Home Research COVID-19 Services Publications People Teaching Job Opening News Forum --> -->
Online Services

●I-TASSER ●I-TASSER-MTD ●C-I-TASSER ●CR-I-TASSER ●QUARK ●C-QUARK ●LOMETS ●MUSTER ●CEthreader ●SEGMER ●DeepFold ●DeepFoldRNA ●FoldDesign ●COFACTOR ●COACH ●MetaGO ●TripletGO ●IonCom ●FG-MD ●ModRefiner ●REMO ●DEMO ●DEMO-EM ●DMFold ●SPRING ●COTH ●Threpp ●PEPPI ●BSpred ●ANGLOR ●EDock ●BSP-SLIM ●SAXSTER ●FUpred ●ThreaDom ●ThreaDomEx ●EvoDesign ●BindProf ●BindProfX ●SSIPe ●GPCR-I-TASSER ●MAGELLAN ●ResQ ●STRUM ●DAMpred

●TM-score ●TM-align ●US-align ●MM-align ●RNA-align ●NW-align ●LS-align ●EDTSurf ●MVP ●MVP-Fit ●SPICKER ●HAAD ●PSSpred ●3DRobot ●MR-REX ●I-TASSER-MR ●SVMSEQ ●NeBcon ●ResPRE ●TripletRes ●DeepPotential ●WDL-RF ●ATPbind ●DockRMSD ●DeepMSA ●FASPR ●EM-Refiner ●GPU-I-TASSER

●BioLiP ●E. coli ●GLASS ●GPCR-HGmod ●GPCR-RD ●GPCR-EXP ●Tara-3D ●TM-fold ●DECOYS ●POTENTIAL ●RW/RWplus ●EvoEF ●HPSF ●THE-DB ●ADDRESS ●Alpaca-Antibody ●CASP7 ●CASP8 ●CASP9 ●CASP10 ●CASP11 ●CASP12 ●CASP13 ●CASP14

BioLiP
>protein
SMKLLYSNTSPYARKVRVVAAEKRIDVDMVLVVLADPECPVADHNPLGKIPVLILPDGESLYDSRVIVEYLDHRTPVAHL
IPQDHTAKIAVRRWEALADGVTDAAVAAVMEGRRPEGMQDSAVIEKQLNKVERGLRRMDQDLEKRKWCVNESFSLADIAV
GCMLGYLELRYQHLDWKQQYPNLARHYAAMMKRASFKDTAPV

The query sequence (length=202) is searched through a non-redundant set of database sequences protein_nr.fasta.gz clustered at 90% identity cutoff to identify representative hits. Homologs that belong to the same sequence cluster of the representative hit are listed in the last column of the table.

