BioLiP

>protein
SREEVESLIQEVLEVYPEKARKDRNKHLAVNDPAVTQSKKCIISNKKSQPGLMTIRGCAYAGSKGVVWGPIKDMIHISHG
PVGCGQYSRAGRRNYYIGTTGVNAFVTMNFTSDFQEKDIVFGGDKKLAKLIDEVETLFPLNKGISVQSECPIGLIGDDIE
SVSKVKGAELSKTIVPVRCEGFRGVSQSLGHHIANDAVRDWVLGKRDEDTFASTPYDVAIIGDYNIGGDAWSSRILLEEM
GLRCVAQWSGDGSISEIELTPKVKLNLVHCYRSMNYISRHMEEKYGIPWMEYNFFGPTKTIESLRAIAAKFDESIQKKCE
EVIAKYKPEWEAVVAKYRPRLEGKRVMLYIGGLRPRHVIGAYEDLGMEVVGTGYEFAHNDDYDRTMKEMGDSTLLYDDVT
GYEFEEFVKRIKPDLIGSGIKEKFIFQKMGIPFREMHSWDYSGPYHGFDGFAIFARDMDMTLNNPCWKKLQAPWEA

The query sequence (length=476) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4xpi:A	479	477	1.0000	0.9937	0.9979	0.0	2afh:A, 2afh:C, 2afi:A, 2afi:C, 2afi:I, 2afi:K, 6bbl:A, 6bbl:C, 8bts:A, 8bts:C, 8bts:H, 8bts:J, 5bvg:A, 5bvg:C, 5bvh:A, 5bvh:C, 6cdk:A, 6cdk:C, 8crs:A, 8crs:C, 5cx1:A, 5cx1:C, 5cx1:E, 5cx1:G, 5cx1:I, 5cx1:K, 5cx1:M, 5cx1:O, 8dbx:A, 8dbx:C, 8dby:A, 8dby:C, 8dfc:A, 8dfc:C, 8dfd:A, 8dfd:C, 8dpn:A, 8dpn:C, 8e3t:A, 8e3t:C, 8e3u:A, 8e3u:C, 8e3v:A, 8e3v:C, 8enl:A, 8enm:A, 8enm:C, 8enn:A, 8enn:C, 8eno:A, 1fp4:A, 1fp4:C, 1g20:A, 1g20:C, 1g21:A, 1g21:C, 7jrf:A, 7jrf:C, 3k1a:A, 3k1a:C, 1m1n:A, 1m1n:C, 1m1n:E, 1m1n:G, 1m1y:A, 1m1y:C, 1m1y:I, 1m1y:K, 1m34:A, 1m34:C, 1m34:I, 1m34:K, 7mci:A, 7mci:C, 2min:A, 2min:C, 3min:A, 3min:C, 1n2c:A, 1n2c:C, 4nd8:A, 4nd8:C, 6o7l:A, 6o7l:C, 6o7m:A, 6o7m:C, 6o7n:A, 6o7n:C, 6o7o:A, 6o7o:C, 6o7p:A, 6o7p:C, 6o7q:A, 6o7q:C, 6o7r:A, 6o7r:C, 6o7s:A, 6o7s:C, 6op1:A, 6op1:C, 6op2:A, 6op2:C, 6op3:A, 6op3:C, 6op4:A, 6op4:C, 8p8g:A, 8p8g:C, 4tku:A, 4tku:C, 4tkv:A, 4tkv:C, 3u7q:A, 3u7q:C, 6ug0:A, 6ug0:C, 7ut6:A, 7ut6:C, 7ut7:A, 7ut7:C, 7ut8:A, 7ut8:C, 7ut9:A, 7ut9:C, 7uta:A, 7uta:C, 5vq4:A, 5vq4:C, 6vxt:A, 6vxt:C, 4wna:A, 4wna:C, 4wza:A, 4wza:C, 4wzb:A, 4wzb:C, 4xpi:C
2	8eno:C	407	432	0.8466	0.9902	0.9329	0.0	1l5h:A
3	1h1l:A	478	468	0.7311	0.7280	0.7436	0.0	1h1l:C, 1qgu:A, 1qgu:C, 1qh1:A, 1qh1:C, 1qh8:A, 1qh8:C
