BioLiP

>protein
SPWRLLGALCLQRPPLVTKPLTPLQEEMADLLQQIEIERSLYSDHELRALDEAQQLAKKKSDLAQDLEDMWEQKFLHFKL
GARLTEADKKDDRTSLHRKLDRNLILLVREKLGDQDIWMLPQSDWQPGETLRQTAERTLATLSENNMEAKFLGNAPCGHY
KFKFLGAKVFFFKALLLTGDFSQAGKKGHHVWVSKEELGDYLKPKYLAQVRRFLLDL

The query sequence (length=217) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6gaw:Bj	217	217	1.0000	1.0000	1.0000	6.97e-160	6gb2:Bj, 7nqh:Bj, 7nql:Bj, 7nsh:Bj, 7nsi:Bj, 6ydp:Bj, 6ydw:Bj
2	8oin:Bv	238	237	1.0000	0.9118	0.9156	6.73e-154	7nsj:Bj, 8oiq:Bv
3	6nu2:e	217	217	0.8894	0.8894	0.8894	4.06e-146
4	8any:e	238	237	0.8894	0.8109	0.8143	1.86e-139	3j7y:e, 7odr:e, 7ods:e, 7odt:e, 8oir:Bv, 8oit:Bv, 8pk0:e, 7po4:e, 7qi4:e, 7qi5:e, 7qi6:e, 8qsj:e, 6zm5:e, 6zm6:e
5	7of0:e	197	217	0.8111	0.8934	0.8111	4.95e-129	7of3:e, 7of5:e, 7of7:e
6	6ywe:6	273	267	0.3226	0.2564	0.2622	1.21e-12	6yws:6, 6ywv:6, 6ywx:6, 6ywy:6
7	5mrc:6	234	135	0.1889	0.1752	0.3037	1.13e-08	5mre:6, 5mrf:6
8	3j6b:6	209	135	0.1889	0.1962	0.3037	3.10e-06
9	3i7v:A	134	66	0.0737	0.1194	0.2424	0.72	3i7v:B
10	8wi0:A	1220	55	0.0968	0.0172	0.3818	1.3	8kci:A, 8wi2:A, 8wi5:A
11	1vc8:A	126	35	0.0553	0.0952	0.3429	1.8	1vc8:B, 1vc9:A, 1vc9:B
12	1ajb:A	449	52	0.0829	0.0401	0.3462	1.9	1ajb:B, 1ajc:A, 1ajc:B, 1ajd:A, 1ajd:B, 1alh:A, 1alh:B, 1ali:A, 1ali:B, 1alj:A, 1alj:B, 1alk:A, 1alk:B, 1ani:A, 1ani:B, 1anj:A, 1anj:B, 2anh:A, 2anh:B, 1b8j:A, 1b8j:B, 3bdh:A, 3bdh:B, 5c66:A, 5c66:B, 3cmr:A, 3cmr:B, 3dpc:B, 3dpc:A, 3dyc:A, 3dyc:B, 1ed8:A, 1ed8:B, 1ed9:A, 1ed9:B, 1elx:A, 1elx:B, 1ely:A, 1ely:B, 1elz:A, 1elz:B, 1ew8:A, 1ew8:B, 1ew9:A, 1ew9:B, 2g9y:A, 2g9y:B, 2ga3:A, 2ga3:B, 1hjk:A, 1hjk:B, 1hqa:A, 1hqa:B, 1kh4:A, 1kh4:B, 1kh5:A, 1kh5:B, 1kh7:A, 1kh7:B, 1kh9:A, 1kh9:B, 1khj:A, 1khj:B, 1khk:A, 1khk:B, 1khl:A, 1khl:B, 1khn:A, 1khn:B, 4km4:A, 4km4:B, 3tg0:A, 3tg0:B, 3tg0:C, 3tg0:D, 5tpq:A, 5tpq:B, 1ura:A, 1ura:B, 1urb:A, 1urb:B, 1y6v:A, 1y6v:B, 1y7a:A, 1y7a:B, 4yr1:A, 4yr1:B
13	8c8v:A	1032	40	0.0691	0.0145	0.3750	3.5	8c8u:A, 8c8w:A, 8c9d:A
14	3urh:B	465	37	0.0599	0.0280	0.3514	4.0	3urh:A
15	7tm9:A	441	38	0.0691	0.0340	0.3947	4.3	7tm9:B, 7tm9:C, 7tm9:D, 7tm9:E, 7tm9:F, 7tm9:G, 7tm9:H
16	1su2:A	159	115	0.1290	0.1761	0.2435	9.8	1su2:B, 1sz3:A, 1sz3:B

[Back]