Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

I-TASSER I-TASSER-MTD C-I-TASSER CR-I-TASSER QUARK C-QUARK LOMETS MUSTER CEthreader SEGMER DeepFold DeepFoldRNA FoldDesign COFACTOR COACH MetaGO TripletGO IonCom FG-MD ModRefiner REMO DEMO DEMO-EM DMFold SPRING COTH Threpp PEPPI BSpred ANGLOR EDock BSP-SLIM SAXSTER FUpred ThreaDom ThreaDomEx EvoDesign BindProf BindProfX SSIPe GPCR-I-TASSER MAGELLAN ResQ STRUM DAMpred

TM-score TM-align US-align MM-align RNA-align NW-align LS-align EDTSurf MVP MVP-Fit SPICKER HAAD PSSpred 3DRobot MR-REX I-TASSER-MR SVMSEQ NeBcon ResPRE TripletRes DeepPotential WDL-RF ATPbind DockRMSD DeepMSA FASPR EM-Refiner GPU-I-TASSER

BioLiP E. coli GLASS GPCR-HGmod GPCR-RD GPCR-EXP Tara-3D TM-fold DECOYS POTENTIAL RW/RWplus EvoEF HPSF THE-DB ADDRESS Alpaca-Antibody CASP7 CASP8 CASP9 CASP10 CASP11 CASP12 CASP13 CASP14

BioLiP
>protein
SPARTAQSPLLAKPVKTKVVDNFADMLVTPALQEALADMGVSTPSPIQQTAIEAVLQRKNTVIAAPHGEGKTLAYLLPLY
QNMEKDRDVYKIPLRERRPRMILLAPTKELVEQLQTVCARLDAATGLTSVCFTSRKRSKYHLSRMLKNTMADVLVMDPKL
ILRLLRTRRLFIEDLRYFAVDEADAMMSSLHDHDAVQLLMKVQKRNQFKYLWPVQTQYVFVTAYMTRKLEYIVGRKISDP
VTCMFRQLMHRPQARLRHRFYAIRREPEKFTVLMHLLRKNGHVPLPFAEGRRTIIFFRNIDATTAVFHQLRSAGFAVSLL
HASLPYKVRKEMYADFASGRTNILCATDVAARGLDLHVDMVINFDVPTNALAYLSRSGRTARMGREGQVLNLYNKHQGVI
VSAIKAFLKDNLPMEGLTNRKADMMQPRYAEWRTHKINALARSYVSL

The query sequence (length=447) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length
Aligned
length
Identity
(normalized by query)
Identity
(normalized by hit)
Identity (normalized
by aligned length)
E-value Homologs
to hit
1 7am2:BW 447 447 1.0000 1.0000 1.0000 0.0
2 6yxy:EB 663 284 0.4139 0.2790 0.6514 3.50e-131 7aoi:XB, 6yxx:EB
3 6yxy:EB 663 167 0.2640 0.1780 0.7066 1.03e-77 7aoi:XB, 6yxx:EB
4 3ex7:C 392 414 0.2438 0.2781 0.2633 5.45e-35 8c6j:7, 3ex7:H, 9fmd:7, 2hyi:C, 2hyi:I, 8i0w:u, 6icz:u, 2j0q:A, 2j0q:B, 2j0s:A, 2j0u:A, 6qdv:7, 2xb2:A, 2xb2:X, 5xjc:u, 5yzg:u, 7znj:A, 7znj:a, 7znj:F, 7znj:f, 7znj:K, 7znj:k
