BioLiP

>protein
SQKYLFIDRDGTLISEPPSDFQVDRFDKLAFEPGVIPQLLKLQKAGYKLVMITNQDGLGTQSFPQADFDGPHNLMMQIFT
SQGVQFDEVLICPHLPADECDCRKPKVKLVERYLMDRANSYVIGDRATDIQLAENMGINGLRYDRETLNWPMIGEQLT

The query sequence (length=158) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	2fps:B	163	161	0.9937	0.9632	0.9752	4.88e-115	2fpr:A, 2fpr:B, 2fps:A, 2fpu:A, 2fpu:B, 2fpw:A, 2fpw:B, 2fpx:A, 2fpx:B
2	3l8e:A	185	150	0.3228	0.2757	0.3400	1.23e-19	3esq:A, 3esr:A, 2gmw:A, 2gmw:B, 3l1u:A, 3l1u:B, 3l1v:A, 3l1v:B, 3l8e:B, 3l8f:A, 3l8g:A
3	3l8h:A	179	139	0.2848	0.2514	0.3237	2.43e-18	3l8h:B, 3l8h:C, 3l8h:D
4	3u7e:B	380	132	0.2468	0.1026	0.2955	6.35e-05	3u7f:B, 3u7g:A, 3u7h:B, 3zvl:A, 3zvm:A, 3zvm:B, 3zvn:A
5	2go7:C	205	50	0.1076	0.0829	0.3400	0.001	2go7:A, 2go7:B, 2go7:D
6	7nkl:d	327	57	0.1139	0.0550	0.3158	0.032
7	2yn4:A	225	31	0.0823	0.0578	0.4194	0.30	2yn4:B
8	4ygr:A	215	123	0.1772	0.1302	0.2276	0.52	4ygs:A
9	5yei:C	397	77	0.1139	0.0453	0.2338	3.0	5yei:D, 5yei:B, 5yei:A, 5yei:F, 5yei:E, 5yei:H, 5yei:G
10	9bh5:CZ	135	40	0.0823	0.0963	0.3250	4.4	9cai:CZ
11	7p01:A	572	45	0.0823	0.0227	0.2889	7.3	7p01:B, 7p07:A, 7p07:B
12	2b82:A	211	59	0.1013	0.0758	0.2712	7.9	2b82:B, 2b8j:A, 2b8j:B, 3cz4:A, 2g1a:A, 2g1a:B, 2heg:A, 2heg:B, 2hf7:A, 2hf7:B, 1n9k:A, 1n9k:B, 1rmq:A, 1rmq:B, 1rmt:A, 1rmt:B, 1rmt:C, 1rmt:D, 1rmy:A, 1rmy:B, 1z88:D
13	6fxh:A	481	50	0.1013	0.0333	0.3200	9.8	5cqz:A, 5cqz:B, 5cr7:A, 5cr7:B, 6ddb:A, 6ddb:B, 6ddc:A, 6ddc:B, 6ddh:A, 6ddz:A, 6de2:A, 6de3:A, 6fir:A, 6fis:A, 6fiu:A, 6fiw:A, 4h4b:A, 2j2c:A, 2jc9:A, 2jcm:A, 5opk:A, 5opl:A, 5opm:A, 5opo:A, 2xcv:A, 2xcw:A, 2xjb:A, 2xjc:A, 2xjd:A, 2xje:A, 2xjf:A
14	5kis:A	1446	55	0.1203	0.0131	0.3455	10.0

[Back]