Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SPPGGERVGILGAGIGGLYSALILQSLDVPFEIIEASNRVGGRLFTHKFPNGGKYDYYDVGAMRYPLPKSDDKGNYQPGV
MQRVGQLFTYLGMHKQLIPYYFKSNKSPGFQYFNGVRARIGEGSSFDAPALGINSSLIDIGVTKIVNDAVGPFAQALFDD
LQKHTTTGWDDMMKNDAYSTRSYFSFKYLPSPSFGLPSEHFSTRVINWLETFDKSTGWYDRGLTETVLEAIAFGEVEVDW
RCIDGGSHVLPDTIAAFLHKKGGNAFVMNASVTAIGLENPNKEDSPMVVVAGGQKRKYSHVISTLPLPVLRTVDLKNSKL
DIVQSNALRKLQYGPSIKIGILFKEPWWTTGQDKNGEKFDLVGGQSYTDLPIRTVVYPSYGVNTNAPSNTLIASYCWTND
AERMGSLIGTGAATYEEQLEHLVLSNLAAVHNTDYQYLKDRLVDVHSWDWNHNPLTMGAFAFFGPGDFQDLYTSLNRPAA
NGKLHFAGEALSVRHAWVVGALDSAWRAVYNYLYVTDPAKLPKFFELWGKNAEWFEQ

The query sequence (length=537) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 9enh:A 544 540 1.0000 0.9871 0.9944 0.0 9enh:B, 9enh:C, 9enh:D, 9eni:A, 9eni:B, 9eni:C, 9eni:D, 9enj:A, 9enj:B, 9enj:C, 9enj:D, 9enk:A, 9enk:B, 9enk:C, 9enk:D, 9enn:A, 9enn:B, 9enn:C, 9enn:D
2 7d4c:A 595 525 0.3594 0.3244 0.3676 9.32e-89 7c3h:A, 7c3h:B, 7c3i:A, 7c3i:B, 7c3j:A, 7c3j:B, 7c3l:A, 7c3l:B, 7d4d:A, 7d4e:A, 3x0v:A, 3x0v:B
3 7e0d:A 604 608 0.2644 0.2351 0.2336 7.04e-21 7e0c:A, 2e1m:A, 2e1m:B, 2e1m:C, 8jpw:A
4 5z2g:A 477 519 0.2216 0.2495 0.2293 7.55e-19 5z2g:B
5 3kve:A 484 519 0.2160 0.2397 0.2235 1.13e-17 3kve:B, 3kve:C, 3kve:D
6 1reo:A 484 515 0.2179 0.2417 0.2272 1.01e-16 1tdk:A, 1tdn:A, 1tdo:A
7 5ts5:A 483 519 0.2179 0.2422 0.2254 1.12e-16 4e0v:A, 4e0v:B, 5ts5:B, 5ts5:C, 5ts5:D
8 1f8r:A 483 512 0.2048 0.2277 0.2148 2.12e-13 1f8r:B, 1f8r:C, 1f8r:D, 1f8s:A, 1f8s:B, 1f8s:C, 1f8s:D, 1f8s:E, 1f8s:F, 1f8s:G, 1f8s:H, 2iid:A, 2iid:B, 2iid:C, 2iid:D
9 8jhe:A 508 524 0.2030 0.2146 0.2080 2.45e-12 8jhe:B, 8jhe:C, 8jhe:D
10 7eih:A 588 621 0.2458 0.2245 0.2126 1.04e-10 7eih:B, 7eii:A, 7eii:B, 7eij:A, 7eij:B
11 4iv9:A 552 546 0.2197 0.2138 0.2161 1.09e-10 4iv9:B
12 5yb6:A 556 536 0.2235 0.2158 0.2239 2.12e-09 3we0:A, 3we0:B, 5yb6:C, 5yb6:B, 5yb6:D, 5yb7:A, 5yb7:C, 5yb7:B, 5yb7:D, 5yb8:A, 5yb8:D, 5yb8:B, 5yb8:C
13 7x7i:A 583 253 0.1210 0.1115 0.2569 2.38e-07 7x7i:B, 7x7j:A, 7x7j:B, 7x7k:A, 7x7k:B
14 7c4k:A 614 457 0.1974 0.1726 0.2319 4.17e-07 7c4l:A, 7c4m:A, 7c4n:A