5 8i9v:Cb 642 370 0.2394 0.1667 0.2892 1.21e-33 8i9t:Cb, 8i9w:Cb, 8i9x:Cb
6 5elx:A 391 400 0.2394 0.2737 0.2675 6.29e-33 3peu:A, 3pev:A, 3pew:A, 3pey:A, 3rrm:A, 3rrn:A
7 8y6o:I 597 406 0.2304 0.1725 0.2537 1.60e-32 8qp8:G, 6qw6:5X, 6qx9:5X, 8r08:G
8 5dtu:A 404 372 0.2192 0.2426 0.2634 9.89e-30
9 7oi6:x 374 375 0.2371 0.2834 0.2827 1.40e-28
10 4bru:A 375 375 0.2058 0.2453 0.2453 2.54e-28
11 2vso:A 366 366 0.2237 0.2732 0.2732 3.34e-28 1fuk:A, 2vso:B, 2vsx:A, 2vsx:B
12 4ct4:B 378 373 0.2058 0.2434 0.2466 7.73e-28 5anr:B, 4ct4:D, 1vec:A, 2wax:C, 2way:A
13 6xki:A 378 359 0.2125 0.2513 0.2646 3.07e-27 5zbz:A, 5zc9:A
14 8v87:3 656 405 0.2215 0.1509 0.2444 4.62e-27 8v84:3
15 4ljy:A 451 353 0.2036 0.2018 0.2578 4.65e-27 7oqb:p, 7oqe:p
16 8arp:C 445 410 0.2148 0.2157 0.2341 5.99e-26 8arp:A, 8arp:B, 8arp:D, 8arp:E, 8arp:F
17 4kbf:A 365 353 0.2237 0.2740 0.2833 9.43e-26 2gxq:A, 2gxs:A, 2gxs:B, 2gxu:A, 3mwk:B, 3mwl:B, 3nbf:A, 3nbf:B, 3nbf:C, 3nbf:D
18 4d26:A 430 367 0.1991 0.2070 0.2425 3.43e-25 4d25:A
19 8fkv:NI 647 372 0.2148 0.1484 0.2581 1.10e-24 8fkt:NI, 8fku:NI, 8fkw:NI, 8fkx:NI, 8fky:NI
20 2db3:A 420 379 0.2058 0.2190 0.2427 1.52e-24 2db3:B, 2db3:C, 2db3:D
21 6l5n:A 377 394 0.2349 0.2785 0.2665 3.05e-24 6l5m:A, 6l5m:B, 6l5m:C, 6l5m:D, 6l5m:E, 6l5n:B, 6l5o:A
22 6uv1:A 438 373 0.2125 0.2169 0.2547 3.42e-24 6uv1:B, 6uv2:A, 6uv3:A, 6uv4:A
23 8enk:B 381 367 0.1924 0.2257 0.2343 6.46e-24 8enk:A, 1xtj:A, 7znk:P, 7znk:p
24 7pmq:C 458 366 0.2170 0.2118 0.2650 4.51e-23 7pli:A, 7pli:B, 7pli:J, 7pli:E, 7pli:F, 7pli:I, 7pmm:A, 7pmm:B, 7pmq:D, 7pmq:A, 7pmq:B
25 7liu:A 442 393 0.2058 0.2081 0.2341 7.28e-23 6cz5:A, 5e7j:A, 5e7m:A, 2i4i:A, 7liu:B, 4px9:A, 4px9:B, 4px9:C, 4pxa:A, 8ssw:A, 8ssw:B
26 8i9z:CE 465 374 0.2036 0.1957 0.2433 2.09e-22 8i9p:CE, 8i9r:CE, 8i9t:CE, 8i9v:CE, 8i9w:CE, 8i9x:CE, 8i9y:CE, 8ia0:CE
27 6b4i:F 426 434 0.2304 0.2418 0.2373 1.69e-21 6b4i:E, 6b4j:E, 6b4j:F, 6b4k:A, 6b4k:B, 3ews:A, 3ews:B, 3fht:A, 3fht:B, 3fmo:B, 3fmp:B, 3fmp:D, 3g0h:A
