Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SRLLLNNGAKMPILGLGTWKSPPGQVTEAVKVAIDVGYRHIDCAHVYQNENEVGVAIQEKLREQVVKREELFIVSKLWCT
YHEKGLVKGACQKTLSDLKLDYLDLYLIHWPTGFKPGKEFFPLDESGNVVPSDTNILDTWAAMEELVDEGLVKAIGISNF
NHLQVEMILNKPGLKYKPAVNQIECHPYLTQEKLIQYCQSKGIVVTAYSPLGSPDDPRIKAIAAKHNKTTAQVLIRFPMQ
RNLVVIPKSVTPERIAENFKVFDFELSSQDMTTLLSYNRNWRVSALLSCTSHKDYPFHEEF

The query sequence (length=301) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 8b34:A 318 314 0.9900 0.9371 0.9490 0.0 8a4n:A, 1abn:A, 2acq:A, 2acr:A, 2acs:A, 2acu:A, 1ads:A, 8ae9:A, 2agt:A, 8aqg:A, 8aqp:A, 8auu:A, 1az1:A, 1az2:A, 8b3n:A, 8b3r:A, 8b66:A, 3bcj:A, 8bjl:A, 8cnf:A, 8cnp:A, 3dn5:A, 2dux:A, 2duz:A, 2dv0:A, 1ef3:A, 1ef3:B, 1el3:A, 2f2k:A, 6f7r:A, 6f81:A, 6f82:A, 6f84:A, 6f8o:A, 8fh5:A, 8fh6:A, 8fh7:A, 8fh8:A, 8fh9:A, 2fz8:A, 2fz9:A, 2fzb:A, 2fzd:A, 3g5e:A, 4gca:A, 3ghr:A, 3ghs:A, 3ght:A, 3ghu:A, 5ha7:A, 5ha7:B, 2hv5:A, 2hvn:A, 2hvo:A, 2i16:A, 2i17:A, 1iei:A, 4igs:A, 2ikg:A, 2ikh:A, 2iki:A, 2ikj:A, 2ine:A, 2inz:A, 2ipw:A, 2iq0:A, 2iqd:A, 2is7:A, 2isf:A, 2j8t:A, 4jir:A, 4lau:A, 4laz:A, 3lbo:A, 4lb3:A, 4lb4:A, 4lbr:A, 4lbs:A, 3ld5:A, 3len:A, 3lep:A, 3lqg:A, 3lql:A, 3lz3:A, 3lz5:A, 3m0i:A, 3m4h:A, 3m64:A, 1mar:A, 3mb9:A, 3mc5:A, 4nkc:A, 2nvc:A, 2nvd:A, 3onb:A, 3onc:A, 5ou0:A, 5ouj:A, 5ouk:A, 8oz2:A, 3p2v:A, 8p2r:A, 2pd5:A, 2pd9:A, 2pdb:A, 2pdc:A, 2pdf:A, 2pdg:A, 2pdh:A, 2pdi:A, 2pdj:A, 2pdk:A, 2pdl:A, 2pdm:A, 2pdn:A, 2pdp:A, 2pdq:A, 2pdu:A, 2pdw:A, 2pdx:A, 2pdy:A, 2pev:A, 2pf8:A, 2pfh:A, 4pr4:A, 4prr:A, 4prt:A, 4puu:A, 4puw:A, 1pwl:A, 1pwm:A, 2pzn:A, 3q65:A, 3q65:B, 3q67:A, 3q67:B, 4q7b:A, 4qbx:A, 4qr6:A, 2qxw:A, 4qx4:A, 4qxi:A, 2r24:A, 4rpq:A, 3rx2:A, 3rx3:A, 3rx4:A, 3s3g:A, 6syw:A, 6t27:A, 6t3p:A, 1t40:A, 1t41:A, 3t42:A, 6t5g:A, 6t7q:A, 6td8:A, 6tuc:A, 6tuf:A, 6txp:A, 3u2c:A, 1us0:A, 3v35:A, 3v36:A, 1x96:A, 1x97:A, 1x98:A, 6xum:A, 4xzh:A, 4xzh:B, 4xzi:A, 6y03:A, 6y1p:A, 4ys1:A, 4yu1:A, 1z3n:A, 1z89:A, 1z8a:A
2 1ah0:A 315 314 0.8571 0.8190 0.8217 0.0 1ah3:A, 1ah4:A, 1eko:A
3 4gq0:A 318 310 0.6877 0.6509 0.6677 2.31e-156 4ga8:A, 4gab:A, 4gqg:A, 4i5x:A, 4icc:X, 4jih:A, 4jii:X, 5lik:X, 5liu:X, 5liw:X, 5lix:X, 5liy:X, 5m2f:X, 4wev:X, 4xzl:X, 4xzm:X, 4xzn:X, 5y7n:A, 1zua:X
