Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SQPSTANGGFPSVVVTAVTATTSISPDIESTWKGLLAGESGIHALEDEFVTKWDLAVKIGGHLKDPVDSHMGRLDMRRMS
YVQRMGKLLGGQLWESAGSPEVDPDRFAVVVGTGLGGAERIVESYDLMNAGGPRKVSPLAVQMIMPNGAAAVIGLQLGAR
AGVMTPVSAQSSGSEAIAHAWRQIVMGDADVAVCGGVEGPIEALPIAAFSMMRAMSTRNDEPERASRPFDKDRDGFVFGE
AGALMLIETEEHAKARGAKPLARLLGAGITSDAFHMVAPAADGVRAGRAMTRSLELAGLSPADIDHVNAHGTATPIGDAA
EANAIRVAGCDQAAVYAPKSALGHSIGAVGALESVLTVLTLRDGVIPPTLNYETPDPEIDLDVVAGEPRYGDYRYAVNNS
FGFGGHNVALAFGRY

The query sequence (length=415) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 4c6v:A 415 415 0.9976 0.9976 0.9976 0.0 4c6u:A, 4c6w:A, 4c6w:B, 4c6x:A, 4c6x:B, 4c6z:A, 4c6z:B, 4c70:A, 4c70:B, 4c71:A, 4c71:B, 4c72:A, 4c72:B, 4c73:A, 4c73:B, 5ld8:A, 5ld8:B, 6p9k:A, 6p9l:A, 6p9m:A, 5w2o:A, 5w2p:A, 5w2q:A, 5w2s:A, 2wge:A, 2wgg:A, 2wgg:B, 2wgg:C, 2wgg:D, 2wgg:E, 2wgg:F, 2wgg:G, 2wgg:H, 6y2i:AAA, 6y2i:BBB, 6y2j:AAA, 6y2j:BBB, 6y2j:CCC, 6y2j:DDD, 6y2j:EEE, 6y2j:FFF, 6y2j:GGG, 6y2j:HHH
2 4ls8:A 416 410 0.3928 0.3918 0.3976 1.34e-96 4ls7:A, 4ls7:B, 4ls8:B
3 8cou:A 413 409 0.3831 0.3850 0.3888 5.64e-88 4b7v:A, 4b7v:B, 8cn2:B, 8cn2:A, 8cn4:A, 8cn4:B, 8cn5:B, 8cn5:A, 8cn7:A, 8cn7:B, 8cne:A, 8cne:B, 8cng:A, 8cng:B, 8cou:B, 8cov:A, 8cov:B, 4jb6:A, 4jb6:B, 4jpf:A, 7oc0:A, 7oc0:B, 7oc1:A, 7oc1:B, 8pd1:A, 8pd1:B, 8pfz:A, 8pfz:B, 8pj0:A, 8pj0:B, 8pj0:C, 8pj0:D, 8qer:A, 8qer:B, 8qm1:A, 8qm1:B, 8r0i:A, 8r0i:B, 8r1v:A, 8r1v:B, 5sn5:A, 5sn6:A, 5sn7:A, 5sn7:B, 5sn8:A, 5sn9:A, 5sna:B, 5snb:A, 5snc:A, 5snd:A, 5snd:B, 5sne:A, 5sne:B, 5snf:A, 5sng:A, 5snh:A, 5snh:B, 5sni:A, 5sni:B, 5snj:A, 5snj:B, 5snk:A, 5snl:B, 5snm:A, 5snn:A, 5snn:B, 5sno:A, 5sno:B, 5snp:A, 5snp:B, 5snq:B, 5sns:B, 5snt:A, 5snu:A, 5snu:B, 5snv:A, 5snv:B, 5snw:A, 5snx:A, 5snx:B, 5sny:A, 5snz:B, 5so0:A, 5so0:B, 5so1:A, 5so1:B, 5so2:A, 5so2:B, 5so3:A, 5so4:A, 5so4:B, 5so5:A, 5so5:B, 5so6:A, 5so7:A, 5so7:B, 5so8:A, 5so8:B, 5so9:B, 5soa:A, 5sob:A, 5sob:B, 5soc:A, 5soc:B, 5sod:A, 5soe:A, 5soe:B, 5sof:A, 5sog:A, 5sog:B, 5soh:A
4 7l4l:A 412 409 0.4120 0.4150 0.4181 6.82e-84 1b3n:A, 3g0y:A, 3g11:A, 2gfx:A, 3hnz:A, 3ho2:A, 3ho9:A, 3i8p:A, 7l4e:A, 7l4l:B, 6okg:A, 6olt:A
5 4f32:B 423 419 0.3880 0.3806 0.3842 2.16e-82 4f32:A
6 2ix4:A 431 428 0.3904 0.3759 0.3785 9.30e-77 2ix4:B
