BioLiP

>protein
SRRARIERRTRESDIVIELDLDGTGQVAVDTGVPFYDHMLTALGSHASFDLTVRATGDVEIEAHHTIEDTAIALGTALGQ
ALGDKRGIRRFGDAFIPMDETLAHAAVDLSGRPYCVHTGEPDHLQHTTIAGSSVPYHTVINRHVFESLAANARIALHVRV
LYGRDPHHITEAQYKAVARALRQAVEPDPR

The query sequence (length=190) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4gqu:A	191	190	1.0000	0.9948	1.0000	1.91e-137	7ddv:A, 7dnq:A, 7fcy:A, 6khh:A, 4lom:A, 4lpf:A, 5xds:A, 6yjh:A, 5zqn:A
2	5el9:A	199	190	0.4842	0.4623	0.4842	1.57e-57	5ekw:A, 5elw:A, 6ezj:A, 6ezj:Q, 6ezj:B, 6ezj:N, 6ezj:C, 6ezj:W, 6ezj:D, 6ezj:H, 6ezj:E, 6ezj:R, 6ezj:F, 6ezj:G, 6ezj:V, 6ezj:L, 6ezj:I, 6ezj:S, 6ezj:J, 6ezj:K, 6ezj:U, 6ezj:X, 6ezj:M, 6ezj:P, 6ezj:O, 6ezj:T, 2f1d:B, 2f1d:A, 2f1d:G, 2f1d:C, 2f1d:D, 2f1d:E, 2f1d:F, 2f1d:H, 2f1d:J, 2f1d:I, 2f1d:O, 2f1d:K, 2f1d:L, 2f1d:M, 2f1d:N, 2f1d:P, 4mu0:A, 4mu1:A, 4mu3:A, 4mu4:A, 4qnj:A, 4qnk:A, 4qnk:B, 4qnk:C, 4qnk:D, 4qnk:E, 4qnk:F, 4qnk:G, 4qnk:H
3	8qaw:A	185	190	0.4632	0.4757	0.4632	1.46e-54	7oj5:A, 7oj5:B, 7oj5:C, 7oj5:D, 7oj5:E, 7oj5:F, 7oj5:G, 7oj5:H, 7oj5:I, 7oj5:J, 7oj5:K, 7oj5:L, 7oj5:M, 7oj5:N, 7oj5:O, 7oj5:P, 7oj5:Q, 7oj5:R, 7oj5:S, 7oj5:T, 7oj5:V, 7oj5:W, 7oj5:X, 7oj5:Y, 8qav:A, 8qav:S, 8qav:W, 8qav:B, 8qav:N, 8qav:R, 8qav:C, 8qav:Q, 8qav:V, 8qav:D, 8qav:H, 8qav:X, 8qav:E, 8qav:O, 8qav:Y, 8qav:F, 8qav:P, 8qav:G, 8qav:J, 8qav:M, 8qav:T, 8qav:I, 8qav:K, 8qav:L, 8qaw:B, 8qaw:C, 8qaw:D, 8qaw:E, 8qaw:F, 8qaw:G, 8qaw:H, 8qax:A, 8qax:B, 8qax:C, 8qax:D, 8qax:E, 8qax:F, 8qay:A, 8qay:B, 8qay:C, 8qay:D, 8qay:E, 8qay:F, 8qay:G, 8qay:H
4	6fwh:A	196	188	0.4421	0.4286	0.4468	2.49e-51	6fwh:C, 6fwh:F, 6fwh:B, 6fwh:K, 6fwh:G, 6fwh:L, 6fwh:E, 6fwh:D, 6fwh:H, 6fwh:J, 6fwh:I
5	6ezm:U	212	207	0.4105	0.3679	0.3768	1.64e-40	6ezm:D, 6ezm:S, 6ezm:L, 6ezm:R, 6ezm:A, 6ezm:Q, 6ezm:V, 6ezm:O, 6ezm:B, 6ezm:N, 6ezm:F, 6ezm:T, 6ezm:C, 6ezm:X, 6ezm:E, 6ezm:H, 6ezm:P, 6ezm:J, 6ezm:G, 6ezm:I, 6ezm:W, 6ezm:K, 6ezm:M
6	1rhy:B	180	189	0.3737	0.3944	0.3757	7.73e-36
7	2ae8:B	172	157	0.3000	0.3314	0.3631	4.95e-28	2ae8:A, 2ae8:C, 2ae8:D, 2ae8:E, 2ae8:F
8	5dnl:A	176	185	0.3211	0.3466	0.3297	2.04e-25	5dnl:C, 5dnl:B, 5dnx:A, 5dnx:C, 5dnx:B
9	3ojc:A	230	46	0.0895	0.0739	0.3696	0.53	3ojc:B
10	8ix9:C	314	24	0.0526	0.0318	0.4167	2.0	8ix9:B, 8ix9:A, 8ixh:A, 8ixh:B, 8ixh:C, 8ixm:A, 8ixm:B
11	6wgm:A	304	37	0.0632	0.0395	0.3243	8.0
12	2kpn:A	97	69	0.1211	0.2371	0.3333	8.6

[Back]