BioLiP

>protein
SNLEERLRACMQKLACGKLTGISDPVTVKTSGSRFGSWMTDPLAPEGDNRVWYMDGYHNNRFVREYKSMVDFMNTDNFTS
HRLPHPWSGTGQVVYNGSIYFNKFQSHIIIRFDLKTETILKTRSLDYAGYNNMYHYAWGGHSDIDLMVDENGLWAVYATN
QNAGNIVISKLDPVSLQILQTWNTSYPKRSAGEAFIICGTLYVTNGYSGGTKVHYAYQTNASTYEYIDIPFQNKYSHISM
LDYNPKDRALYAWNNGHQTLYNVTLF

The query sequence (length=266) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6qm3:A	268	266	1.0000	0.9925	1.0000	0.0	6qhj:A, 6qm3:B, 4xat:A
2	6ou1:A	260	258	0.4549	0.4654	0.4690	3.50e-81	8frr:A, 6ou1:B, 7sib:A, 7sij:A, 7sjt:A, 7sju:A, 7sjv:A, 7sjw:A, 7skd:A, 7ske:A, 7skf:A, 7skg:A, 7t8d:A, 4wxq:A, 4wxs:A, 4wxu:A
3	6nax:A	259	258	0.3872	0.3977	0.3992	5.52e-67	6nax:B
4	5ftt:G	368	258	0.4060	0.2935	0.4186	7.13e-64	5afb:A, 5cmn:E, 5cmn:F, 5cmn:G, 5cmn:H, 5ftt:C, 5ftt:D, 5ftt:H, 5ftu:C, 5ftu:D, 5ftu:G, 5ftu:H, 5ftu:K, 5ftu:L, 4rmk:A, 4rml:A, 4yeb:A
5	6ska:D	347	241	0.3647	0.2795	0.4025	1.23e-58	2jxa:A
6	6rkf:A	335	72	0.0902	0.0716	0.3333	0.43	6rkf:B, 6rkf:C, 6rkf:D, 6rkf:E, 6rkf:F
7	7naf:5	105	40	0.0414	0.1048	0.2750	1.7
8	7nac:5	141	40	0.0414	0.0780	0.2750	2.0	7nad:5
9	2wkp:A	320	62	0.0827	0.0688	0.3548	2.1	6agp:A, 7ajk:BBB, 6bc1:A, 6bc1:B, 2c2h:A, 2c2h:B, 1ds6:A, 1e96:A, 2fju:A, 2g0n:A, 2g0n:B, 1g4u:R, 4gzl:A, 4gzl:B, 4gzm:A, 4gzm:B, 2h7v:A, 2h7v:B, 1he1:C, 1he1:D, 1hh4:A, 1hh4:B, 1i4d:D, 1i4l:D, 1i4t:D, 2ic5:A, 2ic5:B, 1mh1:A, 5n6o:A, 5n6o:B, 5o33:A, 2ov2:A, 2ov2:F, 2ov2:B, 2ov2:C, 2ov2:G, 2ov2:D, 2ov2:E, 2ov2:H, 2p2l:A, 2p2l:B, 2p2l:C, 8q0n:C, 2qme:A, 5qqd:A, 5qqe:A, 5qqf:A, 5qqg:A, 5qqh:A, 5qqi:A, 5qqj:A, 5qqk:A, 5qql:A, 5qqm:A, 5qqn:A, 2rmk:A, 1ryf:A, 1ryf:B, 1ryh:A, 1ryh:B, 3ryt:C, 3sbd:A, 3sbd:B, 3sbe:A, 3su8:A, 3sua:A, 3sua:B, 3sua:C, 3th5:A, 3th5:B, 7usd:F, 7use:F, 7use:G, 2w2t:A, 2w2v:A, 2w2v:B, 2w2v:C, 2w2v:D, 2w2x:A, 2w2x:B, 8wej:E, 2wkq:A, 2wkr:A
10	6pre:A	386	68	0.0752	0.0518	0.2941	3.2	2i58:A, 2i58:B, 6pql:A, 6pql:B, 6pql:C, 6pql:D, 6pre:B, 6pre:C, 6pre:D, 6prg:A, 6prg:B
11	5umb:A	378	42	0.0602	0.0423	0.3810	6.2	8d1p:A, 8d1q:A, 8d1s:A, 8d1w:A, 8d1y:A, 8d20:A, 8d22:A, 8d24:A, 5umb:B, 5umb:C, 5umb:D
12	3ahv:A	472	62	0.0677	0.0381	0.2903	7.9	3aht:A, 3aht:B, 3ahv:B, 7bzm:A, 7bzm:B, 3f4v:A, 3f4v:B, 3f5j:A, 3f5j:B, 3f5k:A, 3f5k:B, 3f5l:A, 3f5l:B, 4qlj:A, 4qlj:B, 4qlk:A, 4qlk:B, 4qll:A, 4qll:B, 2rgl:A, 2rgl:B, 2rgm:A, 2rgm:B, 3scn:A, 3scn:B, 3sco:A, 3sco:B, 3scp:A, 3scp:B, 3scq:A, 3scq:B, 3scr:A, 3scr:B, 3scs:A, 3scs:B, 3sct:A, 3sct:B, 3scu:A, 3scu:B, 3scv:A, 3scv:B, 3scw:A, 3scw:B

[Back]