4	8enl:C	382	433	0.8004	0.9974	0.8799	0.0
5	5koh:A	483	472	0.7227	0.7122	0.7288	0.0	5koh:C, 5koj:A, 5koj:C
6	5vpw:C	495	502	0.4076	0.3919	0.3865	4.94e-122
7	1mio:A	525	525	0.4097	0.3714	0.3714	3.42e-119	1mio:C, 5vpw:A, 5vq3:A, 5vq3:C, 4wes:A, 4wes:C, 4wn9:A, 4wn9:C
8	7adr:A	473	451	0.3172	0.3192	0.3348	1.02e-80	7adr:D, 7ady:A, 7ady:D, 7aiz:A, 7aiz:D, 6fea:A, 6fea:D, 5n6y:A, 5n6y:D
9	8oie:A	520	418	0.2983	0.2731	0.3397	1.79e-70	8oie:F
10	3pdi:A	427	434	0.2878	0.3208	0.3157	2.48e-70	3pdi:C, 3pdi:E, 3pdi:G
11	8boq:A	515	461	0.3130	0.2893	0.3232	2.64e-66	8boq:D
12	8boq:B	461	478	0.2353	0.2430	0.2343	1.45e-05	8boq:E
13	3aer:D	421	241	0.1239	0.1401	0.2448	5.52e-05	3aek:B, 3aek:D, 3aeq:B, 3aeq:D, 3aer:B, 3aes:B, 3aes:D, 3aet:B, 3aet:D, 3aeu:D
14	8oie:C	456	218	0.1155	0.1206	0.2523	1.53e-04	8oie:H, 8pbb:B, 8pbb:D
15	7adr:E	466	134	0.0735	0.0751	0.2612	2.76e-04	7adr:B, 7ady:B, 7ady:E, 7aiz:B, 7aiz:E, 6fea:B, 6fea:E, 5n6y:B, 5n6y:E
16	2ynm:D	488	191	0.1113	0.1086	0.2775	8.42e-04
17	5koh:B	510	145	0.0798	0.0745	0.2621	0.46	5koh:D, 5koj:B, 5koj:D
18	3bwe:A	188	80	0.0483	0.1223	0.2875	1.3	6af5:A, 6af9:A, 6afa:A, 6afb:A, 6afc:A, 6afd:A, 6afe:A, 6aff:A, 6afg:A, 6afh:A, 6afi:A, 6afj:A, 6afl:A, 3bwe:C, 3bwe:D, 3bwe:E, 3bwe:F, 4mnt:A, 4n0m:A, 4p35:A, 4p36:A, 7pa2:AAA, 7pa3:AAA, 8ppw:A, 8pq0:A
19	5jip:A	317	114	0.0672	0.1009	0.2807	1.7	5jip:B
20	2w6i:G	263	95	0.0504	0.0913	0.2526	3.1
21	3k2s:A	243	114	0.0546	0.1070	0.2281	4.1	6cch:A, 3k2s:B, 7rsc:D, 7rsc:E, 7rse:D, 7rse:E, 6w4e:D
22	1qd1:B	325	94	0.0441	0.0646	0.2234	4.6	1qd1:A
23	8x6f:C	1153	62	0.0420	0.0173	0.3226	6.5
24	3j8g:X	418	68	0.0483	0.0550	0.3382	6.8
25	4d1q:H	509	169	0.0756	0.0707	0.2130	7.3	4d1q:A, 4d1q:B, 4d1q:G
26	4xyp:A	70	43	0.0294	0.2000	0.3256	7.4
27	4jxt:A	130	32	0.0273	0.1000	0.4062	8.1
28	5y6p:a8	362	39	0.0294	0.0387	0.3590	9.5	5y6p:a9

[Back]