.3084	0.2912	0.3119	2.44e-52	7zzi:A
20	2yhx:A	457	185	0.1020	0.0985	0.2432	6.70e-06
21	3ngj:D	222	107	0.0499	0.0991	0.2056	1.9	3ngj:A, 3ngj:B, 3ngj:C
22	2f02:A	319	64	0.0385	0.0533	0.2656	4.0	2f02:B
23	4fdg:B	592	61	0.0408	0.0304	0.2951	4.8	8eaf:A, 8eaf:B, 8eaf:C, 8eaf:D, 8eaf:E, 8eaf:F, 8eag:B, 8eag:C, 8eag:D, 8eag:E, 8eag:F, 8eag:A, 8eah:A, 8eah:B, 8eah:C, 8eah:D, 8eah:E, 8eah:F, 8eai:B, 8eai:C, 8eai:D, 8eai:E, 8eai:F, 8eai:A, 8eaj:A, 8eaj:B, 8eaj:C, 8eaj:D, 8eaj:E, 8eaj:F, 8eak:B, 8eak:C, 8eak:D, 8eak:E, 8eak:A, 8eak:F, 8eal:A, 8eal:B, 8eal:C, 8eal:D, 8eal:E, 8eal:F, 8eam:B, 8eam:C, 8eam:D, 8eam:E, 8eam:A, 8eam:F, 4fdg:A, 4fdg:C, 4fdg:D, 4fdg:E, 6mii:A, 6mii:B, 6mii:C, 6mii:D, 6mii:E, 6mii:F, 2vl6:A, 2vl6:B, 2vl6:C, 6wnz:B, 6wnz:A
24	5c37:A	632	123	0.0726	0.0506	0.2602	5.2	5c37:C, 6nna:A, 6nna:B, 4piv:A, 4piv:B
25	4r7y:A	591	61	0.0408	0.0305	0.2951	5.7	4r7y:B, 4r7z:A, 4r7z:B, 4r7z:C, 4r7z:D, 4r7z:E, 4r7z:F, 4r7z:G, 4r7z:H, 4r7z:I, 4r7z:P, 4r7z:J, 4r7z:K, 4r7z:L, 4r7z:M, 4r7z:N, 4r7z:O
26	8eyi:F	1211	123	0.0726	0.0264	0.2602	6.1	4w9n:A, 4w9n:B, 4w9n:C, 4w9n:D
27	8eyk:F	1070	123	0.0726	0.0299	0.2602	7.1
28	8eyk:E	966	123	0.0726	0.0331	0.2602	7.7	8eyi:E, 8gkc:A, 8gkc:D

[Back]