BioLiP

>protein
SRANDAPIVLLHGFTGWGREEMFGFKYWGGVRGDIEQWLNDNGYRTYTLAVGPLSSNWDRACEAYAQLVGGTVDYGAAHA
AKHGHARFGRTYPGLLPELKRGGRIHIIAHSQGGQTARMLVSLLENGSQEEREYAKAHNVSLSPLFEGGHHFVLSVTTIA
TPHDGTTLVNMVDFTDRFFDFQKAVLKAAAVASNVPYTSQVYDFKLDQWGLRRQPGESFDQYFERLKRSPVWTSTDTARY
DLSVPGAEKLNQWVKASPNTYYLSFATERTYRGALTGNYYPELGMNAFSAVVCAPFLGSYRNATLGIDDRWLENDGIVNA
FSMNGPKRGSTDRIVPYDGTIKKGVWNDMGTYNVDHLEVIGVDPNPLFDIRAFYLRLAEQLASLQPHHHHHH

The query sequence (length=392) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6fz1:A	392	392	0.9949	0.9949	0.9949	0.0	6a12:A, 3auk:A, 7buk:A, 7buk:B, 5ce5:A, 2dsn:A, 2dsn:B, 7ey3:A, 7ey3:B, 4fdm:A, 4fkb:A, 4fkb:B, 4fmp:A, 4fmp:B, 6fz7:A, 6fz8:A, 6fz9:A, 6fza:A, 6fzc:A, 6fzd:A, 1ji3:A, 1ji3:B, 1ku0:A, 1ku0:B, 6s3g:A, 6s3j:A, 6s3v:A, 3umj:A, 3umj:B, 2w22:A, 4x6u:A, 4x71:A, 4x7b:A, 4x85:A, 5xpx:A, 5xpx:E, 2z5g:A, 2z5g:B
2	5ah0:B	387	392	0.4770	0.4832	0.4770	1.30e-113	5ah0:A
3	5ah1:A	427	387	0.4617	0.4239	0.4677	8.45e-113
4	2hih:A	387	392	0.3622	0.3669	0.3622	3.02e-72	2hih:B
5	8k7p:A	382	392	0.3393	0.3482	0.3393	6.28e-69	8k7p:B, 8k7q:A, 8k7q:B, 6ksi:A, 6ksi:B, 6ksl:A, 6ksl:B, 6ksm:A, 6ksm:B, 8s9r:A, 8s9r:B, 8yib:A, 8yib:B
6	7cof:A	320	189	0.1122	0.1375	0.2328	0.005	7cog:A, 7cog:B, 7cog:C, 7cog:D, 1hqd:A, 2lip:A, 3lip:A, 4lip:D, 4lip:E, 5lip:A, 2nw6:A, 1oil:A, 1oil:B, 1ys1:X, 1ys2:X
7	1tah:B	318	241	0.1403	0.1730	0.2282	0.021	1cvl:A, 2es4:A, 2es4:B, 1qge:E, 1tah:A, 1tah:C, 1tah:D
8	4yn3:A	596	90	0.0714	0.0470	0.3111	0.069	3vta:A, 3vta:B
9	4hs9:A	287	54	0.0485	0.0662	0.3519	0.070	4gw3:A, 4gxn:A, 6jd9:A
10	1e59:A	239	37	0.0434	0.0711	0.4595	0.30
11	1cjy:A	633	144	0.0842	0.0521	0.2292	0.98	1bci:A, 1cjy:B, 1rlw:A
12	2a3c:A	395	108	0.0714	0.0709	0.2593	1.0	2a3a:A, 2a3a:B, 2a3b:A, 2a3b:B, 2a3c:B, 2a3e:A, 2a3e:B, 3ch9:A, 3ch9:B, 3chc:A, 3chc:B, 3chd:A, 3chd:B, 3che:A, 3che:B, 3chf:A, 3chf:B, 2iuz:A, 2iuz:B, 1w9u:A, 1w9u:B, 1w9v:A, 1w9v:B
13	1l8x:B	354	32	0.0332	0.0367	0.4062	1.2
14	6ky3:A	353	128	0.0816	0.0907	0.2500	1.8
15	2xlq:A	316	92	0.0587	0.0728	0.2500	1.9	2xm7:A
16	7dd9:A	1129	50	0.0434	0.0151	0.3400	2.4	7dd9:C, 7dd9:E, 7dd9:G, 6lz1:A, 6lz1:B, 6lz1:C, 6lz1:D
17	1iiu:A	174	62	0.0459	0.1034	0.2903	2.9
18	7ejw:A	274	90	0.0638	0.0912	0.2778	3.8	7ejw:B, 5j1j:A, 5j1j:B, 8p53:A, 8p53:B, 8pb9:A, 8pb9:B
19	5a39:B	115	18	0.0255	0.0870	0.5556	8.1	5a39:A, 5a3d:A, 5a3d:B, 5g32:A, 5g32:B, 5g33:A, 5g33:B, 5g34:A, 5g34:B, 5g35:A, 5g35:B, 5lcl:A, 5lcl:B, 5lcm:A, 5lcm:B
20	3hia:B	83	46	0.0306	0.1446	0.2609	9.6	3hia:A, 3hia:C

[Back]