15 2jae:A 478 261 0.1322 0.1485 0.2720 1.61e-06 2jae:B, 2jb1:A, 2jb1:B, 2jb2:A, 2jb2:B, 2jb3:A, 2jb3:B
16 2jae:A 478 79 0.0484 0.0544 0.3291 0.047 2jae:B, 2jb1:A, 2jb1:B, 2jb2:A, 2jb2:B, 2jb3:A, 2jb3:B
17 2z5x:A 513 524 0.2160 0.2261 0.2214 9.90e-06 2bxr:A, 2bxr:B, 2bxs:A, 2bxs:B, 2z5y:A
18 8t8a:A 583 256 0.1061 0.0978 0.2227 1.72e-05 8jt7:A, 8t8a:B, 8t8a:C, 8t8a:D
19 8t8a:A 583 83 0.0559 0.0515 0.3614 0.001 8jt7:A, 8t8a:B, 8t8a:C, 8t8a:D
20 8p84:B 450 537 0.2123 0.2533 0.2123 5.56e-05 8p84:A
21 7og2:A 622 415 0.1788 0.1543 0.2313 8.50e-05 7og2:B
22 1o5w:C 512 526 0.2142 0.2246 0.2186 8.94e-05 1o5w:A, 1o5w:B, 1o5w:D
23 8eeg:B 440 42 0.0354 0.0432 0.4524 1.48e-04 8eef:A, 8eef:B, 8eeg:A, 8eeh:A, 8eeh:B, 8eei:A, 8eei:B, 8eej:B, 8eej:A, 8eek:A, 8eek:B, 8eel:A, 8eel:B, 8eem:A, 8eem:B, 8een:B, 8een:A, 8eeo:A, 8eeo:B
24 7eme:A 413 55 0.0372 0.0484 0.3636 0.001 7eme:B
25 7eme:A 413 227 0.1006 0.1308 0.2379 0.012 7eme:B
26 4bay:A 670 57 0.0447 0.0358 0.4211 0.001 3abt:A, 3abu:A, 8bop:A, 8box:A, 7cdc:A, 7cdd:A, 7cde:A, 7cdf:A, 7cdg:A, 4czz:A, 7e0g:A, 2ejr:A, 8f2z:A, 8f30:A, 8f59:A, 8f6s:A, 8fdv:A, 8fj4:A, 8fj6:A, 8fj7:A, 8fqj:A, 8fri:A, 8frq:A, 8frv:A, 8fsk:A, 9fwg:A, 5h6q:A, 5h6r:A, 2h94:A, 2hko:A, 8inl:A, 2iw5:A, 8jf5:A, 6k3e:A, 6kgk:A, 6kgl:A, 6kgm:A, 6kgn:A, 6kgo:A, 6kgp:A, 6kgq:A, 6kgr:A, 4kum:A, 5l3b:A, 5l3c:A, 5l3d:A, 5l3e:A, 5l3f:A, 5l3g:A, 5lbq:A, 5lgn:A, 5lgt:A, 5lgu:A, 5lhg:A, 5lhh:A, 5lhi:A, 6nqm:A, 6nqu:A, 6nr5:A, 8q1g:A, 8q1h:A, 8q1j:A, 6s35:A, 6te1:A, 6tuy:A, 4uv8:A, 4uv9:A, 4uva:A, 4uvb:A, 4uvc:A, 2uxn:A, 2uxx:A, 4uxn:A, 2v1d:A, 7vqs:A, 7vqt:A, 7vqu:A, 6vyp:k, 6vyp:m, 6vyp:M, 6vyp:K, 7w3l:A, 6w4k:A, 6wc6:A, 2x0l:A, 5x60:A, 2xaf:A, 2xag:A, 2xah:A, 2xaj:A, 2xaq:A, 2xas:A, 4xbf:A, 7xw8:A, 2y48:A, 5yjb:A, 8ym7:A, 2z3y:A, 2z5u:A, 3zms:A, 3zmt:A, 3zmu:A, 3zmv:A, 3zmz:A, 3zn0:A, 3zn1:A, 7zry:A
27 2dw4:A 634 57 0.0447 0.0379 0.4211 0.001
28 1rsg:A 481 55 0.0447 0.0499 0.4364 0.002
29 7kho:D 405 65 0.0447 0.0593 0.3692 0.004
