Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SPQPLEQIKLSESQLSGRVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMVSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDY
SPVSEKHLADGMTVGELCAAAITMSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWATELNEALPGDARDTTTPAS
MAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGAGERGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRD
TPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR

The query sequence (length=265) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 2a3u:A 265 265 0.9962 0.9962 0.9962 0.0 2a49:A, 3d4f:A, 5ee8:A, 4fcf:A, 4fd8:A, 4fh2:A, 4fh4:A, 4gd6:A, 4gd8:A, 4gdb:A, 2h0t:A, 2h0y:A, 2h10:A, 2h5s:A, 4jpm:A, 4mbf:A, 4mbh:A, 4mbk:A, 3mke:A, 3mkf:A, 3mxr:A, 3mxs:A, 1n9b:A, 1ong:A, 3oph:A, 3opl:A, 3opp:A, 3opr:A, 1q2p:A, 4r3b:A, 1rcj:A, 1shv:A, 1tdg:A, 1tdl:A, 3v50:A, 3v5m:A, 1vm1:A, 4zam:A, 2zd8:A
2 2v1z:A 270 268 0.6528 0.6407 0.6455 3.61e-125 1axb:A, 1bt5:A, 8de0:A, 8de0:B, 8de0:C, 8de0:D, 8de1:A, 8de1:B, 8de1:C, 8de1:D, 8de2:A, 8de2:B, 8de2:C, 8de2:D, 1erm:A, 1ero:A, 1erq:A, 1esu:A, 1fqg:A, 1jvj:A, 1jwv:A, 1jwz:A, 1li0:A, 1m40:A, 1nxy:A, 1ny0:A, 1nym:A, 1nyy:A, 4opz:A, 4oq0:A, 4oqg:A, 4oqg:B, 4oqg:C, 4oqg:D, 4oqg:F, 4oqh:A, 1pzo:A, 1pzp:A, 7qlp:A, 7qlp:C, 7qlp:D, 7qlp:E, 7qnk:A, 7qnk:B, 7qnk:C, 7qnk:D, 7qnk:E, 4rva:A, 1tem:A, 2v20:A, 1xpb:A
3 8of9:A 254 261 0.5774 0.6024 0.5862 5.14e-96 8rqu:B
4 4dxb:A 637 202 0.5094 0.2119 0.6683 2.04e-93 4dxb:B, 4dxc:A
5 4dxb:A 637 60 0.1547 0.0644 0.6833 1.72e-20 4dxb:B, 4dxc:A
6 6tww:A 266 258 0.5170 0.5150 0.5310 2.01e-78 5fqj:A, 5fqk:A, 6ty6:A, 6ty6:B, 6ty6:C
7 6afn:A 268 247 0.4566 0.4515 0.4899 6.36e-75 6afp:A, 6afp:B, 5glb:A, 5gld:A
8 7doo:A 260 242 0.4340 0.4423 0.4752 9.06e-72 7ddm:A, 7doo:B, 7doo:C
9 9bzq:A 271 239 0.4377 0.4280 0.4854 3.35e-70 9bzr:A
10 8qnn:A 259 225 0.4000 0.4093 0.4711 7.37e-66
11 6wjm:A 269 239 0.4340 0.4275 0.4812 5.31e-65