7 1ox0:A 414 410 0.3542 0.3551 0.3585 3.03e-76 2alm:A, 1oxh:A, 1oxh:B, 1oxh:C, 1oxh:D
8 2iwz:A 426 418 0.3566 0.3474 0.3541 6.01e-65 2iwz:B
9 1tqy:A 421 363 0.2964 0.2922 0.3388 1.50e-53 1tqy:C, 1tqy:E, 1tqy:G
10 4jv3:A 407 410 0.3229 0.3292 0.3268 9.92e-52 3mqd:A, 3u0e:A, 3u0f:A
11 5kof:A 407 406 0.3301 0.3366 0.3374 1.38e-46 2aq7:A, 2aq7:B, 2aq7:D, 2aqb:A, 2aqb:B, 2aqb:D, 2bui:A, 2bui:B, 2bui:C, 2bui:D, 1fj4:A, 1fj4:B, 1fj4:C, 1fj4:D, 1fj8:A, 1fj8:B, 1fj8:C, 1fj8:D, 5kof:B, 6okc:A, 6okc:B, 6okf:A, 6okf:B, 8sms:B, 8sms:A, 7sqi:B, 7sqi:A, 7sz9:A, 7sz9:B, 2vb8:A, 2vb8:B, 2vb8:C, 2vb8:D, 2vba:A, 2vba:B
12 6smp:B 417 318 0.2434 0.2422 0.3176 2.20e-43 6smo:B, 6smo:D, 6smo:F, 6smp:E, 6smp:H, 6smp:K
13 6kxf:A 403 418 0.3205 0.3300 0.3182 5.35e-41
14 8cuy:A 1016 416 0.2723 0.1112 0.2716 3.18e-25
15 2qo3:B 873 390 0.2723 0.1294 0.2897 1.88e-21 2qo3:A
16 7m7f:A 1390 337 0.2386 0.0712 0.2938 6.90e-18 2fr0:A, 2fr1:A, 7m7i:A
17 7s6c:B 891 234 0.1614 0.0752 0.2863 1.43e-17
18 7vef:A 828 286 0.2048 0.1027 0.2972 5.71e-17 8in9:A
19 2vz9:B 2086 262 0.1880 0.0374 0.2977 1.53e-16 2vz9:A
20 6rop:B 831 252 0.1759 0.0878 0.2897 4.22e-16
21 5my0:A 852 252 0.1759 0.0857 0.2897 4.23e-16 5my0:C, 5my0:D, 5my2:D, 6rop:A, 6rop:C, 6rop:D
22 4mz0:B 823 412 0.2337 0.1179 0.2354 2.79e-15
23 4mz0:A 896 412 0.2337 0.1083 0.2354 4.58e-15
24 4v8l:D 2822 300 0.1928 0.0283 0.2667 3.17e-14 4ce4:o, 6hiv:US, 6hiv:UT, 6hiw:US, 6hiw:UT, 6hiy:US, 6hiy:UT, 4v8l:E, 4v8l:F, 4v8l:A, 4v8l:B, 4v8l:C, 4v8v:A, 4v8v:B, 4v8v:C, 4v8v:D, 4v8v:E, 4v8v:F, 4v8w:D, 4v8w:E, 4v8w:F, 4v8w:A, 4v8w:B, 4v8w:C
25 6gjc:A 2770 258 0.1687 0.0253 0.2713 1.80e-11 6gjc:B, 6gjc:C, 6gjc:D, 6gjc:E, 6gjc:F
26 7cpx:A 2262 280 0.1783 0.0327 0.2643 5.71e-11 7cpx:B, 7cpy:A, 7cpy:B
27 6riw:A 923 258 0.1494 0.0672 0.2403 1.66e-09
28 6riw:A 923 142 0.0940 0.0423 0.2746 0.064
29 6smo:E 352 166 0.1036 0.1222 0.2590 2.40e-09 6smo:C, 6smp:C, 6smp:F, 6smp:I, 6smp:L
30 8i4y:A 1687 340 0.2024 0.0498 0.2471 4.35e-07 8i4y:B, 8i4z:A
31 8cg5:A 1282 270 0.1590 0.0515 0.2444 1.25e-05 6fij:B
32 6u5w:A 1435 181 0.1133 0.0328 0.2597 1.47e-04
33 4v59:D 1467 154 0.1012 0.0286 0.2727 1.50e-04 4v59:A, 4v59:B, 4v59:C, 4v59:E, 4v59:F