# Hit Hit
length 		Aligned
length 		Identity
(normalized by query) 		Identity
(normalized by hit) 		Identity (normalized
by aligned length) 		E-value Homologs
to hit
1 4glt:A 208 202 1.0000 0.9712 1.0000 8.87e-151 4glt:B, 4glt:C, 4glt:D
2 3tou:A 212 202 0.4802 0.4575 0.4802 5.19e-59 3tou:B
3 4mk3:A 203 201 0.4455 0.4433 0.4478 6.08e-52
4 4jed:A 212 199 0.4010 0.3821 0.4070 3.26e-45
5 3r2q:A 202 200 0.3366 0.3366 0.3400 5.66e-34
6 4ibp:A 205 207 0.3663 0.3610 0.3575 1.01e-30 4id0:B, 4iji:A, 4iji:B, 4iji:C, 4iji:D, 4iji:E, 4iji:G
7 4qq7:A 204 166 0.2327 0.2304 0.2831 2.01e-12 4qq7:B
8 4mf6:A 240 205 0.2822 0.2375 0.2780 3.06e-11 4mf5:A
9 3qaw:A 219 205 0.2574 0.2374 0.2537 6.55e-11
10 8ai8:A 183 164 0.2129 0.2350 0.2622 3.05e-10 8ai8:B, 8ai9:A, 8ai9:B, 8aib:A, 8aib:B, 7pka:A, 7pka:B
11 5evo:A 213 195 0.2129 0.2019 0.2205 3.66e-09
12 8jzk:A 214 169 0.2327 0.2196 0.2781 1.30e-08
13 4kh7:B 212 206 0.2673 0.2547 0.2621 2.80e-08 4kh7:A
14 8a0p:A 216 168 0.2277 0.2130 0.2738 4.25e-08 8a08:A, 8a0i:A, 8a0o:A, 8a0q:A, 8a0r:A, 7zvp:A, 7zzn:A
15 6m1t:A 201 154 0.2228 0.2239 0.2922 4.57e-08 6m1t:B
16 5kej:A 222 214 0.2624 0.2387 0.2477 8.15e-08 5g5f:A, 5kej:B
17 2cz2:A 212 166 0.2277 0.2170 0.2771 9.76e-08
18 3m3m:A 201 119 0.1683 0.1692 0.2857 1.68e-07
19 6wmt:S 202 165 0.1931 0.1931 0.2364 2.53e-07 6weg:D
20 4iel:B 206 160 0.2030 0.1990 0.2562 3.22e-07 4iel:A
21 5f8b:A 215 180 0.2079 0.1953 0.2333 3.46e-07 5fhi:A
22 3ubl:A 212 183 0.2178 0.2075 0.2404 3.84e-07 3ubl:B
23 5d9v:A 211 193 0.1931 0.1848 0.2021 3.92e-07 5d9w:A, 5d9x:A
24 5a4u:A 211 183 0.2376 0.2275 0.2623 3.95e-07 5a4u:B, 5a4u:C, 5a4u:D, 5a4u:E, 5a4u:F, 5a4v:A, 5a4v:B, 5a4v:C, 5a4v:D, 5a4v:E, 5a4v:F, 5a4w:A, 5a4w:B, 5a4w:C, 5a4w:D, 5a4w:E, 5a4w:F, 5a5k:A, 5a5k:B, 5a5k:C, 5a5k:D, 5a5k:E, 5a5k:F, 5a5k:G, 5a5k:H, 5a5k:I, 5a5k:J, 5a5k:K, 5a5k:L, 5a5k:M, 5a5k:N, 5a5k:O, 5a5k:P, 5a5k:Q, 5a5k:R, 5a5k:S, 5a5k:T, 5a5k:U, 5a5k:V, 5a5k:W, 5a5k:X, 1bx9:A, 1gnw:A, 1gnw:B
25 7aia:AAA 259 253 0.3119 0.2432 0.2490 5.24e-07
26 6mhc:A 244 88 0.1287 0.1066 0.2955 7.01e-07 1eem:A, 4is0:A, 3lfl:A, 3lfl:B, 3lfl:C, 6mhb:A, 6mhb:B, 6mhb:C, 6mhb:D, 6mhb:E, 6mhb:F, 6mhc:B, 6mhd:A, 6mhd:B, 6pnm:A, 6pnn:A, 6pno:A, 5ueh:A, 5v3q:A, 3vln:A, 4yqm:A, 4yqm:B, 4yqm:C, 4yqu:A, 4yqu:B, 4yqv:A, 4yqv:B, 4yqv:C, 5yvn:A, 5yvo:A
27 4ikh:A 227 178 0.2178 0.1938 0.2472 7.47e-07
28 4nhz:H 246 166 0.1832 0.1504 0.2229 1.15e-06 4nhz:A, 4nhz:B, 4nhz:C, 4nhz:D, 4nhz:E, 4nhz:F, 4nhz:G, 4nhz:I, 4nhz:J, 4nhz:K, 4nhz:L, 4nhz:M, 4nhz:N, 4nhz:O, 4nhz:P
