BioLiP

>protein
SRPQSTLRRAITAAYRRPETECLPPLVEAATQSKEIRDAAASTARKLIEALRGKGSMMGEQFVTGETIREALKRSKELEE
KGFSYSYDMLGEAATTAADAERYYRDYESAIHAIGKASAGRGIYEGPGISIKLSALHPRYSRAQAARVMGELLPRVKALA
LLAKNYDIGLNIDAEEADRLELSLDLLEVLCLDGDLSGWNGMGFVVQAYGKRCPFVLDFIIDLARRSGRRIMVRLVKGAY
WDAEIKRAQLDGLADFPVFTRKIHTDVSYIACAAKLLAATDVVFPQFATHNAQTLAAIYHMAGKDFHVGKYEFQCLHGMG
EPLYEEVVGRGKLDRPCRIYAPVGTHETLLAYLVRRLLENGANSSFVHRINDPKVSIDELIADPVEVVRAMPV

The query sequence (length=393) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8dko:B	393	393	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	8dko:A, 8dkp:A, 8dkp:B, 8dkq:B, 8w0k:B
2	6x9d:A	1218	337	0.8575	0.2767	1.0000	0.0	8dkq:A, 5kf6:A, 5kf6:B, 5kf7:A, 7my9:A, 7my9:B, 7mya:A, 7mya:B, 7myb:A, 7myb:B, 7myc:A, 7myc:B, 6ufp:A, 6ufp:B, 6vz9:A, 6vz9:B, 8w0k:A, 6x99:A, 6x99:B, 6x9a:A, 6x9a:B, 6x9b:A, 6x9b:B, 6x9c:A, 6x9c:B, 6x9d:B
3	6x9d:A	1218	65	0.1425	0.0460	0.8615	2.19e-25	8dkq:A, 5kf6:A, 5kf6:B, 5kf7:A, 7my9:A, 7my9:B, 7mya:A, 7mya:B, 7myb:A, 7myb:B, 7myc:A, 7myc:B, 6ufp:A, 6ufp:B, 6vz9:A, 6vz9:B, 8w0k:A, 6x99:A, 6x99:B, 6x9a:A, 6x9a:B, 6x9b:A, 6x9b:B, 6x9c:A, 6x9c:B, 6x9d:B
4	2fzn:A	449	430	0.6845	0.5991	0.6256	0.0
5	3itg:A	399	392	0.6667	0.6566	0.6684	0.0
6	1tj0:A	469	450	0.6870	0.5757	0.6000	0.0	3e2q:A, 3e2r:A, 3e2s:A, 2fzm:A, 4o8a:A, 1tiw:A, 1tj1:A, 1tj2:A
7	7sqn:A	503	338	0.6260	0.4891	0.7278	0.0	3itg:B, 4jny:A, 4jnz:A, 7mwt:A, 7mwu:A, 7mwv:A
8	7sqn:A	503	74	0.0687	0.0537	0.3649	3.09e-04	3itg:B, 4jny:A, 4jnz:A, 7mwt:A, 7mwu:A, 7mwv:A
9	3haz:A	983	339	0.4631	0.1851	0.5369	1.17e-111	6bsn:A, 6bsn:B, 3haz:B, 4q71:A, 4q71:B, 4q72:A, 4q72:B, 4q73:A, 4q73:B
10	5ur2:B	959	343	0.2799	0.1147	0.3207	2.56e-41	5ur2:A, 5ur2:C, 5ur2:D
11	7na0:A	981	389	0.2977	0.1193	0.3008	7.30e-36	7na0:B, 4nm9:A, 4nm9:B, 4nma:A, 4nma:B, 4nmb:A, 4nmb:B, 4nmc:B, 4nmd:A, 4nmd:B, 4nme:A, 4nme:B, 4nmf:A, 4nmf:B
12	4nmc:A	941	321	0.2545	0.1063	0.3115	3.19e-28
13	4h6q:A	281	316	0.2188	0.3060	0.2722	5.63e-13	4h6q:C, 4h6r:A, 4h6r:C
14	2g37:B	300	310	0.2188	0.2867	0.2774	2.23e-10	2ekg:A, 2ekg:B, 2g37:A, 5m42:A
15	5ux5:A	963	166	0.1221	0.0498	0.2892	0.009	5ux5:B, 5ux5:C, 5ux5:D
16	8wil:A	574	53	0.0509	0.0348	0.3774	0.90	8wim:A
17	3tkn:A	451	77	0.0585	0.0510	0.2987	4.3	3pbp:A, 3pbp:D, 3pbp:G, 3pbp:J, 3tkn:G, 3tkn:D
18	2bzf:A	88	78	0.0560	0.2500	0.2821	4.6
19	8hmo:A	205	45	0.0356	0.0683	0.3111	5.1	8hmo:B, 8hmo:C, 8hmo:D, 8hmo:E, 8hmo:F
20	1iwa:A	473	52	0.0356	0.0296	0.2692	6.1	1bwv:A, 1bwv:C, 1bwv:E, 1bwv:G, 4f0h:A, 1iwa:C, 1iwa:E, 1iwa:I, 1iwa:K, 1iwa:M, 1iwa:O
21	2pmq:B	374	39	0.0382	0.0401	0.3846	6.5	4h2h:A, 4h2h:B, 4h2h:C, 4h2h:D, 4h2h:E, 4h2h:F, 4h2h:G, 4h2h:H, 2pmq:A
22	3jrx:A	496	80	0.0509	0.0403	0.2500	7.7	5kkn:B, 5kkn:C

[Back]