Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SQATDPFRAAVEFTLMPMLITNPHLPDNPIVFANPAFLKLTGYEADEVMGRNSRFLQGHGTDPAHVRAIKSAIAAEKPID
IDIINYKKSGEAFWNRLHISPVHNANGRLQHFVSSQLDVTLELSR

The query sequence (length=125) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 6ph4:B 460 124 0.9840 0.2674 0.9919 1.41e-87 5epv:A, 5epv:B, 5epv:C, 5epv:D, 6ph2:A, 6ph2:B, 6ph2:C, 6ph2:D, 6ph3:A, 6ph3:B, 6ph3:C, 6ph3:D, 6ph4:A, 6pps:A, 6pps:B, 6pps:C, 6pps:D, 3t50:A, 3t50:B
2 7qf2:AAA 117 101 0.4160 0.4444 0.5149 1.30e-36 8a2v:A, 8a2w:A, 8a2w:B, 8a4e:A, 4eep:A, 4eer:A, 4ees:A, 4eet:B, 6gpu:A, 6gpv:A, 8q5f:A, 8q5f:B, 7qf3:AAA, 7qf4:AAA, 7qf5:AAA, 6qqh:A, 6qqi:A, 6qqj:A, 6qqk:A, 6qsa:A, 6s45:A, 6s46:A
3 4eeu:A 109 105 0.4160 0.4771 0.4952 4.11e-35 7aby:A, 4eet:D, 4nxb:A, 4nxb:B, 4nxe:A, 4nxe:B, 4nxf:A, 4nxf:B, 4nxg:A, 4nxg:B
4 4hhd:A 152 100 0.3840 0.3158 0.4800 1.62e-34 4hhd:B
5 7tbq:A 375 112 0.4320 0.1440 0.4821 1.17e-33 7tal:A, 7tbn:A, 7tbq:B, 7tbq:C, 7tbq:D, 7tbq:E
6 5hzh:A 320 103 0.4080 0.1594 0.4951 1.22e-33
7 2wkp:A 320 103 0.4080 0.1594 0.4951 1.90e-33 6agp:A, 7ajk:BBB, 6bc1:A, 6bc1:B, 2c2h:A, 2c2h:B, 1ds6:A, 1e96:A, 2fju:A, 2g0n:A, 2g0n:B, 1g4u:R, 4gzl:A, 4gzl:B, 4gzm:A, 4gzm:B, 2h7v:A, 2h7v:B, 1he1:C, 1he1:D, 1hh4:A, 1hh4:B, 1i4d:D, 1i4l:D, 1i4t:D, 2ic5:A, 2ic5:B, 1mh1:A, 5n6o:A, 5n6o:B, 5o33:A, 2ov2:A, 2ov2:F, 2ov2:B, 2ov2:C, 2ov2:G, 2ov2:D, 2ov2:E, 2ov2:H, 2p2l:A, 2p2l:B, 2p2l:C, 8q0n:C, 2qme:A, 5qqd:A, 5qqe:A, 5qqf:A, 5qqg:A, 5qqh:A, 5qqi:A, 5qqj:A, 5qqk:A, 5qql:A, 5qqm:A, 5qqn:A, 2rmk:A, 1ryf:A, 1ryf:B, 1ryh:A, 1ryh:B, 3ryt:C, 3sbd:A, 3sbd:B, 3sbe:A, 3su8:A, 3sua:A, 3sua:B, 3sua:C, 3th5:A, 3th5:B, 7usd:F, 7use:F, 7use:G, 2w2t:A, 2w2v:A, 2w2v:B, 2w2v:C, 2w2v:D, 2w2x:A, 2w2x:B, 8wej:E, 2wkq:A, 2wkr:A
8 1g28:A 104 99 0.3600 0.4327 0.4545 4.86e-33 1g28:B, 1g28:C, 1g28:D, 1jnu:A, 1jnu:B, 1jnu:C, 1jnu:D
9 7tcd:A 436 105 0.4160 0.1193 0.4952 8.79e-33 4wf0:A, 4wf0:B
10 6hmj:A 359 100 0.4160 0.1448 0.5200 5.20e-32 6hmj:B, 6hmj:C, 6hmj:D
11 8qi8:A 110 103 0.3600 0.4091 0.4369 6.06e-32 1n9l:A, 1n9n:A, 1n9o:A, 8qi9:A, 8qia:A, 8qib:A, 8qif:A, 8qig:A, 8qih:A, 8qii:A, 8qik:A, 8qil:A, 8qim:A, 8qin:A, 8qio:A, 8qip:A, 8qiq:A, 8qir:A, 8qis:A, 8qit:A, 8qiu:A, 8qiv:A, 8qiw:A