30 6fvz:A 500 546 0.2067 0.2220 0.2033 0.006 4a79:A, 4a79:B, 4a7a:A, 4a7a:B, 7b0v:A, 7b0v:B, 7b0z:A, 7b0z:B, 2bk3:A, 2bk3:B, 2bk4:A, 2bk4:B, 2bk5:A, 2bk5:B, 2byb:A, 2byb:B, 2c64:A, 2c64:B, 2c65:A, 2c65:B, 2c66:A, 2c66:B, 2c67:A, 2c67:B, 2c70:A, 2c70:B, 2c72:A, 2c72:B, 2c73:A, 2c73:B, 2c75:A, 2c75:B, 2c76:A, 2c76:B, 4crt:A, 4crt:B, 6fvz:B, 6fw0:A, 6fw0:B, 6fwc:A, 6fwc:B, 1gos:A, 1gos:B, 5mrl:A, 5mrl:B, 1oj9:A, 1oj9:B, 1oja:A, 1oja:B, 1ojc:A, 1ojc:B, 1ojd:A, 1ojd:B, 1ojd:C, 1ojd:D, 1ojd:E, 1ojd:F, 1ojd:G, 1ojd:H, 1ojd:I, 1ojd:L, 7p4f:A, 7p4f:B, 7p4h:A, 7p4h:B, 3po7:A, 3po7:B, 6rkb:A, 6rkb:B, 6rkp:A, 6rkp:B, 6rle:A, 6rle:B, 1s2q:A, 1s2q:B, 1s2y:A, 1s2y:B, 1s3b:A, 1s3b:B, 1s3e:A, 1s3e:B, 2v5z:A, 2v5z:B, 2v60:A, 2v60:B, 2v61:A, 2v61:B, 2vrl:A, 2vrl:B, 2vrm:A, 2vrm:B, 2vz2:A, 2vz2:B, 2xcg:A, 2xcg:B, 2xfn:A, 2xfn:B, 2xfo:A, 2xfo:B, 2xfp:A, 2xfp:B, 2xfq:A, 2xfq:B, 2xfu:A, 2xfu:B, 6yt2:A, 6yt2:B, 7zw3:AAA, 7zw3:BBB, 3zyx:A, 3zyx:B
31 3ng7:X 427 123 0.0596 0.0749 0.2602 0.010 3k7m:X, 3k7q:X, 3k7t:A, 3k7t:B, 3ngc:X, 3nh3:X, 3nho:X, 3nk0:X, 3nk1:X, 3nk2:X, 3nn0:X, 3nn6:X
32 6c71:B 440 63 0.0428 0.0523 0.3651 0.010 7c49:A, 7c49:B, 7c4a:A, 7c4a:B, 6c71:A, 6c71:C, 6c71:D, 8dq7:A, 8dq7:B, 8dq8:A, 8dq8:B, 8dsv:A, 8dsv:B, 7khn:A, 7kho:A, 7kho:B, 7kho:C, 5ttj:A, 5ttj:B, 5ttk:A, 5ttk:B, 5ttk:C, 5ttk:D
33 5mbx:A 472 224 0.0987 0.1123 0.2366 0.015 5lae:A, 5lfo:A, 5lgb:A
34 4gdp:B 502 52 0.0428 0.0458 0.4423 0.019 3bi2:A, 3bi2:B, 3bi4:A, 3bi4:B, 3bi5:A, 3bi5:B, 3bnm:B, 3bnm:A, 3bnu:B, 3bnu:A, 3cn8:B, 3cn8:A, 3cnd:B, 3cnd:A, 3cnp:B, 3cnp:A, 3cns:A, 3cns:B, 3cnt:B, 3cnt:A, 4ech:A, 4ech:B, 4gdp:A, 4gdp:C, 4gdp:D, 1rsg:B, 1xpq:A, 1xpq:B, 1xpq:C, 1xpq:D, 1yy5:A, 1yy5:B, 1z6l:A, 1z6l:B
35 8i6i:A 448 51 0.0354 0.0424 0.3725 0.023 8i6i:C
36 2yg3:B 450 39 0.0335 0.0400 0.4615 0.036 2yg3:A, 2yg4:A, 2yg4:B, 2yg5:A, 2yg6:A, 2yg6:B, 2yg7:A, 2yg7:B
37 6lqc:A 450 49 0.0354 0.0422 0.3878 0.053 6lql:A
38 6lqc:A 450 60 0.0428 0.0511 0.3833 4.4 6lql:A
39 4i58:A 451 51 0.0372 0.0443 0.3922 0.13 4i58:B, 4i58:C, 4i58:D, 4i59:A, 4i59:B, 4i59:C, 4i59:D
40 6y48:B 538 46 0.0335 0.0335 0.3913 0.17 6y48:A, 6y48:C, 6y48:D
41 1w4x:A 533 56 0.0354 0.0356 0.3393 0.18 4c74:A, 4c77:A, 4d03:A, 4d04:A, 4ovi:A, 2ylr:A, 2yls:A, 2ylt:A, 2ylw:A, 2ylx:A, 2ylz:A, 2ym1:A, 2ym2:A
