Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SQLKLLVTRGKEQGYLTYAEVNDHLDQIEDIIQMINDMGIQVMEEDAAEAAAQVLSSVTTDPVRMYMREMGTVELLTREG
EIDIAKRIEDGINQVQCSVAEYPEAITYLLEQYDRVEAEEARLSDLITGFVDIDPELAREKFAELRAQYVVTRDTIKHAT
AQEEILKLSEVFKQFRLVPKQFDYLVNSMRVMMDRVRTQERLIMKLCVEQCKMPKKNFITLFTGNETSDTWFNAAIAMNK
PWSEKLHDVSEEVHRALQKLQQIEEETGLTIEQVKDINRRMSIGEAKARRAKKEMVEANLRLVISIAKKYTNRGLQFLDL
IQEGNIGLMKAVDKFEYRRGYKFSTYATWWIRQAITRSIADQARTIRIPVHMIETINKLNRISRQMLQEMGREPTPEELA
ERMLMPEDKIRKVLKIAKEPISMETPIGDDEDSHLGDFIEDTTLELPLDSATTESLRAATHDVLAGLTAREAKVLRMRFG
IDMNTDYTLEEVGKQFDVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSEVLRSFLDD

The query sequence (length=529) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 6psr:L 548 552 0.9924 0.9580 0.9511 0.0 6n58:L, 6n61:F
2 6n4c:F 558 569 0.9773 0.9265 0.9086 0.0 8ad1:F, 6b6h:F, 7bef:F, 7beg:F, 7c17:F, 7c97:F, 6ca0:F, 7chw:F, 7dy6:F, 8ftd:L, 6jnx:F, 8jo2:F, 6k4y:F, 7khb:F, 7khc:F, 7khe:F, 7khi:F, 6ldi:F, 7mkd:L, 7mke:L, 7mki:L, 7mkj:L, 7n4e:F, 6n57:L, 6n62:F, 6oul:L, 6p18:F, 2p7v:B, 6pb4:F, 6pb5:F, 6pb6:F, 6psq:L, 6pss:L, 6pst:L, 6psu:L, 6psv:L, 6psw:L, 7szj:F, 8to1:L, 8to6:L, 8to8:L, 8toe:L, 8tom:L, 5vt0:L, 7vwy:F, 7vwz:F, 7w5w:F, 7w5x:F, 7w5y:F, 6wmu:F, 6xh7:F, 6xh8:F, 6xl5:F, 6xl9:F, 6xlj:F, 6xll:F, 8y6u:F, 4yln:F, 4yln:L, 4yln:R, 4ylo:F, 4ylo:L, 4ylo:R, 4ylp:F, 4ylp:L, 4ylp:R
3 4kn7:X 517 537 0.9452 0.9671 0.9311 0.0
4 3iyd:F 479 478 0.8450 0.9332 0.9351 0.0
5 8u3b:F 431 477 0.7902 0.9698 0.8763 0.0
6 7ubm:F 353 306 0.5671 0.8499 0.9804 0.0 7ubn:F
7 7ubm:F 353 59 0.0945 0.1416 0.8475 6.90e-23 7ubn:F
8 6n60:F 318 266 0.4877 0.8113 0.9699 0.0 8igr:L, 8igs:L
9 6n60:F 318 60 0.1021 0.1698 0.9000 7.86e-29 8igr:L, 8igs:L
10 7ye1:F 497 498 0.5180 0.5513 0.5502 1.74e-167 7ye2:F, 5yix:A
