BioLiP

>protein
SNPYERGPAPTESSVTAVRGYFDTDTDTVSSLVSGFGGGTIYYPTDTSEGTFGGVVIAPGYTASQSSMAWMGHRIASQGF
VVFTIDTITRYDQPDSRGRQIEAALDYLVEDSDVADRVDGNRLAVMGHCMGGGGTLAAAENRPELRAAIPLTPWHLQKNW
SDVEVPTMIIGAENDTVASVRTHSIPFYESLDEDLERAYLELDGASHFAPNISNTVIAKYSISWLKRFVDEDERYEQFLC
PPPDTGLFSDFSDYRDSCPHTT

The query sequence (length=262) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	8xho:A	262	262	1.0000	1.0000	1.0000	0.0	8xho:B
2	8a2c:A	268	260	0.6832	0.6679	0.6885	2.16e-132	8a2c:B
3	5zrq:A	263	261	0.6641	0.6616	0.6667	1.80e-126	7cef:A, 7cef:B, 7ceh:A, 7cts:A, 8ibl:A, 8ibl:B, 8ibm:A, 8ibm:B, 4wfj:A, 4wfk:A, 5zno:A, 5zno:B, 5zrr:A, 5zrs:A
4	7qjt:A	267	261	0.6336	0.6217	0.6360	5.24e-121
5	7yko:A	259	261	0.6221	0.6293	0.6245	1.29e-119
6	6aid:A	261	262	0.6221	0.6245	0.6221	8.98e-119	3wyn:A, 3wyn:B
7	5lui:A	264	262	0.6069	0.6023	0.6069	1.66e-117	5luk:A, 5lul:A, 7xtt:B, 7xtv:A, 7xtv:B
8	8bra:B	259	262	0.6450	0.6525	0.6450	5.46e-109	8brb:A, 8brb:B, 7w6c:A, 7w6c:B, 7w6o:A, 7w6o:B, 7w6q:B
9	7vvc:B	263	261	0.5573	0.5551	0.5594	6.78e-95	8jmo:A, 8jmo:B, 8jmp:A, 8qrj:A, 7vvc:A, 7vve:A, 7vve:B, 7w45:A, 7w45:B
10	7vmd:A	266	267	0.4580	0.4511	0.4494	9.15e-75	7vme:A
11	7vpb:A	270	271	0.4618	0.4481	0.4465	2.28e-72	7vpb:B
12	8ian:A	270	270	0.4351	0.4222	0.4222	3.16e-69	8ian:B
13	8d1d:A	262	256	0.4542	0.4542	0.4648	9.19e-68	8d1d:C, 8h5m:A, 5xh2:A, 5xh3:A, 7xtw:A
14	3f98:A	377	113	0.0992	0.0690	0.2301	4.48e-04	3f97:A, 3f97:B, 3f98:B, 3f98:C, 3f9c:A, 3f9c:B, 5i8p:A, 5i8p:B, 5i9i:A, 5i9i:B, 5jad:A, 5jah:A, 5jal:A, 5jan:A, 5jao:A, 5jap:A, 5jar:A, 5jas:A, 5jat:A, 5jau:A, 5lp1:A, 5lyy:A, 5lz2:A, 5lz4:A, 5lz5:A, 5lz7:A, 5lz8:A, 5lz9:A, 6m06:A, 6m06:B, 6m07:A, 6m07:B, 6m08:B, 5ye7:B, 5ye7:A, 5ye8:B, 5ye8:A, 5ye9:A, 5ye9:B, 5yea:A, 5yea:B
15	3fcy:A	317	37	0.0573	0.0473	0.4054	0.37	3fcy:C
16	5zm3:B	286	61	0.0763	0.0699	0.3279	0.52	7wpy:A, 7wpy:B, 7wpy:C, 7wpy:D, 5zm3:A, 5zm3:C, 5zm3:D, 5zm4:A, 5zm4:B, 5zm4:C, 5zm4:D
17	3fcx:B	275	125	0.1107	0.1055	0.2320	0.74	3fcx:A
18	3e4d:A	278	28	0.0458	0.0432	0.4286	1.6	3e4d:B, 3e4d:C, 3e4d:E, 3e4d:D, 3e4d:F
19	7amv:W	637	36	0.0573	0.0235	0.4167	1.7
20	8a9k:A	998	124	0.1183	0.0311	0.2500	2.0
21	6vhd:A	255	65	0.0763	0.0784	0.3077	2.2	7l0a:A, 7l0a:B, 6vhd:B, 6vhd:C, 6vhd:D, 6vhe:A, 6vhe:B, 6vhe:C, 6vhe:D, 6wcx:A, 6wcx:B, 6wcx:C, 6wcx:D
22	4q1v:A	707	79	0.0916	0.0339	0.3038	2.7	4q1v:B
23	6qe2:A	257	93	0.0916	0.0934	0.2581	3.2	6qe2:B
24	7pog:A	2382	79	0.0725	0.0080	0.2405	3.4	4dmw:A, 3ho6:A, 3ho6:B, 4r04:A, 3srz:A, 3ss1:A, 7u2p:A, 7uby:B, 7uby:A, 5uqk:A, 5uql:A
25	2cjp:B	319	88	0.0992	0.0815	0.2955	3.7
26	2bkl:B	677	60	0.0763	0.0295	0.3333	4.0	2bkl:A
27	7xrt:A	268	37	0.0573	0.0560	0.4054	4.1	7xrt:B, 7xrt:C, 7xrt:D, 7xrt:E, 7xrt:F, 7xrt:G, 7xrt:H, 7xrt:I, 7xrt:J, 7xrv:A, 7xrv:B, 7xrv:D, 7xrv:E, 7xrv:F, 7xrv:G, 7xrv:H, 7xrv:I, 7xrv:J
28	4pht:Y	226	47	0.0611	0.0708	0.3404	4.2	4pht:X, 4pht:Z
29	3m07:A	584	150	0.1260	0.0565	0.2200	4.3
30	4r24:B	85	57	0.0687	0.2118	0.3158	4.9	4r22:B
31	1ss9:A	280	38	0.0534	0.0500	0.3684	5.1	1g9r:A, 1ga8:A
32	3dlt:A	239	110	0.1031	0.1130	0.2455	5.7
33	5t62:W	306	39	0.0496	0.0425	0.3333	7.7

[Back]