29 7dwe:A 212 160 0.2228 0.2123 0.2812 1.31e-06 7dwg:A
30 4hoj:A 197 200 0.2525 0.2589 0.2550 2.03e-06
31 1fw1:A 208 127 0.1733 0.1683 0.2756 2.07e-06
32 7y55:A 224 208 0.2624 0.2366 0.2548 2.77e-06 7y55:B, 7y55:C, 7y55:D
33 7dw4:A 220 171 0.1931 0.1773 0.2281 3.44e-06 7dw1:A, 7dw1:B
34 1f2e:A 201 151 0.1980 0.1990 0.2649 3.85e-06 1f2e:B, 1f2e:C, 1f2e:D
35 3uar:A 203 156 0.2030 0.2020 0.2628 5.02e-06
36 8qll:A 237 125 0.1436 0.1224 0.2320 1.31e-05 8qll:B
37 3qag:A 238 129 0.1782 0.1513 0.2791 1.62e-05 3q19:A, 3q19:B
38 5lol:A 207 192 0.2178 0.2126 0.2292 1.94e-05
39 3wd6:A 242 78 0.1238 0.1033 0.3205 1.95e-05 3wd6:B, 3wd6:C, 3wd6:D
40 4mzw:A 270 177 0.2178 0.1630 0.2486 2.74e-05 4mzw:B
41 4gf0:A 208 155 0.2030 0.1971 0.2645 2.80e-05 4gf0:B
42 3m0f:A 203 161 0.1931 0.1921 0.2422 2.92e-05 3m0f:B
43 4f0c:A 228 211 0.2129 0.1886 0.2038 4.24e-05 5o00:A
44 5f06:A 213 171 0.2129 0.2019 0.2515 7.53e-05 5f06:B
45 3erg:A 208 164 0.2129 0.2067 0.2622 7.96e-05 3erg:B, 3ibh:A
46 8agq:A 213 158 0.2129 0.2019 0.2722 9.18e-05 5f07:A
47 4g9h:A 202 114 0.1386 0.1386 0.2456 1.09e-04 4g9h:B, 4gci:A, 4gci:B
48 4zb6:D 220 170 0.1980 0.1818 0.2353 1.17e-04 4zb6:A, 4zb6:B, 4zb6:C
49 4ags:A 445 213 0.2723 0.1236 0.2582 1.90e-04 4ags:B, 4ags:C
50 4ags:A 445 87 0.1238 0.0562 0.2874 0.001 4ags:B, 4ags:C
51 4hz2:B 206 118 0.1535 0.1505 0.2627 2.01e-04 4hz2:A
52 5mye:A 212 194 0.2079 0.1981 0.2165 2.08e-04 5n9u:A
53 2gdr:A 202 174 0.1931 0.1931 0.2241 2.22e-04 2dsa:A, 2dsa:B, 2dsa:C, 2dsa:D, 2gdr:B, 2gdr:C, 2gdr:D, 2gdr:E, 2gdr:F
54 6ep7:B 214 196 0.2277 0.2150 0.2347 3.83e-04 6ep7:A
55 5g5a:A 219 196 0.2129 0.1963 0.2194 6.69e-04 5g5a:B, 5g5a:C, 5g5a:D
56 9f7k:A 222 159 0.1931 0.1757 0.2453 6.84e-04 9f7k:B
57 5j4u:A 218 92 0.1386 0.1284 0.3043 8.19e-04 5j5n:A, 5j5n:B
58 4g10:A 263 178 0.2129 0.1635 0.2416 0.001 4yav:A
59 4pua:A 261 177 0.1980 0.1533 0.2260 0.002
60 4xt0:A 243 201 0.2277 0.1893 0.2289 0.002
61 5elg:A 212 192 0.2030 0.1934 0.2135 0.002
62 5ech:B 214 199 0.2030 0.1916 0.2060 0.003 5ech:C, 5ech:E, 5ech:F, 5eci:B, 5eci:C, 5eci:E, 5eci:F, 5eck:B, 5eck:C, 5eck:E, 5eck:F, 5ecl:B, 5ecl:C, 5ecl:E, 5ecl:F, 5ecm:B, 5ecm:C, 5ecm:E, 5ecm:F, 5ecn:B, 5ecn:C, 5ecn:E, 5ecn:F, 5eco:B, 5eco:C, 5eco:E, 5eco:F, 5ecp:B, 5ecp:C, 5ecp:E, 5ecp:F, 5ecq:B, 5ecq:C, 5ecq:E, 5ecq:F, 5ecr:B, 5ecr:C, 5ecr:E, 5ecr:F, 5ecs:A, 5ecs:B
63 6sr8:A 235 181 0.2178 0.1872 0.2431 0.003 6sr8:B, 6sr9:A, 6sr9:B, 6sra:A, 6sra:B
64 5agy:A 219 158 0.2178 0.2009 0.2785 0.006 5agy:B, 4chs:A, 4chs:B, 4top:A, 4top:B, 2vo4:A, 2vo4:B
65 5hfk:A 207 166 0.1881 0.1836 0.2289 0.006 3gx0:A, 5hfk:B