11 6wmr:Z 470 483 0.4631 0.5213 0.5072 4.69e-155 6wmt:Z
12 7xya:F 302 305 0.3497 0.6126 0.6066 1.89e-128
13 7ckq:F 272 238 0.3119 0.6066 0.6933 1.18e-116 7f75:F, 8x6f:E
14 7ckq:F 272 41 0.0359 0.0699 0.4634 0.002 7f75:F, 8x6f:E
15 7l7b:F 272 252 0.3138 0.6103 0.6587 1.40e-112
16 7l7b:F 272 31 0.0265 0.0515 0.4516 0.019
17 8k60:F 315 251 0.2836 0.4762 0.5976 7.89e-106 8dy7:F, 8dy9:F, 8hvr:F, 8jke:F, 7vpd:F, 7vpz:F, 7x74:F, 7x75:F, 7x76:F
18 8k60:F 315 49 0.0397 0.0667 0.4286 6.15e-05 8dy7:F, 8dy9:F, 8hvr:F, 8jke:F, 7vpd:F, 7vpz:F, 7x74:F, 7x75:F, 7x76:F
19 6bzo:F 326 238 0.2703 0.4387 0.6008 4.91e-101 6c04:F, 6cce:F, 6ccv:F, 6dcf:F, 6edt:F, 6ee8:F, 6eec:F, 6fbv:F, 8hih:F, 7kif:F, 7kim:F, 7kin:F, 6m7j:F, 6ono:B, 6ono:D, 6onu:B, 6onu:D, 6onu:F, 6onu:H, 7p5x:AF, 5tw1:F, 7u22:F, 5uh5:F, 5uh6:F, 5uh8:F, 5uh9:F, 5uha:F, 5uhb:F, 5uhc:F, 5uhd:F, 5uhe:F, 5uhf:F, 5uhg:F, 5vi5:F, 5vi8:F, 6vvs:F, 6vvt:F, 6vvv:F, 6vvx:F, 6vvy:F, 6vvz:F, 6vw0:F
20 6bzo:F 326 59 0.0435 0.0706 0.3898 8.30e-04 6c04:F, 6cce:F, 6ccv:F, 6dcf:F, 6edt:F, 6ee8:F, 6eec:F, 6fbv:F, 8hih:F, 7kif:F, 7kim:F, 7kin:F, 6m7j:F, 6ono:B, 6ono:D, 6onu:B, 6onu:D, 6onu:F, 6onu:H, 7p5x:AF, 5tw1:F, 7u22:F, 5uh5:F, 5uh6:F, 5uh8:F, 5uh9:F, 5uha:F, 5uhb:F, 5uhc:F, 5uhd:F, 5uhe:F, 5uhf:F, 5uhg:F, 5vi5:F, 5vi8:F, 6vvs:F, 6vvt:F, 6vvv:F, 6vvx:F, 6vvy:F, 6vvz:F, 6vw0:F
21 7rdq:F 349 248 0.2949 0.4470 0.6290 8.83e-99 2a68:F, 2a68:P, 2a69:F, 2a69:P, 6cuu:F, 5d4c:F, 5d4c:P, 5d4d:F, 5d4d:P, 5d4e:F, 5d4e:P, 5e17:F, 5e18:F, 7eh0:F, 7eh1:F, 7eh2:F, 7eh2:P, 4g7h:F, 4g7h:P, 4g7o:F, 4g7o:P, 4g7z:F, 4g7z:P, 5i2d:F, 5i2d:Q, 1iw7:F, 1iw7:P, 4ki2:A, 4ki2:B, 6kqd:F, 6kqd:P, 6kqe:F, 6kqf:F, 6kqg:F, 6kqh:F, 6kql:F, 6kqm:F, 6kqn:F, 1ku7:A, 6l74:F, 6lts:F, 7mlb:F, 7mli:F, 7mlj:F, 3n97:A, 4oin:F, 