28 5z3g:Y 438 372 0.2036 0.2078 0.2446 1.92e-21 6c0f:p, 6cb1:p, 8e5t:p, 7nac:D, 7ohr:D, 7ohs:D, 7ohv:D, 7ohw:D, 7ohx:D, 7r6q:D, 7r7a:D, 8v87:D
29 6o5f:A 417 386 0.1879 0.2014 0.2176 4.69e-21 6o5f:B
30 8esq:D 427 367 0.1902 0.1991 0.2316 5.72e-21 8esr:D, 8eth:D, 8eup:D, 8euy:D, 8ev3:D
31 5sup:B 383 385 0.1969 0.2298 0.2286 1.91e-20 5sup:A, 5sup:C, 5suq:A, 5suq:C
32 8fky:SW 448 390 0.2148 0.2143 0.2462 5.58e-20 8fkp:SW, 8fkq:SW, 8fkr:SW, 8fks:SW, 8fkt:SW, 8fku:SW, 8fkv:SW, 8fkw:SW, 8fkx:SW, 3ly5:A
33 4w7s:B 448 394 0.2170 0.2165 0.2462 2.14e-19
34 7nac:x 539 395 0.2081 0.1725 0.2354 1.60e-18 7nad:x, 7r72:x, 7r7a:x
35 8v83:D 423 361 0.1857 0.1962 0.2299 7.39e-18 6elz:D, 8v84:D
36 8tbx:A 458 411 0.2304 0.2249 0.2506 3.77e-17
37 8ia0:CW 540 371 0.1991 0.1648 0.2399 1.25e-16 8i9z:CW
38 8eti:D 391 359 0.1790 0.2046 0.2228 1.37e-15
39 3i5x:A 509 391 0.2036 0.1788 0.2327 2.45e-15 4db2:C, 4db2:A, 4db2:B, 4db2:D, 4db4:A, 3i5y:A, 3i61:A, 3i62:A, 3sqw:A, 3sqx:A, 4tyn:A, 4tyw:A, 4tyy:A, 4tz0:A, 4tz6:A
40 3iuy:A 213 187 0.1029 0.2160 0.2460 6.67e-13 3iuy:B
41 3ber:A 220 230 0.1342 0.2727 0.2609 2.33e-12
42 5gju:A 199 186 0.1186 0.2663 0.2849 3.23e-12
43 6s8r:A 167 135 0.0895 0.2395 0.2963 3.69e-12
44 5h1y:B 245 231 0.1275 0.2327 0.2468 5.69e-12 5h1y:A
45 6crm:A 512 378 0.1991 0.1738 0.2354 3.63e-11 4tmu:A
46 1oyw:A 516 357 0.1969 0.1705 0.2465 6.16e-11 1oyy:A
47 3fe2:A 234 201 0.1096 0.2094 0.2438 6.04e-10 3fe2:B
48 6aic:A 202 219 0.1141 0.2525 0.2329 1.63e-09
49 3dkp:A 240 168 0.0895 0.1667 0.2381 2.74e-09
50 7aud:A 522 360 0.1924 0.1648 0.2389 2.58e-07 7aud:E, 7aud:B, 7aud:C, 7aud:D, 7aud:F
51 2rb4:A 164 74 0.0626 0.1707 0.3784 2.58e-07
52 4cgz:A 629 360 0.1924 0.1367 0.2389 5.74e-07 4cdg:A, 4cdg:B, 4o3m:A
53 5v9x:A 772 380 0.1969 0.1140 0.2316 2.87e-06
54 3b7g:A 205 167 0.0962 0.2098 0.2575 2.73e-05 3b7g:B, 2oxc:A, 2oxc:B
55 7auc:A 493 359 0.1879 0.1704 0.2340 1.15e-04