66 1oyj:A 228 86 0.1386 0.1228 0.3256 0.007 1oyj:B, 1oyj:C, 1oyj:D
67 1gwc:C 222 175 0.2178 0.1982 0.2514 0.009 1gwc:A, 1gwc:B
68 4zb8:A 220 202 0.2129 0.1955 0.2129 0.018 4zbd:A, 4zbd:B
69 1pmt:A 201 114 0.1386 0.1393 0.2456 0.019 2pmt:A, 2pmt:B, 2pmt:C, 2pmt:D
70 6f70:A 242 132 0.1584 0.1322 0.2424 0.024 6f71:A, 6f71:B, 6f71:C, 6f71:D
71 3gh6:A 209 144 0.1782 0.1722 0.2500 0.032
72 4yan:A 252 79 0.1188 0.0952 0.3038 0.066 4yan:B, 4yan:C, 4yan:D
73 4zba:A 222 210 0.2030 0.1847 0.1952 0.071 4zb9:A, 4zb9:C, 4zb9:D, 4zba:B, 4zba:C, 4zba:D, 4zbb:A, 4zbb:C, 4zbb:B, 4zbb:D
74 3wyw:B 214 171 0.1980 0.1869 0.2339 0.11 3wyw:A
75 1r5a:A 214 169 0.1931 0.1822 0.2308 0.29
76 4pxo:A 216 88 0.1386 0.1296 0.3182 0.34 4pxo:B
77 3mak:A 208 144 0.1535 0.1490 0.2153 0.35 3ein:A
78 3vpq:A 203 161 0.1931 0.1921 0.2422 0.35 3vur:A
79 4i97:A 207 149 0.1584 0.1546 0.2148 0.41 4i97:B
80 4bvx:A 203 163 0.1980 0.1970 0.2454 0.74
81 4kdy:A 222 136 0.2228 0.2027 0.3309 0.91 4kae:A, 4kae:B, 4kdy:B
82 4kx4:A 217 74 0.1089 0.1014 0.2973 1.1 7d9l:A, 7dkp:A, 7dkp:B, 7dkp:C, 7dkp:D
83 8a22:Bt 75 23 0.0594 0.1600 0.5217 1.9 8apn:Bt, 8apo:Bt
84 4uwq:A 548 67 0.0941 0.0347 0.2836 2.1 4uwq:D, 4uwq:G, 4uwq:J, 2wdc:A, 2wdd:A, 2wde:A, 2wdf:A
85 3f63:A 218 73 0.1139 0.1055 0.3151 2.5 3f63:B, 3f6d:A, 3f6d:B, 3g7i:B, 3g7j:A, 3g7j:B
86 3lbf:A 207 38 0.0693 0.0676 0.3684 3.0 3lbf:B, 3lbf:C, 3lbf:D
87 2ycd:A 213 133 0.1683 0.1596 0.2556 3.2
88 5zcr:A 725 75 0.1238 0.0345 0.3333 4.3 5zcr:B
89 4pnf:B 221 171 0.1881 0.1719 0.2222 4.4 4pnf:A, 4pnf:C, 4pnf:D, 4pnf:E, 4pnf:F, 4pnf:G, 4pnf:H, 4yh2:A, 4yh2:B, 4yh2:C, 4yh2:D
90 5koi:A 271 58 0.0891 0.0664 0.3103 4.9 5koi:B, 5koi:C, 5koi:D, 5koi:E, 5koi:F, 5koi:G, 5koi:H
91 6hcy:C 436 73 0.1139 0.0528 0.3151 5.0 6hcy:B, 6hcy:A, 6hd1:C, 6hd1:B, 6hd1:A
92 4kgi:C 206 201 0.2277 0.2233 0.2289 6.2 1a0f:A, 1a0f:B, 4kgi:A, 4kgi:B, 4kgi:D, 1n2a:A, 1n2a:B
93 8ix7:B 221 163 0.1782 0.1629 0.2209 8.4 8ix7:A
94 3ir4:A 218 75 0.1040 0.0963 0.2800 8.5

[Back]
Reference:
  • Chengxin Zhang, Xi Zhang, Peter L Freddolino, and Yang Zhang. BioLiP2: an updated structure database for biologically relevent ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, gkad630 (2023).
  • Jianyi Yang, Ambrish Roy, and Yang Zhang. BioLiP: a semi-manually curated database for biologically relevant ligand-protein interactions, Nucleic Acids Research, 41: D1096-D1103 (2013) (download the PDF file).

    • yangzhanglabumich.edu | (734) 647-1549 | 100 Washtenaw Avenue, Ann Arbor, MI 48109-2218