4oio:F, 4oip:F, 4oiq:F, 4oir:F, 6ovr:F, 6ovy:F, 6ow3:F, 6oy5:F, 6oy6:F, 6oy7:F, 6p70:F, 6p71:F, 4q4z:F, 4q5s:F, 1rio:H, 1smy:F, 5tjg:F, 3ugo:A, 3ugp:A, 5vo8:F, 5voi:F, 8w8n:F, 8w8o:F, 8w8p:F, 6wox:F, 6woy:F, 5x21:F, 5x22:F, 5x22:P, 4xln:F, 4xln:L, 4xlp:F, 4xlp:L, 4xlq:F, 4xlq:L, 4xlr:F, 4xlr:L, 4xls:F, 4xls:L
22 7rdq:F 349 135 0.0737 0.1117 0.2889 1.7 2a68:F, 2a68:P, 2a69:F, 2a69:P, 6cuu:F, 5d4c:F, 5d4c:P, 5d4d:F, 5d4d:P, 5d4e:F, 5d4e:P, 5e17:F, 5e18:F, 7eh0:F, 7eh1:F, 7eh2:F, 7eh2:P, 4g7h:F, 4g7h:P, 4g7o:F, 4g7o:P, 4g7z:F, 4g7z:P, 5i2d:F, 5i2d:Q, 1iw7:F, 1iw7:P, 4ki2:A, 4ki2:B, 6kqd:F, 6kqd:P, 6kqe:F, 6kqf:F, 6kqg:F, 6kqh:F, 6kql:F, 6kqm:F, 6kqn:F, 1ku7:A, 6l74:F, 6lts:F, 7mlb:F, 7mli:F, 7mlj:F, 3n97:A, 4oin:F, 4oio:F, 4oip:F, 4oiq:F, 4oir:F, 6ovr:F, 6ovy:F, 6ow3:F, 6oy5:F, 6oy6:F, 6oy7:F, 6p70:F, 6p71:F, 4q4z:F, 4q5s:F, 1rio:H, 1smy:F, 5tjg:F, 3ugo:A, 3ugp:A, 5vo8:F, 5voi:F, 8w8n:F, 8w8o:F, 8w8p:F, 6wox:F, 6woy:F, 5x21:F, 5x22:F, 5x22:P, 4xln:F, 4xln:L, 4xlp:F, 4xlp:L, 4xlq:F, 4xlq:L, 4xlr:F, 4xlr:L, 4xls:F, 4xls:L
23 8h3v:G 314 248 0.2779 0.4682 0.5927 1.15e-96 8h40:G
24 8h3v:G 314 32 0.0246 0.0414 0.4062 0.52 8h40:G
25 8gzg:F 314 237 0.2647 0.4459 0.5907 1.28e-93 8gzh:F
26 8gzg:F 314 32 0.0265 0.0446 0.4375 0.35 8gzh:F
27 6omf:F 278 247 0.1966 0.3741 0.4211 3.18e-63 5ipl:F, 5ipm:F, 5ipn:F, 6kj6:F, 6utv:FFF, 6utw:FFF, 6utx:FFF, 6uty:FFF, 6utz:FFF, 6uu0:FFF, 6uu1:FFF, 6uu2:FFF, 6uu3:FFF, 6uu4:FFF, 6uu5:FFF, 6uu6:FFF, 6uu7:FFF, 6uu8:FFF, 6uu9:FFF, 6uua:FFF, 6uub:FFF, 6uuc:FFF
28 7f0r:F 278 265 0.2023 0.3849 0.4038 1.38e-60
29 8hkc:E 262 228 0.1285 0.2595 0.2982 2.20e-22
30 8cwr:B 109 68 0.0737 0.3578 0.5735 1.26e-18 8cwt:B, 8cwt:D, 8cwt:F, 8cyf:B, 7kuf:B
31 6pmi:F 239 202 0.1096 0.2427 0.2871 3.57e-12 6pmj:F