12 5hzi:A 476 102 0.4080 0.1071 0.5000 1.56e-31 5djt:A, 5dju:A, 5dju:C, 5efw:A, 5hzi:B, 5hzj:A, 5hzj:B, 5hzk:B, 5hzk:D, 7pgx:AAA, 7pgy:AAA, 7pgz:AAA, 7ph0:AAA, 2v0u:A, 2v0w:A, 2v1a:A, 2v1b:A
13 2mwg:A 261 114 0.3920 0.1877 0.4298 3.07e-31 2mwg:B, 2pr5:A, 2pr5:B, 2pr6:A, 2pr6:B
14 8pm1:A 109 103 0.4240 0.4862 0.5146 6.51e-31 7ab6:A, 7ab6:B, 7ab7:A, 7ab7:B, 8pky:A, 8pky:B, 8pm1:B, 6rhf:A, 6rhf:B, 6rhg:A, 6rhg:B, 6y7r:A, 6y7r:B, 6y7u:A, 6y7u:B, 6ywg:A, 6ywg:B, 6ywh:A, 6ywh:B, 6ywi:A, 6ywi:B, 6ywq:A, 6ywq:B, 6ywr:B, 6ywr:A, 6yx4:A, 6yx4:B, 6yx6:A, 6yx6:B, 6yxb:A, 6yxb:B, 6yxb:C, 6yxb:D, 6yxc:A, 6yxc:B
15 6t74:B 141 114 0.3760 0.3333 0.4123 8.05e-31 5a8b:A, 5a8b:B, 5a8b:C, 5a8b:D, 5dkk:A, 5dkk:B, 5dkl:A, 5dkl:B, 6t73:A, 6t73:B, 6t73:C, 6t74:A
16 4gcz:B 378 114 0.3920 0.1296 0.4298 5.32e-30 4gcz:A
17 6gb3:A 120 101 0.3760 0.3917 0.4653 6.56e-30 6gay:A, 6gay:B, 6gba:A, 6gbv:A, 4kuk:A, 4kuo:A, 7zqu:A
18 6i21:A 135 125 0.3520 0.3259 0.3520 2.43e-28 6i20:A, 6i20:B, 6i20:C, 6i20:D, 6i22:A, 6i22:B, 6i22:C, 6i22:D, 6i23:A, 6i23:B, 6i24:A, 6i25:A
19 3ue6:E 138 116 0.3440 0.3116 0.3707 1.39e-27 3ue6:A, 3ue6:B, 3ue6:C, 3ue6:D, 3ue6:F, 3ulf:A, 3ulf:B, 3ulf:C, 3ulf:D, 3ulf:E, 3ulf:F
20 2z6c:A 121 103 0.3280 0.3388 0.3981 1.62e-27 2z6c:B
21 8a5r:AAA 206 109 0.3280 0.1990 0.3761 2.64e-26 8a5s:AAA, 3p7n:A, 3p7n:B
22 8c05:A 305 104 0.3440 0.1410 0.4135 3.33e-26
23 7oo9:A 106 103 0.4160 0.4906 0.5049 5.33e-26 7oo9:B
24 7r5n:B 151 106 0.3120 0.2583 0.3679 1.56e-23 7r5n:A
25 2z6d:A 118 114 0.3040 0.3220 0.3333 2.70e-23 2z6d:B
26 7a6p:A 149 113 0.3200 0.2685 0.3540 7.53e-23 7a6p:B
27 4r3a:A 318 102 0.3040 0.1195 0.3725 4.05e-22 4r38:A, 4r38:B, 4r38:C, 4r38:D, 4r39:A, 4r39:B, 4r39:C, 4r39:D
28 8a6x:B 368 110 0.3200 0.1087 0.3636 4.68e-21 8a3u:A, 8a52:A, 8a52:B, 8a6x:A, 8a7f:A, 8a7f:B, 8a7h:A, 8a7h:B
29 7yx0:A 166 107 0.2960 0.2229 0.3458 1.60e-20 7yx0:C
30 8j68:A 129 94 0.2880 0.2791 0.3830 6.74e-20 8i11:A, 8il9:A, 8iyn:A
31 4r3a:B 278 102 0.3040 0.1367 0.3725 1.23e-19
32 7r56:A 137 110 0.3120 0.2847 0.3545 2.70e-19 8a33:A, 8a36:A, 8a36:B, 8a36:C, 8a36:D, 8a37:A, 6gg9:A, 6gg9:B, 6gg9:C, 6gg9:D, 5j3w:A, 5j3w:B, 5j3w:C, 5j3w:D, 5j4e:A, 5j4e:B, 5j4e:C, 5j4e:D, 8q5e:A, 8q5e:B, 7r4s:A, 7r4s:B, 7r4s:C, 7r4s:D, 3sw1:A, 3sw1:B
33 4wuj:C 145 103 0.3440 0.2966 0.4175 4.77e-19 4wuj:A, 4wuj:B, 4wuj:D