56 7bkp:A 689 164 0.1051 0.0682 0.2866 1.58e-04 6g19:A, 6gjz:A, 6gkh:A, 6gkm:A, 6h66:A, 7nic:A, 7niq:B
57 2pl3:A 232 181 0.0962 0.1853 0.2376 1.69e-04
58 6yhr:A 541 375 0.1946 0.1608 0.2320 3.35e-04 3aaf:A, 3aaf:B, 7gqs:A, 7gqt:A, 7gqu:A, 8pfl:A, 8pfo:A, 8pfp:A, 8yle:A
59 7jl0:A 662 52 0.0447 0.0302 0.3846 6.25e-04 7jl2:A, 7jl2:C, 7jl2:E
60 1gm5:A 729 99 0.0626 0.0384 0.2828 7.05e-04
61 5jc3:A 668 147 0.0850 0.0569 0.2585 8.48e-04 5jc3:B, 5jc7:B, 5jcf:A, 5jcf:B, 5jch:A, 5jch:B
62 5jc7:A 641 147 0.0850 0.0593 0.2585 0.001
63 7eld:A 1137 105 0.0671 0.0264 0.2857 0.002 7ele:A
64 6zns:A 635 155 0.0738 0.0520 0.2129 0.004
65 6znq:B 711 155 0.0738 0.0464 0.2129 0.004 6znp:B
66 6znp:A 748 155 0.0738 0.0441 0.2129 0.005 6znq:A
67 7yym:A 1281 55 0.0403 0.0141 0.3273 0.005 4ngb:A, 4ngc:A, 4ngg:A, 4nh3:A, 4nh5:A, 4nh6:A, 7yyn:A, 7zpi:A, 7zpj:A, 7zpk:A
68 5zal:A 1314 55 0.0380 0.0129 0.3091 0.006 2eb1:A, 2eb1:B, 2eb1:C, 4ngd:A, 5zam:A
69 7a8r:A 531 345 0.1521 0.1281 0.1971 0.006 7a8r:B, 6jtz:A, 6jtz:B, 4u7d:A, 4u7d:B, 4u7d:D, 4u7d:C, 2v1x:A, 2v1x:B, 2wwy:B, 2wwy:A, 8yrs:B, 8yrs:A
70 4gl2:A 617 73 0.0559 0.0405 0.3425 0.009 4gl2:B
71 7zmq:A 443 386 0.1879 0.1896 0.2176 0.010 5lb3:B, 5lb3:E, 5lb5:A, 5lb5:B, 5lb5:C, 5lb5:D, 5lb8:A, 5lb8:D, 5lba:B, 5lba:A, 5lba:C, 5lba:D, 7zml:A, 7zml:B, 7zml:C, 7zml:D, 7zmm:B, 7zmm:A, 7zmm:C, 7zmm:D, 7zmn:A, 7zmn:B, 7zmo:A, 7zmo:B, 7zmp:A, 7zmp:B, 7zmq:B, 7zmr:A, 7zmr:B, 7zms:A, 7zmt:A, 7zmt:B, 7zmv:A, 7zmv:B, 7zmv:C, 7zmv:D
72 2p6r:A 683 163 0.0895 0.0586 0.2454 0.011
73 6tda:S 783 106 0.0649 0.0370 0.2736 0.019
74 6vz4:K 616 106 0.0649 0.0471 0.2736 0.020 6kw3:Y, 6kw4:Y, 6kw5:Q
75 4q47:A 513 346 0.1655 0.1442 0.2139 0.026 4q47:B, 4q48:A, 4q48:B
76 4qqw:A 911 75 0.0626 0.0307 0.3733 0.041 4qqw:C, 4qqw:E, 4qqw:G, 4qqx:A, 4qqx:C, 4qqx:E, 4qqy:A, 4qqy:C, 4qqy:E, 4qqy:G, 4qqz:A, 4qqz:C, 4qqz:E, 4qqz:G
77 4qqx:G 887 92 0.0671 0.0338 0.3261 0.082
78 6c66:G 832 74 0.0604 0.0325 0.3649 0.087
79 6h61:A 660 106 0.0671 0.0455 0.2830 0.090 6g1s:A, 6g1x:A, 7nga:A