4 1c9w:A 315 310 0.6944 0.6635 0.6742 1.92e-145 1frb:A
5 3o3r:A 315 310 0.6844 0.6540 0.6645 4.39e-144 3o3r:B, 3qkz:A, 3qkz:B
6 1q13:A 322 317 0.5150 0.4814 0.4890 9.78e-112 1q13:B, 1q5m:A, 1q5m:B
7 3bur:A 325 318 0.5116 0.4738 0.4843 3.63e-110 3bur:B, 3buv:B, 3buv:A, 3bv7:A, 3bv7:B, 3caq:A, 3caq:B, 3cas:A, 3cas:B, 3cav:A, 3cav:B, 3cmf:A, 3cmf:B, 3cot:A, 3cot:B, 3dop:A, 3dop:B, 3g1r:A, 3g1r:B, 3uzw:A, 3uzw:B, 3uzx:A, 3uzx:B, 3uzy:A, 3uzy:B, 3uzz:A, 3uzz:B
8 2fvl:A 323 317 0.4917 0.4582 0.4669 8.22e-105 2fvl:B, 2fvl:C
9 4l1w:A 325 314 0.4884 0.4523 0.4682 2.04e-102 6a7a:A, 3c3u:A, 3gug:A, 2hdj:A, 2hdj:B, 1ihi:A, 1ihi:B, 6ijx:A, 2ipj:A, 2ipj:B, 1j96:A, 1j96:B, 8jp2:A, 4jq1:A, 4jq1:B, 4jq2:A, 4jq2:B, 4jq3:A, 4jq3:B, 4jq4:A, 4jq4:B, 4jqa:A, 4jqa:B, 4jtq:A, 4jtq:B, 4jtr:A, 4jtr:B, 4l1w:B, 4l1x:A, 4l1x:B, 1mrq:A, 3nty:A, 1xjb:A, 1xjb:B, 4xo6:A, 4xo6:B, 4xo7:A, 4xo7:B, 4yvp:A, 4yvp:B
10 3fx4:A 325 324 0.5050 0.4677 0.4691 9.35e-101 1ae4:A, 3cv7:A, 1cwn:A, 3h4g:A, 1hqt:A
11 4zfc:B 320 310 0.4751 0.4469 0.4613 2.94e-100 6a7b:A, 6a7b:B, 8bbs:B, 8bbs:A, 7c7f:A, 7c7f:B, 7c7g:A, 7c7g:B, 7c7h:A, 7c7h:B, 4dbs:A, 4dbs:B, 4dbu:A, 4dbu:B, 4dbw:A, 4dbw:B, 4dz5:A, 6f2u:A, 6f2u:B, 2f38:A, 6f78:A, 6f78:B, 4fa3:A, 4fal:A, 4fam:A, 4fam:B, 9ffd:A, 9ffd:B, 2fgb:A, 6gxk:A, 6gxk:B, 4h7c:A, 4hmn:A, 5hnt:A, 5hnt:C, 5hnu:A, 5hnu:C, 8i0c:A, 8i0c:B, 8jp1:A, 8jp1:B, 3r43:A, 3r58:A, 3r6i:A, 3r7m:A, 3r8g:A, 3r8h:A, 3r94:A, 8rb6:A, 8rb6:B, 1ry0:A, 1ry0:B, 1ry8:A, 1ry8:B, 1s1p:A, 1s1r:A, 1s2a:A, 1s2c:A, 3ufy:A, 3ug8:A, 3ugr:A, 3uwe:A, 4wdt:A, 4wdu:A, 4wdw:A, 4wdw:B, 4wdx:A, 4wdx:B, 7wqm:A, 7wqm:B, 7wqr:A, 7wqr:B, 7wqs:A, 7wqs:B, 4wrh:A, 7x3l:A, 7x3l:B, 7x3m:A, 7x3m:B, 7x3o:A, 7x3o:B, 1xf0:A, 4xvd:A, 4xvd:B, 4xve:A, 4yvv:A, 4yvv:B, 4yvx:A, 4yvx:B, 4zfc:A, 1zq5:A
12 3cv6:A 323 316 0.4751 0.4427 0.4525 3.33e-99 3cv6:B, 2he5:A, 2he5:B, 2he5:C, 2he5:D, 2hej:A, 2hej:B, 2ipf:A, 2ipf:B, 2ipg:A, 2ipg:B, 2p5n:A, 2p5n:B
13 1afs:A 319 313 0.4751 0.4483 0.4569 1.37e-96 1afs:B, 1lwi:A, 1lwi:B
14 3ln3:A 319 314 0.4817 0.4545 0.4618 1.77e-96 6m7k:A, 5uxf:A
15 7s5f:B 309 298 0.4485 0.4369 0.4530 5.43e-82 7s5f:A, 7s5f:C, 7s5f:D
16 3h7u:A 312 272 0.4219 0.4071 0.4669 4.79e-81
