BioLiP

>protein
SNEFTYSYLFRMISHEMKQKADQKLEQFDITNEQGHTLGYLYAHQQDGLTQNDIAKALQRTGPTVSNLLRNLERKKLIYR
YVDAQDTRRKNIGLTTSGIKLVEAFTSIFDEMEQTLVSQLSEEENEQMKANLTKMLSSLQ

The query sequence (length=140) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5ffz:A	140	140	1.0000	1.0000	1.0000	6.49e-102	5fb2:A, 4lll:C, 4lll:D, 4lll:A, 4lll:B, 4lll:I, 4lll:J, 4lln:A, 4lln:B, 4lln:C, 4lln:D, 4lln:I, 4lln:J
2	2fbh:A	137	135	0.2429	0.2482	0.2519	8.43e-10
3	7dvr:A	147	117	0.1857	0.1769	0.2222	3.82e-06	7dvt:A, 7dvu:A, 7dvv:A, 7dvv:B
4	7el3:A	138	107	0.2143	0.2174	0.2804	0.010	7el3:B
5	7kfq:A	141	74	0.1429	0.1418	0.2703	0.011	7kfo:A, 7kh3:A, 7kig:A, 7kjq:A, 7kk0:A, 7kkc:A, 7kki:A
6	5aip:A	141	87	0.1857	0.1844	0.2989	0.023	5aip:B
7	6pcp:A	140	90	0.1714	0.1714	0.2667	0.030	6pcp:D, 6pcp:B, 6pcp:C, 6pcp:E, 6pcp:F
8	1c0w:D	175	70	0.1571	0.1257	0.3143	0.44
9	1c0w:B	219	70	0.1571	0.1005	0.3143	0.55	1bi0:A, 1bi3:A, 1bi3:B, 1c0w:A, 1c0w:C, 1ddn:A, 1ddn:B, 1ddn:C, 1ddn:D, 2dtr:A, 1f5t:A, 1f5t:B, 1f5t:C, 1f5t:D, 1fwz:A, 1g3w:A, 1g3y:A
10	5jlu:A	137	82	0.1714	0.1752	0.2927	0.60	5jls:A
11	7nsn:A	1371	47	0.1000	0.0102	0.2979	0.69	7nsn:B
12	7otm:A	3656	98	0.1857	0.0071	0.2653	2.5	7otp:A, 7otv:A, 7otw:A, 7oty:A
13	8ez9:L	3662	98	0.1857	0.0071	0.2653	2.5	8ez9:C
14	7sgl:A	3852	98	0.1857	0.0067	0.2653	2.6
15	7nfe:A	3585	98	0.1857	0.0073	0.2653	2.6
16	6zha:A	3707	98	0.1857	0.0070	0.2653	2.7	6zh8:A
17	8ezb:C	3724	98	0.1857	0.0070	0.2653	2.7	8ezb:L
18	6zhe:F	3731	98	0.1857	0.0070	0.2653	2.7
19	7k1n:A	3634	99	0.1857	0.0072	0.2626	2.7	7z88:A
20	8bot:A	3528	98	0.1857	0.0074	0.2653	2.7
21	7k17:B	3645	99	0.1857	0.0071	0.2626	2.7	7k17:A
22	6zhe:A	3768	98	0.1857	0.0069	0.2653	2.7
23	7k1j:A	3584	99	0.1857	0.0073	0.2626	2.7	7k19:A
24	8eza:L	3720	98	0.1857	0.0070	0.2653	2.8	8eza:C, 7lt3:C, 7lt3:L
25	7k1k:A	3604	99	0.1857	0.0072	0.2626	2.8	7k1b:A
26	7z87:A	3689	98	0.1857	0.0070	0.2653	2.9
27	7su3:A	3802	98	0.1857	0.0068	0.2653	2.9
28	5y3r:C	3636	98	0.1857	0.0072	0.2653	2.9
29	7nfc:A	3562	98	0.1857	0.0073	0.2653	3.0	8bh3:S, 8bh3:A, 8bhv:A, 8bhv:F, 8bhy:A, 8bhy:S, 8bot:F, 8bot:S, 7nfc:F
30	7k0y:A	3669	99	0.1857	0.0071	0.2626	3.0
31	7sud:A	3740	99	0.1857	0.0070	0.2626	3.0
32	4em0:B	150	95	0.1786	0.1667	0.2632	3.5
33	3gzl:A	81	36	0.1000	0.1728	0.3889	3.9	2fq0:A, 2fq2:A, 3gzm:B
34	1fx7:A	230	40	0.1000	0.0609	0.3500	4.9	1b1b:A, 1fx7:B, 1fx7:C, 1fx7:D, 2isz:A, 2isz:B, 2isz:C, 2isz:D, 2it0:A, 2it0:B, 2it0:C, 2it0:D, 1u8r:A, 1u8r:B, 1u8r:C, 1u8r:D, 1u8r:G, 1u8r:H, 1u8r:I, 1u8r:J
35	6ztb:I	217	60	0.1143	0.0737	0.2667	6.2	7cme:A, 7cme:B, 7cmf:A, 8hyi:A, 8hyi:B, 5jym:A, 5jym:C, 4oy9:A, 4zml:A, 4zmn:A, 4zmo:A, 4zmp:A, 4zmq:A, 4zmq:B, 4zmt:A, 4zmt:B, 4zmt:C, 4zmt:D, 4zmt:E, 4zmv:A, 4zmv:B, 4zmw:A, 4zmw:B, 4zmx:A, 4zmx:B, 4zmy:A, 4zmz:A, 6ztr:I, 6ztr:J
36	5x4z:N	1074	34	0.1000	0.0130	0.4118	6.2	5x4z:B, 5x51:B, 5x51:N
37	7b20:B	228	40	0.0929	0.0570	0.3250	8.4	7b1v:A, 7b1v:B, 7b1y:A, 7b1y:B, 7b1y:C, 7b1y:D, 7b1y:dd, 7b1y:aa, 7b20:A, 7b20:C, 7b20:D, 7b20:dd, 7b20:aa, 7b23:A, 7b23:B, 7b23:C, 7b23:D, 7b23:dd, 7b23:aa, 7b24:A, 7b24:B, 7b24:C, 7b24:D, 7b24:dd, 7b24:aa, 7b25:A, 7b25:B, 7b25:C, 7b25:D, 7b25:dd, 7b25:aa
38	6gbe:A	119	22	0.0857	0.1008	0.5455	9.0
39	1y79:1	680	26	0.0786	0.0162	0.4231	9.3

[Back]