80 7bkq:A 640 65 0.0470 0.0328 0.3231 0.15
81 6o8e:A 592 79 0.0515 0.0389 0.2911 0.18 1d9z:A, 2fdc:B, 6o8e:B, 6o8f:A, 6o8f:B, 6o8g:A
82 2d7d:A 621 92 0.0582 0.0419 0.2826 0.19 2nmv:A, 3v4r:B, 3v4r:A
83 5gan:B 1781 82 0.0515 0.0129 0.2805 0.20 4bgd:A, 5gao:B, 5gap:B, 5nrl:B, 5zwm:D, 5zwo:D
84 5f9h:G 653 111 0.0515 0.0352 0.2072 0.22 5e3h:A, 5f98:A, 5f98:C, 5f98:E, 5f98:G, 5f98:I, 5f98:K, 5f9h:A, 5f9h:C, 5f9h:E, 5f9h:I, 5f9h:K, 6gpg:A, 7jl3:A, 7jl3:C, 7jl3:E
85 5f9h:G 653 66 0.0537 0.0368 0.3636 0.35 5e3h:A, 5f98:A, 5f98:C, 5f98:E, 5f98:G, 5f98:I, 5f98:K, 5f9h:A, 5f9h:C, 5f9h:E, 5f9h:I, 5f9h:K, 6gpg:A, 7jl3:A, 7jl3:C, 7jl3:E
86 8dvs:A 682 111 0.0515 0.0337 0.2072 0.25 7bah:A, 7bah:B, 7bai:A, 7bai:B, 7bai:E, 8dvu:A, 5f9f:A, 5f9f:C, 5f9f:E, 5f9f:G, 5f9f:I, 5f9f:K, 7jl1:A, 6kyv:B, 6kyv:D, 6kyv:F, 6kyv:H, 6kyv:J, 6kyv:L, 3lrn:A, 3lrn:B, 3lrr:A, 3lrr:B, 7mk1:A, 7mk1:B, 3ncu:A, 3ncu:B, 3og8:A, 3og8:B, 2qfb:A, 2qfb:B, 2qfb:C, 2qfb:D, 2qfb:E, 2qfb:F, 2qfb:G, 2qfb:H, 2qfb:I, 2qfb:J, 7tny:A, 7tnz:A, 7to0:A, 7to2:A
87 8dvs:A 682 66 0.0537 0.0352 0.3636 0.37 7bah:A, 7bah:B, 7bai:A, 7bai:B, 7bai:E, 8dvu:A, 5f9f:A, 5f9f:C, 5f9f:E, 5f9f:G, 5f9f:I, 5f9f:K, 7jl1:A, 6kyv:B, 6kyv:D, 6kyv:F, 6kyv:H, 6kyv:J, 6kyv:L, 3lrn:A, 3lrn:B, 3lrr:A, 3lrr:B, 7mk1:A, 7mk1:B, 3ncu:A, 3ncu:B, 3og8:A, 3og8:B, 2qfb:A, 2qfb:B, 2qfb:C, 2qfb:D, 2qfb:E, 2qfb:F, 2qfb:G, 2qfb:H, 2qfb:I, 2qfb:J, 7tny:A, 7tnz:A, 7to0:A, 7to2:A
88 6uxw:A 778 131 0.0805 0.0463 0.2748 0.25 7egp:A, 6iy2:O, 6iy3:O, 6uxv:A, 5x0x:O, 5x0y:O, 5z3l:O, 5z3o:O, 5z3u:O, 5z3v:O
89 3rc8:A 610 128 0.0694 0.0508 0.2422 0.28 3rc3:A
90 8g7t:A 647 111 0.0515 0.0355 0.2072 0.29 4ay2:A, 4bpb:A, 8dvr:A, 8g7u:A, 8g7u:C, 8g7v:A, 8g7v:C, 8scz:A, 8sd0:A, 7tnx:A, 7to1:A, 2ykg:A, 3zd6:A
91 3tbk:A 524 109 0.0537 0.0458 0.2202 0.32
92 3tbk:A 524 43 0.0336 0.0286 0.3488 2.8
93 6o8h:A 571 79 0.0515 0.0403 0.2911 0.32 6o8g:B, 6o8g:C
94 5jb2:A 670 45 0.0358 0.0239 0.3556 0.38 5jaj:A, 5jbg:A
