BioLiP

>protein
SMRVLLAPMEGVLDSLVRELLTEVNDYDLCITEFVRVVDQLLPVKVFHRICPELQNASRTPSGTLVRVQLLGQFPQWLAE
NAARAVELGSWGVDLNCGAPSGSGGGATLLKDPELIYQGAKAMREAVPAHLPVSVKVRLGWDSGEKKFEIADAVQQAGAT
ELVVHGRTKEQGYRAEHIDWQAIGDIRQRLNIPVIANGEIWDWQSAQQCMAISGCDAVMIGRGALNIPNLSRVVKYNEPR
MPWPEVVALLQKYTRLEKQGDTGLYHVARIKQWLSYLRKEYDEATELFQHVRVLNNSPDIARAIQAIDI

The query sequence (length=309) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4bf9:A	318	313	0.9968	0.9686	0.9840	0.0	4bfa:A, 4bfa:B, 4yco:A, 4yco:B, 4yco:C, 4ycp:A
2	3w9z:A	290	308	0.9288	0.9897	0.9318	0.0
3	1vhn:A	305	249	0.2492	0.2525	0.3092	2.85e-24
4	6ei9:A	306	319	0.2848	0.2876	0.2759	2.04e-22	6ei9:B
5	4xp7:A	324	263	0.2362	0.2253	0.2776	1.13e-12	6eza:A, 6eza:B, 6ezb:A, 6ezc:A, 4wfs:A
6	3b0v:C	315	185	0.1877	0.1841	0.3135	4.92e-10	3b0p:A, 3b0p:B, 3b0u:X, 3b0u:Y, 3b0v:D
7	3r11:B	364	140	0.1003	0.0852	0.2214	0.087	3r0u:A, 3r10:A, 3r11:A, 3r1z:A, 3r1z:B
8	1ep3:A	311	155	0.1230	0.1222	0.2452	0.25	1ep1:A, 1ep2:A, 5ksw:A, 5ksw:C, 5ue9:A, 5ue9:C
9	3iiv:B	262	45	0.0421	0.0496	0.2889	0.28	7ac8:A, 7ac8:C, 7ac8:E, 6ct3:A, 5d2t:A, 5d2w:A, 6dc1:A, 6dc1:B, 6dc1:H, 6dc1:K, 6dkv:A, 6dnj:A, 1gpw:C, 1gpw:E, 6rtz:A, 6ru0:A, 6ru0:C, 6ru0:E, 2wjz:A, 2wjz:C
10	3q45:A	368	186	0.1359	0.1141	0.2258	0.28	3q45:B, 3q45:C, 3q45:D, 3q45:E, 3q45:F, 3q45:G, 3q45:H, 3q45:I, 3q4d:A, 3q4d:B, 3q4d:C, 3q4d:D, 3q4d:E, 3q4d:F, 3q4d:G, 3q4d:H, 3q4d:I
11	7l00:C	315	72	0.0712	0.0698	0.3056	0.44	7l00:A, 7l00:B, 7l00:D
12	8pun:A	356	58	0.0615	0.0534	0.3276	0.46	8pun:B, 8pun:C, 8pun:D
13	6nke:A	249	58	0.0518	0.0643	0.2759	0.66
14	8e73:G2	258	82	0.0744	0.0891	0.2805	0.78	6x89:G2
15	8a22:At	253	66	0.0615	0.0751	0.2879	0.80	8apn:At, 8apo:At
16	5k2z:B	278	92	0.0971	0.1079	0.3261	1.4	5k2z:A, 5k2z:C, 5k2z:D, 5lnr:A, 5lnr:B, 5lnr:C, 5lnr:D, 5lns:A, 5lns:B, 5lns:C, 5lns:D, 5lnt:A, 5lnt:B, 5lnt:C, 5lnt:D, 5lnu:A, 5lnu:B, 5lnu:C, 5lnu:D, 5lnv:A, 5lnv:B, 5lnv:C, 5lnv:D, 5lnw:A, 5lnw:B, 5lnw:C, 5lnw:D, 7nhe:A, 7nhe:B, 7nhe:C, 7nhe:D
17	5gvh:A	311	55	0.0550	0.0547	0.3091	1.7
18	4mlz:A	299	73	0.0647	0.0669	0.2740	2.6	4mlz:B
19	1xmv:A	293	176	0.1392	0.1468	0.2443	2.8
20	8adj:A	515	46	0.0485	0.0291	0.3261	3.9	8adj:B, 8adj:C
21	3og2:A	986	125	0.1068	0.0335	0.2640	4.3	3ogr:A, 3ogs:A, 3ogv:A
22	7a8r:A	531	90	0.0647	0.0377	0.2222	4.6	7a8r:B, 6jtz:A, 6jtz:B, 4u7d:A, 4u7d:B, 4u7d:D, 4u7d:C, 2v1x:A, 2v1x:B, 2wwy:B, 2wwy:A, 8yrs:B, 8yrs:A
23	1s20:G	335	84	0.0583	0.0537	0.2143	5.3	1s20:A, 1s20:B, 1s20:C, 1s20:D, 1s20:E, 1s20:F, 1s20:H
24	4e4z:A	312	107	0.0874	0.0865	0.2523	5.5	6ala:A, 6ala:C, 6alv:A, 6amp:A, 6an3:A, 6ao6:A, 6ay0:A, 8dsj:A, 8dsj:K, 8dsl:A, 8dsl:B, 8dsn:A, 8dsn:K, 3mib:A, 3mic:A, 3mid:A, 3mie:A, 3mif:A, 3mig:A, 3mih:A, 3mlj:A, 3mlk:A, 3mll:A, 6nck:A, 1opm:A, 1phm:A, 3phm:A, 1sdw:A, 5wja:A, 5wja:D, 1yi9:A, 1yip:A, 1yjk:A
25	2zbk:B	506	50	0.0518	0.0316	0.3200	5.9	2hkj:A, 1mu5:A, 1mx0:A, 1mx0:B, 1mx0:C, 1mx0:D, 1mx0:E, 1mx0:F, 1z59:A, 1z5a:A, 1z5a:B, 1z5b:A, 1z5b:B, 1z5c:A, 1z5c:B, 2zbk:D, 2zbk:F, 2zbk:H
26	5ocs:A	369	135	0.1036	0.0867	0.2370	6.5	5ocs:C
27	2iop:A	618	94	0.0809	0.0405	0.2660	7.3	2iop:B, 2iop:C, 2iop:D, 2ior:A, 1y4s:A, 1y4s:B
28	8e5h:A	368	39	0.0421	0.0353	0.3333	8.3
29	6am0:A	260	73	0.0680	0.0808	0.2877	9.4	6am0:E, 5lop:A

[Back]