32 8x6g:H 244 234 0.0983 0.2131 0.2222 2.04e-08
33 6ido:A 86 50 0.0435 0.2674 0.4600 8.08e-07 6ido:B
34 6pfv:G 223 86 0.0510 0.1211 0.3140 1.12e-04 6pfj:A, 6pfv:A, 6pfv:D
35 3h0d:A 155 23 0.0189 0.0645 0.4348 2.8 3h0d:B
36 2ewa:A 330 85 0.0397 0.0636 0.2471 5.2 4e8a:A, 4eh5:A, 1kv2:A, 5ml5:A, 5n63:A, 5omh:A, 2yis:A, 2yiw:A, 3zsi:A, 6zwp:A
37 3itz:A 357 40 0.0208 0.0308 0.2750 6.0 8a8m:A, 1a9u:A, 4a9y:A, 4aa0:A, 4aa4:A, 4aa5:A, 4aac:A, 8acm:AAA, 8aco:AAA, 6anl:A, 2baj:A, 2bak:A, 2bal:A, 2baq:A, 7bdo:A, 7bdq:A, 7be4:A, 7be5:A, 1bl6:A, 1bl7:A, 1bmk:A, 3bv2:A, 3bv3:A, 3bx5:A, 3c5u:A, 3ctq:A, 3d7z:A, 3d83:A, 1di9:A, 4dli:A, 4dlj:A, 3ds6:A, 3ds6:B, 3ds6:C, 3ds6:D, 3dt1:A, 4e6a:A, 4e6c:A, 3e92:A, 3e93:A, 8efj:A, 4eh2:A, 4eh3:A, 4eh4:A, 4eh6:A, 4eh7:A, 4eh8:A, 4eh9:A, 4ehv:A, 5eta:B, 5eta:A, 5etf:A, 4ewq:A, 4f9w:A, 4f9y:A, 4fa2:A, 3fc1:X, 3fi4:A, 3fkl:A, 3fkn:A, 3fko:A, 3fl4:A, 3fln:C, 3flq:A, 3fls:A, 3flw:A, 3fly:A, 3flz:A, 3fmh:A, 3fmj:A, 3fmk:A, 3fml:A, 3fmm:A, 3fmn:A, 3fsf:A, 3fsk:A, 3gc7:A, 3gcp:A, 3gcq:A, 3gcs:A, 3gcu:A, 3gcu:B, 3gcv:A, 2gfs:A, 3gfe:A, 2ghl:A, 2ghm:A, 3gi3:A, 2gtm:A, 2gtn:A, 3ha8:A, 3hec:A, 3heg:A, 3hl7:A, 3hll:A, 3hp2:A, 3hp5:A, 3hrb:A, 3hub:A, 3huc:A, 3hv3:A, 3hv4:A, 3hv4:B, 3hv5:A, 3hv5:B, 3hv6:A, 3hv7:A, 3hvc:A, 6hwt:A, 6hwu:A, 6hwv:A, 2i0h:A, 3iph:A, 3iw5:A, 3iw6:A, 3iw7:A, 3iw8:A, 3k3i:A, 3k3j:A, 4ka3:A, 3kf7:A, 4kin:A, 4kin:B, 4kin:C, 4kin:D, 4kip:A, 4kip:B, 4kiq:A, 4kiq:B, 4kiq:C, 4kiq:D, 3kq7:A, 1kv1:A, 3l8s:A, 3l8x:A, 4l8m:A, 5lar:A, 1lew:A, 1lez:A, 3lfa:A, 3lfb:A, 3lfc:A, 3lfd:A, 3lfe:A, 3lff:A, 3lhj:A, 4loo:A, 4lop:A, 4lop:C, 4lop:B, 4lop:D, 4loq:A, 4loq:B, 4loq:C, 4loq:D, 1m7q:A, 6m95:A, 6m9l:A, 3mpa:A, 3mpt:A, 5mtx:A, 5mty:A, 3mvl:A, 3mvl:B, 3mvm:A, 3mvm:B, 3mw1:A, 5mz3:A, 5n64:A, 5n65:A, 5n66:A, 