12 7ua7:A 271 229 0.3925 0.3838 0.4541 2.54e-62 7a61:A, 8aki:A, 8akj:A, 8akk:A, 8akl:A, 8akm:A, 6b1f:A, 6b1f:B, 6b1h:A, 6b1h:B, 6b1j:A, 6b1j:B, 6b1w:A, 6b1w:B, 6b1x:A, 6b1x:B, 6b1y:A, 6b1y:B, 6d15:A, 6d16:A, 6d17:A, 6d18:A, 6d19:A, 7e9a:A, 7e9a:B, 7e9a:C, 7e9a:D, 5eec:A, 5eec:B, 8g2r:A, 8g2t:A, 6j8q:A, 6j8q:B, 6j8q:C, 6j8q:D, 6jn3:A, 6jn3:D, 6jn3:B, 6jn3:C, 6jn4:A, 6jn4:D, 6jn4:B, 6jn4:C, 6jn5:A, 6jn5:D, 6jn5:B, 6jn5:C, 5ll7:A, 7llb:A, 7llb:B, 7llh:A, 7llh:B, 7lnl:A, 7lnl:B, 7lr9:A, 7lr9:B, 6m7i:A, 6mey:A, 5mgi:A, 6mll:A, 6mnp:A, 2ov5:A, 2ov5:B, 2ov5:C, 6qw9:A, 6qwa:A, 6qwb:A, 6qwc:A, 3rxw:A, 3rxx:A, 7tc1:A, 6td0:A, 6td1:A, 7ti2:A, 8tmr:A, 8tmt:A, 7u8s:A, 7u9b:A, 5uj3:A, 5uj4:A, 7utb:A, 6v1j:A, 6v7i:A, 7vqn:C, 7vqn:D, 6xd7:A, 6xj8:A, 6z23:A, 6z24:A, 6z25:A, 4zbe:A
13 6dmh:A 270 249 0.3849 0.3778 0.4096 3.08e-61 4euz:A, 4ev4:A
14 8ix8:A 264 233 0.3698 0.3712 0.4206 6.54e-61 8ixx:A, 8iy4:A
15 3lez:A 260 257 0.3887 0.3962 0.4008 1.36e-60
16 4bd0:A 261 257 0.3774 0.3831 0.3891 2.84e-60 5a92:A, 5a93:A, 4bd1:A, 4c3q:A, 6c79:A, 5g18:A, 1iyo:A, 1iyp:A, 1iyq:A, 1iys:A, 5kmw:A, 5ksc:A, 4x69:A, 4x69:B, 2zq8:A, 2zq9:A, 2zqa:A, 2zqc:A, 2zqd:A
17 6v7t:A 264 249 0.3887 0.3902 0.4137 9.17e-60 8b2o:A, 8b2v:A, 8b2w:A, 8b3m:A, 6bt6:A, 6bt6:B, 6bu3:A, 6bu3:B, 6cyq:A, 6cyq:B, 6cyq:C, 6cyq:D, 6cyq:E, 6cyq:F, 6cyq:G, 6cyq:H, 6cyu:A, 4dds:A, 4dds:B, 4ddy:A, 4ddy:B, 4de0:A, 4de0:B, 4de1:A, 4de1:B, 4de2:A, 4de2:B, 4de3:A, 4de3:B, 8ela:A, 8ela:B, 3g2y:A, 3g2y:B, 3g2z:A, 3g2z:B, 3g30:A, 3g31:A, 3g31:B, 3g32:A, 3g32:B, 3g34:A, 3g34:B, 3g35:A, 3g35:B, 6gth:A, 3hlw:A, 3hlw:B, 3huo:A, 3huo:B, 3hvf:A, 3hvf:B, 7k2w:A, 7k2y:A, 4len:A, 4len:B, 6md8:A, 6md8:B, 6mia:A, 6mia:B, 6mz1:A, 6mz1:B, 6mz2:A, 6mz2:B, 6ooe:A, 6ooe:B, 6oof:A, 6oof:B, 6ooh:A, 6ooh:B, 6ooj:A, 6ooj:B, 6ook:A, 6ook:B, 8pcl:A, 8pcm:A, 8pcn:A, 8pco:A, 8pcp:A, 8pcq:A, 8pcr:A, 8pcs:A, 8pct:A, 8pcu:A, 8pcv:A, 4pm5:A, 4pm7:A, 4pm9:A, 3q07:A, 3q07:B, 7q0y:A, 3q1f:A, 3q1f:B, 7q11:A, 8r7m:A, 7s0v:A, 5top:A, 5top:B, 5toy:B, 5toy:A, 5tw6:A, 5twe:A, 5u53:A, 7u70:A, 7u70:B, 4ua7:A, 4ua7:B, 4ua9:A, 4ua9:B, 4uaa:A, 4uaa:B, 5ujo:A, 5ujo:B, 6unb:A, 6unb:B, 6v7h:A, 6v7h:B, 6v7t:B, 6v83:A, 6v8v:A, 6vhs:A, 6vhs:B, 5vle:A, 5vle:B, 6vnu:A, 6vnu:B, 4xxr:A, 4xxr:B, 1ylj:A, 1ylp:A, 1ylt:A, 1yly:A, 1yly:B, 1ylz:A, 1ylz:B, 1ym1:A, 1ym1:B, 1yms:A, 1yms:B, 1ymx:A, 1ymx:B
