BioLiP

>protein
SMLKKKQLTVLDLHPGAGKTRRVLPEIVREAIKTRLRTVILAPTRVVAAEMEEALRGLPVRYMTTSGTEIVDLMCHATFT
SRLLQPIRVPNYNLYIMDEAHFTDPSSIAARGYISTRVEMGEAAAIFMTATPPGTRDAFPDSNSPIMDTEVEVPERAWSS
GFDWVTDHSGKTVWFVPSVRNGNEIAACLTKAGKRVIQLSRKTFETEFQKTKHQEWDFVVTTDISEMGANFKADRVIDSR
RCLKPVILDGERVILAGPMPVTHASAAQRRGRIGRNPNKPGDEYLYGGGCAETDEDHAHWLEARMLLDNIYLQDGLIASL
YRPEADKVAAIEGEFKLRTEQRKTFVELMKRGDLPVWLAYQVASAGITYTDRRWCFDGTTNNTIMEDSVPAEVWTRHGEK
RVLKPRWMDARVCSDHAALKSFKEFAAGKR

The query sequence (length=430) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

#	Hit	Hit length	Aligned length	Identity (normalized by query)	Identity (normalized by hit)	Identity (normalized by aligned length)	E-value	Homologs to hit
1	5jrz:A	443	436	1.0000	0.9707	0.9862	0.0	6adx:A, 6ady:A, 7g9k:A, 7g9l:A, 7g9m:A, 7g9o:A, 7g9p:A, 7g9q:A, 7g9r:A, 7g9s:A, 7g9t:A, 7g9u:A, 7g9v:A, 7g9w:A, 7g9x:A, 7g9y:A, 7ga0:A, 7ga1:A, 7ga2:A, 7ga3:A, 7ga5:A, 7ga6:A, 7ga7:A, 5gjb:A, 5gjc:A, 5k8i:A, 5k8l:A, 5k8t:A, 5k8u:A, 5mfx:A, 5rhg:A, 5rhi:A, 5rhj:A, 5rhk:A, 5rhl:A, 5rhm:A, 5rho:A, 5rhp:A, 5rhq:A, 5rhr:A, 5rhs:A, 5rht:A, 5rhu:A, 5rhv:A, 5rhw:A, 5rhx:A, 6rwz:A, 6s0j:A, 8um3:A, 7v2z:A, 8v7r:A, 8v7u:A, 5y4z:A, 5y6m:A, 5y6n:A
2	8gzr:B	443	437	0.7326	0.7111	0.7208	0.0
3	2vbc:A	600	437	0.7233	0.5183	0.7117	0.0	2jlr:A, 2jls:A, 2jlu:A, 2jlu:B, 2jlv:A, 2jlv:B, 2jlw:A, 2jlw:B, 2jlx:A, 2jlx:B, 2jly:A, 2jly:B, 2jlz:A, 2jlz:B, 2whx:A, 2wzq:A, 5xc6:A, 5xc6:B, 5yvj:B
4	2bhr:B	439	431	0.7256	0.7107	0.7239	0.0	2bhr:A
5	2v6i:A	421	425	0.6581	0.6722	0.6659	0.0
6	7bm0:A	427	427	0.4674	0.4707	0.4707	5.12e-130	7blv:A, 7nxu:A
7	7v4r:A	437	430	0.4651	0.4577	0.4651	3.83e-129
8	4ojq:B	420	154	0.0977	0.1000	0.2727	6.59e-06	1hei:B, 4ok6:B
