BioLiP

>protein
SPMDALCRVCHTASPRCLPLFKPLDDPISGKPATLASILSYCSGLEILEAELFLPHHICPDCVAKLRLSLEFKRSVHRMD
RILRQT

The query sequence (length=86) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6fp5:B	86	86	1.0000	1.0000	1.0000	2.14e-58	6fp5:A
2	2iwi:B	249	22	0.1628	0.0562	0.6364	0.031	2iwi:A, 4x7q:B, 4x7q:A
3	8q1n:A	320	27	0.1395	0.0375	0.4444	1.3	4a7j:A, 7axp:A, 7axq:A, 7axs:A, 7axx:A, 8bb2:B, 8bb3:B, 8bb4:Q, 8bb5:D, 7bcy:A, 7bcy:B, 7bed:A, 7cfp:A, 7cfq:A, 2cnx:A, 2co0:A, 2co0:C, 4cy1:B, 4cy1:A, 4cy2:A, 4cy3:A, 4cy5:A, 6d9x:A, 6dai:A, 6dak:A, 6dar:A, 6das:A, 6das:B, 7dno:A, 7dno:B, 6dy7:A, 6dya:A, 6e1y:A, 6e1y:B, 6e1z:A, 6e1z:B, 6e22:A, 6e22:B, 6e23:A, 6e23:B, 8e9f:A, 5eal:A, 5eal:B, 5eam:A, 5eam:B, 5eap:A, 5ear:A, 5ear:B, 3eg6:A, 3emh:A, 4erq:A, 4erq:B, 4erq:C, 4ery:A, 4erz:C, 4erz:A, 4erz:B, 4es0:A, 4esg:B, 4esg:A, 4ewr:A, 8f1g:A, 8f1g:B, 8f93:A, 8f93:B, 8g3c:A, 8g3e:A, 8g3e:B, 2g99:B, 2g99:A, 2g9a:A, 4gm3:A, 4gm3:B, 4gm3:C, 4gm3:D, 4gm3:E, 4gm3:F, 4gm3:G, 4gm3:H, 4gm8:A, 4gm8:B, 4gm8:C, 4gm8:D, 4gm9:A, 4gm9:B, 4gmb:A, 2h13:A, 2h6k:A, 2h6k:B, 2h6n:A, 2h6n:B, 2h6q:A, 2h6q:B, 2h9m:A, 2h9m:C, 2h9n:A, 2h9n:C, 2h9p:A, 8hmx:A, 4ia9:A, 6iam:A, 7jto:B, 7jtp:A, 5m23:A, 5m25:A, 4o45:A, 2o9k:A, 2o9k:C, 6oi0:A, 6oi1:A, 6oi2:A, 6oi3:A, 8okf:A, 3p4f:A, 6pg3:A, 6pg3:B, 6pg4:A, 6pg5:A, 6pg6:A, 6pg6:B, 6pg7:A, 6pg8:A, 6pg8:B, 6pg8:C, 6pg8:D, 6pg9:A, 6pg9:B, 6pga:A, 6pgb:A, 6pgc:A, 6pgd:A, 6pge:A, 6pgf:A, 3psl:A, 3psl:B, 8q1n:B, 7q2j:D, 4ql1:A, 4ql1:B, 4qqe:A, 3smr:A, 3smr:B, 3smr:C, 3smr:D, 5sxm:B, 5sxm:A, 8t5i:A, 8t5i:B, 6u5m:A, 6u5m:B, 6u5y:A, 6u5y:B, 6u6w:A, 6u6w:B, 6u80:A, 6u80:B, 6u8b:A, 6u8b:B, 6u8l:A, 6u8l:B, 6u8o:A, 7u9y:A, 7uas:A, 7uas:B, 6ucs:A, 6ucs:B, 6ufx:A, 6uhy:A, 6uhy:B, 6uhz:A, 6uhz:B, 6uif:A, 6uif:B, 6uik:A, 6uik:B, 6uj4:A, 6uj4:B, 6ujh:A, 6ujh:B, 6ujj:A, 6ujl:A, 8ujy:A, 8ujy:B, 6uoz:A, 6uoz:B, 3ur4:A, 3ur4:B, 3uvk:A, 3uvl:A, 3uvm:A, 3uvn:A, 3uvn:C, 3uvo:A, 5vfc:A, 6wjq:A, 6wjq:B, 7wvk:A, 8wxq:A, 8wxq:B, 8wxr:A, 8wxr:B, 8wxt:A, 8wxu:B, 8wxv:A, 8wxv:C, 8wxx:B, 8wxx:A, 8x3r:A, 8x3s:A, 2xl2:A, 2xl2:B, 2xl3:A, 2xl3:B, 4y7r:A
4	3m5k:A	168	31	0.1395	0.0714	0.3871	2.0	3m5k:B
5	7pok:A	98	80	0.2326	0.2041	0.2500	2.1	7pok:B, 7pok:C, 7pok:D
6	2iry:A	288	24	0.1163	0.0347	0.4167	2.2	2irx:A, 2iry:B, 4mky:B, 4mky:A, 4mky:C, 4mky:D, 3pky:A, 3pky:B, 2r9l:A, 2r9l:B
7	3f2b:A	994	17	0.0930	0.0080	0.4706	2.9	3f2c:A, 3f2d:A
8	7yed:H	1288	24	0.1279	0.0085	0.4583	3.1	7yed:I, 7yed:J, 7yed:K, 7yed:L, 7yev:H, 7yev:I, 7yev:J, 7yev:K, 7yev:L, 7yez:H, 7yez:I, 7yez:J, 7yez:K, 7yez:L
9	3wrg:A	658	36	0.1628	0.0213	0.3889	3.3	7bzl:A, 7dif:A, 7exu:A, 7exv:A, 7exw:A, 8qf2:A, 3wkx:A, 3wre:A
10	6gzd:A	297	32	0.1395	0.0404	0.3750	3.4	5fqd:C, 5fqd:F, 8g66:C
11	7mgo:A	489	19	0.1047	0.0184	0.4737	3.5
12	2c3c:A	522	19	0.1047	0.0172	0.4737	3.5	2c3c:B, 2c3d:A, 2c3d:B, 7mgn:A, 7mgn:B, 7mgo:B, 1mo9:A, 1mo9:B, 1mok:A, 1mok:B, 1mok:C, 1mok:D, 3q6j:A, 3q6j:B
13	8pyh:B	319	25	0.1163	0.0313	0.4000	8.7	8pyh:A
14	7ase:N	93	19	0.1047	0.0968	0.4737	9.9	5opt:n

[Back]