42 3rha:A 459 39 0.0317 0.0370 0.4359 0.38 3rha:B
43 6pfz:A 541 46 0.0298 0.0296 0.3478 0.46 6pfz:D, 6pfz:C, 6pfz:B
44 3nks:A 465 55 0.0335 0.0387 0.3273 0.60 4ivm:B, 4ivo:B
45 3uoz:A 540 93 0.0428 0.0426 0.2473 0.62 3uov:A, 3uov:B, 3uox:A, 3uox:B, 3uoy:A, 3uoy:B, 3uoz:B, 3up4:A, 3up4:B, 3up5:A, 3up5:B
46 7oy0:A 462 132 0.0652 0.0758 0.2652 1.0
47 7mfm:I 490 47 0.0335 0.0367 0.3830 1.2 7mfm:J, 7mft:I
48 1sez:A 465 40 0.0261 0.0301 0.3500 1.4 1sez:B
49 3kpf:A 467 46 0.0298 0.0343 0.3478 1.5 1b37:A, 1b37:B, 1b37:C, 1b5q:A, 1b5q:B, 1b5q:C, 1h81:A, 1h81:B, 1h81:C, 1h82:A, 1h82:B, 1h82:C, 1h83:A, 1h83:B, 1h83:C, 1h84:A, 1h84:B, 1h84:C, 1h86:A, 1h86:B, 1h86:C, 3kpf:B, 3ku9:A, 3ku9:B, 3l1r:A, 3l1r:B
50 8oxm:A 2748 134 0.0540 0.0106 0.2164 1.8 8oxm:B
51 7sic:A 2773 134 0.0540 0.0105 0.2164 1.9 8oxo:A, 8oxo:B, 8oxp:A, 8oxp:B, 7sic:B, 7sid:A, 7sid:C
52 3i6d:B 419 49 0.0335 0.0430 0.3673 1.9 3i6d:A
53 7cag:A 285 62 0.0372 0.0702 0.3226 2.0 8hps:A
54 7ni5:A 2791 134 0.0540 0.0104 0.2164 2.1 7ni4:A, 7ni4:B, 7ni5:B, 7ni6:A, 7ni6:B, 8oxq:A, 8oxq:B
55 4aos:A 523 49 0.0317 0.0325 0.3469 2.2 4aox:A, 4ap1:A, 4ap3:A
56 8cja:A 669 61 0.0354 0.0284 0.3115 2.3 8cjb:A, 8cjc:A, 8cmw:A, 7zkj:A, 7zkk:A, 7zkv:A
57 8a22:AO 377 81 0.0410 0.0584 0.2716 2.3 8apn:AO, 8apo:AO
58 7u6l:D 436 47 0.0298 0.0367 0.3404 2.8 7e7h:A, 7e7h:B, 7u6l:A, 7u6l:B, 7u6l:C
59 8bcv:G 94 50 0.0372 0.2128 0.4000 3.1
60 6lja:A 841 49 0.0298 0.0190 0.3265 3.4 6ljl:A
61 2yr4:A 674 155 0.0726 0.0579 0.2516 3.5 2yr4:B
62 5xyu:D 138 47 0.0298 0.1159 0.3404 3.5
63 6cr0:A 430 40 0.0298 0.0372 0.4000 3.6
64 9f1t:A 477 99 0.0484 0.0545 0.2626 4.3 9f1t:B, 9f3z:B, 9f3z:A
65 2ive:A 451 42 0.0298 0.0355 0.3810 4.9 2ivd:A, 2ivd:B, 2ive:B
66 8apz:A 412 95 0.0484 0.0631 0.2737 5.0 8apz:B, 8aq0:A, 8aq0:B
67 6oyu:B 459 65 0.0391 0.0458 0.3231 6.8 6oyu:A, 6oyv:A, 6oyv:B
68 8xku:R 267 49 0.0242 0.0487 0.2653 7.8 8xkv:R
69 7bkd:A 664 44 0.0261 0.0211 0.3182 7.8 7bkb:A, 7bkb:a, 7bkc:A, 7bkc:a, 7bkd:a, 7bke:A, 7bke:a
70 7v4x:A 529 42 0.0279 0.0284 0.3571 8.3 6a37:A, 7v50:A, 7v51:A

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218