9	4b6f:A	645	256	0.1419	0.0946	0.2383	1.31e-04	1a1v:A, 4a1t:A, 4a1t:B, 4a1v:A, 4a1v:B, 4a1x:A, 4a1x:B, 4a92:A, 4a92:B, 4b6e:B, 4b6f:B, 4b71:A, 4b71:B, 4b73:A, 4b73:B, 4b74:A, 4b74:B, 4b75:A, 4b75:B, 4b76:A, 4b76:B, 1bt7:A, 1cu1:A, 1cu1:B, 1dxp:A, 1dxp:B, 1dxw:A, 1dy8:A, 1dy8:B, 1dy9:A, 1dy9:B, 5e4f:A, 5e4f:B, 2f55:A, 2f55:B, 2f55:C, 6fe6:A, 5fps:A, 5fps:B, 5fpt:A, 5fpt:B, 5fpy:A, 5fpy:B, 1hei:A, 4i31:A, 4i31:B, 4i32:A, 4i32:B, 4i33:A, 4i33:B, 4jmy:A, 4jmy:B, 1jxp:A, 1jxp:B, 2k1q:A, 4k8b:A, 4k8b:B, 3kee:A, 3kee:B, 3kee:C, 3kee:D, 3kqh:B, 3kqh:A, 3kqk:B, 3kqk:A, 3kql:A, 3kql:B, 3kqn:A, 3kqu:A, 3kqu:B, 3kqu:C, 3kqu:D, 3kqu:E, 3kqu:F, 4ktc:A, 4ktc:C, 1ns3:A, 1ns3:B, 3o8b:A, 3o8b:B, 3o8c:A, 3o8c:B, 3o8d:A, 3o8d:B, 3o8r:A, 3o8r:B, 4ojq:A, 4ok3:A, 4ok5:A, 4ok6:A, 4oks:A, 4oks:B, 3oyp:A, 3oyp:B, 3p8n:A, 3p8n:B, 3p8o:A, 3p8o:B, 3rvb:A, 4tyd:A, 4tyd:D, 4tyd:B, 4tyd:E, 4tyd:C, 4tyd:F, 4tyd:G, 4tyd:M, 4tyd:H, 4tyd:J, 4tyd:L, 4tyd:K, 4u01:A, 4u01:B, 4u01:C, 4u01:D, 4u01:E, 4u01:F, 4u01:G, 4u01:H, 4u01:J, 1w3c:A, 1w3c:B, 4wxp:A, 4wxr:A, 4wxr:B, 2zjo:A
10	5wdx:A	642	184	0.1140	0.0763	0.2663	0.014
11	8po7:A	594	323	0.1837	0.1330	0.2446	0.12
12	6zww:C	749	323	0.1837	0.1055	0.2446	0.17	8po7:B, 8po8:A, 8po8:B, 6zww:A, 6zww:E, 6zww:G
13	4b3g:A	614	53	0.0419	0.0293	0.3396	0.25	4b3g:B
14	3r2l:A	154	30	0.0395	0.1104	0.5667	3.3	3r2m:A, 3r2r:A, 3r2s:A
15	3s27:H	797	95	0.0651	0.0351	0.2947	3.4	3s27:A, 3s27:B, 3s27:C, 3s27:D, 3s27:E, 3s27:F, 3s27:G, 3s28:A, 3s28:B, 3s28:C, 3s28:D, 3s28:E, 3s28:F, 3s28:G, 3s28:H, 3s29:A, 3s29:B, 3s29:C, 3s29:D, 3s29:E, 3s29:F, 3s29:G, 3s29:H
16	6h57:A	795	109	0.0814	0.0440	0.3211	4.5
17	7d63:RZ	839	55	0.0535	0.0274	0.4182	4.6	7d4i:RZ, 7d5t:RZ, 7mqj:A
18	7d63:RZ	839	224	0.1070	0.0548	0.2054	5.5	7d4i:RZ, 7d5t:RZ, 7mqj:A
19	6zqg:JD	829	109	0.0814	0.0422	0.3211	4.7
20	8ro1:DX	682	68	0.0558	0.0352	0.3529	4.8
21	7aju:JD	811	109	0.0814	0.0432	0.3211	5.0	6zqd:JD, 6zqe:JD, 6zqf:JD
22	6ks6:E	536	68	0.0372	0.0299	0.2353	5.6	6ks6:e, 4v81:E, 4v81:M, 4v81:e, 4v81:m, 4v8r:AE, 4v8r:Ae, 4v8r:BE, 4v8r:Be, 4v94:E, 4v94:M, 4v94:e, 4v94:m, 7ylw:E, 7ylw:e, 7ylx:E, 7ylx:e, 7yly:E, 7yly:e
23	6aic:A	202	57	0.0488	0.1040	0.3684	8.3

[Back]