18 7u48:A 264 249 0.3811 0.3826 0.4056 4.22e-59 7bh5:A, 7bh7:A, 8ehh:A, 5fa7:A, 5fa7:B, 5fao:A, 5fao:B, 5fap:B, 5fap:A, 4hbu:A, 6ity:A, 6ity:B, 6j2b:A, 6j2b:B, 6j2k:A, 6j2k:B, 6j2o:A, 6j2o:B, 6qw8:A, 4s2i:A, 4s2i:B, 6sp6:A, 5t66:A, 5t66:B, 7ti0:A, 7u48:B, 7u48:C, 7u49:A, 7u49:B, 7u49:C, 7u4b:A, 7u4b:B, 7u4b:C, 4xuz:A, 6z7k:A
19 6w2z:B 261 225 0.3547 0.3602 0.4178 8.41e-59 6w2z:A
20 3bfc:A 262 227 0.3660 0.3702 0.4273 1.61e-58 3bfc:B, 3bfc:C, 3bfc:D, 3bff:A, 3bff:B, 3bff:C, 3bff:D, 3bfg:A, 3bfg:B, 3bfg:C, 3bfg:D
21 8jk3:B 267 229 0.3623 0.3596 0.4192 2.96e-56 5eph:A, 5eph:B, 5eph:C, 5eph:D, 5eua:A, 5eua:B
22 1bul:A 265 251 0.3434 0.3434 0.3625 3.01e-56
23 6bpf:A 265 262 0.3698 0.3698 0.3740 9.06e-56
24 8isq:A 261 229 0.3774 0.3831 0.4367 9.29e-56 8isp:A, 8isr:A, 8isr:B
25 6mkq:A 262 254 0.3736 0.3779 0.3898 1.15e-55
26 8ek9:A 266 229 0.3547 0.3534 0.4105 1.94e-54
27 5zft:A 258 215 0.3208 0.3295 0.3953 3.44e-52 4a5r:A, 4a5r:B, 3b3x:A, 3b3x:B, 5ghy:B, 5ghy:A, 5ghz:B, 5ghz:A, 1i2w:A, 1i2w:B, 3ly4:A, 3m2j:A, 3m2k:A, 3m2k:B, 4n9k:B, 4n9k:A, 4n9l:B, 4n9l:A, 3sh7:A, 3sh7:B, 3sh8:A, 3sh8:B, 3sh9:A, 3sh9:B, 2wk0:A, 2wk0:B, 2x71:A, 2y91:A, 2y91:B, 5zft:B, 5zg6:B, 5zg6:A
28 5f83:A 268 251 0.3358 0.3321 0.3546 1.48e-50 5f83:B, 4gog:A, 4gog:B, 4h8r:A, 4h8r:B, 3nia:A, 6q35:A, 6q35:B, 4qu3:A, 4qu3:B, 8v9g:A, 8v9g:B, 8v9h:A, 8v9h:B
29 5ne1:B 270 246 0.3849 0.3778 0.4146 2.68e-49 5ne2:A, 5ne2:B, 5ne3:A, 5ne3:B, 6qw7:A, 6qw7:B
30 5nj2:A 272 194 0.3170 0.3088 0.4330 4.17e-45 7a72:A, 6b5y:A, 6b5y:B, 6b5y:C, 6b5y:D, 6b68:A, 6b68:B, 6b68:C, 6b68:D, 6b69:A, 6b69:B, 6b69:C, 6b69:D, 6b6a:A, 6b6a:B, 6b6a:C, 6b6a:D, 6b6c:A, 6b6d:A, 6b6e:A, 6b6f:A, 8btv:A, 8btw:A, 8bv4:A, 3cg5:A, 4df6:A, 3dwz:A, 4ebl:B, 4ebl:C, 4ebn:B, 4ebn:C, 4ebp:B, 4ebp:C, 8ebi:B, 8ebi:D, 8ebr:A, 8ebr:B, 8ebr:C, 8ebr:D, 8ec4:A, 8ec4:B, 