95 5jbj:A 627 45 0.0358 0.0255 0.3556 0.41
96 2zja:A 700 164 0.0828 0.0529 0.2256 0.48 2zj5:A
97 8dfv:A 1664 59 0.0380 0.0102 0.2881 0.53
98 8dg5:A 1635 59 0.0380 0.0104 0.2881 0.55 8dg7:A
99 5lst:A 617 51 0.0425 0.0308 0.3725 0.60
100 5lst:A 617 79 0.0470 0.0340 0.2658 1.6
101 4a36:A 523 110 0.0537 0.0459 0.2182 0.85 4a36:B
102 6qv4:A 1666 92 0.0582 0.0156 0.2826 0.89 6qv3:A
103 6ut6:D 292 56 0.0492 0.0753 0.3929 1.0 6hz4:A, 6hz4:B, 6hz4:C, 6hz4:D, 6hz4:E, 6hz4:F, 6hz5:A, 6hz5:B, 6hz5:C, 6hz5:D, 6hz5:E, 6hz5:F, 6hz5:G, 6hz5:H, 6hz5:I, 6hz5:J, 6hz5:K, 6hz5:L, 6hz6:A, 6hz6:B, 6hz6:C, 6hz6:D, 6hz6:E, 6hz6:F, 6hz6:G, 6hz6:H, 6hz6:I, 6hz6:J, 6hz6:K, 6hz6:L, 6hz7:A, 6hz7:B, 6hz7:C, 6hz7:D, 6hz7:E, 6hz7:F, 6hz7:G, 6hz7:H, 6hz7:I, 6hz7:J, 6hz7:K, 6hz7:L, 6hz8:A, 6hz8:B, 6hz8:C, 6hz8:D, 6hz8:E, 6hz8:F, 6hz8:G, 6hz8:H, 6hz8:I, 6hz8:J, 6hz8:K, 6hz8:L, 6hz9:A, 6hz9:B, 6hz9:C, 6hz9:D, 6hz9:E, 6hz9:F, 6hz9:G, 6hz9:H, 6hz9:I, 6hz9:J, 6hz9:K, 6hz9:L, 6ut6:A, 6ut6:B, 6ut6:C, 6ut6:E, 6ut6:F, 7vsr:A, 7vsr:B, 7vsr:C, 7vsr:D, 7vsr:G, 7vsr:H, 7vsr:I
104 7ase:f 1523 79 0.0470 0.0138 0.2658 1.1 7ask:F
105 8cx1:A 381 122 0.0694 0.0814 0.2541 1.1 8cx0:A, 8cx1:F, 8cx2:A, 8cx2:F, 3e1u:A, 3iqs:A, 3ir2:A, 3ir2:B, 2jyw:A, 6k3j:A, 6k3k:A, 2kbo:A, 2kem:A, 4rov:A, 4rov:B, 4row:A, 3v4j:A, 3v4j:B, 3v4k:A, 3v4k:B
106 3zd7:A 623 119 0.0582 0.0417 0.2185 1.3 8g7t:C
107 8t5s:A 693 26 0.0268 0.0173 0.4615 1.4
108 8kcc:K 508 103 0.0515 0.0453 0.2233 3.8 8j90:K, 8kcb:K, 8wh5:K, 8wh8:K, 8wh9:K, 8wha:K, 8wha:L
109 7ux9:P 468 103 0.0515 0.0491 0.2233 4.8
110 7rxb:A 548 54 0.0403 0.0328 0.3333 5.4 7rxb:B
111 3din:A 816 107 0.0537 0.0294 0.2243 6.9 3din:B, 3jux:A, 4ys0:A
112 6jua:A 533 103 0.0582 0.0488 0.2524 7.1 6jub:A, 6jud:A
113 2xzl:A 756 67 0.0425 0.0251 0.2836 7.7
114 7zpq:CA 1742 48 0.0336 0.0086 0.3125 8.3 7zrs:CA, 7zuw:CA

[Back]

Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).
  • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218