17 5ket:A 328 327 0.4319 0.3963 0.3976 1.05e-77 5ket:B
18 5jh2:A 257 265 0.4086 0.4786 0.4642 9.87e-76
19 3wcz:A 307 311 0.4120 0.4039 0.3987 2.60e-74
20 5zcm:A 329 303 0.4319 0.3951 0.4290 8.03e-73
21 4g5d:A 283 286 0.4219 0.4488 0.4441 4.58e-72 4g5d:B
22 5az1:A 327 314 0.4120 0.3792 0.3949 9.83e-72 5az0:A
23 5z6t:A 317 307 0.4286 0.4069 0.4202 3.62e-71 5z6t:B
24 1k8c:B 319 306 0.4319 0.4075 0.4248 6.32e-71 1k8c:A, 1k8c:C, 1k8c:D, 1mi3:A, 1mi3:B, 1mi3:C, 1mi3:D, 1r38:A, 1r38:B, 1r38:C, 1r38:D, 1sm9:A, 1sm9:B, 1sm9:C, 1sm9:D, 1ye4:A, 1ye4:B, 1ye4:C, 1ye4:D, 1ye6:A, 1ye6:B, 1ye6:C, 1ye6:D, 1z9a:A, 1z9a:B, 1z9a:C, 1z9a:D
25 3h7r:A 307 282 0.4053 0.3974 0.4326 6.97e-71
26 3krb:A 307 289 0.3987 0.3909 0.4152 1.54e-68 3krb:B
27 1vbj:A 281 284 0.4053 0.4342 0.4296 5.12e-68 1vbj:B
28 7f7k:B 310 274 0.4319 0.4194 0.4745 7.00e-67 7f7k:A, 7f7l:A, 7f7l:B, 7f7m:A, 7f7m:B, 7w1w:A, 7w1w:B, 7w1x:A, 7w1x:B
29 2bgs:A 308 287 0.3953 0.3864 0.4146 1.78e-65 2vdg:A
30 4gie:A 288 291 0.3854 0.4028 0.3986 1.37e-64 4fzi:A, 4fzi:B
31 3d3f:A 275 284 0.4120 0.4509 0.4366 8.67e-62 3d3f:B
32 1vp5:A 284 300 0.3821 0.4049 0.3833 1.36e-61 1vp5:B
33 3b3d:A 280 288 0.3887 0.4179 0.4062 1.65e-58 3b3d:B, 3b3d:C
34 3wbw:A 271 278 0.3422 0.3801 0.3705 2.13e-58 3wbw:B, 3wby:A, 3wby:B
35 5jgw:A 314 287 0.3920 0.3758 0.4111 6.82e-55 5jgw:B, 5jgw:C, 5jgw:D, 5jgy:A, 5jgy:B
36 2wzm:A 274 274 0.3322 0.3650 0.3650 1.08e-53 2wzm:B
37 1a80:A 277 278 0.3289 0.3574 0.3561 5.27e-52 1m9h:A
38 1zgd:A 308 296 0.3721 0.3636 0.3784 1.78e-51 1zgd:B
39 4ijr:A 328 276 0.3488 0.3201 0.3804 5.28e-51 4ijr:C
40 6kik:A 275 294 0.3189 0.3491 0.3265 1.05e-37 5dan:A, 6kiy:A, 6ky6:A, 6ky6:B
41 4h8n:A 303 320 0.3189 0.3168 0.3000 5.59e-37 4h8n:B
42 3wg6:A 299 290 0.2924 0.2943 0.3034 8.47e-37 3wg6:B, 3wg6:C, 3wg6:D
43 5c7h:A 281 282 0.2890 0.3096 0.3085 4.68e-30 4pmj:A
44 6cia:A 284 285 0.2757 0.2923 0.2912 8.91e-24 4wgh:A
45 1pz1:A 333 228 0.1993 0.1802 0.2632 7.00e-14 1pz1:B
46 3v0s:A 287 288 0.2126 0.2230 0.2222 5.47e-11 3v0t:A
47 8hnq:A 286 285 0.2193 0.2308 0.2316 2.59e-09
48 1lqa:A 346 162 0.1595 0.1387 0.2963 2.05e-08 1lqa:B
49 1pz0:A 311 298 0.2259 0.2186 0.2282 5.13e-08