5n67:A, 5n68:A, 3new:A, 3nnu:A, 3nnv:A, 3nnw:A, 3nnx:A, 3nww:A, 5nzz:E, 5nzz:F, 5nzz:G, 5nzz:H, 3o8p:A, 3o8t:A, 3o8u:A, 5o8u:A, 5o8v:A, 5o90:A, 3obg:A, 3obj:A, 3oc1:A, 3ocg:A, 6ohd:A, 2okr:A, 2okr:D, 5omg:A, 1ouk:A, 1ouy:A, 1ove:A, 1oz1:A, 3p4k:A, 3p5k:A, 3p78:A, 3p79:A, 3p7a:A, 3p7b:A, 3p7c:A, 3pg3:A, 2puu:A, 7pvu:B, 2qd9:A, 6qdz:A, 6qe1:A, 3qud:A, 3que:A, 1r3c:A, 4r3c:A, 5r8u:A, 5r8v:A, 5r8w:A, 5r8x:A, 5r8y:A, 5r8z:A, 5r90:A, 5r91:A, 5r92:A, 5r93:A, 5r94:A, 5r95:A, 5r96:A, 5r97:A, 5r98:A, 5r99:A, 5r9a:A, 5r9b:A, 5r9c:A, 5r9d:A, 5r9e:A, 5r9f:A, 5r9g:A, 5r9h:A, 5r9i:A, 5r9j:A, 5r9k:A, 5r9l:A, 5r9m:A, 5r9n:A, 5r9o:A, 5r9p:A, 5r9q:A, 5r9r:A, 5r9s:A, 5r9t:A, 5r9u:A, 5r9v:A, 5r9w:A, 5r9x:A, 5r9y:A, 5r9z:A, 5ra0:A, 5ra1:A, 5ra2:A, 5ra3:A, 5ra4:A, 5ra5:A, 5ra6:A, 5ra7:A, 5ra8:A, 5ra9:A, 2rg5:A, 2rg6:A, 3rin:A, 3roc:A, 3s3i:A, 3s4q:A, 6sfi:A, 6sfj:A, 6sfk:A, 6sfo:A, 6so1:A, 6so2:A, 6so4:A, 6sod:A, 6soi:A, 6sot:A, 6sou:A, 6sov:A, 6sp9:A, 6spl:A, 5tbe:A, 5tco:A, 6tca:B, 6tca:D, 6tca:F, 6tca:H, 4tyh:B, 3u8w:A, 3uvp:A, 3uvq:A, 3uvr:A, 8vxe:A, 1w7h:A, 1w82:A, 1w83:A, 1w84:A, 1wbn:A, 1wbo:A, 1wbs:A, 1wbt:A, 1wbv:A, 1wbw:A, 5wjj:A, 5xyx:A, 5xyy:A, 6y4t:A, 6y4u:A, 6y4v:A, 6y4w:A, 6y4x:A, 6y6v:A, 6y7w:A, 6y7x:A, 6y7y:A, 6y7z:A, 2y8o:A, 6y80:A, 6y81:A, 6y82:A, 6y85:A, 6y8h:A, 6ycu:A, 6ycw:A, 2yix:A, 6yjc:A, 6yk7:A, 1yqj:A, 1yw2:A, 1ywr:A, 7z6i:AAA, 7z9t:AAA, 7z9t:BBB, 2zaz:A, 2zb0:A, 2zb1:A, 6zqs:A, 3zs5:A, 3zsg:A, 3zsh:A, 4zth:A, 6zwr:A, 1zyj:A, 3zya:A, 1zz2:A, 1zzl:A
38 4qww:D 225 55 0.0321 0.0756 0.3091 6.4 4qww:F, 3sge:H, 3sge:J
39 7vdv:A 809 106 0.0624 0.0408 0.3113 6.5 7vdt:A
40 7a3q:H 127 15 0.0170 0.0709 0.6000 7.9 7a3q:I
41 8ojt:H 225 41 0.0246 0.0578 0.3171 8.7

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218