BioLiP

>protein
SMQFDIVTLFPDMFRALTDWGITSRAAKQERYGLRTWNPRDFTTDNYRTIDDRPYGGGPGMVMLARPLEDAINAAKAAQA
EQGIGGARVVMMSPQGATLNHDKVMRFAAEPGLILLCGRYEAIDQRLIDRVVDEEVSLGDFVLSGGELPAMALIDAVVRH
LPGVLNQDSFVDGLLDCPHYTRPEEYDGVRVPDVLLGGHHAEIEQWRRREALRNTWLKRPDLIVQARKNKLLSRADEAWL
ASLAKDASK

The query sequence (length=249) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	4h3z:B	256	255	1.0000	0.9727	0.9765	0.0	4h3y:A, 4h3y:B, 4h3z:A
2	7mys:A	239	238	0.5060	0.5272	0.5294	7.74e-91	7mys:B
3	8apw:A	250	239	0.5221	0.5200	0.5439	2.74e-88	8apt:A, 8apu:A, 8apv:A, 3axz:A, 5d9f:A, 4mcb:A, 4mcb:B, 4mcc:A, 4mcc:B, 4mcd:A, 1uak:A, 1ual:A, 1uam:A, 4ypw:A, 4ypx:A, 4ypy:A, 4ypz:A, 4yq0:A, 4yq1:A, 4yq2:A, 4yq3:A, 4yq4:A, 4yq5:A, 4yq6:A, 4yq7:A, 4yq8:A, 4yq9:A, 4yqa:A, 4yqb:A, 4yqc:A, 4yqd:A, 4yqg:A, 4yqi:A, 4yqj:A, 4yqk:A, 4yql:A, 4yqn:A, 4yqo:A, 4yqp:A, 4yqq:A, 4yqr:A, 4yqs:A, 4yqt:A, 4yvg:A, 4yvh:A, 4yvi:A, 4yvi:B, 4yvj:A, 4yvj:B, 4yvk:A, 4yvk:B
4	5wyr:B	248	240	0.5221	0.5242	0.5417	6.20e-85	6afk:A, 6afk:B, 6jki:A, 6jki:B, 6joe:A, 6joe:B, 5wyq:A, 5wyq:B, 5wyr:A, 5zhm:A, 5zhm:B, 5zhn:A, 5zhn:B
5	1p9p:A	235	222	0.5060	0.5362	0.5676	3.11e-82
6	8b1n:B	410	249	0.3855	0.2341	0.3855	3.09e-59
7	8b1n:A	433	253	0.3855	0.2217	0.3794	4.78e-59	8byh:A, 8byh:B, 8ri0:A, 8ri0:B
8	4ig6:A	223	228	0.3655	0.4081	0.3991	3.08e-54
9	7kff:A	249	256	0.3695	0.3695	0.3594	2.35e-51
10	6qrb:A	220	227	0.3373	0.3818	0.3700	1.69e-45	6nw6:A, 6nw6:B, 6nw7:A, 6nw7:B, 6qo2:A, 6qo2:B, 6qo3:A, 6qo3:B, 6qo4:A, 6qo4:B, 6qo6:A, 6qo6:B, 6qoa:A, 6qoa:B, 6qoc:A, 6qoc:B, 6qod:A, 6qod:B, 6qoe:B, 6qof:A, 6qof:B, 6qog:A, 6qoh:A, 6qoh:B, 6qoi:A, 6qoi:B, 6qoj:A, 6qoj:B, 6qok:A, 6qok:B, 6qol:A, 6qol:B, 6qom:A, 6qon:A, 6qon:B, 6qoo:A, 6qoo:B, 6qop:A, 6qop:B, 6qoq:A, 6qoq:B, 6qor:A, 6qor:B, 6qos:A, 6qos:B, 6qot:A, 6qot:B, 6qou:A, 6qou:B, 6qov:A, 6qov:B, 6qow:A, 6qow:B, 6qox:B, 6qqq:A, 6qqq:B, 6qqr:B, 6qqs:A, 6qqt:A, 6qqt:B, 6qqu:A, 6qqu:B, 6qqv:A, 6qqv:B, 6qqw:A, 6qqx:A, 6qqx:B, 6qqy:A, 6qqy:B, 6qqz:A, 6qr0:A, 6qr1:A, 6qr2:A, 6qr3:A, 6qr3:B, 6qr4:A, 6qr4:B, 6qr5:A, 6qr6:A, 6qr6:B, 6qr7:A, 6qr7:B, 6qr8:A, 6qr8:B, 6qr9:A, 6qr9:B, 6qra:A, 6qra:B, 6qrb:B, 6qrc:A, 6qrc:B, 6qrd:A, 6qrd:B, 6qre:A, 6qre:B, 6qrf:A, 6qrg:A, 6qrg:B, 7rez:A, 7rez:B, 7rf0:A, 7rf0:B
11	6w15:A	202	226	0.3534	0.4356	0.3894	2.95e-44
12	8fci:A	197	227	0.3574	0.4518	0.3921	1.27e-43	8fci:B
13	5zhk:A	208	225	0.3373	0.4038	0.3733	2.09e-42	6jof:A, 5zhj:A, 5zhl:A
14	6qqs:B	204	230	0.3414	0.4167	0.3696	2.01e-40	6qqw:B, 6qqz:B, 6qr0:B, 6qr1:B, 6qr2:B, 6qr5:B, 6qrf:B
15	8dfs:I	555	94	0.1084	0.0486	0.2872	3.8	8dej:J, 8dej:K, 8dex:I, 8dfa:I, 8dfa:J, 8dfo:I
16	6i97:A	763	61	0.0723	0.0236	0.2951	5.0	8b43:A, 6i96:A, 6i97:B, 6i98:A, 6z8a:A
17	6lsv:A	338	57	0.0643	0.0473	0.2807	7.0	6lsv:B
18	3jsz:A	520	60	0.0562	0.0269	0.2333	7.4	3jt1:A, 2wzg:A
19	7o5b:g	403	102	0.1044	0.0645	0.2549	7.6	7o9f:A, 7o9f:C, 7o9f:B, 4ue4:C

[Back]