50 7twz:A 298 213 0.1761 0.1779 0.2488 2.35e-07 7twz:B, 7twz:C, 7twz:D, 7twz:E, 7twz:F
51 5t79:A 315 232 0.1960 0.1873 0.2543 3.98e-07 3erp:A, 3erp:B
52 8hw0:A 329 176 0.1628 0.1489 0.2784 4.64e-07
53 7bc1:A 295 233 0.1761 0.1797 0.2275 1.04e-06
54 1og6:C 298 213 0.1761 0.1779 0.2488 9.18e-06 1og6:A, 1og6:B
55 7ezi:A 323 313 0.2558 0.2384 0.2460 1.14e-05 7ezl:A
56 6hg6:A 313 298 0.2159 0.2077 0.2181 1.15e-05
57 1ynp:B 298 161 0.1296 0.1309 0.2422 4.05e-05 1ynp:A, 1ynq:A, 1ynq:B
58 7wf3:C 328 176 0.1362 0.1250 0.2330 4.47e-05 2a79:A, 3eau:A, 3eb3:A, 3eb4:A, 6ebk:A, 6ebk:C, 6ebk:E, 6ebk:G, 6ebl:A, 6ebl:C, 6ebl:E, 6ebl:G, 7ej1:A, 7ej1:C, 7ej1:E, 7ej1:G, 7ej2:A, 7ej2:C, 7ej2:E, 7ej2:G, 1exb:A, 4jta:A, 4jta:P, 4jtc:A, 4jtc:G, 4jtd:A, 4jtd:G, 3lnm:A, 3lnm:C, 3lut:A, 1qrq:A, 1qrq:B, 1qrq:C, 1qrq:D, 2r9r:A, 2r9r:G, 7sit:A, 7sit:C, 7siz:A, 7siz:C, 7wf3:G, 7wf3:I, 7wf3:M, 7wf4:G, 7wf4:I, 7wf4:M, 7wf4:o, 5wie:A, 5wie:G, 1zsx:A
59 8usu:A 316 238 0.2027 0.1930 0.2563 2.42e-04 8usu:B
60 8jwo:L 311 308 0.2060 0.1994 0.2013 6.14e-04 8jwk:H, 8jwo:A, 8jwo:C, 8jwo:D, 8jwo:E, 8jwo:G, 8jwo:I, 8jwo:K, 8jwo:M, 8jwo:O
61 7svq:A 315 287 0.2292 0.2190 0.2404 0.001 7svq:B
62 8jwm:B 331 230 0.1595 0.1450 0.2087 0.008 8jwk:D, 8jwk:J, 8jwk:L, 8jwk:N, 8jwk:P, 8jwl:C, 8jwl:H, 8jwm:A, 8jwm:C, 8jwm:D, 8jwm:E, 8jwm:F, 8jwm:G, 8jwm:H, 8jwn:A, 8jwn:B, 8jwn:C, 8jwn:D, 8jwn:E, 8jwn:F, 8jwn:G, 8jwn:H, 8jwo:B, 8jwo:F, 8jwo:H, 8jwo:J, 8jwo:N, 8jwo:P, 8xr4:A, 8xr4:B, 8xr4:C, 8xr4:D, 8xr4:E, 8xr4:F, 8xr4:G, 8xr4:H
63 6dlu:P 747 76 0.0598 0.0241 0.2368 1.0 2aka:B, 5d3q:A, 5d3q:B, 6dlu:B, 6s9a:B, 2x2e:A, 2x2e:D, 2x2f:A, 2x2f:D, 3zyc:A, 3zyc:D
64 7ova:DDD 231 129 0.1163 0.1515 0.2713 1.2 7ova:AAA, 7ova:BBB, 7ova:CCC
65 5gz9:A 280 87 0.0831 0.0893 0.2874 1.9
66 1lqt:B 454 57 0.0532 0.0352 0.2807 4.0 2c7g:A, 1lqt:A, 1lqu:A, 1lqu:B
67 7evg:A 426 86 0.0698 0.0493 0.2442 5.3 7don:B, 7evb:B, 7evc:B, 7evd:B, 7eve:B, 7evh:A, 7evi:B, 7evk:B, 7evl:B, 7f1a:B, 7f1b:A
68 7un9:G 241 49 0.0498 0.0622 0.3061 5.5
69 8dgf:A 1541 48 0.0532 0.0104 0.3333 6.4 8dgf:B, 8dgf:C, 8dgf:D
70 7csz:A 175 60 0.0698 0.1200 0.3500 9.2

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218