8ec4:C, 8ec4:D, 8ecf:A, 8ecf:B, 8ecf:C, 8ecf:D, 8gcx:A, 8gcx:B, 8gcx:C, 8gcx:D, 6h2a:A, 6h2c:A, 6h2c:B, 6h2g:A, 6h2g:B, 6h2h:A, 6h2h:B, 6h2i:A, 6h2i:B, 6h2k:A, 6h2k:B, 3iqa:A, 7k8e:B, 7k8e:D, 7k8f:B, 7k8f:D, 7k8h:A, 7k8h:B, 7k8h:C, 7k8h:D, 7k8k:A, 7k8k:B, 7k8k:C, 7k8k:D, 3m6b:A, 3m6h:A, 6n14:A, 3n6i:A, 3n7w:A, 3n8l:A, 3n8r:A, 3n8s:A, 3nbl:A, 3nc8:A, 3nck:A, 3nde:A, 3ndg:A, 5nj2:B, 3ny4:A, 4q8i:A, 4qb8:A, 4qhc:A, 3vff:A, 3vff:B, 3vff:C, 3vff:D, 3vfh:B, 3vfh:C, 4x6t:A
31 1blc:A 257 226 0.2755 0.2840 0.3230 2.55e-41 1blh:A, 1ghi:A, 1ghm:A, 1ghp:A, 1kgg:A
32 1alq:A 259 216 0.2642 0.2703 0.3241 1.97e-39
33 6h2a:C 248 195 0.2943 0.3145 0.4000 2.96e-35
34 6nvu:A 277 226 0.2264 0.2166 0.2655 1.25e-20 5gs8:A, 5gwa:A, 6pq8:A, 5x5g:A
35 6d3g:C 281 220 0.2453 0.2313 0.2955 7.57e-20 6d3g:A, 6d3g:B, 6d3g:D
36 8eo6:A 268 259 0.2604 0.2575 0.2664 3.38e-14 8eo6:B
37 2jbf:D 274 221 0.2377 0.2299 0.2851 7.94e-10 2j8y:A, 2j8y:B, 2j8y:C, 2j8y:D, 2jbf:A, 2jbf:B, 2jbf:C
38 8fwg:n1 299 46 0.0642 0.0569 0.3696 1.1 8fwg:k1, 8fwg:g1, 8fwg:r1, 8fwg:o1, 8fwg:h1, 8fwg:k2, 8fwg:n2, 8fwg:g2, 8fwg:r2, 8fwg:o2, 8fwg:h2, 8fwg:k5, 8fwg:n5, 8fwg:g5, 8fwg:r5, 8fwg:o5, 8fwg:h5, 8fwg:k6, 8fwg:n6, 8fwg:g6, 8fwg:r6, 8fwg:o6, 8fwg:h6, 8fwg:k7, 8fwg:n7, 8fwg:g7, 8fwg:r7, 8fwg:o7, 8fwg:h7, 8fxp:i, 8fxp:j, 8fxp:k, 8fxp:n, 8fxp:g, 8fxp:r, 8fxp:o, 8fxp:h, 8fxp:w, 8fxp:y, 8fxp:x, 8fxp:AB, 8fxp:AC, 8fxp:AG, 8fxp:AJ, 8fxp:AF, 8fxp:AA, 8fxr:k1, 8fxr:n1, 8fxr:o1, 8fxr:g1, 8fxr:r1, 8fxr:h1, 8fxr:k2, 8fxr:n2, 8fxr:g2, 8fxr:r2, 8fxr:o2, 8fxr:h2, 8fxr:k5, 8fxr:n5, 8fxr:g5, 8fxr:r5, 8fxr:o5, 8fxr:h5, 8fxr:k6, 8fxr:n6, 8fxr:g6, 8fxr:r6, 8fxr:o6, 8fxr:h6, 8fxr:k7, 8fxr:n7, 8fxr:g7, 8fxr:r7, 8fxr:o7, 8fxr:h7
39 5tv6:A 239 61 0.0830 0.0921 0.3607 5.7 5tv6:B, 5tv8:A, 5tv8:B, 5tva:A, 5tva:B
40 6z1q:BBB 337 50 0.0566 0.0445 0.3000 6.3 4dn5:A, 4dn5:B, 4g3d:A, 4g3d:D, 4idt:A, 4idt:B, 4idv:A, 4idv:B, 4idv:C, 4idv:D, 6wpp:A, 6wpp:B, 8yhw:A, 8yhw:B, 8yhw:C, 8yhw:D, 6z1q:AAA, 6z1t:AAA, 6z1t:BBB

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218