BioLiP

>protein
SNAMSKPIVLSGVQPSGELSIGNYLGALRQWQQMQDDYDCQYCVVDLHAITVRQDPQALHEATLDALAICLAVGVDPKKS
TLFVQSHVPEHAQLGWVLNCYTQMGELSRMTQFKDKSARYANDVNAGLFGYPVLMAADILLYGAHQVPVGSDQKQHLELA
RDIATRFNNIYSPEQPIFTIPEPYIPTVNARVMSLQDATKKMSKSDDNRKNVITLLEDPKSIIKKINKAQTDAETPPRIA
YDVENKAGIANLMGLYSAATGKTFAEIEAQYAGVEMYGPFKKDVGEAVVAMLEPVQAEYQRIRNDREYLNSVMRDGAEKA
SAKALQTLKKVYAAVGFVARP

The query sequence (length=341) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	3sz3:A	341	341	1.0000	1.0000	1.0000	0.0
2	8i1w:B	333	336	0.6598	0.6757	0.6696	2.12e-169	8i1y:A, 8i1y:B, 8i1z:A, 8i1z:B, 8i27:A, 8i27:B, 8i2a:B, 8i2a:A, 8i2c:A, 8i2c:B, 8i2j:A, 8i2j:B, 8i2l:B, 8i2l:A, 8i2m:A, 8i2m:B, 8i4i:A, 8i4i:B, 5v0i:A, 5v0i:B
3	6dfu:A	332	334	0.6393	0.6566	0.6527	1.24e-162	6dfu:B
4	7cms:A	328	332	0.5073	0.5274	0.5211	2.78e-113	7cki:A, 7cms:B, 5dk4:A, 7eer:A, 7eer:B, 7eer:C, 7eer:D, 1i6k:A, 1i6l:A, 1i6m:A, 1m83:A, 1mau:A, 1maw:A, 1maw:B, 1maw:C, 1maw:D, 1maw:E, 1maw:F, 1mb2:A, 1mb2:B, 1mb2:C, 1mb2:D, 1mb2:E, 1mb2:F, 2ov4:A
5	7elt:A	330	332	0.4692	0.4848	0.4819	6.75e-102	7ens:A, 7ent:A, 7ev2:A, 7ev3:A
6	3fi0:G	302	329	0.4545	0.5132	0.4711	4.08e-97	3fhj:A, 3fhj:B, 3fhj:E, 3fhj:F, 3fi0:A, 3fi0:B, 3fi0:C, 3fi0:D, 3fi0:E, 3fi0:F, 3fi0:H, 3fi0:I, 3fi0:J, 3fi0:K, 3fi0:L, 3fi0:M, 3fi0:N, 3fi0:O, 3fi0:P, 3fi0:Q, 3fi0:R
7	3fhj:D	286	329	0.4487	0.5350	0.4650	1.68e-95	3fhj:C
8	5ekd:A	327	334	0.3900	0.4067	0.3982	2.86e-86	5ekd:B
9	2yy5:B	346	344	0.3783	0.3728	0.3750	8.99e-64	2yy5:A, 2yy5:C, 2yy5:D
10	3tzl:B	320	329	0.3636	0.3875	0.3769	2.54e-60	3tzl:A
11	5tew:A	333	334	0.3343	0.3423	0.3413	1.31e-45
12	2g36:A	322	351	0.3314	0.3509	0.3219	2.68e-44
13	6ncr:A	342	350	0.3196	0.3187	0.3114	1.31e-43	6ncr:B
14	2a4m:C	331	343	0.3196	0.3293	0.3178	4.60e-30	1yi8:C, 1yia:B, 1yid:B
15	3a04:A	367	235	0.1789	0.1662	0.2596	1.01e-08	3a05:A
16	7sc6:A	349	269	0.1965	0.1920	0.2491	4.29e-05	7scq:A, 7scq:B
17	2cyb:A	319	228	0.1496	0.1599	0.2237	6.52e-05	2cyb:B
18	3kt8:D	410	83	0.0821	0.0683	0.3373	0.029	3kt0:A, 3kt3:A, 3kt3:B, 3kt3:C, 3kt3:D, 3kt6:A, 3kt6:B, 3kt6:C, 3kt6:D, 3kt8:A, 3kt8:B, 3kt8:C
19	8eew:A	766	96	0.0733	0.0326	0.2604	0.038	8eew:B, 8eff:A, 8eff:B, 8eff:C, 8eff:D, 8efr:A, 8efr:B, 8efr:C, 8efr:K, 8efr:D, 8efr:L, 8efr:E, 8efr:M, 8efr:F, 8efr:N, 8efr:G, 8efr:O, 8efr:H, 8efr:P, 8efr:I, 8efr:Q, 8efr:J, 8efr:R, 6jtg:A
20	4j75:A	374	82	0.0792	0.0722	0.3293	0.054	4j75:B, 4jfa:A, 4jfa:B, 4jfa:D
21	7ror:B	362	201	0.1320	0.1243	0.2239	0.15	7ror:A, 7ros:A, 7ros:B, 7rot:A, 7rot:B, 3vgj:A, 3vgj:B
22	6vz0:A	74	57	0.0557	0.2568	0.3333	0.16
23	5ujj:A	446	166	0.1232	0.0942	0.2530	0.41	2ake:A, 2azx:A, 2azx:B, 2dr2:A, 2quh:A, 2quh:B, 2qui:A, 2qui:B, 2quj:A, 2quj:B, 1r6t:A, 1r6u:A, 5ujj:B
24	2hke:A	377	81	0.0645	0.0584	0.2716	0.46	2hke:B
25	2cyc:A	371	346	0.1965	0.1806	0.1936	0.76	2cyc:B
26	5usf:A	682	162	0.1114	0.0557	0.2346	0.80	3p0h:A, 3p0i:A, 3p0j:C, 3p0j:D, 5usf:B
27	6i0x:B	422	108	0.0850	0.0687	0.2685	1.3	5ak7:A, 5ak8:A, 6i0x:A, 4ytb:A, 4ytg:A
28	3p0j:A	657	264	0.1701	0.0883	0.2197	1.4	3p0h:B, 3p0i:B, 3p0j:B
29	3jxe:B	363	233	0.1408	0.1322	0.2060	4.4	3jxe:A
30	2j5b:A	321	181	0.1290	0.1371	0.2431	7.1	2j5b:B
31	4jfa:C	348	95	0.0704	0.0690	0.2526	7.8
32	6lh4:A	235	53	0.0440	0.0638	0.2830	8.4	6lh4:B, 6lh4:C, 6lh4:D

[Back]