BioLiP

>protein
SMWELTILHTNDVHSRLEQTSEDSSKCVDASRCMGGVARLFTKVQQIRRAEPNVLLLDAGDQYQGTIWFTVYKGAEVAHF
MNALRYDAMALGNHEFDNGVEGLIEPLLKEAKFPILSANIKAKASQISGLYLPYKVLPVGDEVVGIVGYTSKETPFLSNP
GTNLVFEDEITALQPEVDKLKTLNVNKIIALGHSGFEMDKLIAQKVRGVDVVVGGHSNTFLYTGNPPSKEVPAGKYPFIV
TSDDGRKVPVVQAYAFGKYLGYLKIEFDERGNVISSHGNPILLNSSIPEDPSIKADINKWRIKLDDYSTQELGKTIVYLD
GSSQSCRFRECNMGNLICDAMINNNLEMFWNHVSMCILNGGGIRSPIDERNDGTITWENLAAVLPFGGTFDLVQLKGSTL
KKAFEHSVHRYGQSTGEFLQVGGIHVVYDLSRKPGDRVVKLDVLCTKCRVPSYDPLKMDEVYKVILPNFLANGGDGFQMI
KDELLRHDSGDQDINVVSTYISKMKVIYPAVEGRIKFS

The query sequence (length=518) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	7jv8:C	529	525	1.0000	0.9792	0.9867	0.0	7bbj:A, 7bbj:B, 4h1s:A, 4h1s:B, 4h1y:P, 4h2b:A, 4h2f:A, 4h2g:A, 4h2i:A, 6hxw:A, 6hxw:B, 7jv8:A, 7jv8:B, 7jv8:D, 7jv9:A, 7jv9:B, 7p9n:A, 7p9r:A, 7p9t:A, 7pa4:A, 7pb5:A, 7pba:A, 7pbb:A, 7pby:A, 7pcp:A, 7pd9:A, 7qga:A, 7qgl:A, 7qgm:A, 7qgo:A, 6s7f:A, 6s7h:A, 6tve:P, 6tvg:A, 6tvx:A, 6tw0:A, 6twa:A, 6twf:A, 6vc9:A, 6xue:A, 6xue:B, 6xug:A, 6xug:B, 6xuq:A, 6ye1:A, 6ye1:B, 6ye2:A, 6ye2:B, 6z9b:A, 6z9d:A
2	5h7w:B	529	524	0.6892	0.6749	0.6813	0.0	7d0v:A, 7d0v:B, 5h7w:A
3	2z1a:A	507	518	0.3900	0.3984	0.3900	4.94e-105
4	3ztv:A	565	527	0.3069	0.2814	0.3017	5.36e-50	3zu0:A
5	3zu0:B	505	500	0.2876	0.2950	0.2980	3.51e-47
6	3ivd:A	499	508	0.2568	0.2665	0.2618	6.47e-35	3ivd:B, 3ive:A
7	1ho5:A	525	538	0.2645	0.2610	0.2546	8.75e-30	1ho5:B, 1hp1:A, 1hpu:A, 1hpu:B, 1hpu:C, 1hpu:D, 1oi8:A, 1oi8:B, 1ush:A, 2ush:A, 2ush:B, 4wwl:A
8	3gve:A	334	326	0.1815	0.2814	0.2883	7.30e-25	3gve:B
9	4q7f:A	510	476	0.2008	0.2039	0.2185	8.62e-15	3qfk:A
10	3jyf:A	336	294	0.1371	0.2113	0.2415	9.62e-11	3jyf:B
11	5eqv:A	336	287	0.1467	0.2262	0.2648	1.96e-10
12	4uwq:A	548	203	0.1042	0.0985	0.2660	2.50e-09	4uwq:D, 4uwq:G, 4uwq:J, 2wdc:A, 2wdd:A, 2wde:A, 2wdf:A
13	6g90:T	462	81	0.0347	0.0390	0.2222	1.1	7dco:u, 4dgw:A, 5nrl:T, 5zwm:u
14	5cot:A	340	87	0.0521	0.0794	0.3103	1.3	5cou:A, 6vt1:A, 6vt1:B, 6vt1:C, 6vt1:D, 6vt6:A, 6vt8:A, 6vt9:A, 6vtb:A, 6vtd:A, 6vte:A, 6vtf:A, 6vtf:B, 6vtf:C, 6vtf:D
15	6tj7:A	134	20	0.0212	0.0821	0.5500	5.0
16	6clx:B	342	96	0.0502	0.0760	0.2708	5.8	6clx:A
17	8aaf:a	848	45	0.0212	0.0130	0.2444	7.0	8agt:a, 8agu:a, 8agv:a, 8agw:a, 8agx:a, 8agz:a
18	7eap:A	755	67	0.0367	0.0252	0.2836	8.3	5yot:A, 5yot:B, 5yqs:A, 5yqs:B
19	7nhk:H	207	46	0.0290	0.0725	0.3261	9.5	6o8w:D, 6o8x:D, 6o8y:D, 6o8z:D, 6o90:D, 7p7q:H, 7p7r:H, 7p7s:H, 7p7t:H, 7p7u:H, 6w6p:D, 6wu9:D

[Back]