BioLiP

>protein
SNAMEALKRKIEEEGVVLSDQVLKVDSFLNHQIDPLLMQRIGDEFASRFAKDGITKIVTIESSGIAPAVMTGLKLGVPVV
FARKHKSLTLTDNLLTASVYSFTKQTESQIAVSGTHLSDQDHVLIIDDFLANGQAAHGLVSIVKQAGASIAGIGIVIEKS
FQPGRDELVKLGYRVESLARIQSLEEGKVSFVQ

The query sequence (length=193) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	6w1i:B	194	192	0.9948	0.9897	1.0000	1.39e-138	2fxv:A, 2fxv:B, 6w1i:A, 6w1i:C, 6w1i:D, 1y0b:A, 1y0b:B, 1y0b:C, 1y0b:D
2	7rmw:A	270	124	0.1865	0.1333	0.2903	1.25e-12	1p4a:A, 1p4a:B, 1p4a:C, 1p4a:D, 7rmw:B, 7rmw:C, 7rmw:F
3	4m0k:C	176	174	0.2539	0.2784	0.2816	1.34e-06	4m0k:A, 4m0k:B, 4m0k:D
4	5vn4:A	237	138	0.1969	0.1603	0.2754	7.70e-06	5vn4:B
5	8izj:B	183	115	0.1658	0.1749	0.2783	8.26e-06	8izj:A, 7y94:A, 7y94:B
6	5yw5:A	178	150	0.2124	0.2303	0.2733	5.86e-05	5yw5:B, 5yw5:C, 5yw5:D
7	5znq:A	183	137	0.1710	0.1803	0.2409	2.28e-04	5b6h:A, 5y07:A, 5y07:B, 5zc7:A, 5zc7:B, 5zmi:A, 5znq:B, 5zoc:A
8	1l1q:A	181	148	0.1969	0.2099	0.2568	0.007	1l1r:A
9	5vjp:B	179	162	0.2228	0.2402	0.2654	0.041	1g2p:A, 5vjn:A, 5vjn:B, 5vjp:A
10	1mzv:A	216	121	0.1503	0.1343	0.2397	0.14
11	1lh0:A	213	71	0.0933	0.0845	0.2535	0.81	1lh0:B, 1opr:A, 1oro:A, 1sto:A
12	4v6u:BC	365	61	0.0829	0.0438	0.2623	1.6
13	4v4n:AC	342	61	0.0829	0.0468	0.2623	1.9
14	4rv4:B	211	64	0.0777	0.0711	0.2344	2.1	4rv4:A, 4rv4:C
15	3rkr:A	221	85	0.1451	0.1267	0.3294	2.6	3rkr:B
16	1gxz:A	223	51	0.0881	0.0762	0.3333	2.8	1gxz:B, 1og1:A, 1og3:A, 1og4:A
17	7mex:A	1737	93	0.1347	0.0150	0.2796	3.5	6kgi:B, 7mey:A, 3nih:A, 3nii:A, 3nij:A, 3nik:B, 3nik:D, 3nik:A, 3nik:F, 3nil:D, 3nil:A, 3nil:B, 3nil:F, 3nim:B, 3nim:F, 3nim:A, 3nim:D, 3nin:A, 3nin:B, 3nis:A, 3nis:B, 3nis:D, 3nis:F, 3nit:A
18	8emh:B	676	43	0.0777	0.0222	0.3488	4.4	8emh:A, 8emh:C, 8emh:F, 8emh:H, 8emh:I, 8emh:J, 8emh:K
19	7s05:B	437	43	0.0725	0.0320	0.3256	5.6	7s05:A
20	8g9s:A	70	24	0.0725	0.2000	0.5833	5.7
21	4omb:A	298	44	0.0777	0.0503	0.3409	6.0	4omb:B, 4omb:C, 4omb:D
22	7s6n:B	446	28	0.0622	0.0269	0.4286	6.6	7s6n:A, 7sj2:A, 7sj2:B
23	3djj:A	462	96	0.1451	0.0606	0.2917	7.3	2aaq:A, 1bwc:A, 3djg:X, 3dk4:A, 3dk8:A, 3dk9:A, 1dnc:A, 2gh5:A, 2gh5:B, 1gra:A, 1grb:A, 1gre:A, 1grf:A, 1grg:A, 1grh:A, 1grt:A, 2grt:A, 3grs:A, 3grt:A, 4gr1:A, 4grt:A, 5grt:A, 1gsn:A, 1k4q:A, 3sqp:A, 3sqp:B, 1xan:A
24	6fci:A	179	120	0.1399	0.1508	0.2250	8.9	6fch:A, 6fch:B, 6fci:D, 6fci:B, 6fci:C, 6fcl:A, 6fcl:B, 6fd4:B, 6fd4:A, 6fd5:A, 6fd5:B, 6fd6:A, 6fd6:B, 6hgp:A, 6hgq:A, 6hgq:C, 6hgq:D, 6hgq:B, 6hgr:A, 6hgr:B, 6hgs:A, 6hgs:B, 1ore:A, 4x44:A, 4x45:B, 1zn7:A, 1zn7:B, 1zn8:A, 1zn8:B, 1zn9:B
25	3vat:A	458	44	0.0933	0.0393	0.4091	9.1	4dyo:A

[Back]