34 4v59:D 1467 122 0.0867 0.0245 0.2951 6.6 4v59:A, 4v59:B, 4v59:C, 4v59:E, 4v59:F
35 6bjb:A 384 131 0.0964 0.1042 0.3053 0.001 6bjb:B
36 8cg6:A 1208 214 0.1277 0.0439 0.2477 0.002
37 5f38:D 394 130 0.1133 0.1193 0.3615 0.009 5f38:B, 5f38:C
38 8gqn:A 390 127 0.1012 0.1077 0.3307 0.081 8gqn:B, 8gqn:C, 8gqn:D
39 6ql9:D 1765 148 0.0892 0.0210 0.2500 0.17 3hmj:A, 3hmj:B, 3hmj:C, 8prv:A, 8prv:B, 8prw:A, 8prw:B, 8prw:C, 8prw:D, 8prw:E, 8prw:F, 8ps1:A, 6ql6:F, 6ql6:E, 6ql6:D, 6ql6:C, 6ql6:B, 6ql6:A, 6ql9:F, 6ql9:A, 6ql9:E, 6ql9:B, 6ql9:C, 6ta1:A, 6ta1:B, 6ta1:D, 6ta1:K, 6ta1:F, 6ta1:I, 6u5u:A, 2vkz:A, 2vkz:B, 2vkz:C, 2wat:A, 2wat:B, 2wat:C, 2wat:D, 2wat:E, 2wat:F
40 4xl4:A 392 133 0.0892 0.0944 0.2782 0.18 4xl4:B
41 5bz4:K 400 119 0.0867 0.0900 0.3025 0.34 5bz4:B, 5bz4:D, 5bz4:F, 5bz4:H
42 1ou6:A 392 149 0.1229 0.1301 0.3423 0.68 1dlv:A, 1dlv:B, 1dlv:C, 1dlv:D, 1dm3:A, 1dm3:B, 1dm3:C, 1dm3:D, 7lbz:A, 7lbz:B, 7lbz:C, 7lbz:D, 7lca:A, 7lca:B, 7lca:C, 7lca:D, 7lcl:A, 7lcl:B, 7lcl:C, 7lcl:D, 7ld2:A, 7ld2:B, 7ld2:C, 7ld2:D, 7ldc:A, 7ldc:B, 7ldc:C, 7ldc:D, 7ldt:A, 7ldt:B, 7ldt:C, 7ldt:D, 7ldu:A, 7ldu:B, 7ldu:C, 7ldu:D, 7ldv:A, 7ldv:B, 7ldv:C, 7ldv:D, 7ldw:A, 7ldw:B, 7ldw:C, 7ldw:D, 1m1o:A, 1m1o:B, 1m3z:A, 1m3z:B, 1m3z:C, 1m3z:D, 1nl7:A, 1nl7:B, 1ou6:B, 1qfl:A, 1qfl:B, 1qfl:C, 1qfl:D, 2vtz:A, 2vtz:B, 2vtz:C, 2vtz:D, 2vu0:A, 2vu0:B, 2vu1:A, 2vu1:B, 2vu2:A, 2vu2:B, 2wkt:A, 2wkt:B, 2wkt:C, 2wkt:D, 2wku:A, 2wku:B, 2wkv:A, 2wkv:B, 2wkv:C, 2wkv:D, 2wl4:A, 2wl4:B, 2wl5:A, 2wl5:B, 2wl5:C
43 7cw5:B 394 131 0.0916 0.0964 0.2901 0.76 7cw5:A
44 5szj:A 175 61 0.0386 0.0914 0.2623 2.0 5lpn:A, 5lpn:C
45 4oci:A 139 41 0.0337 0.1007 0.3415 2.2
46 6evj:C 748 131 0.0819 0.0455 0.2595 2.5 6evj:F, 6evk:C, 9f2r:C, 9f37:C, 6fhh:C, 6fhi:C, 5m3h:C, 6szu:C, 6szv:C, 6t0n:C, 6t0r:C, 6t0s:C, 6t0u:C, 6t0v:C, 6tw1:C, 4wsb:C
47 7pua:DH 568 146 0.0819 0.0599 0.2329 3.8 6hiv:DH, 6hiw:DH, 6hiz:DH, 7pub:DH
48 4c2j:D 395 124 0.0892 0.0937 0.2984 4.0 4c2j:A, 4c2j:B, 4c2j:C
49 4c2j:D 395 76 0.0554 0.0582 0.3026 5.8 4c2j:A, 4c2j:B, 4c2j:C
50 2d3t:C 390 120 0.0819 0.0872 0.2833 4.7 2d3t:D, 1wdk:C, 1wdk:D, 1wdl:C, 1wdl:D, 1wdm:C, 1wdm:D
51 8gqm:A 377 111 0.0867 0.0955 0.3243 5.7

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218