34 5svu:B 135 109 0.2720 0.2519 0.3119 3.18e-17 5svg:B, 5svg:A, 5svg:C, 5svg:D, 5svu:A, 5svu:C, 5svu:D, 5svv:D, 5svv:A, 5svv:B, 5svv:C, 5svw:B, 5svw:A, 5svw:C, 5svw:D, 6wle:B, 6wle:A, 6wle:C, 6wle:D, 6wle:E, 6wle:F, 6wle:G, 6wlp:B, 6wlp:A, 6wlp:C, 6wlp:D, 6wlp:E, 6wlp:F, 6wlp:G
35 3hjk:A 150 116 0.2800 0.2333 0.3017 3.09e-16 6cny:A, 6cny:B, 6cny:C, 6cny:D, 3d72:A, 3d72:B, 3hji:A, 3hji:B, 3hjk:B, 3is2:A, 3is2:B, 2pd7:A, 2pd7:B, 2pd8:A, 2pd8:B, 2pdr:A, 2pdr:B, 2pdr:C, 2pdr:D, 3rh8:B, 3rh8:D
36 4hj6:B 178 113 0.3200 0.2247 0.3540 3.70e-16 4hia:A, 4hia:B, 4hj3:A, 4hj3:B, 4hj4:A, 4hj4:B, 4hj6:A, 4hnb:A, 4hnb:B, 7ob0:A, 7ob0:B, 7ob0:C, 7ob0:D, 7obz:A, 7obz:B, 7obz:C, 7obz:D, 7obz:E, 7obz:F
37 7wa4:B 107 94 0.2480 0.2897 0.3298 9.00e-15
38 2gj3:A 119 115 0.2960 0.3109 0.3217 9.53e-11 2gj3:B
39 7yid:A 660 105 0.2320 0.0439 0.2762 1.92e-10 7yid:B, 7yid:C, 7yid:D
40 3ewk:A 227 95 0.1920 0.1057 0.2526 2.54e-07
41 3ewk:A 227 93 0.1680 0.0925 0.2258 1.11e-05
42 1s66:L 119 110 0.2560 0.2689 0.2909 6.23e-06 1s66:U, 1s67:L, 1s67:U, 1v9y:A, 1v9y:B, 1v9z:A, 1v9z:B, 1vb6:A, 1vb6:B
43 6pl0:B 608 84 0.1360 0.0280 0.2024 0.055 5akp:A, 5akp:B, 7l59:A, 6ndo:A, 6ndo:B, 6ndp:A, 6ndp:B, 6pl0:A, 5uyr:A, 5uyr:B
44 8dik:A 127 94 0.1840 0.1811 0.2447 0.081 8dik:B
45 6j7u:A 247 40 0.1280 0.0648 0.4000 0.087 6j7u:B, 6j7u:C, 6j7u:D
46 1d06:A 130 87 0.1840 0.1769 0.2644 0.51 1ew0:A
47 2j0f:A 446 29 0.0960 0.0269 0.4138 3.0 2j0f:B, 2j0f:C, 1uou:A, 2wk6:A, 2wk6:B
48 3aej:A 387 41 0.1120 0.0362 0.3415 3.6 3aej:D, 3aej:B, 3aej:C, 3ael:A, 3ael:D, 3ael:B, 3ael:C, 3aem:A, 3aem:D, 3aem:B, 3aem:C, 3aen:A, 3aen:D, 3aen:B, 3aen:C, 3aeo:A, 3aeo:D, 3aeo:B, 3aeo:C, 3aep:A, 3aep:D, 3aep:B, 3aep:C
49 7w15:A 294 48 0.1200 0.0510 0.3125 4.0 7w15:B, 7w19:A, 7w19:B, 7w1a:B, 7w1a:A
50 6cst:A 446 41 0.1200 0.0336 0.3659 4.4 6brx:A, 6brx:B, 6bs1:A, 6bs1:B, 6cst:B, 3in5:A, 3in5:B, 7nv0:A, 7nv1:A, 2oh2:A, 2oh2:B, 3pzp:A, 3pzp:B, 5t14:A, 5t14:B, 4u6p:A, 4u6p:B, 4u7c:A, 4u7c:B, 5w2a:A, 5w2a:B, 5w2c:A, 5w2c:B, 2w7o:B, 2w7o:A, 2w7p:B, 2w7p:A
51 2y3c:A 278 91 0.1600 0.0719 0.2198 5.2
52 8jem:B 419 33 0.0800 0.0239 0.3030 5.9 8jem:A, 8jem:C, 8jem:D, 8jes:A, 8jes:B, 8jes:C, 8jes:D, 8jf2:A, 8jf2:B, 8jf2:C, 8jf2:D
53 8isk:B 848 88 0.1920 0.0283 0.2727 8.3 8isk:A

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218