BioLiP

>protein
SPEFMSQYGFVRVPREVEKAIPVVNAPRPRAVVPPPNSETARLVREYAAKELTAPVLNHSLRVFQYSVAIIRDQFPAWDL
DQEVLYVTCLLHDIATTDKNMRATKMSFEYYGGILSRELVFNATGGNQDYADAVTEAIIRHQDLTGTGYITTLGLILQIA
VTLDNVGSNTDLIHIDTVSAINEQFPRLHWLSCFATVVDTENSRKPWGHTSSLGDDFSKKVICNTFGYTK

The query sequence (length=230) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6dk9:F	232	229	0.9913	0.9828	0.9956	8.77e-174	6dk9:A, 6dk9:B, 6dk9:C, 6dk9:D, 6dk9:E, 6dk9:G, 6dk9:H, 6dk9:I, 6dka:A, 6dka:B, 6dka:C, 6dka:D, 6dka:E, 6dka:F, 6dka:G, 6dka:H, 6dka:I, 6dkc:A, 6dkc:B, 6dkc:C, 6dkc:D, 6dkc:E, 6dkc:F, 6dkc:G, 6dkc:H, 6dkc:I, 6dkd:A, 6dkd:B, 6dkd:C, 6dkd:D, 6dkd:E, 6dkd:F, 6dkd:G, 6dkd:H, 6dkd:I
2	1v9i:C	261	37	0.0609	0.0536	0.3784	2.0	5a25:A, 5a25:B, 4cnr:A, 4cnr:B, 4cnr:C, 4cnr:D, 4cnv:A, 4cnw:A, 4cnw:B, 4cnx:A, 5ezt:X, 6sks:A, 6skt:A, 6skv:A, 1v9e:A, 1v9e:B
3	7egv:A	590	52	0.0826	0.0322	0.3654	2.0	7egv:B, 7ehe:A, 7ehe:B
4	4wzh:A	304	55	0.0652	0.0493	0.2727	2.2	4wzh:B
5	3w87:A	314	55	0.0652	0.0478	0.2727	2.4	3c3n:A, 3c3n:B, 3c3n:C, 3c3n:D, 2djl:A, 2djl:B, 2djx:A, 2djx:B, 2e68:A, 2e68:B, 2e6a:A, 2e6a:B, 2e6d:A, 2e6d:B, 2e6f:A, 2e6f:B, 5e93:A, 5e93:B, 5ea9:A, 5ea9:B, 4jd4:A, 4jd4:B, 4jdb:A, 4jdb:B, 3w1a:A, 3w1a:B, 3w1l:A, 3w1l:B, 3w1m:A, 3w1m:B, 3w1n:A, 3w1n:B, 3w1p:A, 3w1p:B, 3w1q:A, 3w1q:B, 3w1r:A, 3w1r:B, 3w1t:A, 3w1t:B, 3w1u:A, 3w1u:B, 3w1x:A, 3w1x:B, 3w22:A, 3w22:B, 3w23:A, 3w23:B, 3w2j:A, 3w2j:B, 3w2k:A, 3w2k:B, 3w2l:A, 3w2l:B, 3w2m:A, 3w2m:B, 3w2n:A, 3w2n:B, 3w2u:A, 3w2u:B, 3w3o:A, 3w3o:B, 3w6y:A, 3w6y:B, 3w70:A, 3w70:B, 3w71:A, 3w71:B, 3w72:A, 3w72:B, 3w73:A, 3w73:B, 3w74:A, 3w74:B, 3w75:A, 3w75:B, 3w76:A, 3w76:B, 3w7c:A, 3w7c:B, 3w7d:A, 3w7d:B, 3w7e:A, 3w7e:B, 3w7g:A, 3w7g:B, 3w7h:A, 3w7h:B, 3w7i:A, 3w7i:B, 3w7j:A, 3w7j:B, 3w7k:A, 3w7k:B, 3w7l:A, 3w7l:B, 3w7m:A, 3w7m:B, 3w7n:A, 3w7n:B, 3w7o:A, 3w7o:B, 3w7p:A, 3w7p:B, 3w7q:A, 3w7q:B, 3w83:A, 3w83:B, 3w84:A, 3w84:B, 3w85:A, 3w85:B, 3w86:A, 3w86:B, 3w87:B, 3w88:A, 3w88:B
6	4pfb:A	308	43	0.0696	0.0519	0.3721	2.4
7	6pwy:B	513	93	0.1087	0.0487	0.2688	4.6	6pwy:A, 6pwy:D, 6pwy:C

[Back]